MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_017310	TCA	2	6	526896	526901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152288
12003	NC_017310	GCC	2	6	526976	526981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152288
12004	NC_017310	GCG	2	6	527048	527053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152288
12005	NC_017310	GAG	2	6	527099	527104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152288
12006	NC_017310	CGC	2	6	527108	527113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152288
12007	NC_017310	GCGTC	2	10	527165	527174	0 %	20 %	40 %	40 %	387152288
12008	NC_017310	GAT	2	6	527222	527227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152288
12009	NC_017310	AGCA	2	8	527270	527277	50 %	0 %	25 %	25 %	387152288
12010	NC_017310	GCG	2	6	527307	527312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152288
12011	NC_017310	GGC	2	6	527402	527407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12012	NC_017310	CTGC	2	8	527480	527487	0 %	25 %	25 %	50 %	387152289
12013	NC_017310	TCG	2	6	527636	527641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_017310	GTC	2	6	527679	527684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_017310	GC	3	6	527737	527742	0 %	0 %	50 %	50 %	387152290
12016	NC_017310	GGC	2	6	527779	527784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152290
12017	NC_017310	CTT	2	6	527787	527792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152290
12018	NC_017310	TCTT	2	8	527826	527833	0 %	75 %	0 %	25 %	387152290
12019	NC_017310	CTT	2	6	527863	527868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152290
12020	NC_017310	CCCTG	2	10	527998	528007	0 %	20 %	20 %	60 %	387152290
12021	NC_017310	CGTG	3	12	528103	528114	0 %	25 %	50 %	25 %	387152290
12022	NC_017310	CGG	2	6	528321	528326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152290
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12026	NC_017310	GCT	2	6	528391	528396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152290
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12029	NC_017310	CTG	2	6	528554	528559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152291
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12041	NC_017310	TCG	2	6	529227	529232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152291
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12050	NC_017310	GGC	2	6	529574	529579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12051	NC_017310	GCC	2	6	529585	529590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12052	NC_017310	C	6	6	529742	529747	0 %	0 %	0 %	100 %	387152292
12053	NC_017310	CG	3	6	529878	529883	0 %	0 %	50 %	50 %	387152292
12054	NC_017310	GGC	2	6	529929	529934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152292
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12074	NC_017310	TGCG	2	8	530904	530911	0 %	25 %	50 %	25 %	387152292
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12089	NC_017310	GCG	2	6	531543	531548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12090	NC_017310	GACGT	2	10	531581	531590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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12092	NC_017310	GT	3	6	531706	531711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12093	NC_017310	GGT	2	6	531714	531719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12094	NC_017310	T	6	6	531772	531777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12101	NC_017310	GCC	2	6	532114	532119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12102	NC_017310	CAG	2	6	532153	532158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12103	NC_017310	GCG	2	6	532171	532176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12104	NC_017310	GC	3	6	532199	532204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12105	NC_017310	CAA	2	6	532207	532212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12106	NC_017310	CAT	2	6	532232	532237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152294
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12109	NC_017310	TGG	2	6	532345	532350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152294
12110	NC_017310	GGC	2	6	532383	532388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152294
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12113	NC_017310	CCA	2	6	532627	532632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152294
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12116	NC_017310	GGT	2	6	532712	532717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152294
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12119	NC_017310	CCGT	2	8	532891	532898	0 %	25 %	25 %	50 %	387152294
12120	NC_017310	GCCC	2	8	532944	532951	0 %	0 %	25 %	75 %	387152294
12121	NC_017310	GCCATC	2	12	533010	533021	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387152294
12122	NC_017310	AGG	2	6	533082	533087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152295
12123	NC_017310	CAT	2	6	533122	533127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152295
12124	NC_017310	CGA	2	6	533185	533190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152295
12125	NC_017310	GAG	3	9	533228	533236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152295
12126	NC_017310	GCC	2	6	533244	533249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152295
12127	NC_017310	CGC	2	6	533251	533256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152295
12128	NC_017310	GTG	2	6	533267	533272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152295
12129	NC_017310	ATC	2	6	533291	533296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152295
12130	NC_017310	CTG	2	6	533309	533314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152295
12131	NC_017310	GCT	2	6	533369	533374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152295
12132	NC_017310	GTG	3	9	533402	533410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152295
12133	NC_017310	CCG	2	6	533487	533492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152295
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12135	NC_017310	GCT	2	6	533551	533556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152295
12136	NC_017310	GGGCA	2	10	533564	533573	20 %	0 %	60 %	20 %	387152295
12137	NC_017310	GCG	2	6	533642	533647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152295
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12139	NC_017310	GAA	2	6	533720	533725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152295
12140	NC_017310	CGA	2	6	533769	533774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152295
12141	NC_017310	TGC	2	6	533817	533822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152295
12142	NC_017310	GC	3	6	533831	533836	0 %	0 %	50 %	50 %	387152295
12143	NC_017310	GC	3	6	533893	533898	0 %	0 %	50 %	50 %	387152295
12144	NC_017310	GTG	2	6	533918	533923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152295
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12151	NC_017310	TCG	2	6	534295	534300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152296
12152	NC_017310	CTGC	2	8	534570	534577	0 %	25 %	25 %	50 %	387152296
12153	NC_017310	CGG	3	9	534584	534592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152296
12154	NC_017310	GCG	2	6	534644	534649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152296
