MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 61563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_018867	ATG	2	6	609831	609836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660224
12502	NC_018867	CCTG	2	8	609972	609979	0 %	25 %	25 %	50 %	410660224
12503	NC_018867	GT	3	6	610130	610135	0 %	50 %	50 %	0 %	410660224
12504	NC_018867	A	6	6	610136	610141	100 %	0 %	0 %	0 %	410660224
12505	NC_018867	TGA	3	9	610177	610185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660224
12506	NC_018867	CT	3	6	610225	610230	0 %	50 %	0 %	50 %	410660224
12507	NC_018867	AAG	2	6	610260	610265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410660224
12508	NC_018867	AGGC	2	8	610332	610339	25 %	0 %	50 %	25 %	410660224
12509	NC_018867	CTT	2	6	610365	610370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410660224
12510	NC_018867	GAT	2	6	610391	610396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660224
12511	NC_018867	TACGG	2	10	610406	610415	20 %	20 %	40 %	20 %	410660224
12512	NC_018867	TGG	2	6	610436	610441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410660224
12513	NC_018867	GCC	2	6	610465	610470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410660224
12514	NC_018867	AAT	2	6	610475	610480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_018867	CAGTT	2	10	610481	610490	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12516	NC_018867	TTA	2	6	610561	610566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_018867	GTC	2	6	610633	610638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_018867	CTT	2	6	610656	610661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_018867	T	6	6	610660	610665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_018867	T	6	6	610674	610679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_018867	ATA	2	6	610733	610738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_018867	CTT	2	6	610772	610777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_018867	AAT	2	6	610805	610810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_018867	TAA	2	6	610889	610894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410660225
12525	NC_018867	TAT	2	6	610902	610907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410660225
12526	NC_018867	GAG	2	6	611071	611076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410660225
12527	NC_018867	ATG	2	6	611129	611134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660225
12528	NC_018867	CTGT	2	8	611171	611178	0 %	50 %	25 %	25 %	410660225
12529	NC_018867	T	7	7	611178	611184	0 %	100 %	0 %	0 %	410660225
12530	NC_018867	ATG	2	6	611194	611199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660225
12531	NC_018867	A	6	6	611232	611237	100 %	0 %	0 %	0 %	410660225
12532	NC_018867	A	6	6	611258	611263	100 %	0 %	0 %	0 %	410660225
12533	NC_018867	ATCA	2	8	611279	611286	50 %	25 %	0 %	25 %	410660225
12534	NC_018867	TA	3	6	611333	611338	50 %	50 %	0 %	0 %	410660225
12535	NC_018867	TAT	2	6	611374	611379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410660225
12536	NC_018867	ATT	2	6	611454	611459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410660225
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12538	NC_018867	A	6	6	611487	611492	100 %	0 %	0 %	0 %	410660225
12539	NC_018867	CAA	2	6	611658	611663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_018867	CGG	2	6	611666	611671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_018867	GTA	2	6	611693	611698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_018867	CGA	2	6	611774	611779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_018867	TAA	2	6	611824	611829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_018867	TAC	2	6	611842	611847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_018867	GCG	2	6	611868	611873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_018867	GTT	3	9	611890	611898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_018867	CGA	2	6	611947	611952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_018867	CAG	2	6	612001	612006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_018867	AGT	3	9	612044	612052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_018867	GAA	2	6	612058	612063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_018867	GAA	2	6	612065	612070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_018867	GAA	2	6	612083	612088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410660226
12553	NC_018867	GCC	2	6	612115	612120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410660226
12554	NC_018867	CGG	2	6	612149	612154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410660226
12555	NC_018867	AGC	2	6	612275	612280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410660226
12556	NC_018867	TGC	2	6	612310	612315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410660226
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12558	NC_018867	GGA	2	6	612414	612419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410660226
12559	NC_018867	GCGCA	2	10	612539	612548	20 %	0 %	40 %	40 %	410660226
12560	NC_018867	GAAG	2	8	612560	612567	50 %	0 %	50 %	0 %	410660226
12561	NC_018867	TAC	2	6	612576	612581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410660226
12562	NC_018867	CTG	2	6	612648	612653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410660226
12563	NC_018867	ATA	2	6	612660	612665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410660226
12564	NC_018867	AAG	2	6	612670	612675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410660226
