MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017310	TGA	2	6	615492	615497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152367
14002	NC_017310	AGT	2	6	615504	615509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152367
14003	NC_017310	ATC	2	6	615569	615574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152367
14004	NC_017310	TTG	2	6	615592	615597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152367
14005	NC_017310	CAT	2	6	615598	615603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152367
14006	NC_017310	TTG	2	6	615653	615658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152367
14007	NC_017310	TTC	2	6	615673	615678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152367
14008	NC_017310	GCG	2	6	615679	615684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152367
14009	NC_017310	GCG	2	6	615725	615730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152367
14010	NC_017310	CCG	2	6	615732	615737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152367
14011	NC_017310	CTG	2	6	615799	615804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152367
14012	NC_017310	TTCCA	2	10	615811	615820	20 %	40 %	0 %	40 %	387152367
14013	NC_017310	AGC	2	6	615848	615853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152367
14014	NC_017310	GAT	2	6	615874	615879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152367
14015	NC_017310	CGA	2	6	615981	615986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152367
14016	NC_017310	CAG	2	6	616036	616041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14017	NC_017310	GAA	2	6	616048	616053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152368
14018	NC_017310	CGT	2	6	616066	616071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14019	NC_017310	ATG	2	6	616107	616112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152368
14020	NC_017310	GAC	2	6	616118	616123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14021	NC_017310	TCG	2	6	616159	616164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14022	NC_017310	GCCCG	2	10	616208	616217	0 %	0 %	40 %	60 %	387152368
14023	NC_017310	CGGCA	2	10	616289	616298	20 %	0 %	40 %	40 %	387152368
14024	NC_017310	GAG	2	6	616310	616315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152368
14025	NC_017310	CGT	2	6	616450	616455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14026	NC_017310	GT	3	6	616477	616482	0 %	50 %	50 %	0 %	387152368
14027	NC_017310	GGGC	2	8	616488	616495	0 %	0 %	75 %	25 %	387152368
14028	NC_017310	GAC	2	6	616514	616519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14029	NC_017310	GT	3	6	616536	616541	0 %	50 %	50 %	0 %	387152368
14030	NC_017310	GAT	2	6	616547	616552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152368
14031	NC_017310	ATG	2	6	616614	616619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152368
14032	NC_017310	GTT	2	6	616631	616636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152368
14033	NC_017310	CTG	2	6	616654	616659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14034	NC_017310	CTG	2	6	616688	616693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14035	NC_017310	TCG	2	6	616723	616728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14036	NC_017310	GT	3	6	616763	616768	0 %	50 %	50 %	0 %	387152368
14037	NC_017310	TGA	2	6	616789	616794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152368
14038	NC_017310	CAT	2	6	616864	616869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152368
14039	NC_017310	ACC	2	6	616886	616891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152368
14040	NC_017310	AGC	2	6	616959	616964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14041	NC_017310	AGG	2	6	617016	617021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152368
14042	NC_017310	TGT	2	6	617038	617043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152368
14043	NC_017310	GTCT	2	8	617107	617114	0 %	50 %	25 %	25 %	387152368
14044	NC_017310	GGT	2	6	617153	617158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152368
14045	NC_017310	CG	3	6	617177	617182	0 %	0 %	50 %	50 %	387152368
14046	NC_017310	TGC	2	6	617246	617251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14047	NC_017310	GCAG	2	8	617287	617294	25 %	0 %	50 %	25 %	387152368
14048	NC_017310	GCG	2	6	617301	617306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152368
14049	NC_017310	CGA	2	6	617398	617403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14050	NC_017310	TCGCG	2	10	617456	617465	0 %	20 %	40 %	40 %	387152368
14051	NC_017310	TGC	2	6	617502	617507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14052	NC_017310	TGA	2	6	617548	617553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152368
14053	NC_017310	GGC	2	6	617630	617635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152368
14054	NC_017310	GAC	2	6	617657	617662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14055	NC_017310	GAA	2	6	617672	617677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152368
14056	NC_017310	GAT	2	6	617684	617689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152368
14057	NC_017310	AGG	2	6	617731	617736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152368
14058	NC_017310	CCT	2	6	617743	617748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152368
14059	NC_017310	TCG	2	6	617766	617771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152368
14060	NC_017310	G	7	7	617859	617865	0 %	0 %	100 %	0 %	387152368
14061	NC_017310	CTT	2	6	617899	617904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152368
14062	NC_017310	ACGG	2	8	617909	617916	25 %	0 %	50 %	25 %	387152368
14063	NC_017310	GGCG	2	8	617917	617924	0 %	0 %	75 %	25 %	387152368
14064	NC_017310	GTCGG	2	10	617979	617988	0 %	20 %	60 %	20 %	387152368
14065	NC_017310	AG	3	6	618018	618023	50 %	0 %	50 %	0 %	387152368
14066	NC_017310	ACGA	2	8	618120	618127	50 %	0 %	25 %	25 %	387152368
14067	NC_017310	GAT	2	6	618143	618148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152368
14068	NC_017310	CGG	2	6	618259	618264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152368
14069	NC_017310	GAA	2	6	618302	618307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152368
14070	NC_017310	GGC	2	6	618376	618381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152368
14071	NC_017310	CG	3	6	618462	618467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14072	NC_017310	GGC	2	6	618527	618532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_017310	TGTTT	2	10	618609	618618	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_017310	TTTTC	2	10	618625	618634	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14075	NC_017310	GCTT	2	8	618650	618657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14076	NC_017310	ATG	2	6	618729	618734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152369
