MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 61563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_018867	GA	3	6	1559087	1559092	50 %	0 %	50 %	0 %	410661143
31502	NC_018867	CTT	2	6	1559209	1559214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661143
31503	NC_018867	CAT	2	6	1559231	1559236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661143
31504	NC_018867	GCA	2	6	1559241	1559246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661143
31505	NC_018867	GAA	2	6	1559341	1559346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410661143
31506	NC_018867	TTG	2	6	1559457	1559462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410661143
31507	NC_018867	GTT	2	6	1559501	1559506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410661143
31508	NC_018867	CTT	2	6	1559524	1559529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661143
31509	NC_018867	CTG	2	6	1559533	1559538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661143
31510	NC_018867	CCT	2	6	1559604	1559609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31511	NC_018867	AT	3	6	1559625	1559630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31512	NC_018867	A	7	7	1559668	1559674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31513	NC_018867	TCC	2	6	1559683	1559688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31514	NC_018867	TCGTAA	2	12	1559733	1559744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410661144
31515	NC_018867	GAAT	2	8	1559755	1559762	50 %	25 %	25 %	0 %	410661144
31516	NC_018867	TCA	2	6	1559789	1559794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661144
31517	NC_018867	CCG	2	6	1559795	1559800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661144
31518	NC_018867	TTC	2	6	1559820	1559825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661144
31519	NC_018867	ATA	2	6	1559829	1559834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661144
31520	NC_018867	ACC	2	6	1559842	1559847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410661144
31521	NC_018867	TC	3	6	1559868	1559873	0 %	50 %	0 %	50 %	410661144
31522	NC_018867	TCTGTT	2	12	1559891	1559902	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410661144
31523	NC_018867	AAT	2	6	1559946	1559951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661144
31524	NC_018867	GCA	2	6	1560035	1560040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661144
31525	NC_018867	GCT	2	6	1560082	1560087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661144
31526	NC_018867	GC	3	6	1560162	1560167	0 %	0 %	50 %	50 %	410661144
31527	NC_018867	AAT	2	6	1560204	1560209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661144
31528	NC_018867	CGC	2	6	1560251	1560256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661144
31529	NC_018867	TCC	2	6	1560316	1560321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661144
31530	NC_018867	CCT	2	6	1560460	1560465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661145
31531	NC_018867	ATC	2	6	1560471	1560476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661145
31532	NC_018867	GTT	2	6	1560543	1560548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410661145
31533	NC_018867	T	7	7	1560567	1560573	0 %	100 %	0 %	0 %	410661145
31534	NC_018867	CT	3	6	1560586	1560591	0 %	50 %	0 %	50 %	410661145
31535	NC_018867	T	6	6	1560671	1560676	0 %	100 %	0 %	0 %	410661145
31536	NC_018867	CTT	2	6	1560677	1560682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661145
31537	NC_018867	GGA	2	6	1560688	1560693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410661145
31538	NC_018867	ATAA	3	12	1560735	1560746	75 %	25 %	0 %	0 %	410661145
31539	NC_018867	A	6	6	1560745	1560750	100 %	0 %	0 %	0 %	410661145
31540	NC_018867	GTA	2	6	1560764	1560769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661145
31541	NC_018867	GATAAC	2	12	1560779	1560790	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410661145
31542	NC_018867	T	7	7	1560850	1560856	0 %	100 %	0 %	0 %	410661145
31543	NC_018867	T	6	6	1560863	1560868	0 %	100 %	0 %	0 %	410661145
31544	NC_018867	GCC	2	6	1560965	1560970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661146
31545	NC_018867	AGC	2	6	1560984	1560989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661146
31546	NC_018867	T	6	6	1561002	1561007	0 %	100 %	0 %	0 %	410661146
31547	NC_018867	ACTG	2	8	1561020	1561027	25 %	25 %	25 %	25 %	410661146
31548	NC_018867	CAT	2	6	1561151	1561156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661146
31549	NC_018867	TCA	2	6	1561297	1561302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661146
31550	NC_018867	AAT	2	6	1561379	1561384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661147
31551	NC_018867	CTT	2	6	1561431	1561436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661147
31552	NC_018867	CGT	2	6	1561470	1561475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661147
31553	NC_018867	ATT	2	6	1561481	1561486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410661147
31554	NC_018867	CTT	2	6	1561488	1561493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661147
31555	NC_018867	CAG	2	6	1561495	1561500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661147
31556	NC_018867	AAT	2	6	1561510	1561515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661147
31557	NC_018867	ATGGCC	2	12	1561532	1561543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410661147
