MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020055	CAG	2	6	616371	616376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840327
12003	NC_020055	CT	3	6	616392	616397	0 %	50 %	0 %	50 %	436840327
12004	NC_020055	TGA	2	6	616459	616464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840327
12005	NC_020055	TC	3	6	616513	616518	0 %	50 %	0 %	50 %	436840327
12006	NC_020055	AAG	2	6	616524	616529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840327
12007	NC_020055	GAT	2	6	616618	616623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840327
12008	NC_020055	CTA	2	6	616721	616726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840328
12009	NC_020055	TCA	2	6	616835	616840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840328
12010	NC_020055	G	7	7	616884	616890	0 %	0 %	100 %	0 %	436840329
12011	NC_020055	G	6	6	616909	616914	0 %	0 %	100 %	0 %	436840329
12012	NC_020055	ATC	2	6	616938	616943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840329
12013	NC_020055	TTC	2	6	617012	617017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840329
12014	NC_020055	CAAA	2	8	617056	617063	75 %	0 %	0 %	25 %	436840329
12015	NC_020055	GTC	2	6	617183	617188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840329
12016	NC_020055	CGGGG	2	10	617433	617442	0 %	0 %	80 %	20 %	436840329
12017	NC_020055	AG	3	6	617511	617516	50 %	0 %	50 %	0 %	436840329
12018	NC_020055	TG	3	6	617642	617647	0 %	50 %	50 %	0 %	436840329
12019	NC_020055	GGGT	2	8	617648	617655	0 %	25 %	75 %	0 %	436840329
12020	NC_020055	TGG	2	6	617719	617724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_020055	GCT	2	6	617909	617914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840330
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12025	NC_020055	GAA	2	6	618044	618049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840330
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12028	NC_020055	CTA	2	6	618195	618200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840331
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12030	NC_020055	A	7	7	618293	618299	100 %	0 %	0 %	0 %	436840331
12031	NC_020055	ATGG	2	8	618313	618320	25 %	25 %	50 %	0 %	436840331
12032	NC_020055	TGG	2	6	618361	618366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840331
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12034	NC_020055	CTG	2	6	618494	618499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840331
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12036	NC_020055	TTCA	2	8	618722	618729	25 %	50 %	0 %	25 %	436840332
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12051	NC_020055	A	7	7	619362	619368	100 %	0 %	0 %	0 %	436840332
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12055	NC_020055	ATT	2	6	619518	619523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840332
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12057	NC_020055	ATTG	2	8	619610	619617	25 %	50 %	25 %	0 %	436840332
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12063	NC_020055	TTCCA	2	10	619799	619808	20 %	40 %	0 %	40 %	436840332
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12089	NC_020055	TTA	2	6	621324	621329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12105	NC_020055	TGAT	2	8	621983	621990	25 %	50 %	25 %	0 %	436840333
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12110	NC_020055	AAT	2	6	622165	622170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12111	NC_020055	CTT	2	6	622227	622232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840334
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12119	NC_020055	AT	3	6	622732	622737	50 %	50 %	0 %	0 %	436840334
12120	NC_020055	A	6	6	622839	622844	100 %	0 %	0 %	0 %	436840334
12121	NC_020055	ACAA	2	8	622870	622877	75 %	0 %	0 %	25 %	436840334
12122	NC_020055	A	8	8	622881	622888	100 %	0 %	0 %	0 %	436840334
12123	NC_020055	TGC	2	6	622922	622927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840334
12124	NC_020055	ACC	2	6	623019	623024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840334
12125	NC_020055	ACC	2	6	623061	623066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840334
12126	NC_020055	ATG	2	6	623070	623075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840334
12127	NC_020055	TCC	2	6	623082	623087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436840334
12128	NC_020055	A	7	7	623107	623113	100 %	0 %	0 %	0 %	436840334
12129	NC_020055	GCT	2	6	623114	623119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840334
12130	NC_020055	GAT	2	6	623139	623144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840334
12131	NC_020055	CTGG	2	8	623183	623190	0 %	25 %	50 %	25 %	436840334