14077	NC_017310	GTC	3	9	618803	618811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152369
14078	NC_017310	GTCGAG	2	12	618944	618955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387152369
14079	NC_017310	CTT	2	6	619067	619072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152369
14080	NC_017310	GT	3	6	619077	619082	0 %	50 %	50 %	0 %	387152369
14081	NC_017310	AGT	2	6	619128	619133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152369
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14083	NC_017310	GCTG	2	8	619287	619294	0 %	25 %	50 %	25 %	387152370
14084	NC_017310	CGG	2	6	619366	619371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152370
14085	NC_017310	GAC	2	6	619405	619410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152370
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14087	NC_017310	TCA	2	6	619434	619439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152370
14088	NC_017310	GCT	2	6	619468	619473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152370
14089	NC_017310	CGTT	2	8	619509	619516	0 %	50 %	25 %	25 %	387152370
14090	NC_017310	TCA	2	6	619533	619538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152370
14091	NC_017310	GGC	2	6	619588	619593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152370
14092	NC_017310	GT	3	6	619602	619607	0 %	50 %	50 %	0 %	387152370
14093	NC_017310	CCA	2	6	619680	619685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152370
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14095	NC_017310	TGGG	2	8	619769	619776	0 %	25 %	75 %	0 %	387152370
14096	NC_017310	CGT	2	6	619876	619881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152370
14097	NC_017310	TCG	2	6	619902	619907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152370
14098	NC_017310	TTC	2	6	619910	619915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152370
14099	NC_017310	AC	3	6	619954	619959	50 %	0 %	0 %	50 %	387152370
14100	NC_017310	GCA	2	6	619968	619973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152370
14101	NC_017310	GTC	2	6	620029	620034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152370
14102	NC_017310	GCC	2	6	620156	620161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152370
14103	NC_017310	ATC	3	9	620222	620230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152370
14104	NC_017310	AAGG	2	8	620246	620253	50 %	0 %	50 %	0 %	387152370
14105	NC_017310	CGA	2	6	620294	620299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152371
14106	NC_017310	AAG	3	9	620301	620309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152371
14107	NC_017310	GCC	2	6	620349	620354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152371
14108	NC_017310	TCT	2	6	620359	620364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152371
14109	NC_017310	GTGC	2	8	620381	620388	0 %	25 %	50 %	25 %	387152371
14110	NC_017310	GCA	2	6	620432	620437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152371
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14112	NC_017310	CAA	2	6	620534	620539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152371
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14115	NC_017310	TGA	2	6	620707	620712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152372
14116	NC_017310	TGCG	2	8	620718	620725	0 %	25 %	50 %	25 %	387152372
14117	NC_017310	AGA	2	6	620728	620733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152372
14118	NC_017310	CATG	2	8	620863	620870	25 %	25 %	25 %	25 %	387152372
14119	NC_017310	GCC	2	6	620885	620890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152372
14120	NC_017310	CGA	2	6	620901	620906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152372
14121	NC_017310	GTG	2	6	620955	620960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152372
14122	NC_017310	TGG	2	6	620964	620969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152372
14123	NC_017310	GCC	2	6	620987	620992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152372
14124	NC_017310	GAT	2	6	621043	621048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152372
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14126	NC_017310	CTG	2	6	621095	621100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152372
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14130	NC_017310	GGC	2	6	621175	621180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14131	NC_017310	CT	3	6	621181	621186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14132	NC_017310	C	8	8	621223	621230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14133	NC_017310	GA	3	6	621253	621258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_017310	TGTAT	2	10	621311	621320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_017310	TTG	2	6	621346	621351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14141	NC_017310	GGA	2	6	621549	621554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14142	NC_017310	GGTT	2	8	621570	621577	0 %	50 %	50 %	0 %	387152373
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14224	NC_017310	ATG	2	6	624896	624901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152375
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14232	NC_017310	GCGCA	2	10	625425	625434	20 %	0 %	40 %	40 %	387152376
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14237	NC_017310	GGA	2	6	625667	625672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152376
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14363	NC_017310	GT	3	6	631905	631910	0 %	50 %	50 %	0 %	387152383
14364	NC_017310	ATCGA	2	10	631942	631951	40 %	20 %	20 %	20 %	387152383
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14412	NC_017310	CGG	2	6	634574	634579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14465	NC_017310	TGA	2	6	636729	636734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152389
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14468	NC_017310	GATG	2	8	636795	636802	25 %	25 %	50 %	0 %	387152389
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14470	NC_017310	GAT	2	6	636940	636945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152389
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14479	NC_017310	CACGAA	2	12	637282	637293	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387152389
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14481	NC_017310	CATGAA	2	12	637363	637374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387152389
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