MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 61563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_018867	CTG	2	6	2810259	2810264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56002	NC_018867	CCG	2	6	2810461	2810466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662344
56003	NC_018867	GTTAT	2	10	2810474	2810483	20 %	60 %	20 %	0 %	410662344
56004	NC_018867	ACC	2	6	2810522	2810527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662344
56005	NC_018867	GAT	2	6	2810592	2810597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662344
56006	NC_018867	AAG	2	6	2810656	2810661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662345
56007	NC_018867	AACA	2	8	2810668	2810675	75 %	0 %	0 %	25 %	410662345
56008	NC_018867	CAG	2	6	2810694	2810699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662345
56009	NC_018867	T	6	6	2810718	2810723	0 %	100 %	0 %	0 %	410662345
56010	NC_018867	TAC	2	6	2810757	2810762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662345
56011	NC_018867	AAAG	2	8	2810771	2810778	75 %	0 %	25 %	0 %	410662345
56012	NC_018867	A	6	6	2810869	2810874	100 %	0 %	0 %	0 %	410662345
56013	NC_018867	GAA	2	6	2810895	2810900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662345
56014	NC_018867	CTTTC	2	10	2810922	2810931	0 %	60 %	0 %	40 %	410662345
56015	NC_018867	A	8	8	2811001	2811008	100 %	0 %	0 %	0 %	410662345
56016	NC_018867	CTG	2	6	2811026	2811031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662345
56017	NC_018867	AG	3	6	2811138	2811143	50 %	0 %	50 %	0 %	410662345
56018	NC_018867	GATG	2	8	2811144	2811151	25 %	25 %	50 %	0 %	410662345
56019	NC_018867	TGC	2	6	2811170	2811175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662345
56020	NC_018867	ATA	3	9	2811220	2811228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662345
56021	NC_018867	A	6	6	2811297	2811302	100 %	0 %	0 %	0 %	410662345
56022	NC_018867	AAT	3	9	2811313	2811321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662345
56023	NC_018867	AT	3	6	2811320	2811325	50 %	50 %	0 %	0 %	410662345
56024	NC_018867	CCT	2	6	2811330	2811335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410662345
56025	NC_018867	AAT	2	6	2811338	2811343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662345
56026	NC_018867	A	7	7	2811366	2811372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56027	NC_018867	AATT	2	8	2811422	2811429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56028	NC_018867	ATA	3	9	2811437	2811445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56029	NC_018867	TAA	2	6	2811474	2811479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56030	NC_018867	AGG	2	6	2811492	2811497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56031	NC_018867	A	7	7	2811500	2811506	100 %	0 %	0 %	0 %	410662346
56032	NC_018867	GAT	2	6	2811571	2811576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662346
56033	NC_018867	GAA	2	6	2811617	2811622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662346
56034	NC_018867	AATG	2	8	2811654	2811661	50 %	25 %	25 %	0 %	410662346
56035	NC_018867	CTT	2	6	2811838	2811843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662347
56036	NC_018867	CTC	2	6	2811973	2811978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410662347
56037	NC_018867	CGGCTT	2	12	2812042	2812053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662347
56038	NC_018867	TTCCCT	2	12	2812179	2812190	0 %	50 %	0 %	50 %	410662348
56039	NC_018867	TCAA	2	8	2812226	2812233	50 %	25 %	0 %	25 %	410662348
56040	NC_018867	A	6	6	2812298	2812303	100 %	0 %	0 %	0 %	410662348
56041	NC_018867	TTC	2	6	2812324	2812329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662348
56042	NC_018867	GAT	2	6	2812354	2812359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662348
56043	NC_018867	A	6	6	2812440	2812445	100 %	0 %	0 %	0 %	410662348
56044	NC_018867	CAG	2	6	2812450	2812455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662348
56045	NC_018867	GCC	2	6	2812481	2812486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662348
56046	NC_018867	AAT	2	6	2812491	2812496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662348
56047	NC_018867	TTA	2	6	2812652	2812657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410662348
56048	NC_018867	AAGT	2	8	2812666	2812673	50 %	25 %	25 %	0 %	410662348
56049	NC_018867	CCTTG	2	10	2813010	2813019	0 %	40 %	20 %	40 %	410662348
56050	NC_018867	AGG	2	6	2813082	2813087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410662348
56051	NC_018867	CAG	2	6	2813100	2813105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662348
56052	NC_018867	CAT	2	6	2813181	2813186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662348
56053	NC_018867	TTC	2	6	2813215	2813220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662348
56054	NC_018867	GAT	2	6	2813265	2813270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662348
