MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_020055	AGC	2	6	2564373	2564378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842161
50003	NC_020055	T	6	6	2564490	2564495	0 %	100 %	0 %	0 %	436842161
50004	NC_020055	ACA	2	6	2564545	2564550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842161
50005	NC_020055	AAC	2	6	2564626	2564631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842161
50006	NC_020055	ACCC	2	8	2564659	2564666	25 %	0 %	0 %	75 %	436842161
50007	NC_020055	GCC	2	6	2564757	2564762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842161
50008	NC_020055	GCA	2	6	2564800	2564805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842161
50009	NC_020055	CCG	2	6	2564878	2564883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842161
50010	NC_020055	GCT	2	6	2564986	2564991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842161
50011	NC_020055	GCAA	2	8	2564992	2564999	50 %	0 %	25 %	25 %	436842161
50012	NC_020055	A	7	7	2565001	2565007	100 %	0 %	0 %	0 %	436842161
50013	NC_020055	TCC	2	6	2565015	2565020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842161
50014	NC_020055	A	7	7	2565063	2565069	100 %	0 %	0 %	0 %	436842161
50015	NC_020055	CAA	2	6	2565156	2565161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842161
50016	NC_020055	CCG	2	6	2565163	2565168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842161
50017	NC_020055	TC	4	8	2565299	2565306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50018	NC_020055	ATA	2	6	2565387	2565392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842162
50019	NC_020055	T	6	6	2565417	2565422	0 %	100 %	0 %	0 %	436842162
50020	NC_020055	GTTG	2	8	2565430	2565437	0 %	50 %	50 %	0 %	436842162
50021	NC_020055	TCT	2	6	2565508	2565513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842162
50022	NC_020055	CAG	2	6	2565640	2565645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50023	NC_020055	GTT	2	6	2565689	2565694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50024	NC_020055	A	6	6	2565758	2565763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50025	NC_020055	GCG	2	6	2565808	2565813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50026	NC_020055	CAT	2	6	2565867	2565872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842163
50027	NC_020055	GAA	2	6	2565983	2565988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50028	NC_020055	CTT	2	6	2566050	2566055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842164
50029	NC_020055	TGA	2	6	2566061	2566066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842164
50030	NC_020055	TCT	2	6	2566074	2566079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842164
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50032	NC_020055	ATG	2	6	2566146	2566151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842164
50033	NC_020055	T	6	6	2566217	2566222	0 %	100 %	0 %	0 %	436842164
50034	NC_020055	A	6	6	2566253	2566258	100 %	0 %	0 %	0 %	436842164
50035	NC_020055	GGCA	2	8	2566260	2566267	25 %	0 %	50 %	25 %	436842164
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50037	NC_020055	T	6	6	2566413	2566418	0 %	100 %	0 %	0 %	436842165
50038	NC_020055	TGCTT	2	10	2566461	2566470	0 %	60 %	20 %	20 %	436842165
50039	NC_020055	CTT	2	6	2566538	2566543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842165
50040	NC_020055	TGA	2	6	2566565	2566570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842165
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50042	NC_020055	T	6	6	2566695	2566700	0 %	100 %	0 %	0 %	436842165
50043	NC_020055	CCG	2	6	2566939	2566944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842166
50044	NC_020055	CAT	2	6	2566971	2566976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842166
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50046	NC_020055	TAT	2	6	2567031	2567036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842166
50047	NC_020055	A	7	7	2567040	2567046	100 %	0 %	0 %	0 %	436842166
50048	NC_020055	TGA	2	6	2567118	2567123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842166
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50053	NC_020055	CTG	2	6	2567610	2567615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842166
50054	NC_020055	GGTT	2	8	2567623	2567630	0 %	50 %	50 %	0 %	436842166
50055	NC_020055	GGAT	2	8	2567637	2567644	25 %	25 %	50 %	0 %	436842166
50056	NC_020055	AAGCTG	2	12	2567680	2567691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436842166
50057	NC_020055	T	7	7	2567749	2567755	0 %	100 %	0 %	0 %	436842166
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50062	NC_020055	GTC	2	6	2568006	2568011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842167
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50090	NC_020055	TG	3	6	2569725	2569730	0 %	50 %	50 %	0 %	436842168