12155	NC_017310	TGCG	2	8	534656	534663	0 %	25 %	50 %	25 %	387152296
12156	NC_017310	CAT	2	6	534681	534686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152296
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12159	NC_017310	GCC	3	9	534739	534747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152296
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12174	NC_017310	GCA	2	6	535266	535271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152297
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12179	NC_017310	GC	3	6	535361	535366	0 %	0 %	50 %	50 %	387152297
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12187	NC_017310	CGT	2	6	535751	535756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152297
12188	NC_017310	GCAG	2	8	535929	535936	25 %	0 %	50 %	25 %	387152297
12189	NC_017310	CGC	2	6	535979	535984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152297
12190	NC_017310	TGG	2	6	536110	536115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152297
12191	NC_017310	GGC	2	6	536183	536188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152297
12192	NC_017310	GGC	2	6	536192	536197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152297
12193	NC_017310	GTC	2	6	536217	536222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152297
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12203	NC_017310	GCT	2	6	536719	536724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152298
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12207	NC_017310	GCC	3	9	536975	536983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152298
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12209	NC_017310	CCGT	2	8	537168	537175	0 %	25 %	25 %	50 %	387152298
12210	NC_017310	CGTTC	2	10	537177	537186	0 %	40 %	20 %	40 %	387152298
12211	NC_017310	CCG	2	6	537204	537209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152298
12212	NC_017310	TCG	2	6	537225	537230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152298
12213	NC_017310	TGG	3	9	537242	537250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152298
12214	NC_017310	CGCA	2	8	537251	537258	25 %	0 %	25 %	50 %	387152298
12215	NC_017310	TGA	2	6	537259	537264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152298
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12217	NC_017310	GTT	2	6	537310	537315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12218	NC_017310	CTCC	2	8	537325	537332	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12219	NC_017310	CTTTTT	2	12	537345	537356	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12220	NC_017310	GAG	2	6	537406	537411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12221	NC_017310	GAC	2	6	537427	537432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152299
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12225	NC_017310	GGGCA	2	10	537694	537703	20 %	0 %	60 %	20 %	387152299
12226	NC_017310	GGAC	2	8	537726	537733	25 %	0 %	50 %	25 %	387152299
12227	NC_017310	CAT	2	6	537750	537755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152299
12228	NC_017310	CTTC	2	8	537765	537772	0 %	50 %	0 %	50 %	387152299
12229	NC_017310	GGC	2	6	537794	537799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152299
12230	NC_017310	GCGT	2	8	537869	537876	0 %	25 %	50 %	25 %	387152299
12231	NC_017310	GCG	2	6	537885	537890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152299
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12235	NC_017310	CG	3	6	538174	538179	0 %	0 %	50 %	50 %	387152299
12236	NC_017310	CGA	2	6	538185	538190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152299
12237	NC_017310	GC	3	6	538203	538208	0 %	0 %	50 %	50 %	387152299
12238	NC_017310	GAT	2	6	538227	538232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152299
12239	NC_017310	GGT	2	6	538254	538259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152299
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12241	NC_017310	GCT	2	6	538374	538379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152299
12242	NC_017310	TCG	2	6	538384	538389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152299
12243	NC_017310	GCA	2	6	538409	538414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152299
12244	NC_017310	CG	3	6	538454	538459	0 %	0 %	50 %	50 %	387152299
12245	NC_017310	CG	3	6	538479	538484	0 %	0 %	50 %	50 %	387152299
12246	NC_017310	CGG	2	6	538490	538495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152299
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12353	NC_017310	GGC	2	6	542970	542975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152304
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12360	NC_017310	GGC	2	6	543378	543383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152304
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12362	NC_017310	AGGCA	2	10	543461	543470	40 %	0 %	40 %	20 %	387152304
12363	NC_017310	GGC	2	6	543511	543516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152305
12364	NC_017310	CGG	2	6	543546	543551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152305
12365	NC_017310	CGA	2	6	543558	543563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152305
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12370	NC_017310	CGCTG	2	10	543705	543714	0 %	20 %	40 %	40 %	387152305
12371	NC_017310	GGAC	2	8	543721	543728	25 %	0 %	50 %	25 %	387152305
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12382	NC_017310	GGC	2	6	544255	544260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12383	NC_017310	GCC	2	6	544267	544272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12384	NC_017310	TGT	2	6	544281	544286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12386	NC_017310	GC	3	6	544349	544354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12387	NC_017310	TGA	2	6	544463	544468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12391	NC_017310	TGC	2	6	544661	544666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12393	NC_017310	CAT	2	6	544769	544774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12422	NC_017310	ACG	2	6	546187	546192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12485	NC_017310	TCG	2	6	549287	549292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152309
12486	NC_017310	GGC	2	6	549372	549377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152309
12487	NC_017310	GGCG	2	8	549396	549403	0 %	0 %	75 %	25 %	387152309
12488	NC_017310	CTT	2	6	549411	549416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152309
12489	NC_017310	ACG	2	6	549486	549491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152309
12490	NC_017310	CGTGA	2	10	549574	549583	20 %	20 %	40 %	20 %	387152309
12491	NC_017310	CAT	2	6	549594	549599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152309
12492	NC_017310	TC	3	6	549666	549671	0 %	50 %	0 %	50 %	387152309
12493	NC_017310	TAC	2	6	549700	549705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152309
12494	NC_017310	CG	3	6	549744	549749	0 %	0 %	50 %	50 %	387152309
12495	NC_017310	CTT	2	6	549888	549893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152309
12496	NC_017310	GGC	2	6	549951	549956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152309
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12499	NC_017310	CAGG	2	8	550108	550115	25 %	0 %	50 %	25 %	387152309
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