MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017310	GC	3	6	550154	550159	0 %	0 %	50 %	50 %	387152309
12502	NC_017310	GCC	2	6	550184	550189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152309
12503	NC_017310	CG	3	6	550216	550221	0 %	0 %	50 %	50 %	387152309
12504	NC_017310	GCG	2	6	550258	550263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152309
12505	NC_017310	GAC	2	6	550285	550290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152309
12506	NC_017310	GAC	2	6	550414	550419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152309
12507	NC_017310	CTC	2	6	550444	550449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152309
12508	NC_017310	ACCCG	2	10	550512	550521	20 %	0 %	20 %	60 %	387152309
12509	NC_017310	TGC	2	6	550569	550574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152309
12510	NC_017310	GAT	2	6	550597	550602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152309
12511	NC_017310	GCGGG	2	10	550629	550638	0 %	0 %	80 %	20 %	387152309
12512	NC_017310	TTG	2	6	550693	550698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_017310	ATG	2	6	550709	550714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152310
12514	NC_017310	CGA	2	6	550756	550761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152310
12515	NC_017310	GCG	2	6	550876	550881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152310
12516	NC_017310	TGA	2	6	550897	550902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152310
12517	NC_017310	CTG	2	6	551045	551050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152310
12518	NC_017310	AC	3	6	551058	551063	50 %	0 %	0 %	50 %	387152310
12519	NC_017310	CAT	2	6	551068	551073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152310
12520	NC_017310	TGC	2	6	551112	551117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152310
12521	NC_017310	GC	3	6	551116	551121	0 %	0 %	50 %	50 %	387152310
12522	NC_017310	TGCG	2	8	551170	551177	0 %	25 %	50 %	25 %	387152310
12523	NC_017310	TGCG	2	8	551236	551243	0 %	25 %	50 %	25 %	387152310
12524	NC_017310	CCG	2	6	551312	551317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152310
12525	NC_017310	TGTC	2	8	551376	551383	0 %	50 %	25 %	25 %	387152310
12526	NC_017310	GCCGTT	2	12	551422	551433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152310
12527	NC_017310	GCA	2	6	551477	551482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_017310	GGC	2	6	551517	551522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_017310	CGG	2	6	551554	551559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_017310	TCG	4	12	551747	551758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152311
12531	NC_017310	CCA	2	6	551768	551773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152311
12532	NC_017310	GAA	2	6	551784	551789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152311
12533	NC_017310	CGC	2	6	551800	551805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152311
12534	NC_017310	TGC	2	6	551846	551851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152311
12535	NC_017310	GTG	2	6	551881	551886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152311
12536	NC_017310	CCA	2	6	551906	551911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152311
12537	NC_017310	AAC	2	6	551941	551946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152311
12538	NC_017310	TGT	2	6	551963	551968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152311
12539	NC_017310	TCA	2	6	551999	552004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152311
12540	NC_017310	CAG	2	6	552009	552014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152311
12541	NC_017310	CGA	3	9	552051	552059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152311
12542	NC_017310	ACC	2	6	552061	552066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152311
12543	NC_017310	TGC	2	6	552068	552073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152311
12544	NC_017310	AGC	2	6	552107	552112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152311
12545	NC_017310	TTC	2	6	552169	552174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152311
12546	NC_017310	AGG	2	6	552251	552256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152311
12547	NC_017310	TGG	2	6	552352	552357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152311
12548	NC_017310	GC	3	6	552409	552414	0 %	0 %	50 %	50 %	387152311
12549	NC_017310	AAC	2	6	552491	552496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152311
12550	NC_017310	CCA	2	6	552527	552532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152311
12551	NC_017310	GGA	2	6	552579	552584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152311
12552	NC_017310	CGC	2	6	552615	552620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152311
12553	NC_017310	G	6	6	552639	552644	0 %	0 %	100 %	0 %	387152311
12554	NC_017310	TGC	2	6	552672	552677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_017310	ATCG	2	8	552678	552685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12556	NC_017310	CGT	2	6	552825	552830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152312
12557	NC_017310	GTG	2	6	552839	552844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152312
12558	NC_017310	GC	3	6	552892	552897	0 %	0 %	50 %	50 %	387152312
12559	NC_017310	CGT	2	6	552909	552914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152312
12560	NC_017310	GGGA	2	8	552943	552950	25 %	0 %	75 %	0 %	387152312
12561	NC_017310	GGAT	2	8	552983	552990	25 %	25 %	50 %	0 %	387152312
12562	NC_017310	GTG	2	6	553034	553039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152312
12563	NC_017310	AGC	2	6	553049	553054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152312
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12565	NC_017310	CAT	2	6	553150	553155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152312
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12569	NC_017310	GGC	2	6	553258	553263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152312
12570	NC_017310	TCG	2	6	553370	553375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152312
12571	NC_017310	CTG	2	6	553405	553410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152312
12572	NC_017310	CGA	2	6	553449	553454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152312
12573	NC_017310	GTCGG	2	10	553486	553495	0 %	20 %	60 %	20 %	387152312
12574	NC_017310	GCC	2	6	553540	553545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152312
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12585	NC_017310	CGC	2	6	554010	554015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152312
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12587	NC_017310	GAT	2	6	554068	554073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152312
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12589	NC_017310	CGA	2	6	554136	554141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152312
12590	NC_017310	CG	3	6	554146	554151	0 %	0 %	50 %	50 %	387152312
12591	NC_017310	TCG	2	6	554159	554164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152312