12565	NC_018867	TCA	2	6	612700	612705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410660226
12566	NC_018867	GGA	2	6	612755	612760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410660226
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12570	NC_018867	TA	3	6	613153	613158	50 %	50 %	0 %	0 %	410660226
12571	NC_018867	ATT	2	6	613174	613179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410660226
12572	NC_018867	ACG	2	6	613232	613237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410660226
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12574	NC_018867	CA	3	6	613324	613329	50 %	0 %	0 %	50 %	410660226
12575	NC_018867	TGAC	2	8	613393	613400	25 %	25 %	25 %	25 %	410660226
12576	NC_018867	ATG	2	6	613423	613428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660226
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12578	NC_018867	GGT	2	6	613496	613501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_018867	CCT	2	6	613527	613532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12580	NC_018867	TGA	2	6	613540	613545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_018867	TAA	2	6	613553	613558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_018867	GTATT	2	10	613616	613625	20 %	60 %	20 %	0 %	410660227
12583	NC_018867	TCTG	2	8	613704	613711	0 %	50 %	25 %	25 %	410660227
12584	NC_018867	AAT	2	6	613747	613752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410660227
12585	NC_018867	CCAG	2	8	613755	613762	25 %	0 %	25 %	50 %	410660227
12586	NC_018867	GAT	2	6	613774	613779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660227
12587	NC_018867	AAT	2	6	613803	613808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410660227
12588	NC_018867	CAT	2	6	613816	613821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410660227
12589	NC_018867	CAT	2	6	613852	613857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410660227
12590	NC_018867	CCT	2	6	613867	613872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12591	NC_018867	A	6	6	613903	613908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_018867	T	7	7	613932	613938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_018867	TCA	2	6	613952	613957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_018867	ATG	2	6	613985	613990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_018867	AAATC	2	10	614011	614020	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12596	NC_018867	TGC	2	6	614041	614046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_018867	GAA	2	6	614109	614114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_018867	A	6	6	614138	614143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_018867	GAT	2	6	614261	614266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12601	NC_018867	TGT	2	6	614314	614319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410660228
12602	NC_018867	CAG	2	6	614372	614377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410660228
12603	NC_018867	CAG	2	6	614381	614386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410660228
12604	NC_018867	GGA	2	6	614429	614434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410660228
12605	NC_018867	GGA	2	6	614472	614477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410660228
12606	NC_018867	GGA	2	6	614489	614494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410660228
12607	NC_018867	ATT	2	6	614669	614674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410660228
12608	NC_018867	GAA	2	6	614717	614722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410660228
12609	NC_018867	CT	3	6	614816	614821	0 %	50 %	0 %	50 %	410660228
12610	NC_018867	GGGAA	2	10	614901	614910	40 %	0 %	60 %	0 %	410660228
12611	NC_018867	AT	3	6	614941	614946	50 %	50 %	0 %	0 %	410660228
12612	NC_018867	GGC	2	6	614948	614953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410660228
12613	NC_018867	GAT	2	6	614984	614989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660228
12614	NC_018867	GCT	2	6	615052	615057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410660228
12615	NC_018867	CGTTAA	2	12	615229	615240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12616	NC_018867	AT	3	6	615298	615303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_018867	ATA	2	6	615340	615345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_018867	GGT	2	6	615375	615380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_018867	ATT	2	6	615401	615406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410660229
12620	NC_018867	A	6	6	615451	615456	100 %	0 %	0 %	0 %	410660229
12621	NC_018867	ATC	2	6	615482	615487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410660229
12622	NC_018867	AGA	2	6	615516	615521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410660229
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12624	NC_018867	ATG	2	6	615584	615589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410660229
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12995	NC_018867	CTG	2	6	634361	634366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410660248
12996	NC_018867	CAAA	2	8	634551	634558	75 %	0 %	0 %	25 %	410660248
12997	NC_018867	A	6	6	634587	634592	100 %	0 %	0 %	0 %	410660248
12998	NC_018867	ATC	2	6	634602	634607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410660248
12999	NC_018867	GCT	2	6	634652	634657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410660248
13000	NC_018867	TTA	2	6	634680	634685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410660248

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