MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_020055	GTA	2	6	2820796	2820801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842412
55002	NC_020055	CCG	2	6	2820886	2820891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842412
55003	NC_020055	CCT	2	6	2820943	2820948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55004	NC_020055	TCAGT	2	10	2820997	2821006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55005	NC_020055	CTG	2	6	2821027	2821032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55006	NC_020055	TAT	2	6	2821090	2821095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55007	NC_020055	CCAG	2	8	2821098	2821105	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55008	NC_020055	CAT	2	6	2821172	2821177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842413
55009	NC_020055	A	6	6	2821183	2821188	100 %	0 %	0 %	0 %	436842413
55010	NC_020055	AAC	2	6	2821192	2821197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842413
55011	NC_020055	GCTGG	2	10	2821235	2821244	0 %	20 %	60 %	20 %	436842413
55012	NC_020055	GCC	2	6	2821402	2821407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842413
55013	NC_020055	CAG	2	6	2821429	2821434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842413
55014	NC_020055	GC	3	6	2821435	2821440	0 %	0 %	50 %	50 %	436842413
55015	NC_020055	A	7	7	2821476	2821482	100 %	0 %	0 %	0 %	436842413
55016	NC_020055	GAT	2	6	2821488	2821493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842413
55017	NC_020055	CAT	2	6	2821541	2821546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842413
55018	NC_020055	A	6	6	2821562	2821567	100 %	0 %	0 %	0 %	436842413
55019	NC_020055	CGG	2	6	2821595	2821600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842413
55020	NC_020055	AGC	2	6	2821727	2821732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842413
55021	NC_020055	TGA	2	6	2821751	2821756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842413
55022	NC_020055	CGA	2	6	2821811	2821816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842413
55023	NC_020055	AAT	2	6	2821835	2821840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842413
55024	NC_020055	TGA	2	6	2821868	2821873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842413
55025	NC_020055	CAC	2	6	2821920	2821925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842413
55026	NC_020055	GCAGC	2	10	2821938	2821947	20 %	0 %	40 %	40 %	436842413
55027	NC_020055	ATC	2	6	2821968	2821973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842413
55028	NC_020055	CTT	2	6	2821981	2821986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842413
55029	NC_020055	ATAAAG	2	12	2822056	2822067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	436842413
55030	NC_020055	GAA	2	6	2822068	2822073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842413
55031	NC_020055	GCT	2	6	2822131	2822136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842413
55032	NC_020055	GCA	2	6	2822182	2822187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842413
55033	NC_020055	A	6	6	2822187	2822192	100 %	0 %	0 %	0 %	436842413
55034	NC_020055	GGT	2	6	2822259	2822264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436842413
55035	NC_020055	CGG	2	6	2822504	2822509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842413
55036	NC_020055	GCG	2	6	2822607	2822612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842413
55037	NC_020055	TAT	2	6	2822787	2822792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842413
55038	NC_020055	TAA	2	6	2822813	2822818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842413
55039	NC_020055	AT	3	6	2822820	2822825	50 %	50 %	0 %	0 %	436842413
55040	NC_020055	AGC	2	6	2822854	2822859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842413
55041	NC_020055	AAC	2	6	2822985	2822990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842413
55042	NC_020055	A	6	6	2823027	2823032	100 %	0 %	0 %	0 %	436842413
55043	NC_020055	TCCAGA	2	12	2823051	2823062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436842413
55044	NC_020055	AAC	2	6	2823094	2823099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842413
55045	NC_020055	A	6	6	2823111	2823116	100 %	0 %	0 %	0 %	436842413
55046	NC_020055	A	6	6	2823135	2823140	100 %	0 %	0 %	0 %	436842413
55047	NC_020055	AGA	2	6	2823151	2823156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842413
55048	NC_020055	A	7	7	2823156	2823162	100 %	0 %	0 %	0 %	436842413
55049	NC_020055	AT	3	6	2823183	2823188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55050	NC_020055	CAT	2	6	2823282	2823287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842414
