MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017310	G	6	6	571700	571705	0 %	0 %	100 %	0 %	387152325
13003	NC_017310	CGT	2	6	571746	571751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152325
13004	NC_017310	GT	4	8	571760	571767	0 %	50 %	50 %	0 %	387152325
13005	NC_017310	CGT	2	6	571842	571847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152325
13006	NC_017310	CGC	2	6	571869	571874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152325
13007	NC_017310	GCC	2	6	571940	571945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152325
13008	NC_017310	GTGC	2	8	572075	572082	0 %	25 %	50 %	25 %	387152325
13009	NC_017310	CGT	2	6	572143	572148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152325
13010	NC_017310	TGC	2	6	572180	572185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152325
13011	NC_017310	CTT	2	6	572191	572196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152325
13012	NC_017310	G	6	6	572206	572211	0 %	0 %	100 %	0 %	387152325
13013	NC_017310	TCC	2	6	572237	572242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152325
13014	NC_017310	TGT	2	6	572307	572312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152325
13015	NC_017310	AGG	2	6	572382	572387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152325
13016	NC_017310	GTG	2	6	572393	572398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152325
13017	NC_017310	CTTC	2	8	572406	572413	0 %	50 %	0 %	50 %	387152325
13018	NC_017310	CAC	2	6	572431	572436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152325
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13020	NC_017310	GAC	2	6	572482	572487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152325
13021	NC_017310	TCG	2	6	572495	572500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152325
13022	NC_017310	GCGG	2	8	572506	572513	0 %	0 %	75 %	25 %	387152325
13023	NC_017310	GAGG	2	8	572515	572522	25 %	0 %	75 %	0 %	387152325
13024	NC_017310	GTC	2	6	572530	572535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152325
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13028	NC_017310	GCA	2	6	572727	572732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152325
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13030	NC_017310	CCAT	2	8	572837	572844	25 %	25 %	0 %	50 %	387152325
13031	NC_017310	GGGT	2	8	572901	572908	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_017310	GCGG	2	8	572916	572923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13033	NC_017310	G	6	6	572956	572961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_017310	CGTG	2	8	573072	573079	0 %	25 %	50 %	25 %	387152326
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13040	NC_017310	CCA	2	6	573421	573426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152327
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13044	NC_017310	CGG	3	9	573639	573647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152327
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13050	NC_017310	GCA	2	6	573890	573895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152327
13051	NC_017310	GCA	2	6	573902	573907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152327
13052	NC_017310	CGT	2	6	574011	574016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152327
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13057	NC_017310	GCT	2	6	574203	574208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152327
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13060	NC_017310	CGT	2	6	574286	574291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152327
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13072	NC_017310	GCCA	2	8	575068	575075	25 %	0 %	25 %	50 %	387152328
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13101	NC_017310	CGACCG	2	12	576726	576737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387152329
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13104	NC_017310	G	6	6	576849	576854	0 %	0 %	100 %	0 %	387152329
13105	NC_017310	GTG	2	6	576856	576861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152329
13106	NC_017310	TGC	2	6	577055	577060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152329
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13109	NC_017310	GC	3	6	577207	577212	0 %	0 %	50 %	50 %	387152329
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13232	NC_017310	G	6	6	581949	581954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_017310	C	6	6	581963	581968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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13240	NC_017310	T	6	6	582227	582232	0 %	100 %	0 %	0 %	387152333
13241	NC_017310	TCC	2	6	582260	582265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13242	NC_017310	CG	3	6	582357	582362	0 %	0 %	50 %	50 %	387152334
13243	NC_017310	CCA	2	6	582408	582413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152334
13244	NC_017310	CCT	2	6	582456	582461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152334
13245	NC_017310	CGTG	2	8	582501	582508	0 %	25 %	50 %	25 %	387152334
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13247	NC_017310	G	6	6	582832	582837	0 %	0 %	100 %	0 %	387152334
13248	NC_017310	CCT	2	6	582840	582845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152334
