MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 61563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_018867	ATC	2	6	2679524	2679529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662233
53502	NC_018867	TTC	2	6	2679563	2679568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662233
53503	NC_018867	A	6	6	2679672	2679677	100 %	0 %	0 %	0 %	410662233
53504	NC_018867	TAT	2	6	2679805	2679810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53505	NC_018867	T	7	7	2679815	2679821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53506	NC_018867	T	7	7	2679857	2679863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53507	NC_018867	GAT	2	6	2679916	2679921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662234
53508	NC_018867	ATG	2	6	2679959	2679964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662234
53509	NC_018867	CTG	2	6	2680037	2680042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662234
53510	NC_018867	CGC	2	6	2680053	2680058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662234
53511	NC_018867	GAT	2	6	2680062	2680067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662234
53512	NC_018867	GCA	2	6	2680071	2680076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662234
53513	NC_018867	AAT	2	6	2680078	2680083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662234
53514	NC_018867	GA	3	6	2680147	2680152	50 %	0 %	50 %	0 %	410662234
53515	NC_018867	CCGA	2	8	2680154	2680161	25 %	0 %	25 %	50 %	410662234
53516	NC_018867	TCC	2	6	2680241	2680246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410662234
53517	NC_018867	TCA	2	6	2680388	2680393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662234
53518	NC_018867	GGCCA	2	10	2680405	2680414	20 %	0 %	40 %	40 %	410662234
53519	NC_018867	CAG	2	6	2680486	2680491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662234
53520	NC_018867	TGG	2	6	2680509	2680514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410662234
53521	NC_018867	TGA	2	6	2680535	2680540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662234
53522	NC_018867	CGG	2	6	2680583	2680588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662234
53523	NC_018867	T	6	6	2680628	2680633	0 %	100 %	0 %	0 %	410662235
53524	NC_018867	CTG	2	6	2680714	2680719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662235
53525	NC_018867	GCT	2	6	2680758	2680763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662235
53526	NC_018867	CAG	2	6	2680846	2680851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662235
53527	NC_018867	CTG	2	6	2680865	2680870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662235
53528	NC_018867	TCA	2	6	2680906	2680911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662235
53529	NC_018867	TTAAG	2	10	2680930	2680939	40 %	40 %	20 %	0 %	410662235
53530	NC_018867	TCC	2	6	2680956	2680961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410662235
53531	NC_018867	CAG	2	6	2680966	2680971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662235
53532	NC_018867	CAC	2	6	2680997	2681002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662235
53533	NC_018867	ATC	2	6	2681027	2681032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662235
53534	NC_018867	TCG	2	6	2681136	2681141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662235
53535	NC_018867	TCC	2	6	2681178	2681183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410662235
53536	NC_018867	CCT	2	6	2681195	2681200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410662235
53537	NC_018867	CGAAGC	2	12	2681204	2681215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662235
53538	NC_018867	CAT	2	6	2681225	2681230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662235
53539	NC_018867	TTC	2	6	2681257	2681262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53540	NC_018867	ATC	2	6	2681265	2681270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53541	NC_018867	AAG	2	6	2681320	2681325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53542	NC_018867	GAA	2	6	2681351	2681356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53543	NC_018867	TCT	2	6	2681397	2681402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53544	NC_018867	T	7	7	2681423	2681429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53545	NC_018867	AGC	2	6	2681523	2681528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662236
53546	NC_018867	TAA	2	6	2681545	2681550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662236
53547	NC_018867	CT	3	6	2681676	2681681	0 %	50 %	0 %	50 %	410662236
53548	NC_018867	ATC	2	6	2681987	2681992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662236
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53550	NC_018867	TTC	2	6	2682120	2682125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662236
53551	NC_018867	TCA	2	6	2682192	2682197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662236
53552	NC_018867	GCC	2	6	2682387	2682392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662236
53553	NC_018867	CAGC	2	8	2682406	2682413	25 %	0 %	25 %	50 %	410662236
53554	NC_018867	CAT	2	6	2682418	2682423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662236
53555	NC_018867	CCTG	2	8	2682460	2682467	0 %	25 %	25 %	50 %	410662236
53556	NC_018867	CCA	2	6	2682543	2682548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662236
53557	NC_018867	GGC	2	6	2682554	2682559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662236
53558	NC_018867	ACGCAG	2	12	2682574	2682585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662236
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53560	NC_018867	AGA	2	6	2682625	2682630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662236
53561	NC_018867	TGA	2	6	2682670	2682675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662236
53562	NC_018867	T	6	6	2682793	2682798	0 %	100 %	0 %	0 %	410662236
53563	NC_018867	TGC	2	6	2682823	2682828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662236
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53566	NC_018867	CGT	2	6	2683043	2683048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662236
53567	NC_018867	TCCC	2	8	2683084	2683091	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53568	NC_018867	CT	3	6	2683097	2683102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53569	NC_018867	TAA	2	6	2683132	2683137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53570	NC_018867	TAA	2	6	2683163	2683168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53571	NC_018867	AAG	2	6	2683195	2683200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53572	NC_018867	CCTT	2	8	2683228	2683235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53573	NC_018867	GGA	2	6	2683341	2683346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410662237
53574	NC_018867	TAA	2	6	2683396	2683401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662237
53575	NC_018867	GATCTG	2	12	2683451	2683462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410662237
53576	NC_018867	CGA	2	6	2683471	2683476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662237
53577	NC_018867	CTT	2	6	2683477	2683482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662237
53578	NC_018867	T	6	6	2683531	2683536	0 %	100 %	0 %	0 %	410662237
53579	NC_018867	TGA	2	6	2683558	2683563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662237
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53582	NC_018867	CAAATC	2	12	2683892	2683903	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410662237
53583	NC_018867	T	7	7	2684002	2684008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53584	NC_018867	AAT	2	6	2684021	2684026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662238
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53588	NC_018867	TTGTC	2	10	2684234	2684243	0 %	60 %	20 %	20 %	410662238
53589	NC_018867	CCGTTT	2	12	2684289	2684300	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410662238
53590	NC_018867	TAA	2	6	2684384	2684389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662238
53591	NC_018867	A	6	6	2684388	2684393	100 %	0 %	0 %	0 %	410662238
53592	NC_018867	CACC	2	8	2684418	2684425	25 %	0 %	0 %	75 %	410662238
53593	NC_018867	TGA	2	6	2684448	2684453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662238
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53596	NC_018867	CGG	2	6	2684604	2684609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662238
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53598	NC_018867	T	7	7	2684722	2684728	0 %	100 %	0 %	0 %	410662238
53599	NC_018867	AAT	2	6	2684782	2684787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53600	NC_018867	AAATAA	2	12	2684826	2684837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53601	NC_018867	ATA	2	6	2684849	2684854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53602	NC_018867	AAGG	2	8	2684891	2684898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53603	NC_018867	GAA	2	6	2684912	2684917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662239
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53605	NC_018867	A	7	7	2684966	2684972	100 %	0 %	0 %	0 %	410662239
53606	NC_018867	TTTC	2	8	2684990	2684997	0 %	75 %	0 %	25 %	410662239
53607	NC_018867	AAG	2	6	2685031	2685036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662239
53608	NC_018867	CCTGA	2	10	2685044	2685053	20 %	20 %	20 %	40 %	410662239
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53732	NC_018867	ATTT	2	8	2691884	2691891	25 %	75 %	0 %	0 %	410662243
53733	NC_018867	GAA	2	6	2691906	2691911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662243
53734	NC_018867	TCG	2	6	2692012	2692017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662243
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