55051	NC_020055	GGAC	2	8	2823288	2823295	25 %	0 %	50 %	25 %	436842414
55052	NC_020055	TTAT	2	8	2823341	2823348	25 %	75 %	0 %	0 %	436842414
55053	NC_020055	GAC	2	6	2823361	2823366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842414
55054	NC_020055	TAT	2	6	2823427	2823432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842414
55055	NC_020055	GCAG	2	8	2823454	2823461	25 %	0 %	50 %	25 %	436842414
55056	NC_020055	ATG	2	6	2823467	2823472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842414
55057	NC_020055	CAG	2	6	2823549	2823554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842414
55058	NC_020055	T	6	6	2823557	2823562	0 %	100 %	0 %	0 %	436842414
55059	NC_020055	AGC	2	6	2823581	2823586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842414
55060	NC_020055	TGGA	2	8	2823622	2823629	25 %	25 %	50 %	0 %	436842414
55061	NC_020055	CTG	2	6	2823640	2823645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842414
55062	NC_020055	CTCAG	2	10	2823776	2823785	20 %	20 %	20 %	40 %	436842414
55063	NC_020055	AGA	2	6	2823831	2823836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842414
55064	NC_020055	TCAA	2	8	2823889	2823896	50 %	25 %	0 %	25 %	436842414
55065	NC_020055	AAC	2	6	2824045	2824050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842414
55066	NC_020055	GCA	2	6	2824097	2824102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842414
55067	NC_020055	CAAC	2	8	2824139	2824146	50 %	0 %	0 %	50 %	436842414
55068	NC_020055	ATC	2	6	2824256	2824261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842414
55069	NC_020055	ATG	2	6	2824295	2824300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842414
55070	NC_020055	GCCT	2	8	2824438	2824445	0 %	25 %	25 %	50 %	436842414
55071	NC_020055	GC	3	6	2824480	2824485	0 %	0 %	50 %	50 %	436842414
55072	NC_020055	TTG	2	6	2824544	2824549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842414
55073	NC_020055	G	6	6	2824583	2824588	0 %	0 %	100 %	0 %	436842414
55074	NC_020055	AGC	2	6	2824616	2824621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842414
55075	NC_020055	A	7	7	2824680	2824686	100 %	0 %	0 %	0 %	436842415
55076	NC_020055	TGC	2	6	2824706	2824711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842415
55077	NC_020055	AAAG	2	8	2824784	2824791	75 %	0 %	25 %	0 %	436842415
55078	NC_020055	AGA	2	6	2824839	2824844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842415
55079	NC_020055	TAA	2	6	2824865	2824870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842415
55080	NC_020055	CGA	2	6	2825063	2825068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842415
55081	NC_020055	ATA	2	6	2825083	2825088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842415
55082	NC_020055	AAC	2	6	2825172	2825177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842415
55083	NC_020055	TTAA	2	8	2825257	2825264	50 %	50 %	0 %	0 %	436842415
55084	NC_020055	CTC	2	6	2825265	2825270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55085	NC_020055	AT	3	6	2825331	2825336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55086	NC_020055	AAATGA	2	12	2825381	2825392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55087	NC_020055	TCAG	2	8	2825431	2825438	25 %	25 %	25 %	25 %	436842416
55088	NC_020055	CAT	2	6	2825471	2825476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842416
55089	NC_020055	TCA	2	6	2825518	2825523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842416
55090	NC_020055	CTTT	2	8	2825545	2825552	0 %	75 %	0 %	25 %	436842416
55091	NC_020055	A	6	6	2825606	2825611	100 %	0 %	0 %	0 %	436842416
55092	NC_020055	TCA	2	6	2825627	2825632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842416
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55094	NC_020055	CTATC	2	10	2825683	2825692	20 %	40 %	0 %	40 %	436842417
55095	NC_020055	ATTA	2	8	2825758	2825765	50 %	50 %	0 %	0 %	436842417
55096	NC_020055	A	6	6	2825900	2825905	100 %	0 %	0 %	0 %	436842417
55097	NC_020055	CTC	2	6	2825908	2825913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842417
55098	NC_020055	A	6	6	2825914	2825919	100 %	0 %	0 %	0 %	436842417
55099	NC_020055	T	6	6	2826058	2826063	0 %	100 %	0 %	0 %	436842417
55100	NC_020055	CCG	2	6	2826125	2826130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842417
55101	NC_020055	AAGT	2	8	2826132	2826139	50 %	25 %	25 %	0 %	436842417
55102	NC_020055	CCAC	2	8	2826174	2826181	25 %	0 %	0 %	75 %	436842417
55103	NC_020055	CAT	2	6	2826216	2826221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842417
55104	NC_020055	CTG	2	6	2826275	2826280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842417
55105	NC_020055	CAT	2	6	2826301	2826306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842417