12592	NC_017310	CGT	2	6	554191	554196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152312
12593	NC_017310	GAT	2	6	554226	554231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12595	NC_017310	GAA	2	6	554309	554314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017310	CGC	2	6	554322	554327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12597	NC_017310	CGGG	2	8	554382	554389	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12598	NC_017310	GGAC	2	8	554440	554447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12599	NC_017310	GGC	2	6	554460	554465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_017310	GCCA	2	8	554602	554609	25 %	0 %	25 %	50 %	387152313
12601	NC_017310	GCCT	2	8	554652	554659	0 %	25 %	25 %	50 %	387152313
12602	NC_017310	CAT	2	6	554679	554684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152313
12603	NC_017310	GTC	2	6	554694	554699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152313
12604	NC_017310	GCG	2	6	554709	554714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152313
12605	NC_017310	AGGA	2	8	554734	554741	50 %	0 %	50 %	0 %	387152313
12606	NC_017310	GTC	3	9	554832	554840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152313
12607	NC_017310	GCCA	2	8	554913	554920	25 %	0 %	25 %	50 %	387152313
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12610	NC_017310	GCA	2	6	554945	554950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152313
12611	NC_017310	GCG	2	6	554962	554967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152313
12612	NC_017310	CGA	2	6	554975	554980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152313
12613	NC_017310	TCG	2	6	555079	555084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152313
12614	NC_017310	GTC	2	6	555204	555209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152313
12615	NC_017310	ATG	2	6	555269	555274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152313
12616	NC_017310	GCG	2	6	555343	555348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152313
12617	NC_017310	TGC	2	6	555399	555404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152313
12618	NC_017310	G	6	6	555408	555413	0 %	0 %	100 %	0 %	387152313
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12620	NC_017310	GCC	2	6	555508	555513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152313
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12622	NC_017310	TCG	2	6	555559	555564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152313
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12724	NC_017310	TGG	2	6	559170	559175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12731	NC_017310	GCGG	2	8	559464	559471	0 %	0 %	75 %	25 %	387152317
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12735	NC_017310	TCG	2	6	559654	559659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152317
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12738	NC_017310	GCG	3	9	559802	559810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152318
12739	NC_017310	GTC	2	6	559813	559818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152318
12740	NC_017310	GCCC	2	8	559845	559852	0 %	0 %	25 %	75 %	387152318
12741	NC_017310	GGC	2	6	559978	559983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152318
12742	NC_017310	CAC	3	9	559984	559992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152318
12743	NC_017310	GGC	2	6	560037	560042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152318
12744	NC_017310	ATG	2	6	560060	560065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152318
12745	NC_017310	AGC	2	6	560093	560098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152318
12746	NC_017310	CGG	3	9	560151	560159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152318
12747	NC_017310	TCA	3	9	560160	560168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152318
12748	NC_017310	GAT	2	6	560245	560250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152318
12749	NC_017310	TCA	2	6	560252	560257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152318
12750	NC_017310	GGGGC	2	10	560279	560288	0 %	0 %	80 %	20 %	387152318
12751	NC_017310	GCC	2	6	560302	560307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152318
12752	NC_017310	GGGCAG	2	12	560359	560370	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	387152318
12753	NC_017310	CGA	2	6	560430	560435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152318
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12760	NC_017310	CGG	2	6	560628	560633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152318
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12769	NC_017310	GGA	2	6	560995	561000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12770	NC_017310	CGG	2	6	561101	561106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12771	NC_017310	CAT	2	6	561130	561135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12772	NC_017310	CGA	2	6	561182	561187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152319
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12800	NC_017310	CTGGT	2	10	562516	562525	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12801	NC_017310	GGC	2	6	562546	562551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12802	NC_017310	GC	3	6	562562	562567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12803	NC_017310	AGGT	2	8	562683	562690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12804	NC_017310	AGTG	2	8	562770	562777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12805	NC_017310	TCG	2	6	562793	562798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12807	NC_017310	GTC	2	6	562954	562959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12814	NC_017310	CGA	2	6	563161	563166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12821	NC_017310	CGG	2	6	563380	563385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12831	NC_017310	TTC	2	6	563942	563947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12855	NC_017310	CGG	2	6	565516	565521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152320
12856	NC_017310	GC	3	6	565624	565629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12857	NC_017310	TCTG	2	8	565692	565699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12858	NC_017310	TG	3	6	565765	565770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12859	NC_017310	G	6	6	565839	565844	0 %	0 %	100 %	0 %	387152321
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12980	NC_017310	CGG	2	6	570918	570923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152325
12981	NC_017310	CCT	2	6	570933	570938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152325
12982	NC_017310	TGC	2	6	570959	570964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152325
12983	NC_017310	TCG	2	6	570968	570973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152325
12984	NC_017310	GGC	2	6	570979	570984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152325
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12991	NC_017310	TG	3	6	571427	571432	0 %	50 %	50 %	0 %	387152325
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