MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 61563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_018867	TTC	2	6	2130290	2130295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661693
42503	NC_018867	TCT	2	6	2130301	2130306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661693
42504	NC_018867	GCC	2	6	2130317	2130322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661693
42505	NC_018867	TAA	2	6	2130367	2130372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661693
42506	NC_018867	GA	3	6	2130390	2130395	50 %	0 %	50 %	0 %	410661693
42507	NC_018867	GCA	2	6	2130421	2130426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661693
42508	NC_018867	CGT	2	6	2130571	2130576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661693
42509	NC_018867	TCT	3	9	2130618	2130626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661693
42510	NC_018867	TGC	2	6	2130697	2130702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661693
42511	NC_018867	GGA	2	6	2130786	2130791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410661693
42512	NC_018867	ATC	2	6	2130792	2130797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661693
42513	NC_018867	GCA	2	6	2130799	2130804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661693
42514	NC_018867	CGGA	2	8	2130860	2130867	25 %	0 %	50 %	25 %	410661693
42515	NC_018867	ATG	2	6	2130899	2130904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661693
42516	NC_018867	GAT	2	6	2130941	2130946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661693
42517	NC_018867	TCA	2	6	2130951	2130956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661693
42518	NC_018867	TGTC	2	8	2130992	2130999	0 %	50 %	25 %	25 %	410661693
42519	NC_018867	CG	3	6	2131000	2131005	0 %	0 %	50 %	50 %	410661693
42520	NC_018867	GT	3	6	2131022	2131027	0 %	50 %	50 %	0 %	410661693
42521	NC_018867	GTCAT	2	10	2131134	2131143	20 %	40 %	20 %	20 %	410661693
42522	NC_018867	TTC	2	6	2131247	2131252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661693
42523	NC_018867	CCAGG	2	10	2131286	2131295	20 %	0 %	40 %	40 %	410661693
42524	NC_018867	GCT	2	6	2131371	2131376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661693
42525	NC_018867	TC	3	6	2131385	2131390	0 %	50 %	0 %	50 %	410661693
42526	NC_018867	TTC	2	6	2131415	2131420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661693
42527	NC_018867	CAT	2	6	2131484	2131489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661693
42528	NC_018867	CGG	2	6	2131594	2131599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410661693
42529	NC_018867	CGGA	2	8	2131745	2131752	25 %	0 %	50 %	25 %	410661693
42530	NC_018867	GTCT	2	8	2131756	2131763	0 %	50 %	25 %	25 %	410661693
42531	NC_018867	ATA	2	6	2131777	2131782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661693
42532	NC_018867	TTC	2	6	2131853	2131858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661693
42533	NC_018867	A	6	6	2131877	2131882	100 %	0 %	0 %	0 %	410661693
42534	NC_018867	GAC	2	6	2131972	2131977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661693
42535	NC_018867	AGCG	2	8	2132022	2132029	25 %	0 %	50 %	25 %	410661693
42536	NC_018867	CTT	2	6	2132038	2132043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661693
42537	NC_018867	CCT	2	6	2132059	2132064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42538	NC_018867	CTT	2	6	2132073	2132078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42539	NC_018867	T	6	6	2132089	2132094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42540	NC_018867	ATT	2	6	2132118	2132123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42541	NC_018867	TAT	2	6	2132124	2132129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42542	NC_018867	A	8	8	2132145	2132152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42543	NC_018867	ACT	2	6	2132295	2132300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661694
42544	NC_018867	CAAT	2	8	2132359	2132366	50 %	25 %	0 %	25 %	410661694
42545	NC_018867	CGG	2	6	2132379	2132384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410661694
42546	NC_018867	ATG	2	6	2132387	2132392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661694
42547	NC_018867	TCTT	2	8	2132394	2132401	0 %	75 %	0 %	25 %	410661694
42548	NC_018867	TGC	2	6	2132487	2132492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661694
42549	NC_018867	CTT	2	6	2132513	2132518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661694
42550	NC_018867	T	6	6	2132555	2132560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42551	NC_018867	CTG	2	6	2132567	2132572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42552	NC_018867	TCG	2	6	2132593	2132598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42553	NC_018867	GTTTT	2	10	2132653	2132662	0 %	80 %	20 %	0 %	410661695
42554	NC_018867	TTTTG	2	10	2132669	2132678	0 %	80 %	20 %	0 %	410661695
42555	NC_018867	TCT	2	6	2132733	2132738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661695
42556	NC_018867	A	7	7	2132803	2132809	100 %	0 %	0 %	0 %	410661695
42557	NC_018867	TCT	2	6	2132823	2132828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661695
42558	NC_018867	TCA	2	6	2132865	2132870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661695
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42561	NC_018867	CCCG	2	8	2132985	2132992	0 %	0 %	25 %	75 %	410661695
42562	NC_018867	ACC	2	6	2133002	2133007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410661695
42563	NC_018867	CAT	2	6	2133034	2133039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661695
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42565	NC_018867	GTC	2	6	2133106	2133111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661695
42566	NC_018867	ACA	2	6	2133128	2133133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410661695
42567	NC_018867	AGT	2	6	2133207	2133212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661695
42568	NC_018867	CAG	2	6	2133247	2133252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661695
42569	NC_018867	GA	3	6	2133297	2133302	50 %	0 %	50 %	0 %	410661695
42570	NC_018867	TTC	2	6	2133461	2133466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661695
42571	NC_018867	AGCA	2	8	2133523	2133530	50 %	0 %	25 %	25 %	410661695
