MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017310	GCC	2	6	659383	659388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152409
15002	NC_017310	TGG	2	6	659422	659427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152409
15003	NC_017310	GAA	2	6	659479	659484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152409
15004	NC_017310	CGG	2	6	659489	659494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152409
15005	NC_017310	ACT	2	6	659540	659545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152409
15006	NC_017310	GCG	3	9	659621	659629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152409
15007	NC_017310	CAA	2	6	659637	659642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152409
15008	NC_017310	GTTC	2	8	659708	659715	0 %	50 %	25 %	25 %	387152409
15009	NC_017310	CCG	2	6	659738	659743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152409
15010	NC_017310	TCT	2	6	659759	659764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152409
15011	NC_017310	TGC	2	6	659773	659778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152409
15012	NC_017310	GAAG	2	8	659790	659797	50 %	0 %	50 %	0 %	387152409
15013	NC_017310	CAT	2	6	659880	659885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152409
15014	NC_017310	AAG	2	6	659899	659904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152409
15015	NC_017310	AAGG	2	8	659923	659930	50 %	0 %	50 %	0 %	387152409
15016	NC_017310	CCA	2	6	659999	660004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152409
15017	NC_017310	GGC	2	6	660052	660057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152409
15018	NC_017310	AAG	2	6	660067	660072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152409
15019	NC_017310	CAG	2	6	660076	660081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152409
15020	NC_017310	CCG	2	6	660104	660109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152409
15021	NC_017310	GTTC	2	8	660146	660153	0 %	50 %	25 %	25 %	387152409
15022	NC_017310	CCG	2	6	660177	660182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152409
15023	NC_017310	GC	3	6	660208	660213	0 %	0 %	50 %	50 %	387152409
15024	NC_017310	CTG	2	6	660240	660245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152409
15025	NC_017310	GTGG	2	8	660345	660352	0 %	25 %	75 %	0 %	387152409
15026	NC_017310	GTG	2	6	660358	660363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152409
15027	NC_017310	GGC	2	6	660370	660375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152409
15028	NC_017310	TCA	2	6	660398	660403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152409
15029	NC_017310	AGC	2	6	660512	660517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152409
15030	NC_017310	GAA	2	6	660552	660557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152409
15031	NC_017310	CCG	2	6	660636	660641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152409
15032	NC_017310	TCG	2	6	660653	660658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152409
15033	NC_017310	TCT	2	6	660674	660679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152409
15034	NC_017310	TGG	2	6	660827	660832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152409
15035	NC_017310	GAA	2	6	660864	660869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152409
15036	NC_017310	CGG	2	6	660870	660875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152409
15037	NC_017310	CTG	2	6	660889	660894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152409
15038	NC_017310	TGG	2	6	660947	660952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152409
15039	NC_017310	AGGT	2	8	660972	660979	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_017310	TTC	2	6	660993	660998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152410
15041	NC_017310	GAA	2	6	661055	661060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152410
15042	NC_017310	CCTG	2	8	661061	661068	0 %	25 %	25 %	50 %	387152410
15043	NC_017310	GAG	2	6	661071	661076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152410
15044	NC_017310	TTC	2	6	661185	661190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152410
15045	NC_017310	GCC	2	6	661201	661206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152410
15046	NC_017310	C	6	6	661218	661223	0 %	0 %	0 %	100 %	387152410
15047	NC_017310	GGT	2	6	661259	661264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152410
15048	NC_017310	GACGA	2	10	661269	661278	40 %	0 %	40 %	20 %	387152410
15049	NC_017310	GCGT	2	8	661327	661334	0 %	25 %	50 %	25 %	387152410
15050	NC_017310	TGCC	2	8	661429	661436	0 %	25 %	25 %	50 %	387152410
15051	NC_017310	CTCGCC	2	12	661491	661502	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387152410
15052	NC_017310	GAA	2	6	661523	661528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152410
15053	NC_017310	CGGTG	2	10	661538	661547	0 %	20 %	60 %	20 %	387152410
15054	NC_017310	ACG	2	6	661561	661566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152410
15055	NC_017310	GTG	2	6	661572	661577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152410
15056	NC_017310	CCAT	2	8	661635	661642	25 %	25 %	0 %	50 %	387152410