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50115	NC_020055	CT	3	6	2570849	2570854	0 %	50 %	0 %	50 %	436842169
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50230	NC_020055	CTT	2	6	2577054	2577059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50231	NC_020055	GA	3	6	2577101	2577106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50232	NC_020055	TTCT	2	8	2577120	2577127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50233	NC_020055	CAT	2	6	2577138	2577143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50234	NC_020055	ATTT	2	8	2577151	2577158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50235	NC_020055	TAG	2	6	2577172	2577177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50236	NC_020055	T	7	7	2577202	2577208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50356	NC_020055	GAT	2	6	2582732	2582737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842177
50357	NC_020055	ATG	2	6	2582763	2582768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842177
50358	NC_020055	CT	3	6	2582777	2582782	0 %	50 %	0 %	50 %	436842177
50359	NC_020055	GAA	2	6	2582795	2582800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842177
50360	NC_020055	A	6	6	2582807	2582812	100 %	0 %	0 %	0 %	436842177
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50362	NC_020055	G	6	6	2582894	2582899	0 %	0 %	100 %	0 %	436842178
50363	NC_020055	T	7	7	2582921	2582927	0 %	100 %	0 %	0 %	436842178
50364	NC_020055	ACGG	2	8	2583007	2583014	25 %	0 %	50 %	25 %	436842178
50365	NC_020055	CGG	2	6	2583050	2583055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842178
50366	NC_020055	TGA	2	6	2583095	2583100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842178
50367	NC_020055	TCA	2	6	2583121	2583126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842178
50368	NC_020055	TGT	2	6	2583146	2583151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842178
50369	NC_020055	CG	3	6	2583183	2583188	0 %	0 %	50 %	50 %	436842178
50370	NC_020055	ATG	2	6	2583217	2583222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842178
50371	NC_020055	AGT	2	6	2583257	2583262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842178
50372	NC_020055	TTA	2	6	2583346	2583351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842178
50373	NC_020055	T	7	7	2583365	2583371	0 %	100 %	0 %	0 %	436842178
50374	NC_020055	A	7	7	2583372	2583378	100 %	0 %	0 %	0 %	436842178
50375	NC_020055	GTT	2	6	2583423	2583428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842178
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50378	NC_020055	CGG	2	6	2583604	2583609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842178
50379	NC_020055	TGC	2	6	2583614	2583619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842178
50380	NC_020055	GCT	2	6	2583745	2583750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842179
50381	NC_020055	TGG	2	6	2583762	2583767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436842179
50382	NC_020055	TGT	2	6	2583769	2583774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842179
50383	NC_020055	CTT	2	6	2583833	2583838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842179
50384	NC_020055	TGA	2	6	2584027	2584032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842179
50385	NC_020055	GC	3	6	2584074	2584079	0 %	0 %	50 %	50 %	436842179
50386	NC_020055	CGGG	2	8	2584141	2584148	0 %	0 %	75 %	25 %	436842179
50387	NC_020055	TTA	2	6	2584212	2584217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842179
50388	NC_020055	TTG	2	6	2584230	2584235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842179
50389	NC_020055	TTG	2	6	2584344	2584349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842179
50390	NC_020055	GGA	2	6	2584354	2584359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436842179
50391	NC_020055	GCT	2	6	2584376	2584381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842179
50392	NC_020055	CGG	2	6	2584384	2584389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842179
50393	NC_020055	TAC	2	6	2584396	2584401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842179
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50400	NC_020055	ATGT	2	8	2584812	2584819	25 %	50 %	25 %	0 %	436842180
50401	NC_020055	TGTC	2	8	2584831	2584838	0 %	50 %	25 %	25 %	436842180
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50403	NC_020055	GTG	2	6	2585002	2585007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436842180
50404	NC_020055	CCTG	2	8	2585021	2585028	0 %	25 %	25 %	50 %	436842180
50405	NC_020055	TA	3	6	2585113	2585118	50 %	50 %	0 %	0 %	436842180
50406	NC_020055	GAT	2	6	2585130	2585135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842180
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50414	NC_020055	AGT	2	6	2585476	2585481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842181
