MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 27985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018001	CCA	2	6	640275	640280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390938408
13002	NC_018001	GGT	2	6	640281	640286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938408
13003	NC_018001	AGCTA	2	10	640323	640332	40 %	20 %	20 %	20 %	390938408
13004	NC_018001	GGA	2	6	640335	640340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938408
13005	NC_018001	CAT	2	6	640347	640352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938408
13006	NC_018001	CAA	2	6	640356	640361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390938408
13007	NC_018001	TGC	2	6	640367	640372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390938408
13008	NC_018001	GGA	2	6	640386	640391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938408
13009	NC_018001	AGG	2	6	640451	640456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938408
13010	NC_018001	GATA	2	8	640497	640504	50 %	25 %	25 %	0 %	390938408
13011	NC_018001	TGAAG	2	10	640518	640527	40 %	20 %	40 %	0 %	390938408
13012	NC_018001	AAG	2	6	640546	640551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938408
13013	NC_018001	GAGG	2	8	640587	640594	25 %	0 %	75 %	0 %	390938408
13014	NC_018001	TGG	2	6	640664	640669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_018001	CTC	2	6	640759	640764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390938409
13016	NC_018001	GGA	2	6	640772	640777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938409
13017	NC_018001	GGGT	2	8	640781	640788	0 %	25 %	75 %	0 %	390938409
13018	NC_018001	AGT	2	6	640854	640859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938409
13019	NC_018001	AGGAG	2	10	640866	640875	40 %	0 %	60 %	0 %	390938409
13020	NC_018001	CGT	2	6	640901	640906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390938409
13021	NC_018001	TAG	2	6	640937	640942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938409
13022	NC_018001	TAA	2	6	640980	640985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938409
13023	NC_018001	ATC	2	6	641008	641013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938409
13024	NC_018001	GAG	2	6	641044	641049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938409
13025	NC_018001	ACA	2	6	641094	641099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390938409
13026	NC_018001	T	6	6	641104	641109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_018001	GGT	2	6	641153	641158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_018001	TTG	2	6	641176	641181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390938410
13029	NC_018001	GA	3	6	641195	641200	50 %	0 %	50 %	0 %	390938410
13030	NC_018001	GGCA	2	8	641204	641211	25 %	0 %	50 %	25 %	390938410
13031	NC_018001	TGAT	2	8	641212	641219	25 %	50 %	25 %	0 %	390938410
13032	NC_018001	GCT	2	6	641252	641257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390938410
13033	NC_018001	ACT	2	6	641297	641302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938410
13034	NC_018001	GAGG	2	8	641333	641340	25 %	0 %	75 %	0 %	390938410
13035	NC_018001	GTA	2	6	641370	641375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938410
13036	NC_018001	TTG	2	6	641527	641532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390938410
13037	NC_018001	GAG	2	6	641598	641603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938410
13038	NC_018001	AT	3	6	641701	641706	50 %	50 %	0 %	0 %	390938410
13039	NC_018001	GGC	2	6	641714	641719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390938410
13040	NC_018001	GGT	2	6	641748	641753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938410
13041	NC_018001	GATAA	2	10	641823	641832	60 %	20 %	20 %	0 %	390938410
13042	NC_018001	AGG	2	6	641854	641859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938410
13043	NC_018001	GAG	2	6	641878	641883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938411
13044	NC_018001	AGCC	2	8	641900	641907	25 %	0 %	25 %	50 %	390938411
13045	NC_018001	TAT	2	6	641924	641929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938411
13046	NC_018001	ATA	2	6	641977	641982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938411
13047	NC_018001	ACT	2	6	642069	642074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938411
13048	NC_018001	ATC	2	6	642121	642126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938411
13049	NC_018001	GGC	3	9	642127	642135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390938411
13050	NC_018001	ATA	2	6	642167	642172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938411
13051	NC_018001	AAG	2	6	642179	642184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938411
13052	NC_018001	TGG	2	6	642191	642196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938411
13053	NC_018001	GTG	2	6	642208	642213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938411
13054	NC_018001	GAA	2	6	642225	642230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938411
13055	NC_018001	TCA	2	6	642284	642289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938411
13056	NC_018001	TGGA	2	8	642290	642297	25 %	25 %	50 %	0 %	390938411
13057	NC_018001	AAT	2	6	642342	642347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938411
13058	NC_018001	AGGCG	2	10	642369	642378	20 %	0 %	60 %	20 %	390938411
13059	NC_018001	CA	3	6	642450	642455	50 %	0 %	0 %	50 %	390938411
13060	NC_018001	AGC	2	6	642463	642468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390938411
13061	NC_018001	AT	3	6	642542	642547	50 %	50 %	0 %	0 %	390938411
13062	NC_018001	TCA	2	6	642578	642583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938411
13063	NC_018001	GAG	2	6	642606	642611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938411
13064	NC_018001	GA	3	6	642646	642651	50 %	0 %	50 %	0 %	390938411
13065	NC_018001	GGCG	2	8	642676	642683	0 %	0 %	75 %	25 %	390938411
13066	NC_018001	GTT	2	6	642693	642698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390938411
13067	NC_018001	ACT	2	6	642762	642767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_018001	ACT	2	6	642825	642830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390938412
13069	NC_018001	TAT	2	6	642845	642850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938412
13070	NC_018001	GAG	2	6	642863	642868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938412
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13072	NC_018001	TA	4	8	642887	642894	50 %	50 %	0 %	0 %	390938412
13073	NC_018001	TCCC	2	8	643005	643012	0 %	25 %	0 %	75 %	390938412
13074	NC_018001	CCTA	2	8	643118	643125	25 %	25 %	0 %	50 %	390938412
13075	NC_018001	AAC	2	6	643214	643219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390938412
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13077	NC_018001	AT	4	8	643289	643296	50 %	50 %	0 %	0 %	390938412
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13080	NC_018001	GAG	2	6	643346	643351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938412
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13086	NC_018001	AGT	2	6	643602	643607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938412
13087	NC_018001	CCTC	2	8	643654	643661	0 %	25 %	0 %	75 %	390938413
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13091	NC_018001	TCG	2	6	643931	643936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390938413
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13093	NC_018001	TAT	2	6	643962	643967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390938413
13094	NC_018001	AGT	2	6	643987	643992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938413
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13099	NC_018001	GGTA	2	8	644128	644135	25 %	25 %	50 %	0 %	390938413
13100	NC_018001	CCA	2	6	644165	644170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390938413
13101	NC_018001	TAT	2	6	644185	644190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_018001	ATA	2	6	644204	644209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_018001	CAC	2	6	644218	644223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13104	NC_018001	CTAG	2	8	644263	644270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13105	NC_018001	CGGGT	2	10	644292	644301	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13106	NC_018001	GTAG	2	8	644303	644310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_018001	T	6	6	644359	644364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_018001	ATT	2	6	644386	644391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_018001	TGG	2	6	644406	644411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_018001	CAC	2	6	644441	644446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390938414
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13112	NC_018001	GTG	2	6	644493	644498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938414
13113	NC_018001	TGG	2	6	644528	644533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938414
13114	NC_018001	TGCTAG	2	12	644548	644559	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390938414
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13116	NC_018001	AT	3	6	644688	644693	50 %	50 %	0 %	0 %	390938414
13117	NC_018001	CAGGC	2	10	644699	644708	20 %	0 %	40 %	40 %	390938414
13118	NC_018001	CTC	2	6	644789	644794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390938414
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13122	NC_018001	TGG	2	6	645029	645034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390938414
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