31558	NC_018867	AGG	2	6	1561559	1561564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410661147
31559	NC_018867	GAT	2	6	1561588	1561593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661147
31560	NC_018867	GGA	2	6	1561719	1561724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410661147
31561	NC_018867	GCA	2	6	1561866	1561871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661147
31562	NC_018867	TAA	2	6	1562009	1562014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661148
31563	NC_018867	T	6	6	1562027	1562032	0 %	100 %	0 %	0 %	410661148
31564	NC_018867	TCT	3	9	1562077	1562085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661148
31565	NC_018867	CCA	2	6	1562144	1562149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410661148
31566	NC_018867	CCG	2	6	1562197	1562202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661148
31567	NC_018867	TC	3	6	1562250	1562255	0 %	50 %	0 %	50 %	410661148
31568	NC_018867	ACC	2	6	1562281	1562286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410661148
31569	NC_018867	TCT	2	6	1562304	1562309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661148
31570	NC_018867	GAT	2	6	1562340	1562345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661148
31571	NC_018867	GTC	2	6	1562409	1562414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661148
31572	NC_018867	GCC	2	6	1562463	1562468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661148
31573	NC_018867	T	6	6	1562495	1562500	0 %	100 %	0 %	0 %	410661148
31574	NC_018867	ACA	2	6	1562554	1562559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410661148
31575	NC_018867	AT	3	6	1562580	1562585	50 %	50 %	0 %	0 %	410661148
31576	NC_018867	TCA	2	6	1562606	1562611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31577	NC_018867	ATT	2	6	1562673	1562678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410661149
31578	NC_018867	TAG	2	6	1562686	1562691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661149
31579	NC_018867	AGA	2	6	1562692	1562697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410661149
31580	NC_018867	GCT	2	6	1562716	1562721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661149
31581	NC_018867	AT	3	6	1562738	1562743	50 %	50 %	0 %	0 %	410661149
31582	NC_018867	GTC	2	6	1562851	1562856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661149
31583	NC_018867	CAC	2	6	1562962	1562967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410661149
31584	NC_018867	TTGAT	2	10	1563003	1563012	20 %	60 %	20 %	0 %	410661149
31585	NC_018867	GGC	2	6	1563038	1563043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410661149
31586	NC_018867	CAT	2	6	1563066	1563071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661149
31587	NC_018867	CCG	2	6	1563072	1563077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661149
31588	NC_018867	ATCA	2	8	1563121	1563128	50 %	25 %	0 %	25 %	410661149
31589	NC_018867	T	6	6	1563144	1563149	0 %	100 %	0 %	0 %	410661149
31590	NC_018867	GGC	2	6	1563153	1563158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410661149
31591	NC_018867	T	6	6	1563279	1563284	0 %	100 %	0 %	0 %	410661149
31592	NC_018867	CAG	2	6	1563292	1563297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661149
31593	NC_018867	AAT	2	6	1563370	1563375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661149
31594	NC_018867	TCAG	2	8	1563392	1563399	25 %	25 %	25 %	25 %	410661149
31595	NC_018867	CAC	2	6	1563415	1563420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410661149
31596	NC_018867	GCT	2	6	1563451	1563456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661149
31597	NC_018867	CTTG	2	8	1563524	1563531	0 %	50 %	25 %	25 %	410661149
31598	NC_018867	TCC	2	6	1563549	1563554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661150
31599	NC_018867	ATC	2	6	1563599	1563604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661150
31600	NC_018867	GA	3	6	1563677	1563682	50 %	0 %	50 %	0 %	410661150
31601	NC_018867	GTCAG	2	10	1563792	1563801	20 %	20 %	40 %	20 %	410661150
31602	NC_018867	A	6	6	1563816	1563821	100 %	0 %	0 %	0 %	410661150
31603	NC_018867	CTTC	2	8	1563913	1563920	0 %	50 %	0 %	50 %	410661150
31604	NC_018867	GAC	2	6	1563938	1563943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661150
31605	NC_018867	GAT	2	6	1563959	1563964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410661150
31606	NC_018867	CCG	2	6	1563991	1563996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661150
31607	NC_018867	TCT	2	6	1564034	1564039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661150
31608	NC_018867	GTT	3	9	1564077	1564085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410661150
31609	NC_018867	AGC	2	6	1564254	1564259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661150
31610	NC_018867	TC	3	6	1564270	1564275	0 %	50 %	0 %	50 %	410661150
31611	NC_018867	CTG	2	6	1564335	1564340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661150
31612	NC_018867	CAT	2	6	1564414	1564419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661150
31613	NC_018867	CT	3	6	1564433	1564438	0 %	50 %	0 %	50 %	410661150
31614	NC_018867	TTTTCT	2	12	1564449	1564460	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410661150
31615	NC_018867	T	6	6	1564479	1564484	0 %	100 %	0 %	0 %	410661150
31616	NC_018867	TCC	2	6	1564518	1564523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661150
31617	NC_018867	TCTT	2	8	1564553	1564560	0 %	75 %	0 %	25 %	410661150
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