MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 61563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_018867	CCGG	2	8	3089342	3089349	0 %	0 %	50 %	50 %	410662596
61502	NC_018867	ATC	2	6	3089371	3089376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662596
61503	NC_018867	ATA	2	6	3089425	3089430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61504	NC_018867	AAT	2	6	3089585	3089590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662597
61505	NC_018867	CCG	2	6	3089591	3089596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662597
61506	NC_018867	TTC	2	6	3089684	3089689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662597
61507	NC_018867	ATCA	2	8	3089714	3089721	50 %	25 %	0 %	25 %	410662597
61508	NC_018867	TTA	2	6	3089733	3089738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410662597
61509	NC_018867	T	7	7	3089744	3089750	0 %	100 %	0 %	0 %	410662597
61510	NC_018867	ATTT	2	8	3089837	3089844	25 %	75 %	0 %	0 %	410662597
61511	NC_018867	TCA	2	6	3089853	3089858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662597
61512	NC_018867	ATC	2	6	3089939	3089944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662597
61513	NC_018867	T	7	7	3089999	3090005	0 %	100 %	0 %	0 %	410662597
61514	NC_018867	TTC	2	6	3090011	3090016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662597
61515	NC_018867	CTG	2	6	3090042	3090047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662597
61516	NC_018867	CCT	2	6	3090126	3090131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410662598
61517	NC_018867	CTT	2	6	3090145	3090150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662598
61518	NC_018867	T	6	6	3090149	3090154	0 %	100 %	0 %	0 %	410662598
61519	NC_018867	CTT	2	6	3090167	3090172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662598
61520	NC_018867	GAAG	2	8	3090237	3090244	50 %	0 %	50 %	0 %	410662598
61521	NC_018867	ACA	2	6	3090283	3090288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410662598
61522	NC_018867	T	6	6	3090329	3090334	0 %	100 %	0 %	0 %	410662598
61523	NC_018867	TTG	2	6	3090351	3090356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662598
61524	NC_018867	TTG	2	6	3090361	3090366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662598
61525	NC_018867	AAGA	2	8	3090387	3090394	75 %	0 %	25 %	0 %	410662598
61526	NC_018867	CAT	2	6	3090487	3090492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662598
61527	NC_018867	TTC	2	6	3090587	3090592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662598
61528	NC_018867	TCT	2	6	3090610	3090615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662598
61529	NC_018867	GCA	2	6	3090652	3090657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662598
61530	NC_018867	ATG	3	9	3090738	3090746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662598
61531	NC_018867	GAT	2	6	3090752	3090757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662598
61532	NC_018867	GA	3	6	3090795	3090800	50 %	0 %	50 %	0 %	410662598
61533	NC_018867	CCT	2	6	3090857	3090862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410662599
61534	NC_018867	CCG	2	6	3090878	3090883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662599
61535	NC_018867	TGA	2	6	3090936	3090941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662599
61536	NC_018867	GAT	2	6	3091042	3091047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662599
61537	NC_018867	CAT	2	6	3091087	3091092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662599
61538	NC_018867	AT	3	6	3091113	3091118	50 %	50 %	0 %	0 %	410662600
61539	NC_018867	TTG	2	6	3091152	3091157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662600
61540	NC_018867	ATC	2	6	3091179	3091184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662600
61541	NC_018867	T	6	6	3091274	3091279	0 %	100 %	0 %	0 %	410662600
61542	NC_018867	T	6	6	3091298	3091303	0 %	100 %	0 %	0 %	410662600
61543	NC_018867	AT	4	8	3091320	3091327	50 %	50 %	0 %	0 %	410662600
61544	NC_018867	TTC	2	6	3091389	3091394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662600
61545	NC_018867	CAG	2	6	3091409	3091414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662600
61546	NC_018867	CCT	2	6	3091423	3091428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61547	NC_018867	A	6	6	3091454	3091459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61548	NC_018867	CTT	2	6	3091490	3091495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61549	NC_018867	ACG	3	9	3091508	3091516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61550	NC_018867	AGAC	2	8	3091743	3091750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61551	NC_018867	ATT	2	6	3091770	3091775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61552	NC_018867	TAT	2	6	3091778	3091783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61553	NC_018867	TAA	2	6	3091802	3091807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61554	NC_018867	AATAT	2	10	3091815	3091824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61555	NC_018867	GAA	2	6	3091825	3091830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61556	NC_018867	TTGT	2	8	3091839	3091846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61557	NC_018867	GTT	2	6	3091894	3091899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61558	NC_018867	TGA	2	6	3091929	3091934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61559	NC_018867	T	6	6	3091949	3091954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61560	NC_018867	CTT	2	6	3091955	3091960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61561	NC_018867	AAT	2	6	3091999	3092004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61562	NC_018867	T	9	9	3092004	3092012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61563	NC_018867	TGA	2	6	3092015	3092020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.