55106	NC_020055	CGA	2	6	2826396	2826401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842417
55107	NC_020055	TGG	2	6	2826411	2826416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436842417
55108	NC_020055	AT	3	6	2826459	2826464	50 %	50 %	0 %	0 %	436842417
55109	NC_020055	CG	3	6	2826499	2826504	0 %	0 %	50 %	50 %	436842417
55110	NC_020055	TCA	2	6	2826506	2826511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842417
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55112	NC_020055	CGT	2	6	2826640	2826645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842417
55113	NC_020055	ACA	2	6	2826647	2826652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842417
55114	NC_020055	GCA	2	6	2826701	2826706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842417
55115	NC_020055	CTT	2	6	2826843	2826848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842417
55116	NC_020055	CAA	3	9	2826870	2826878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842417
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55118	NC_020055	AAG	2	6	2826931	2826936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842417
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55237	NC_020055	GAA	2	6	2833455	2833460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842423
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55240	NC_020055	CAT	2	6	2833601	2833606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842423
55241	NC_020055	GCCTG	2	10	2833640	2833649	0 %	20 %	40 %	40 %	436842423
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55243	NC_020055	TGCT	2	8	2833861	2833868	0 %	50 %	25 %	25 %	436842423
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55245	NC_020055	ATCG	2	8	2833991	2833998	25 %	25 %	25 %	25 %	436842423
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55250	NC_020055	A	7	7	2834248	2834254	100 %	0 %	0 %	0 %	436842424
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55280	NC_020055	A	6	6	2835549	2835554	100 %	0 %	0 %	0 %	436842425
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55289	NC_020055	A	7	7	2835911	2835917	100 %	0 %	0 %	0 %	436842425
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55293	NC_020055	TTAT	2	8	2836153	2836160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55294	NC_020055	TATT	2	8	2836219	2836226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55295	NC_020055	TG	3	6	2836241	2836246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55296	NC_020055	ATAC	2	8	2836294	2836301	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55297	NC_020055	AACA	2	8	2836338	2836345	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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55304	NC_020055	TGC	2	6	2836989	2836994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842426
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55307	NC_020055	AAT	2	6	2837070	2837075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55342	NC_020055	CTT	2	6	2838633	2838638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842428
55343	NC_020055	A	7	7	2838704	2838710	100 %	0 %	0 %	0 %	436842428
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55350	NC_020055	GCA	2	6	2838920	2838925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842428
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55354	NC_020055	ACT	2	6	2839104	2839109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842428
55355	NC_020055	AGA	2	6	2839123	2839128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842428
55356	NC_020055	GCA	2	6	2839133	2839138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842428
55357	NC_020055	ACA	2	6	2839198	2839203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842428
55358	NC_020055	CTGT	2	8	2839260	2839267	0 %	50 %	25 %	25 %	436842428
55359	NC_020055	CAA	2	6	2839378	2839383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842428
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55361	NC_020055	GGCC	2	8	2839528	2839535	0 %	0 %	50 %	50 %	436842428
55362	NC_020055	GACG	2	8	2839565	2839572	25 %	0 %	50 %	25 %	436842428
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55369	NC_020055	TCA	2	6	2839896	2839901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842428
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55374	NC_020055	TCC	2	6	2840159	2840164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842428
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55383	NC_020055	T	6	6	2840574	2840579	0 %	100 %	0 %	0 %	436842428
55384	NC_020055	ATTC	2	8	2840590	2840597	25 %	50 %	0 %	25 %	436842428
