MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 61563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018867	CTA	2	6	24253	24258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659641
502	NC_018867	TCA	2	6	24259	24264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659641
503	NC_018867	A	6	6	24313	24318	100 %	0 %	0 %	0 %	410659641
504	NC_018867	AGG	2	6	24331	24336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018867	ATC	2	6	24394	24399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659642
506	NC_018867	GAA	2	6	24549	24554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659642
507	NC_018867	TGT	2	6	24563	24568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659642
508	NC_018867	AGC	2	6	24628	24633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659642
509	NC_018867	CCA	2	6	24770	24775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410659642
510	NC_018867	TTA	2	6	24804	24809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659642
511	NC_018867	TTA	2	6	24819	24824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659642
512	NC_018867	AATC	2	8	24846	24853	50 %	25 %	0 %	25 %	410659642
513	NC_018867	ATG	2	6	24898	24903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659642
514	NC_018867	AAG	2	6	24925	24930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659642
515	NC_018867	GAC	2	6	24987	24992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659642
516	NC_018867	TTG	2	6	25006	25011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659642
517	NC_018867	TGG	2	6	25018	25023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659642
518	NC_018867	ATC	2	6	25047	25052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659642
519	NC_018867	GAA	2	6	25065	25070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659642
520	NC_018867	AAAAG	2	10	25088	25097	80 %	0 %	20 %	0 %	410659642
521	NC_018867	TCT	2	6	25184	25189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410659642
522	NC_018867	TGG	2	6	25256	25261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659642
523	NC_018867	AGG	2	6	25295	25300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018867	GAA	2	6	25314	25319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659643
525	NC_018867	GCT	2	6	25383	25388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659643
526	NC_018867	AAAAGC	2	12	25419	25430	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410659643
527	NC_018867	CAAA	2	8	25481	25488	75 %	0 %	0 %	25 %	410659643
528	NC_018867	ACC	2	6	25598	25603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410659643
529	NC_018867	T	6	6	25617	25622	0 %	100 %	0 %	0 %	410659643
530	NC_018867	GATGCC	2	12	25632	25643	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410659643
531	NC_018867	GCT	2	6	25650	25655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659643
532	NC_018867	A	6	6	25683	25688	100 %	0 %	0 %	0 %	410659643
533	NC_018867	GCC	2	6	25689	25694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410659643
534	NC_018867	CGTC	2	8	25695	25702	0 %	25 %	25 %	50 %	410659643
535	NC_018867	GAA	2	6	25739	25744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659643
536	NC_018867	A	6	6	25804	25809	100 %	0 %	0 %	0 %	410659644
537	NC_018867	GGC	2	6	25875	25880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410659644
538	NC_018867	CAG	2	6	25884	25889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659644
539	NC_018867	TTA	2	6	25910	25915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659644
540	NC_018867	TTC	2	6	26007	26012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410659644
541	NC_018867	A	6	6	26045	26050	100 %	0 %	0 %	0 %	410659644
542	NC_018867	CAA	2	6	26131	26136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410659644
543	NC_018867	GCC	2	6	26175	26180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410659644
544	NC_018867	AGG	2	6	26224	26229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410659644
545	NC_018867	GTG	2	6	26321	26326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659644
546	NC_018867	TGC	2	6	26340	26345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659644
547	NC_018867	AAAATC	2	12	26360	26371	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410659644
548	NC_018867	AAG	2	6	26390	26395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659644
549	NC_018867	AGGC	2	8	26490	26497	25 %	0 %	50 %	25 %	410659644
550	NC_018867	GAT	2	6	26498	26503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659644
551	NC_018867	GAT	2	6	26630	26635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659644
552	NC_018867	A	7	7	26680	26686	100 %	0 %	0 %	0 %	410659644
553	NC_018867	ACG	2	6	26823	26828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659644
554	NC_018867	AAG	2	6	26855	26860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659644
555	NC_018867	ATC	3	9	26873	26881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659644
556	NC_018867	CTT	2	6	26905	26910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410659644
557	NC_018867	AC	3	6	26925	26930	50 %	0 %	0 %	50 %	410659644
558	NC_018867	TG	3	6	26946	26951	0 %	50 %	50 %	0 %	410659644
559	NC_018867	TGA	2	6	26959	26964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659644
560	NC_018867	TGG	2	6	26971	26976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659644
561	NC_018867	GGC	2	6	27013	27018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410659644
562	NC_018867	CT	3	6	27120	27125	0 %	50 %	0 %	50 %	410659644
563	NC_018867	ACC	2	6	27194	27199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410659644