12132	NC_020055	AGA	2	6	623216	623221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840334
12133	NC_020055	GGA	2	6	623246	623251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840334
12134	NC_020055	ATC	2	6	623349	623354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840334
12135	NC_020055	AG	4	8	623406	623413	50 %	0 %	50 %	0 %	436840334
12136	NC_020055	TCA	2	6	623436	623441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840334
12137	NC_020055	AGCT	2	8	623602	623609	25 %	25 %	25 %	25 %	436840334
12138	NC_020055	ACA	2	6	623657	623662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840334
12139	NC_020055	TGA	2	6	623678	623683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840334
12140	NC_020055	GCA	2	6	623687	623692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840334
12141	NC_020055	T	6	6	623752	623757	0 %	100 %	0 %	0 %	436840334
12142	NC_020055	A	6	6	623761	623766	100 %	0 %	0 %	0 %	436840334
12143	NC_020055	GCC	2	6	623826	623831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840334
12144	NC_020055	GC	3	6	623881	623886	0 %	0 %	50 %	50 %	436840334
12145	NC_020055	AT	3	6	623891	623896	50 %	50 %	0 %	0 %	436840334
12146	NC_020055	TGG	2	6	623926	623931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840334
12147	NC_020055	TCA	2	6	623935	623940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840334
12148	NC_020055	ACA	2	6	624000	624005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840334
12149	NC_020055	TGA	2	6	624131	624136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840334
12150	NC_020055	ATT	2	6	624139	624144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840334
12151	NC_020055	ACT	2	6	624154	624159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840334
12152	NC_020055	TA	3	6	624193	624198	50 %	50 %	0 %	0 %	436840334
12153	NC_020055	CCG	2	6	624226	624231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840334
12154	NC_020055	GCT	2	6	624311	624316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840334
12155	NC_020055	GAC	2	6	624357	624362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840334
12156	NC_020055	ATT	2	6	624372	624377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840334
12157	NC_020055	A	6	6	624456	624461	100 %	0 %	0 %	0 %	436840335
12158	NC_020055	AG	3	6	624465	624470	50 %	0 %	50 %	0 %	436840335
12159	NC_020055	CTG	2	6	624509	624514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840335
12160	NC_020055	GCT	2	6	624538	624543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840335
12161	NC_020055	CCA	2	6	624558	624563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840335
12162	NC_020055	CGC	2	6	624583	624588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840335
12163	NC_020055	GTC	2	6	624626	624631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840335
12164	NC_020055	ATTC	2	8	624714	624721	25 %	50 %	0 %	25 %	436840335
12165	NC_020055	CTAT	2	8	624774	624781	25 %	50 %	0 %	25 %	436840335
12166	NC_020055	CGGA	2	8	624792	624799	25 %	0 %	50 %	25 %	436840335
12167	NC_020055	TGG	2	6	624909	624914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840335
12168	NC_020055	CTG	3	9	624917	624925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840335
12169	NC_020055	TCT	2	6	624958	624963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840335
12170	NC_020055	TGC	2	6	624969	624974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840335
12171	NC_020055	CAT	2	6	625068	625073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840335
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12173	NC_020055	GCA	2	6	625157	625162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840335
12174	NC_020055	ATTC	2	8	625212	625219	25 %	50 %	0 %	25 %	436840335
12175	NC_020055	TGG	2	6	625390	625395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840336
12176	NC_020055	CGG	2	6	625444	625449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840336
12177	NC_020055	CATG	2	8	625534	625541	25 %	25 %	25 %	25 %	436840336
12178	NC_020055	CGG	2	6	625591	625596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840336
12179	NC_020055	CTG	2	6	625670	625675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840336
12180	NC_020055	ATC	2	6	625790	625795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840336
12181	NC_020055	GCC	2	6	625816	625821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840336
12182	NC_020055	AGT	2	6	625872	625877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840336
