MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 94432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018068	ATTT	2	8	51501	51508	25 %	75 %	0 %	0 %	392423504
1002	NC_018068	GCA	2	6	51588	51593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423504
1003	NC_018068	GGA	2	6	51612	51617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423504
1004	NC_018068	AACG	2	8	51665	51672	50 %	0 %	25 %	25 %	392423504
1005	NC_018068	ACA	2	6	51675	51680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423504
1006	NC_018068	GGT	2	6	51749	51754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423504
1007	NC_018068	TGA	2	6	51785	51790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423504
1008	NC_018068	GTT	2	6	51798	51803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423504
1009	NC_018068	GGT	2	6	51888	51893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423504
1010	NC_018068	AACAT	2	10	52000	52009	60 %	20 %	0 %	20 %	392423504
1011	NC_018068	TTC	2	6	52091	52096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423504
1012	NC_018068	TGC	2	6	52175	52180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423504
1013	NC_018068	AAG	2	6	52189	52194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423504
1014	NC_018068	GAA	2	6	52348	52353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423504
1015	NC_018068	CTT	2	6	52374	52379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423504
1016	NC_018068	GTT	2	6	52425	52430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423504
1017	NC_018068	TTC	2	6	52497	52502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423504
1018	NC_018068	AGA	2	6	52520	52525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423504
1019	NC_018068	AC	3	6	52572	52577	50 %	0 %	0 %	50 %	392423504
1020	NC_018068	GTGG	2	8	52590	52597	0 %	25 %	75 %	0 %	392423504
1021	NC_018068	TTC	2	6	52648	52653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_018068	CTT	2	6	52655	52660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_018068	TTAAT	2	10	52694	52703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018068	AT	3	6	52734	52739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018068	TAA	2	6	52743	52748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018068	GTT	2	6	53003	53008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423505
1027	NC_018068	AGC	2	6	53091	53096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423505
1028	NC_018068	TGC	2	6	53099	53104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423505
1029	NC_018068	TTA	2	6	53118	53123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423505
1030	NC_018068	A	8	8	53150	53157	100 %	0 %	0 %	0 %	392423505
1031	NC_018068	GTT	2	6	53159	53164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423505
1032	NC_018068	GAA	2	6	53241	53246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423505
1033	NC_018068	T	6	6	53252	53257	0 %	100 %	0 %	0 %	392423505
1034	NC_018068	CTTG	2	8	53269	53276	0 %	50 %	25 %	25 %	392423505
1035	NC_018068	CGC	2	6	53401	53406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423505
1036	NC_018068	TA	3	6	53425	53430	50 %	50 %	0 %	0 %	392423505
1037	NC_018068	AGC	2	6	53482	53487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423505
1038	NC_018068	GTG	2	6	53560	53565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423505
1039	NC_018068	AT	3	6	53666	53671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018068	ATT	2	6	53685	53690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423506
1041	NC_018068	TGA	2	6	53879	53884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423506
1042	NC_018068	GAA	2	6	54004	54009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423506
1043	NC_018068	AACG	2	8	54124	54131	50 %	0 %	25 %	25 %	392423506
1044	NC_018068	CAT	2	6	54185	54190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423506
1045	NC_018068	CGGA	2	8	54201	54208	25 %	0 %	50 %	25 %	392423506
1046	NC_018068	GAA	2	6	54223	54228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423506
1047	NC_018068	CTG	2	6	54305	54310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423506
1048	NC_018068	ATGTT	2	10	54314	54323	20 %	60 %	20 %	0 %	392423506
1049	NC_018068	GAA	2	6	54339	54344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423506
1050	NC_018068	AAT	2	6	54365	54370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423506
1051	NC_018068	TGG	2	6	54400	54405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423507
1052	NC_018068	GCA	2	6	54567	54572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423507
1053	NC_018068	TCC	2	6	54600	54605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423507
1054	NC_018068	CT	3	6	54616	54621	0 %	50 %	0 %	50 %	392423507
1055	NC_018068	AAGC	2	8	54626	54633	50 %	0 %	25 %	25 %	392423507
1056	NC_018068	GGGT	2	8	54671	54678	0 %	25 %	75 %	0 %	392423507
1057	NC_018068	TCT	2	6	54695	54700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423507
1058	NC_018068	CCGC	2	8	54719	54726	0 %	0 %	25 %	75 %	392423507
1059	NC_018068	AG	3	6	54753	54758	50 %	0 %	50 %	0 %	392423507
1060	NC_018068	CAG	2	6	54817	54822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423507
1061	NC_018068	GTC	2	6	54843	54848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423507
1062	NC_018068	ATC	2	6	54878	54883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423507
1063	NC_018068	ATTA	2	8	54891	54898	50 %	50 %	0 %	0 %	392423507
1064	NC_018068	GAT	2	6	54926	54931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423507
1065	NC_018068	TGA	2	6	54980	54985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423507
1066	NC_018068	AGG	2	6	54998	55003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423507
1067	NC_018068	TGA	2	6	55027	55032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423507
1068	NC_018068	TGT	2	6	55049	55054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423507
1069	NC_018068	GT	3	6	55063	55068	0 %	50 %	50 %	0 %	392423507
1070	NC_018068	TTG	2	6	55102	55107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423507
1071	NC_018068	TTAT	2	8	55112	55119	25 %	75 %	0 %	0 %	392423507