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50417	NC_020055	ATC	2	6	2585543	2585548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842181
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50420	NC_020055	T	6	6	2585744	2585749	0 %	100 %	0 %	0 %	436842181
50421	NC_020055	GTT	2	6	2586098	2586103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842181
50422	NC_020055	GAG	2	6	2586104	2586109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436842181
50423	NC_020055	GACGGT	2	12	2586134	2586145	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436842181
50424	NC_020055	TTG	3	9	2586156	2586164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842181
50425	NC_020055	GGC	2	6	2586308	2586313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842181
50426	NC_020055	GGT	2	6	2586383	2586388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436842181
50427	NC_020055	CAC	2	6	2586424	2586429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842181
50428	NC_020055	GCA	2	6	2586550	2586555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842181
50429	NC_020055	TAA	2	6	2586755	2586760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842181
50430	NC_020055	AT	3	6	2586789	2586794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50431	NC_020055	TCA	2	6	2586816	2586821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842182
50432	NC_020055	A	6	6	2586821	2586826	100 %	0 %	0 %	0 %	436842182
50433	NC_020055	TTA	2	6	2586828	2586833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842182
50434	NC_020055	TGCC	2	8	2586864	2586871	0 %	25 %	25 %	50 %	436842182
50435	NC_020055	A	6	6	2586874	2586879	100 %	0 %	0 %	0 %	436842182
50436	NC_020055	GAA	2	6	2586935	2586940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842182
50437	NC_020055	TGT	2	6	2586964	2586969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842182
50438	NC_020055	TCA	2	6	2586972	2586977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842182
50439	NC_020055	A	7	7	2586989	2586995	100 %	0 %	0 %	0 %	436842182
50440	NC_020055	GGC	2	6	2587049	2587054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842182
50441	NC_020055	ATT	2	6	2587103	2587108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842182
50442	NC_020055	AGC	2	6	2587125	2587130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842182
50443	NC_020055	GAT	2	6	2587202	2587207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842182
50444	NC_020055	TGAT	2	8	2587242	2587249	25 %	50 %	25 %	0 %	436842182
50445	NC_020055	TGT	2	6	2587273	2587278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842182
50446	NC_020055	ATT	2	6	2587322	2587327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842182
50447	NC_020055	CCT	2	6	2587382	2587387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842182
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50449	NC_020055	ATC	2	6	2587452	2587457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842182
50450	NC_020055	G	8	8	2587480	2587487	0 %	0 %	100 %	0 %	436842182
50451	NC_020055	TGA	2	6	2587636	2587641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842182
50452	NC_020055	T	7	7	2587752	2587758	0 %	100 %	0 %	0 %	436842183
50453	NC_020055	TGA	2	6	2587776	2587781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842183
50454	NC_020055	AAT	2	6	2587782	2587787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842183
50455	NC_020055	ACTT	2	8	2587806	2587813	25 %	50 %	0 %	25 %	436842183
50456	NC_020055	GCA	2	6	2587887	2587892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842183
50457	NC_020055	CAG	2	6	2587902	2587907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842183
50458	NC_020055	AATTCT	2	12	2587912	2587923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	436842183
50459	NC_020055	CCGG	2	8	2587975	2587982	0 %	0 %	50 %	50 %	436842183
50460	NC_020055	TGA	2	6	2588022	2588027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842183
50461	NC_020055	ATG	2	6	2588087	2588092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842183
50462	NC_020055	TGA	2	6	2588127	2588132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842183
50463	NC_020055	TTC	2	6	2588133	2588138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842183
50464	NC_020055	TAA	2	6	2588154	2588159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842183
50465	NC_020055	TGA	2	6	2588190	2588195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842183
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50468	NC_020055	GAA	2	6	2588316	2588321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842183
50469	NC_020055	T	6	6	2588336	2588341	0 %	100 %	0 %	0 %	436842183
50470	NC_020055	GCT	2	6	2588344	2588349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842183
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