12183	NC_020055	TTA	2	6	625878	625883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12184	NC_020055	TTC	2	6	625915	625920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12185	NC_020055	AT	3	6	625973	625978	50 %	50 %	0 %	0 %	436840337
12186	NC_020055	GTT	2	6	626130	626135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840338
12187	NC_020055	GTCTGG	2	12	626154	626165	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436840338
12188	NC_020055	TAA	2	6	626177	626182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840338
12189	NC_020055	AT	3	6	626183	626188	50 %	50 %	0 %	0 %	436840338
12190	NC_020055	CAG	2	6	626209	626214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840338
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12192	NC_020055	GCG	2	6	626374	626379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840338
12193	NC_020055	AT	3	6	626423	626428	50 %	50 %	0 %	0 %	436840338
12194	NC_020055	AAT	2	6	626459	626464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840338
12195	NC_020055	CACCAT	2	12	626492	626503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	436840338
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12197	NC_020055	A	7	7	626688	626694	100 %	0 %	0 %	0 %	436840338
12198	NC_020055	CTGCA	2	10	626705	626714	20 %	20 %	20 %	40 %	436840338
12199	NC_020055	TGA	2	6	626735	626740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840338
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12201	NC_020055	GGA	2	6	626835	626840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840338
12202	NC_020055	CTG	2	6	626854	626859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840338
12203	NC_020055	TGG	2	6	626918	626923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840338
12204	NC_020055	GAA	2	6	626973	626978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840338
12205	NC_020055	A	6	6	627038	627043	100 %	0 %	0 %	0 %	436840338
12206	NC_020055	AAG	2	6	627055	627060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840338
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12208	NC_020055	GAAA	2	8	627137	627144	75 %	0 %	25 %	0 %	436840338
12209	NC_020055	CCG	2	6	627192	627197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840338
12210	NC_020055	TAAT	2	8	627202	627209	50 %	50 %	0 %	0 %	436840338
12211	NC_020055	TAA	2	6	627261	627266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840338
12212	NC_020055	AT	4	8	627306	627313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12213	NC_020055	TTA	2	6	627314	627319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12214	NC_020055	TGA	2	6	627320	627325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12215	NC_020055	AGC	2	6	627423	627428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840339
12216	NC_020055	CA	3	6	627432	627437	50 %	0 %	0 %	50 %	436840339
12217	NC_020055	AAG	2	6	627533	627538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840339
12218	NC_020055	GTC	2	6	627549	627554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840339
12219	NC_020055	ATG	2	6	627623	627628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840339
12220	NC_020055	GCC	2	6	627629	627634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840339
12221	NC_020055	ACT	2	6	627752	627757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840339
12222	NC_020055	A	6	6	627931	627936	100 %	0 %	0 %	0 %	436840339
12223	NC_020055	CGG	2	6	628016	628021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840339
12224	NC_020055	G	7	7	628020	628026	0 %	0 %	100 %	0 %	436840339
12225	NC_020055	AAC	2	6	628072	628077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840339
12226	NC_020055	GGA	2	6	628080	628085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840339
12227	NC_020055	ACA	2	6	628103	628108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840339
12228	NC_020055	A	6	6	628132	628137	100 %	0 %	0 %	0 %	436840339
12229	NC_020055	A	6	6	628159	628164	100 %	0 %	0 %	0 %	436840339
12230	NC_020055	CCAT	2	8	628172	628179	25 %	25 %	0 %	50 %	436840339
12231	NC_020055	GACA	2	8	628188	628195	50 %	0 %	25 %	25 %	436840339
12232	NC_020055	GAA	2	6	628321	628326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840339
12233	NC_020055	CTT	2	6	628338	628343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840339
12234	NC_020055	ACA	2	6	628379	628384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840339
12235	NC_020055	TGGG	2	8	628423	628430	0 %	25 %	75 %	0 %	436840339
12236	NC_020055	TACT	2	8	628454	628461	25 %	50 %	0 %	25 %	436840339
12237	NC_020055	TCA	2	6	628491	628496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840339
12238	NC_020055	A	8	8	628504	628511	100 %	0 %	0 %	0 %	436840339
12239	NC_020055	A	6	6	628636	628641	100 %	0 %	0 %	0 %	436840339
