MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 61563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_018867	AATCAG	2	12	1533802	1533813	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410661117
31002	NC_018867	ATA	2	6	1533837	1533842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661117
31003	NC_018867	A	6	6	1533945	1533950	100 %	0 %	0 %	0 %	410661118
31004	NC_018867	CCG	2	6	1534010	1534015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661118
31005	NC_018867	TCT	2	6	1534019	1534024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661118
31006	NC_018867	CTG	2	6	1534040	1534045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661118
31007	NC_018867	GCT	2	6	1534065	1534070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661118
31008	NC_018867	TTCC	2	8	1534085	1534092	0 %	50 %	0 %	50 %	410661118
31009	NC_018867	GAGCT	2	10	1534141	1534150	20 %	20 %	40 %	20 %	410661118
31010	NC_018867	AAT	2	6	1534281	1534286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661118
31011	NC_018867	T	6	6	1534356	1534361	0 %	100 %	0 %	0 %	410661118
31012	NC_018867	TTC	2	6	1534456	1534461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31013	NC_018867	C	7	7	1534463	1534469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31014	NC_018867	CAG	2	6	1534490	1534495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661119
31015	NC_018867	TGGA	2	8	1534544	1534551	25 %	25 %	50 %	0 %	410661119
31016	NC_018867	T	6	6	1534560	1534565	0 %	100 %	0 %	0 %	410661119
31017	NC_018867	GCA	2	6	1534596	1534601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661119
31018	NC_018867	AGG	2	6	1534617	1534622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410661119
31019	NC_018867	TTC	2	6	1534703	1534708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661119
31020	NC_018867	TTC	2	6	1534746	1534751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661119
31021	NC_018867	GCA	2	6	1534834	1534839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661119
31022	NC_018867	CAA	2	6	1534862	1534867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410661119
31023	NC_018867	TGT	2	6	1534875	1534880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410661119
31024	NC_018867	TCT	2	6	1534942	1534947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661119
31025	NC_018867	TTC	2	6	1535001	1535006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661119
31026	NC_018867	CGA	2	6	1535097	1535102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661119
31027	NC_018867	CTG	2	6	1535126	1535131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661119
31028	NC_018867	TAA	2	6	1535136	1535141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661119
31029	NC_018867	CAG	2	6	1535237	1535242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661119
31030	NC_018867	AGC	2	6	1535293	1535298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661119
31031	NC_018867	C	6	6	1535317	1535322	0 %	0 %	0 %	100 %	410661119
31032	NC_018867	GCA	2	6	1535381	1535386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661119
31033	NC_018867	CTTT	2	8	1535424	1535431	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31034	NC_018867	GCA	2	6	1535507	1535512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661120
31035	NC_018867	CAT	2	6	1535523	1535528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661120
31036	NC_018867	TC	3	6	1535561	1535566	0 %	50 %	0 %	50 %	410661120
31037	NC_018867	ACA	2	6	1535609	1535614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410661120
31038	NC_018867	A	6	6	1535630	1535635	100 %	0 %	0 %	0 %	410661120
31039	NC_018867	TCC	2	6	1535667	1535672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661120
31040	NC_018867	TCC	2	6	1535813	1535818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661120
31041	NC_018867	TAA	2	6	1535829	1535834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661120
31042	NC_018867	AAG	2	6	1535848	1535853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410661120
31043	NC_018867	CT	3	6	1535854	1535859	0 %	50 %	0 %	50 %	410661120
31044	NC_018867	GAC	2	6	1535880	1535885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661120
31045	NC_018867	CAC	2	6	1535944	1535949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31046	NC_018867	TTAC	2	8	1535950	1535957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31047	NC_018867	T	7	7	1535991	1535997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31048	NC_018867	CTG	2	6	1536006	1536011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31049	NC_018867	A	8	8	1536013	1536020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31050	NC_018867	A	8	8	1536027	1536034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31051	NC_018867	T	6	6	1536052	1536057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31052	NC_018867	A	9	9	1536081	1536089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31053	NC_018867	GCA	3	9	1536141	1536149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661121
31054	NC_018867	CGC	2	6	1536220	1536225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661121
31055	NC_018867	GCAG	2	8	1536240	1536247	25 %	0 %	50 %	25 %	410661121
31056	NC_018867	GCT	2	6	1536263	1536268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661121
31057	NC_018867	A	6	6	1536309	1536314	100 %	0 %	0 %	0 %	410661121
31058	NC_018867	T	6	6	1536407	1536412	0 %	100 %	0 %	0 %	410661121
31059	NC_018867	AGC	2	6	1536425	1536430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661121
31060	NC_018867	AT	3	6	1536444	1536449	50 %	50 %	0 %	0 %	410661121
31061	NC_018867	TCC	2	6	1536460	1536465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410661121
31062	NC_018867	T	7	7	1536511	1536517	0 %	100 %	0 %	0 %	410661121
31063	NC_018867	GA	3	6	1536524	1536529	50 %	0 %	50 %	0 %	410661121
31064	NC_018867	CAT	2	6	1536533	1536538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661121
31065	NC_018867	A	6	6	1536545	1536550	100 %	0 %	0 %	0 %	410661121
