MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.02

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018067	CA	3	6	89	94	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018067	TTC	2	6	129	134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018067	TAC	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018067	AGT	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018067	G	6	6	257	262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018067	ATG	2	6	283	288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	391738066
7	NC_018067	GAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	391738066
8	NC_018067	A	7	7	308	314	100 %	0 %	0 %	0 %	391738066
9	NC_018067	AG	3	6	378	383	50 %	0 %	50 %	0 %	391738066
10	NC_018067	GGC	2	6	389	394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	391738066
11	NC_018067	AT	3	6	510	515	50 %	50 %	0 %	0 %	391738066
12	NC_018067	GAA	2	6	550	555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	391738066
13	NC_018067	ATT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018067	GAA	2	6	718	723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018067	CAA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	391738068
16	NC_018067	CTT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738068
17	NC_018067	ATAAA	2	10	1258	1267	80 %	20 %	0 %	0 %	391738068
18	NC_018067	GTT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	391738068
19	NC_018067	A	7	7	1333	1339	100 %	0 %	0 %	0 %	391738068
20	NC_018067	ATT	2	6	1489	1494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018067	ACA	2	6	1500	1505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018067	T	7	7	1555	1561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018067	CCCT	2	8	1563	1570	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_018067	CGT	2	6	1602	1607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018067	T	6	6	1607	1612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018067	A	8	8	1683	1690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018067	GGGA	2	8	1795	1802	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018067	GAT	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018067	TCG	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018067	G	6	6	2123	2128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018067	AT	3	6	2149	2154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018067	CT	3	6	2221	2226	0 %	50 %	0 %	50 %	391738069
33	NC_018067	T	7	7	2234	2240	0 %	100 %	0 %	0 %	391738069
34	NC_018067	TTA	2	6	2267	2272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	391738069
35	NC_018067	CTT	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
36	NC_018067	GCTT	2	8	2515	2522	0 %	50 %	25 %	25 %	391738069
37	NC_018067	AATC	2	8	2529	2536	50 %	25 %	0 %	25 %	391738069
38	NC_018067	T	6	6	2559	2564	0 %	100 %	0 %	0 %	391738069
39	NC_018067	ACT	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	391738069
40	NC_018067	TC	3	6	2607	2612	0 %	50 %	0 %	50 %	391738069
41	NC_018067	CTT	2	6	2702	2707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
42	NC_018067	CCTGG	2	10	2727	2736	0 %	20 %	40 %	40 %	391738069
43	NC_018067	GTT	3	9	2777	2785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	391738069
44	NC_018067	GT	3	6	2846	2851	0 %	50 %	50 %	0 %	391738069
45	NC_018067	TTC	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
46	NC_018067	TCCG	2	8	2907	2914	0 %	25 %	25 %	50 %	391738069
47	NC_018067	TCA	2	6	2935	2940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	391738069
48	NC_018067	GTT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	391738069
49	NC_018067	CGG	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	391738069
50	NC_018067	GGTT	2	8	2991	2998	0 %	50 %	50 %	0 %	391738069
51	NC_018067	TATT	2	8	3026	3033	25 %	75 %	0 %	0 %	391738069
52	NC_018067	CTT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
53	NC_018067	TCT	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
54	NC_018067	TTGG	2	8	3071	3078	0 %	50 %	50 %	0 %	391738069
55	NC_018067	GCTT	2	8	3095	3102	0 %	50 %	25 %	25 %	391738069
56	NC_018067	ATGT	2	8	3105	3112	25 %	50 %	25 %	0 %	391738069
57	NC_018067	TGG	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	391738069
58	NC_018067	CATGA	2	10	3477	3486	40 %	20 %	20 %	20 %	391738069
59	NC_018067	GGT	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	391738069
60	NC_018067	CTG	2	6	3585	3590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	391738069
61	NC_018067	T	6	6	3797	3802	0 %	100 %	0 %	0 %	391738069
62	NC_018067	CCT	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	391738069
63	NC_018067	TAT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	391738069
64	NC_018067	GATA	2	8	3875	3882	50 %	25 %	25 %	0 %	391738069

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.