564	NC_018867	ATGG	2	8	27341	27348	25 %	25 %	50 %	0 %	410659644
565	NC_018867	TC	3	6	27388	27393	0 %	50 %	0 %	50 %	410659644
566	NC_018867	AAAGCC	2	12	27493	27504	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410659644
567	NC_018867	TGA	2	6	27505	27510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659644
568	NC_018867	ATG	2	6	27516	27521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659644
569	NC_018867	AATC	2	8	27529	27536	50 %	25 %	0 %	25 %	410659644
570	NC_018867	CGAAAC	2	12	27544	27555	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410659644
571	NC_018867	T	6	6	27573	27578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018867	AGG	2	6	27603	27608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018867	T	6	6	27624	27629	0 %	100 %	0 %	0 %	410659645
574	NC_018867	GGT	2	6	27771	27776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659645
575	NC_018867	ATA	2	6	27830	27835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659645
576	NC_018867	CAT	2	6	27854	27859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659646
577	NC_018867	GCT	2	6	27887	27892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659646
578	NC_018867	GGT	2	6	27996	28001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659646
579	NC_018867	TCA	2	6	28036	28041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659646
580	NC_018867	TAT	2	6	28055	28060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659646
581	NC_018867	T	6	6	28140	28145	0 %	100 %	0 %	0 %	410659646
582	NC_018867	TGA	2	6	28174	28179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659646
583	NC_018867	TTA	2	6	28180	28185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659646
584	NC_018867	CAT	3	9	28199	28207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659646
585	NC_018867	CAC	2	6	28283	28288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410659646
586	NC_018867	TCA	2	6	28408	28413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659646
587	NC_018867	TGA	2	6	28441	28446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659646
588	NC_018867	CTGCT	2	10	28653	28662	0 %	40 %	20 %	40 %	410659646
589	NC_018867	CTG	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410659647
590	NC_018867	GAA	2	6	28862	28867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659647
591	NC_018867	ATG	2	6	28896	28901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659647
592	NC_018867	AAC	2	6	29008	29013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018867	AGG	2	6	29071	29076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018867	ATA	2	6	29177	29182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659648
595	NC_018867	A	6	6	29182	29187	100 %	0 %	0 %	0 %	410659648
596	NC_018867	TCCT	2	8	29389	29396	0 %	50 %	0 %	50 %	410659648
597	NC_018867	AGC	2	6	29428	29433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659648
598	NC_018867	GCA	2	6	29448	29453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659648
599	NC_018867	CAGC	2	8	29499	29506	25 %	0 %	25 %	50 %	410659648
600	NC_018867	TGA	2	6	29528	29533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410659648
601	NC_018867	GGT	2	6	29821	29826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659648
602	NC_018867	CTGAA	2	10	29864	29873	40 %	20 %	20 %	20 %	410659648
603	NC_018867	A	6	6	30016	30021	100 %	0 %	0 %	0 %	410659648
604	NC_018867	ATT	2	6	30049	30054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410659648
605	NC_018867	CTAC	2	8	30068	30075	25 %	25 %	0 %	50 %	410659648
606	NC_018867	GAGGC	2	10	30077	30086	20 %	0 %	60 %	20 %	410659648
607	NC_018867	A	7	7	30087	30093	100 %	0 %	0 %	0 %	410659648
608	NC_018867	CAG	2	6	30172	30177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659648
609	NC_018867	TCC	2	6	30271	30276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410659648
610	NC_018867	AAC	2	6	30318	30323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410659648
611	NC_018867	ATC	2	6	30324	30329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659648
612	NC_018867	TAC	2	6	30351	30356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659648
613	NC_018867	AAT	2	6	30415	30420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410659648
614	NC_018867	TCA	2	6	30422	30427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659648
615	NC_018867	TAC	2	6	30534	30539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659648
616	NC_018867	GGT	2	6	30606	30611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410659648
617	NC_018867	CTA	2	6	30623	30628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659648
618	NC_018867	TG	3	6	30719	30724	0 %	50 %	50 %	0 %	410659648
619	NC_018867	TTG	2	6	30731	30736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410659648
620	NC_018867	AAG	2	6	30743	30748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659648
621	NC_018867	A	6	6	30764	30769	100 %	0 %	0 %	0 %	410659648
622	NC_018867	ATC	2	6	30772	30777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410659648
623	NC_018867	GCA	2	6	30891	30896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410659648
624	NC_018867	ACC	2	6	30947	30952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410659648
625	NC_018867	AGA	2	6	31131	31136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410659648
626	NC_018867	GCC	2	6	31144	31149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410659648
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628	NC_018867	CTT	2	6	31225	31230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410659648
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