15057	NC_017310	GCA	2	6	661652	661657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152410
15058	NC_017310	GTT	2	6	661670	661675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152410
15059	NC_017310	CGG	3	9	661706	661714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_017310	CGCC	2	8	661741	661748	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15061	NC_017310	CGG	2	6	661756	661761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_017310	GA	3	6	661762	661767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_017310	GAA	2	6	661810	661815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_017310	CGG	2	6	661840	661845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15065	NC_017310	TG	3	6	661972	661977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_017310	CAG	2	6	662030	662035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_017310	AGCC	2	8	662050	662057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15068	NC_017310	GGA	2	6	662101	662106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_017310	G	6	6	662145	662150	0 %	0 %	100 %	0 %	387152411
15070	NC_017310	CAT	2	6	662196	662201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152411
15071	NC_017310	GC	3	6	662260	662265	0 %	0 %	50 %	50 %	387152411
15072	NC_017310	TGA	2	6	662336	662341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152411
15073	NC_017310	ATC	2	6	662356	662361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152411
15074	NC_017310	TGC	2	6	662444	662449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152411
15075	NC_017310	TGG	2	6	662450	662455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152411
15076	NC_017310	G	6	6	662457	662462	0 %	0 %	100 %	0 %	387152411
15077	NC_017310	CTGC	2	8	662493	662500	0 %	25 %	25 %	50 %	387152411
15078	NC_017310	CTCGCC	2	12	662536	662547	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387152411
15079	NC_017310	CTG	2	6	662638	662643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152411
15080	NC_017310	AGG	2	6	662672	662677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152411
15081	NC_017310	TGG	2	6	662699	662704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152411
15082	NC_017310	ACGCC	2	10	662714	662723	20 %	0 %	20 %	60 %	387152411
15083	NC_017310	CTG	2	6	662730	662735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152411
15084	NC_017310	TCG	2	6	662795	662800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152411
15085	NC_017310	GCG	2	6	662861	662866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152411
15086	NC_017310	GTC	2	6	662869	662874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152411
15087	NC_017310	CG	3	6	662885	662890	0 %	0 %	50 %	50 %	387152411
15088	NC_017310	ACG	2	6	663022	663027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_017310	CCT	2	6	663128	663133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15090	NC_017310	GCCT	2	8	663140	663147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15091	NC_017310	GGT	2	6	663169	663174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_017310	CGT	2	6	663194	663199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_017310	GT	3	6	663254	663259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_017310	CGTA	2	8	663267	663274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15095	NC_017310	TCC	2	6	663338	663343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15096	NC_017310	CATT	2	8	663360	663367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15097	NC_017310	GCG	2	6	663505	663510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152412
15098	NC_017310	AGC	2	6	663645	663650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152412
15099	NC_017310	TG	3	6	663716	663721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_017310	TAA	2	6	663780	663785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_017310	TCG	2	6	663893	663898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152413
15102	NC_017310	TGC	2	6	663917	663922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152413
15103	NC_017310	GCA	2	6	664004	664009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152413
15104	NC_017310	TCG	2	6	664025	664030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152413
15105	NC_017310	CGG	2	6	664088	664093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152413
15106	NC_017310	CAT	2	6	664272	664277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152413
15107	NC_017310	GCA	2	6	664299	664304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152413
15108	NC_017310	GGT	2	6	664305	664310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152413
15109	NC_017310	GCC	2	6	664447	664452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152413
15110	NC_017310	GGCG	2	8	664458	664465	0 %	0 %	75 %	25 %	387152413
15111	NC_017310	TCG	3	9	664757	664765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152413
15112	NC_017310	TGG	2	6	664775	664780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152413
15113	NC_017310	CTG	2	6	664838	664843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152413
15114	NC_017310	CGC	2	6	664861	664866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152413