31066	NC_018867	AATAT	2	10	1536572	1536581	60 %	40 %	0 %	0 %	410661121
31067	NC_018867	TAA	2	6	1536621	1536626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661121
31068	NC_018867	CGG	2	6	1536688	1536693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410661121
31069	NC_018867	AT	3	6	1536699	1536704	50 %	50 %	0 %	0 %	410661121
31070	NC_018867	CCA	2	6	1536790	1536795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410661121
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31073	NC_018867	A	6	6	1536932	1536937	100 %	0 %	0 %	0 %	410661121
31074	NC_018867	CGT	2	6	1536968	1536973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661121
31075	NC_018867	T	6	6	1537034	1537039	0 %	100 %	0 %	0 %	410661121
31076	NC_018867	TCT	2	6	1537084	1537089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661121
31077	NC_018867	TTC	2	6	1537136	1537141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661121
31078	NC_018867	CTT	2	6	1537150	1537155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661121
31079	NC_018867	ATC	2	6	1537227	1537232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661121
31080	NC_018867	GGC	2	6	1537434	1537439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31081	NC_018867	ACTT	2	8	1537452	1537459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31082	NC_018867	A	6	6	1537493	1537498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31083	NC_018867	TTG	3	9	1537524	1537532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31085	NC_018867	ATC	2	6	1537596	1537601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661122
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31087	NC_018867	TCC	2	6	1537761	1537766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31088	NC_018867	AGTT	2	8	1537773	1537780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31089	NC_018867	TAT	2	6	1537787	1537792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31090	NC_018867	AAG	2	6	1537808	1537813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31091	NC_018867	AAAT	2	8	1537815	1537822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_018867	GAAAA	2	10	1537864	1537873	80 %	0 %	20 %	0 %	410661123
31093	NC_018867	A	6	6	1537949	1537954	100 %	0 %	0 %	0 %	410661123
31094	NC_018867	CAG	2	6	1537973	1537978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661123
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31100	NC_018867	AAG	2	6	1538229	1538234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410661123
31101	NC_018867	GGTAT	2	10	1538313	1538322	20 %	40 %	40 %	0 %	410661123
31102	NC_018867	CAA	2	6	1538350	1538355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410661123
31103	NC_018867	CGA	2	6	1538380	1538385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661123
31104	NC_018867	GACA	2	8	1538388	1538395	50 %	0 %	25 %	25 %	410661123
31105	NC_018867	A	8	8	1538401	1538408	100 %	0 %	0 %	0 %	410661123
31106	NC_018867	GAA	2	6	1538471	1538476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410661123
31107	NC_018867	CAC	2	6	1538561	1538566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410661123
31108	NC_018867	AAT	2	6	1538584	1538589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410661123
31109	NC_018867	TCT	2	6	1538719	1538724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661123
31110	NC_018867	ATC	2	6	1538750	1538755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661123
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31113	NC_018867	GCA	2	6	1538904	1538909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661123
31114	NC_018867	CAGC	2	8	1538912	1538919	25 %	0 %	25 %	50 %	410661123
31115	NC_018867	TCA	2	6	1538922	1538927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410661123
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31360	NC_018867	CAA	2	6	1551911	1551916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410661133
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31478	NC_018867	AGA	2	6	1557972	1557977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410661142
31479	NC_018867	CTTT	2	8	1558002	1558009	0 %	75 %	0 %	25 %	410661142
31480	NC_018867	GCT	2	6	1558042	1558047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661142
31481	NC_018867	GAACT	2	10	1558053	1558062	40 %	20 %	20 %	20 %	410661142
31482	NC_018867	TAT	2	6	1558087	1558092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410661142
31483	NC_018867	GAA	2	6	1558141	1558146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410661142
31484	NC_018867	CTG	2	6	1558179	1558184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661142
31485	NC_018867	TCC	2	6	1558248	1558253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31486	NC_018867	TGCT	2	8	1558330	1558337	0 %	50 %	25 %	25 %	410661143
31487	NC_018867	TCT	2	6	1558338	1558343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410661143
31488	NC_018867	TCCTG	2	10	1558381	1558390	0 %	40 %	20 %	40 %	410661143
31489	NC_018867	CTG	2	6	1558397	1558402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410661143
31490	NC_018867	TGTT	2	8	1558635	1558642	0 %	75 %	25 %	0 %	410661143
31491	NC_018867	GTT	2	6	1558805	1558810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410661143
31492	NC_018867	GAA	2	6	1558815	1558820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410661143
31493	NC_018867	CCG	2	6	1558852	1558857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661143
31494	NC_018867	CGC	2	6	1558864	1558869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410661143
31495	NC_018867	GTCA	2	8	1558952	1558959	25 %	25 %	25 %	25 %	410661143
31496	NC_018867	AGC	2	6	1558968	1558973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410661143
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31498	NC_018867	T	7	7	1559016	1559022	0 %	100 %	0 %	0 %	410661143
31499	NC_018867	AG	3	6	1559039	1559044	50 %	0 %	50 %	0 %	410661143
31500	NC_018867	AT	3	6	1559062	1559067	50 %	50 %	0 %	0 %	410661143

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