42572	NC_018867	CAA	2	6	2133724	2133729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410661696
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42575	NC_018867	TA	3	6	2133977	2133982	50 %	50 %	0 %	0 %	410661696
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42578	NC_018867	TGCC	2	8	2134122	2134129	0 %	25 %	25 %	50 %	410661696
42579	NC_018867	T	6	6	2134131	2134136	0 %	100 %	0 %	0 %	410661696
42580	NC_018867	TTGCC	2	10	2134339	2134348	0 %	40 %	20 %	40 %	410661696
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42586	NC_018867	TCCGCC	2	12	2134584	2134595	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	410661697
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42589	NC_018867	TCT	2	6	2134768	2134773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661697
42590	NC_018867	CTG	2	6	2134803	2134808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661697
42591	NC_018867	GCA	2	6	2134838	2134843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661697
42592	NC_018867	TTG	2	6	2134882	2134887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410661697
42593	NC_018867	TGA	2	6	2134982	2134987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661697
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42597	NC_018867	CAGAA	2	10	2135244	2135253	60 %	0 %	20 %	20 %	410661697
42598	NC_018867	GAAA	2	8	2135272	2135279	75 %	0 %	25 %	0 %	410661697
42599	NC_018867	TAA	2	6	2135311	2135316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661697
42600	NC_018867	T	7	7	2135321	2135327	0 %	100 %	0 %	0 %	410661697
42601	NC_018867	AGCA	2	8	2135355	2135362	50 %	0 %	25 %	25 %	410661697
42602	NC_018867	AT	3	6	2135390	2135395	50 %	50 %	0 %	0 %	410661697
42603	NC_018867	T	6	6	2135430	2135435	0 %	100 %	0 %	0 %	410661697
42604	NC_018867	TCG	2	6	2135459	2135464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661697
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42606	NC_018867	TGA	2	6	2135583	2135588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661698
42607	NC_018867	TTTA	2	8	2135623	2135630	25 %	75 %	0 %	0 %	410661698
42608	NC_018867	TCT	3	9	2135654	2135662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661698
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42610	NC_018867	CT	3	6	2135858	2135863	0 %	50 %	0 %	50 %	410661699
42611	NC_018867	TCC	2	6	2135871	2135876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661699
42612	NC_018867	CTT	2	6	2135902	2135907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661699
42613	NC_018867	CAT	2	6	2135968	2135973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661699
42614	NC_018867	TA	3	6	2136071	2136076	50 %	50 %	0 %	0 %	410661699
42615	NC_018867	AGGT	2	8	2136154	2136161	25 %	25 %	50 %	0 %	410661699
42616	NC_018867	TCA	2	6	2136192	2136197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661699
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42618	NC_018867	CTG	2	6	2136247	2136252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661699
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42689	NC_018867	GT	3	6	2139202	2139207	0 %	50 %	50 %	0 %	410661703
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42724	NC_018867	AC	3	6	2140522	2140527	50 %	0 %	0 %	50 %	410661705
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42730	NC_018867	CTGCG	2	10	2140950	2140959	0 %	20 %	40 %	40 %	410661705
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42732	NC_018867	T	7	7	2141027	2141033	0 %	100 %	0 %	0 %	410661705
42733	NC_018867	CTT	2	6	2141036	2141041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661705
42734	NC_018867	ATC	2	6	2141064	2141069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661705
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42974	NC_018867	G	6	6	2154086	2154091	0 %	0 %	100 %	0 %	410661713
42975	NC_018867	CTT	2	6	2154141	2154146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661714
42976	NC_018867	CGC	2	6	2154150	2154155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661714
42977	NC_018867	ATG	2	6	2154201	2154206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661714
42978	NC_018867	CATT	2	8	2154227	2154234	25 %	50 %	0 %	25 %	410661714
42979	NC_018867	GGC	2	6	2154256	2154261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410661714
42980	NC_018867	CCT	2	6	2154402	2154407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661714
42981	NC_018867	T	6	6	2154495	2154500	0 %	100 %	0 %	0 %	410661714
42982	NC_018867	TGC	2	6	2154548	2154553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661714
42983	NC_018867	TCA	2	6	2154710	2154715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661714
42984	NC_018867	GAC	2	6	2154724	2154729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661714
42985	NC_018867	CTG	2	6	2154784	2154789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661714
42986	NC_018867	TTCCGT	2	12	2154798	2154809	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410661714
42987	NC_018867	T	6	6	2154880	2154885	0 %	100 %	0 %	0 %	410661714
42988	NC_018867	TGGC	2	8	2155014	2155021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42989	NC_018867	AT	3	6	2155130	2155135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42990	NC_018867	A	6	6	2155165	2155170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42991	NC_018867	CGT	2	6	2155329	2155334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42992	NC_018867	TTTCTT	2	12	2155378	2155389	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410661715
42993	NC_018867	T	6	6	2155388	2155393	0 %	100 %	0 %	0 %	410661715
42994	NC_018867	T	6	6	2155457	2155462	0 %	100 %	0 %	0 %	410661715
42995	NC_018867	TCA	2	6	2155509	2155514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661715
42996	NC_018867	TCT	2	6	2155554	2155559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661715
42997	NC_018867	CTTT	2	8	2155561	2155568	0 %	75 %	0 %	25 %	410661715
42998	NC_018867	CCG	2	6	2155600	2155605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661715
42999	NC_018867	TGA	2	6	2155627	2155632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661715
43000	NC_018867	ATC	2	6	2155728	2155733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661715

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