15115	NC_017310	AGC	2	6	664904	664909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152413
15116	NC_017310	CCTCG	2	10	664950	664959	0 %	20 %	20 %	60 %	387152413
15117	NC_017310	CGC	2	6	664995	665000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152413
15118	NC_017310	CGG	2	6	665024	665029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152413
15119	NC_017310	TC	3	6	665034	665039	0 %	50 %	0 %	50 %	387152413
15120	NC_017310	GGC	2	6	665058	665063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152413
15121	NC_017310	GAG	2	6	665071	665076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152413
15122	NC_017310	CGCC	2	8	665130	665137	0 %	0 %	25 %	75 %	387152413
15123	NC_017310	GGC	2	6	665182	665187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152413
15124	NC_017310	GGT	2	6	665205	665210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152413
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15126	NC_017310	GAG	2	6	665248	665253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152413
15127	NC_017310	CTG	2	6	665272	665277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152413
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15132	NC_017310	CAGC	2	8	665504	665511	25 %	0 %	25 %	50 %	387152413
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15210	NC_017310	GCA	2	6	668477	668482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15219	NC_017310	GTC	2	6	669055	669060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152418
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15224	NC_017310	CGGGG	2	10	669209	669218	0 %	0 %	80 %	20 %	387152418
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15227	NC_017310	CGA	2	6	669312	669317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152418
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15231	NC_017310	GC	3	6	669448	669453	0 %	0 %	50 %	50 %	387152418
15232	NC_017310	GGGC	2	8	669495	669502	0 %	0 %	75 %	25 %	387152418
15233	NC_017310	GGA	2	6	669546	669551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152418
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15237	NC_017310	T	7	7	669886	669892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_017310	C	7	7	669929	669935	0 %	0 %	0 %	100 %	387152419
15239	NC_017310	GGT	2	6	669978	669983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152419
15240	NC_017310	CAT	2	6	669989	669994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152419
15241	NC_017310	TGG	2	6	670060	670065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152419
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15243	NC_017310	CGG	2	6	670156	670161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152419
15244	NC_017310	CGG	2	6	670169	670174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152419
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15364	NC_017310	GGC	2	6	676206	676211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152422
15365	NC_017310	TGCCG	2	10	676272	676281	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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15367	NC_017310	TGA	2	6	676572	676577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15481	NC_017310	GCC	2	6	681755	681760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152428
15482	NC_017310	CAG	2	6	681781	681786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152428
15483	NC_017310	TGA	2	6	681810	681815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152428
15484	NC_017310	TCAGTT	2	12	681867	681878	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387152428
15485	NC_017310	CCA	2	6	681912	681917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152428
15486	NC_017310	CAC	2	6	681925	681930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152428
15487	NC_017310	CCG	2	6	681975	681980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152428
15488	NC_017310	CGG	2	6	681984	681989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152428
15489	NC_017310	TCC	2	6	682025	682030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152428
15490	NC_017310	CG	3	6	682077	682082	0 %	0 %	50 %	50 %	387152428
15491	NC_017310	CTC	2	6	682108	682113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152428
15492	NC_017310	GGA	2	6	682120	682125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152428
15493	NC_017310	CGA	2	6	682134	682139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152428
15494	NC_017310	GCC	2	6	682157	682162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152428
15495	NC_017310	GCGG	2	8	682201	682208	0 %	0 %	75 %	25 %	387152428
15496	NC_017310	CCT	2	6	682257	682262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152428
15497	NC_017310	ATC	2	6	682286	682291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152428
15498	NC_017310	ACA	2	6	682457	682462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152428
15499	NC_017310	CAG	2	6	682471	682476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152428
15500	NC_017310	ATG	3	9	682478	682486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152428

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