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55389	NC_020055	CTG	2	6	2840825	2840830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842428
55390	NC_020055	CAA	2	6	2840831	2840836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842428
55391	NC_020055	CCTG	2	8	2840946	2840953	0 %	25 %	25 %	50 %	436842428
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55395	NC_020055	CGG	2	6	2841205	2841210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842428
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55427	NC_020055	T	6	6	2843385	2843390	0 %	100 %	0 %	0 %	436842429
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55429	NC_020055	GCTTT	2	10	2843563	2843572	0 %	60 %	20 %	20 %	436842429
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55435	NC_020055	CTGG	2	8	2843765	2843772	0 %	25 %	50 %	25 %	436842429
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55454	NC_020055	TTC	2	6	2844597	2844602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842429
55455	NC_020055	TTC	2	6	2844679	2844684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842429
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55459	NC_020055	T	6	6	2844822	2844827	0 %	100 %	0 %	0 %	436842430
55460	NC_020055	T	6	6	2844833	2844838	0 %	100 %	0 %	0 %	436842430
55461	NC_020055	GCC	2	6	2844864	2844869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55462	NC_020055	CTG	2	6	2844951	2844956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842431
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55464	NC_020055	TGA	2	6	2845027	2845032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842431
55465	NC_020055	ACA	2	6	2845148	2845153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842431
55466	NC_020055	CTA	2	6	2845169	2845174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842431
55467	NC_020055	GGC	2	6	2845184	2845189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842431
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55469	NC_020055	GCA	2	6	2845220	2845225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842431
55470	NC_020055	TGC	2	6	2845244	2845249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842431
55471	NC_020055	GAAC	2	8	2845320	2845327	50 %	0 %	25 %	25 %	436842431
55472	NC_020055	T	6	6	2845328	2845333	0 %	100 %	0 %	0 %	436842431
55473	NC_020055	GC	3	6	2845474	2845479	0 %	0 %	50 %	50 %	436842431
55474	NC_020055	TCT	2	6	2845540	2845545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842431
55475	NC_020055	GCCTT	2	10	2845564	2845573	0 %	40 %	20 %	40 %	436842431
55476	NC_020055	GCCG	2	8	2845595	2845602	0 %	0 %	50 %	50 %	436842431
55477	NC_020055	A	6	6	2845675	2845680	100 %	0 %	0 %	0 %	436842431
55478	NC_020055	TTC	2	6	2845681	2845686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842431
55479	NC_020055	TTC	2	6	2845725	2845730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842431
55480	NC_020055	TGC	2	6	2845741	2845746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842431
55481	NC_020055	CGG	2	6	2845763	2845768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842431
55482	NC_020055	CAA	2	6	2845874	2845879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842431
55483	NC_020055	TATT	2	8	2845937	2845944	25 %	75 %	0 %	0 %	436842431
55484	NC_020055	GTG	2	6	2845947	2845952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436842431
55485	NC_020055	GCC	2	6	2846009	2846014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842431
55486	NC_020055	T	6	6	2846062	2846067	0 %	100 %	0 %	0 %	436842431
55487	NC_020055	CTG	2	6	2846097	2846102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842431
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55490	NC_020055	CG	3	6	2846174	2846179	0 %	0 %	50 %	50 %	436842431
55491	NC_020055	TTC	2	6	2846253	2846258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842431
55492	NC_020055	CCAT	2	8	2846296	2846303	25 %	25 %	0 %	50 %	436842431
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55494	NC_020055	ATC	2	6	2846367	2846372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842431
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55496	NC_020055	CAT	2	6	2846455	2846460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842431
55497	NC_020055	TGC	2	6	2846641	2846646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842431
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55499	NC_020055	GGC	2	6	2846761	2846766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842431
55500	NC_020055	GAT	2	6	2846890	2846895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842432

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