56055	NC_018867	GAA	2	6	2813326	2813331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662348
56056	NC_018867	GTT	2	6	2813337	2813342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662348
56057	NC_018867	ATG	2	6	2813444	2813449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662348
56058	NC_018867	AAG	2	6	2813470	2813475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662348
56059	NC_018867	CTT	2	6	2813577	2813582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662348
56060	NC_018867	ATG	2	6	2813633	2813638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662348
56061	NC_018867	CCG	3	9	2813732	2813740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56062	NC_018867	TTA	2	6	2813742	2813747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56063	NC_018867	TTAT	2	8	2813774	2813781	25 %	75 %	0 %	0 %	410662349
56064	NC_018867	TG	3	6	2813850	2813855	0 %	50 %	50 %	0 %	410662349
56065	NC_018867	TCG	2	6	2813886	2813891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662349
56066	NC_018867	CTT	2	6	2813903	2813908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662349
56067	NC_018867	CCA	2	6	2813965	2813970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662349
56068	NC_018867	TCTCC	2	10	2813977	2813986	0 %	40 %	0 %	60 %	410662349
56069	NC_018867	ATG	2	6	2814026	2814031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662349
56070	NC_018867	T	6	6	2814118	2814123	0 %	100 %	0 %	0 %	410662349
56071	NC_018867	ATC	2	6	2814128	2814133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662349
56072	NC_018867	GAGT	2	8	2814136	2814143	25 %	25 %	50 %	0 %	410662349
56073	NC_018867	CAG	2	6	2814155	2814160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662349
56074	NC_018867	TCG	2	6	2814165	2814170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662349
56075	NC_018867	TGG	2	6	2814381	2814386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410662349
56076	NC_018867	GTT	2	6	2814407	2814412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662349
56077	NC_018867	GTT	2	6	2814425	2814430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662349
56078	NC_018867	GAA	2	6	2814574	2814579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662349
56079	NC_018867	GTG	2	6	2814708	2814713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410662349
56080	NC_018867	CAA	2	6	2814758	2814763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410662349
56081	NC_018867	TCG	2	6	2814780	2814785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662349
56082	NC_018867	TTA	2	6	2814863	2814868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56083	NC_018867	CAGC	2	8	2814886	2814893	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56084	NC_018867	A	6	6	2814937	2814942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56085	NC_018867	T	6	6	2814967	2814972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56086	NC_018867	AT	3	6	2815007	2815012	50 %	50 %	0 %	0 %	410662350
56087	NC_018867	GAA	2	6	2815071	2815076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662350
56088	NC_018867	AGAT	2	8	2815087	2815094	50 %	25 %	25 %	0 %	410662350
56089	NC_018867	AAGA	2	8	2815122	2815129	75 %	0 %	25 %	0 %	410662350
56090	NC_018867	AT	3	6	2815240	2815245	50 %	50 %	0 %	0 %	410662350
56091	NC_018867	ATGA	2	8	2815303	2815310	50 %	25 %	25 %	0 %	410662351
56092	NC_018867	A	7	7	2815317	2815323	100 %	0 %	0 %	0 %	410662351
56093	NC_018867	A	6	6	2815407	2815412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56094	NC_018867	CAGA	2	8	2815433	2815440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56095	NC_018867	T	7	7	2815471	2815477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56096	NC_018867	AGA	2	6	2815516	2815521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56097	NC_018867	CTCAGG	2	12	2815535	2815546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56098	NC_018867	TAA	2	6	2815579	2815584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56099	NC_018867	AGG	2	6	2815589	2815594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56100	NC_018867	ACGA	2	8	2815694	2815701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56101	NC_018867	TGG	2	6	2815753	2815758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56102	NC_018867	CTG	2	6	2815788	2815793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56103	NC_018867	AAC	2	6	2815889	2815894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56104	NC_018867	TAATT	2	10	2815898	2815907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56105	NC_018867	G	7	7	2815937	2815943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56106	NC_018867	TTTTTG	2	12	2815944	2815955	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56107	NC_018867	TATT	2	8	2815962	2815969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56108	NC_018867	T	6	6	2815968	2815973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56109	NC_018867	TA	3	6	2816030	2816035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56110	NC_018867	TAC	2	6	2816037	2816042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56111	NC_018867	GAAT	2	8	2816072	2816079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56112	NC_018867	GAA	2	6	2816258	2816263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662352