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13252	NC_017310	GTCG	2	8	582949	582956	0 %	25 %	50 %	25 %	387152334
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13256	NC_017310	TCT	3	9	583092	583100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152334
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13279	NC_017310	GCA	2	6	584542	584547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13360	NC_017310	GCG	2	6	587414	587419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152337
13361	NC_017310	GAT	2	6	587420	587425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152337
13362	NC_017310	GC	3	6	587426	587431	0 %	0 %	50 %	50 %	387152337
13363	NC_017310	CG	3	6	587466	587471	0 %	0 %	50 %	50 %	387152337
13364	NC_017310	CTT	2	6	587524	587529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152337
13365	NC_017310	GGC	2	6	587561	587566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152337
13366	NC_017310	CCT	2	6	587572	587577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152337
13367	NC_017310	TGG	2	6	587737	587742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152337
13368	NC_017310	TCG	2	6	587791	587796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152337
13369	NC_017310	CCG	2	6	587880	587885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152338
13370	NC_017310	CGC	2	6	587917	587922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152338
13371	NC_017310	TCG	2	6	587958	587963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152338
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13374	NC_017310	CGT	2	6	588106	588111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152339
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13379	NC_017310	ATCT	2	8	588353	588360	25 %	50 %	0 %	25 %	387152339
13380	NC_017310	CCAGC	2	10	588362	588371	20 %	0 %	20 %	60 %	387152339
13381	NC_017310	GTC	2	6	588428	588433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152339
13382	NC_017310	GAG	2	6	588449	588454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152339
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13387	NC_017310	TCACGC	2	12	588633	588644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387152339
13388	NC_017310	CGT	2	6	588709	588714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152339
13389	NC_017310	CGG	2	6	588732	588737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152339
13390	NC_017310	TCCT	2	8	588794	588801	0 %	50 %	0 %	50 %	387152339
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13392	NC_017310	CGC	2	6	588835	588840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152339
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13409	NC_017310	CGG	2	6	589417	589422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152340
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13468	NC_017310	CTGC	2	8	592210	592217	0 %	25 %	25 %	50 %	387152343
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13476	NC_017310	GCC	2	6	592520	592525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152343
13477	NC_017310	G	6	6	592539	592544	0 %	0 %	100 %	0 %	387152343
13478	NC_017310	GGGC	2	8	592621	592628	0 %	0 %	75 %	25 %	387152343
13479	NC_017310	GCAGG	2	10	592655	592664	20 %	0 %	60 %	20 %	387152343
13480	NC_017310	GAC	2	6	592676	592681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152343
13481	NC_017310	CGG	2	6	592695	592700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152343
13482	NC_017310	CGGA	2	8	592776	592783	25 %	0 %	50 %	25 %	387152343
13483	NC_017310	GTG	2	6	592862	592867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152343
13484	NC_017310	GGA	2	6	592883	592888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13485	NC_017310	GAT	2	6	592894	592899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152344
13486	NC_017310	GCC	2	6	592913	592918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152344
13487	NC_017310	TGC	2	6	592929	592934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152344
13488	NC_017310	CGC	2	6	592951	592956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152344
13489	NC_017310	GCA	2	6	592960	592965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152344
13490	NC_017310	GCCCC	2	10	592988	592997	0 %	0 %	20 %	80 %	387152344
13491	NC_017310	GGC	2	6	593020	593025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152344
13492	NC_017310	ACG	2	6	593049	593054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152344
13493	NC_017310	GCG	2	6	593089	593094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152344
13494	NC_017310	TCG	2	6	593121	593126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152344
13495	NC_017310	GCCAAG	2	12	593132	593143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152344
13496	NC_017310	CAA	2	6	593179	593184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152344
13497	NC_017310	GGACA	2	10	593207	593216	40 %	0 %	40 %	20 %	387152344
13498	NC_017310	GGC	2	6	593384	593389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152344
13499	NC_017310	GC	4	8	593406	593413	0 %	0 %	50 %	50 %	387152344
13500	NC_017310	CG	3	6	593418	593423	0 %	0 %	50 %	50 %	387152344

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