12240	NC_020055	AATT	2	8	628674	628681	50 %	50 %	0 %	0 %	436840339
12241	NC_020055	TGGG	2	8	628711	628718	0 %	25 %	75 %	0 %	436840339
12242	NC_020055	GATAAA	2	12	628747	628758	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	436840339
12243	NC_020055	TTG	2	6	628763	628768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840339
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12245	NC_020055	ACA	2	6	628814	628819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840339
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12356	NC_020055	C	7	7	634440	634446	0 %	0 %	0 %	100 %	436840344
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12363	NC_020055	TTA	2	6	634929	634934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12364	NC_020055	TAT	2	6	634962	634967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12366	NC_020055	CAT	2	6	635025	635030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840345
12367	NC_020055	CAG	2	6	635070	635075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840345
12368	NC_020055	TCC	2	6	635122	635127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436840345
12369	NC_020055	TCA	2	6	635161	635166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840345
12370	NC_020055	AG	3	6	635181	635186	50 %	0 %	50 %	0 %	436840345
12371	NC_020055	ATG	2	6	635247	635252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840345
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12373	NC_020055	CAGA	2	8	635322	635329	50 %	0 %	25 %	25 %	436840345
12374	NC_020055	TCA	2	6	635359	635364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840345
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12379	NC_020055	TGA	2	6	635659	635664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840345
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12384	NC_020055	ACC	2	6	635814	635819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840345
12385	NC_020055	AGAT	2	8	635839	635846	50 %	25 %	25 %	0 %	436840345
12386	NC_020055	TCT	2	6	635876	635881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840345
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12390	NC_020055	AACA	2	8	636133	636140	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12391	NC_020055	CAT	2	6	636145	636150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12407	NC_020055	A	8	8	637023	637030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12408	NC_020055	A	6	6	637068	637073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12461	NC_020055	ACTA	2	8	639263	639270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12472	NC_020055	CGG	2	6	639821	639826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840349
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12474	NC_020055	GC	3	6	639898	639903	0 %	0 %	50 %	50 %	436840349
12475	NC_020055	GCG	2	6	639931	639936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840349
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12483	NC_020055	CAGC	2	8	640217	640224	25 %	0 %	25 %	50 %	436840349
12484	NC_020055	C	6	6	640229	640234	0 %	0 %	0 %	100 %	436840349
12485	NC_020055	CTG	2	6	640266	640271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840349
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12487	NC_020055	TTC	2	6	640436	640441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840349
12488	NC_020055	TGG	2	6	640498	640503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840349
12489	NC_020055	GGA	2	6	640542	640547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840349
12490	NC_020055	G	6	6	640550	640555	0 %	0 %	100 %	0 %	436840349
12491	NC_020055	ATT	2	6	640586	640591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840349
12492	NC_020055	T	8	8	640598	640605	0 %	100 %	0 %	0 %	436840349
12493	NC_020055	CGC	2	6	640630	640635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840349
12494	NC_020055	CTG	2	6	640665	640670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840349
12495	NC_020055	AGT	2	6	640682	640687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840349
12496	NC_020055	TTCTGG	2	12	640723	640734	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	436840349
12497	NC_020055	TGG	2	6	640840	640845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840349
12498	NC_020055	GCT	2	6	640856	640861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840349
12499	NC_020055	ACCAGT	2	12	640977	640988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436840349
12500	NC_020055	TCA	2	6	641061	641066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840349

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