56113	NC_018867	TGA	2	6	2816358	2816363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662352
56114	NC_018867	GGA	2	6	2816425	2816430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410662352
56115	NC_018867	GCA	2	6	2816453	2816458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662352
56116	NC_018867	GGC	2	6	2816474	2816479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662352
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56118	NC_018867	TCCGG	2	10	2816549	2816558	0 %	20 %	40 %	40 %	410662352
56119	NC_018867	CAAG	2	8	2816599	2816606	50 %	0 %	25 %	25 %	410662352
56120	NC_018867	TTC	2	6	2816637	2816642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662352
56121	NC_018867	ACC	2	6	2816649	2816654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662352
56122	NC_018867	AGA	2	6	2816683	2816688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662352
56123	NC_018867	GGCA	2	8	2816800	2816807	25 %	0 %	50 %	25 %	410662352
56124	NC_018867	TTG	2	6	2816838	2816843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662352
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56129	NC_018867	GAT	2	6	2817089	2817094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662352
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56135	NC_018867	GAT	2	6	2817403	2817408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662352
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56225	NC_018867	CTGC	2	8	2821514	2821521	0 %	25 %	25 %	50 %	410662356
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56229	NC_018867	T	7	7	2821722	2821728	0 %	100 %	0 %	0 %	410662356
56230	NC_018867	GGA	2	6	2821754	2821759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410662356
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56232	NC_018867	AAG	2	6	2821842	2821847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662356
56233	NC_018867	CTG	2	6	2821934	2821939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662356
56234	NC_018867	GTT	2	6	2821991	2821996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662356
56235	NC_018867	TCT	2	6	2822014	2822019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56236	NC_018867	AAATT	2	10	2822054	2822063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56237	NC_018867	AT	3	6	2822080	2822085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56238	NC_018867	CAG	2	6	2822288	2822293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662357
56239	NC_018867	TGT	2	6	2822296	2822301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662357
56240	NC_018867	AAG	2	6	2822351	2822356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662357
56241	NC_018867	CTG	2	6	2822436	2822441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662357
56242	NC_018867	T	8	8	2822493	2822500	0 %	100 %	0 %	0 %	410662357
56243	NC_018867	CATTCC	2	12	2822514	2822525	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410662357
56244	NC_018867	CAT	2	6	2822676	2822681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662357
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56251	NC_018867	TTCT	2	8	2823101	2823108	0 %	75 %	0 %	25 %	410662357
56252	NC_018867	ATGGA	2	10	2823212	2823221	40 %	20 %	40 %	0 %	410662357
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56257	NC_018867	ATTTCG	2	12	2823451	2823462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410662357
56258	NC_018867	CTTC	2	8	2823593	2823600	0 %	50 %	0 %	50 %	410662357
56259	NC_018867	ATC	2	6	2823636	2823641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662357
56260	NC_018867	TATC	2	8	2823707	2823714	25 %	50 %	0 %	25 %	410662357
56261	NC_018867	TGT	2	6	2823759	2823764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662357
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56310	NC_018867	TTA	2	6	2825842	2825847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56314	NC_018867	A	8	8	2825963	2825970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56345	NC_018867	A	6	6	2827114	2827119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56347	NC_018867	A	7	7	2827200	2827206	100 %	0 %	0 %	0 %	410662360
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56479	NC_018867	T	6	6	2833297	2833302	0 %	100 %	0 %	0 %	410662367
56480	NC_018867	GCT	2	6	2833322	2833327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662367
56481	NC_018867	TCAA	2	8	2833426	2833433	50 %	25 %	0 %	25 %	410662367
56482	NC_018867	CCCTT	2	10	2833551	2833560	0 %	40 %	0 %	60 %	410662367
56483	NC_018867	GA	3	6	2833581	2833586	50 %	0 %	50 %	0 %	410662367
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