1072	NC_018068	ATT	2	6	55164	55169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423507
1073	NC_018068	GGA	2	6	55175	55180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423507
1074	NC_018068	ATT	2	6	55207	55212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018068	T	7	7	55240	55246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_018068	GTG	2	6	55296	55301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_018068	TGT	2	6	55395	55400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423508
1078	NC_018068	ATG	2	6	55403	55408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423508
1079	NC_018068	GTC	2	6	55414	55419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423508
1080	NC_018068	TTG	2	6	55439	55444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423508
1081	NC_018068	GCA	2	6	55507	55512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423508
1082	NC_018068	CTG	2	6	55529	55534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423508
1083	NC_018068	AAG	2	6	55550	55555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423508
1084	NC_018068	ATT	2	6	55564	55569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018068	TCT	2	6	55597	55602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_018068	T	9	9	55602	55610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_018068	AT	3	6	55640	55645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018068	GTT	2	6	55646	55651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018068	A	6	6	55654	55659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_018068	TAAAC	2	10	55718	55727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_018068	GCT	2	6	55770	55775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423509
1092	NC_018068	CCAA	2	8	55864	55871	50 %	0 %	0 %	50 %	392423509
1093	NC_018068	TTG	2	6	55918	55923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423509
1094	NC_018068	AGT	2	6	55952	55957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423509
1095	NC_018068	GGA	2	6	56012	56017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423509
1096	NC_018068	GAG	2	6	56104	56109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423509
1097	NC_018068	AGC	2	6	56140	56145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423509
1098	NC_018068	TTG	2	6	56194	56199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423509
1099	NC_018068	GCA	2	6	56211	56216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423509
1100	NC_018068	TGA	2	6	56219	56224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423509
1101	NC_018068	CTC	2	6	56302	56307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423509
1102	NC_018068	AGA	2	6	56390	56395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423509
1103	NC_018068	GCA	2	6	56802	56807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423509
1104	NC_018068	TA	3	6	56832	56837	50 %	50 %	0 %	0 %	392423509
1105	NC_018068	GCA	2	6	56902	56907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423509
1106	NC_018068	CATT	2	8	56934	56941	25 %	50 %	0 %	25 %	392423509
1107	NC_018068	GCA	2	6	56947	56952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423509
1108	NC_018068	CAA	2	6	57010	57015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423509
1109	NC_018068	CAA	2	6	57060	57065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423509
1110	NC_018068	ATT	2	6	57066	57071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423509
1111	NC_018068	GAGAA	2	10	57090	57099	60 %	0 %	40 %	0 %	392423509
1112	NC_018068	GCA	2	6	57122	57127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423510
1113	NC_018068	ATT	2	6	57186	57191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423510
1114	NC_018068	TGA	2	6	57256	57261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423510
1115	NC_018068	CCAA	2	8	57308	57315	50 %	0 %	0 %	50 %	392423510
1116	NC_018068	ACA	2	6	57318	57323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423510
1117	NC_018068	TTA	2	6	57336	57341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423510
1118	NC_018068	TGAT	2	8	57342	57349	25 %	50 %	25 %	0 %	392423510
1119	NC_018068	CCG	2	6	57370	57375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423510
1120	NC_018068	TTA	2	6	57394	57399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423510
1121	NC_018068	CGT	2	6	57616	57621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423510
1122	NC_018068	ATT	2	6	57689	57694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423510
1123	NC_018068	GGC	2	6	57702	57707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423510
1124	NC_018068	TGAT	2	8	57771	57778	25 %	50 %	25 %	0 %	392423510
1125	NC_018068	CAT	2	6	57781	57786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423510
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1127	NC_018068	TGC	2	6	57912	57917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423510
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1132	NC_018068	TTC	2	6	58179	58184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423511
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1161	NC_018068	A	6	6	59718	59723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1239	NC_018068	TTAT	2	8	64221	64228	25 %	75 %	0 %	0 %	392423515
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1241	NC_018068	GAA	2	6	64345	64350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423515
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1243	NC_018068	ATT	2	6	64418	64423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1246	NC_018068	AAT	2	6	64457	64462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_018068	AT	3	6	64476	64481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_018068	GAA	2	6	64578	64583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423516
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1251	NC_018068	TCG	2	6	64621	64626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423516
1252	NC_018068	A	7	7	64693	64699	100 %	0 %	0 %	0 %	392423516
1253	NC_018068	ATT	2	6	64799	64804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423516
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