MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017310	G	7	7	458553	458559	0 %	0 %	100 %	0 %	387152240
10502	NC_017310	ACGC	2	8	458565	458572	25 %	0 %	25 %	50 %	387152240
10503	NC_017310	GCG	2	6	458602	458607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152240
10504	NC_017310	TGGC	2	8	458774	458781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10505	NC_017310	TCG	2	6	458870	458875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_017310	TGCC	2	8	458916	458923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10507	NC_017310	CGC	2	6	458993	458998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10508	NC_017310	TCCA	2	8	459132	459139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10509	NC_017310	GCCCT	2	10	459153	459162	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10510	NC_017310	CATGCG	2	12	459193	459204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_017310	GGC	2	6	459264	459269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152241
10512	NC_017310	CAGC	2	8	459309	459316	25 %	0 %	25 %	50 %	387152241
10513	NC_017310	TGA	2	6	459347	459352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152241
10514	NC_017310	AGA	2	6	459437	459442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152241
10515	NC_017310	GGT	2	6	459468	459473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152241
10516	NC_017310	GCA	3	9	459509	459517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152241
10517	NC_017310	CCG	2	6	459548	459553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152241
10518	NC_017310	GA	4	8	459560	459567	50 %	0 %	50 %	0 %	387152241
10519	NC_017310	CTT	2	6	459579	459584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152241
10520	NC_017310	GGC	2	6	459600	459605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152241
10521	NC_017310	CGATGC	2	12	459719	459730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387152241
10522	NC_017310	TGC	2	6	459765	459770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152241
10523	NC_017310	GTT	2	6	459792	459797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152241
10524	NC_017310	GC	3	6	459814	459819	0 %	0 %	50 %	50 %	387152241
10525	NC_017310	GAA	2	6	459846	459851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152241
10526	NC_017310	AGC	2	6	459889	459894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152241
10527	NC_017310	CGT	2	6	459946	459951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152241
10528	NC_017310	AGA	2	6	460058	460063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152241
10529	NC_017310	GCG	2	6	460066	460071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152241
10530	NC_017310	TAT	2	6	460136	460141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_017310	TTG	2	6	460170	460175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_017310	TCG	2	6	460193	460198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_017310	ACG	2	6	460297	460302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_017310	AGG	2	6	460326	460331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_017310	GCC	2	6	460353	460358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152242
10536	NC_017310	GCAA	2	8	460423	460430	50 %	0 %	25 %	25 %	387152242
10537	NC_017310	GCC	2	6	460512	460517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152242
10538	NC_017310	CAT	2	6	460622	460627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152242
10539	NC_017310	GGC	2	6	460643	460648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152242
10540	NC_017310	TGG	2	6	460870	460875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152242
10541	NC_017310	ATG	2	6	460900	460905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152242
10542	NC_017310	CCG	2	6	460906	460911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152242
10543	NC_017310	GCAA	2	8	460933	460940	50 %	0 %	25 %	25 %	387152242
10544	NC_017310	TTC	2	6	460995	461000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_017310	A	7	7	461004	461010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_017310	CG	3	6	461011	461016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10547	NC_017310	TTG	2	6	461017	461022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_017310	CGA	2	6	461102	461107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10549	NC_017310	GGC	2	6	461171	461176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152243
10550	NC_017310	GTC	2	6	461268	461273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10551	NC_017310	GAG	2	6	461286	461291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152243
10552	NC_017310	TCG	2	6	461311	461316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10553	NC_017310	GAA	2	6	461337	461342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152243
10554	NC_017310	GCG	2	6	461357	461362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152243
10555	NC_017310	TGA	2	6	461422	461427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152243
10556	NC_017310	GC	3	6	461438	461443	0 %	0 %	50 %	50 %	387152243
10557	NC_017310	CTC	2	6	461448	461453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152243
10558	NC_017310	TCGAGG	2	12	461488	461499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387152243
10559	NC_017310	CACG	2	8	461500	461507	25 %	0 %	25 %	50 %	387152243
10560	NC_017310	GGA	2	6	461558	461563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152243
10561	NC_017310	CAA	2	6	461648	461653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152243
10562	NC_017310	AGA	2	6	461686	461691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152243
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10564	NC_017310	GCT	2	6	461969	461974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10565	NC_017310	GGGC	2	8	462017	462024	0 %	0 %	75 %	25 %	387152243
10566	NC_017310	CTG	2	6	462039	462044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10567	NC_017310	CGA	2	6	462056	462061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10568	NC_017310	GCT	2	6	462107	462112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10569	NC_017310	GCA	2	6	462120	462125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10570	NC_017310	TCG	2	6	462133	462138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10571	NC_017310	TGG	2	6	462142	462147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152243
10572	NC_017310	CTC	2	6	462195	462200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152243
10573	NC_017310	GCC	2	6	462219	462224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152243
10574	NC_017310	CGT	2	6	462237	462242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10575	NC_017310	TGTCCG	2	12	462268	462279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10576	NC_017310	CGC	2	6	462341	462346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152243
10577	NC_017310	TGC	2	6	462360	462365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
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10579	NC_017310	CGC	2	6	462422	462427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152243
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10581	NC_017310	TCG	2	6	462640	462645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10582	NC_017310	TGC	2	6	462661	462666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10583	NC_017310	ATGC	2	8	462684	462691	25 %	25 %	25 %	25 %	387152243
10584	NC_017310	GGC	2	6	462709	462714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152243
10585	NC_017310	GCT	2	6	462809	462814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10586	NC_017310	ATG	2	6	462840	462845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152243
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10588	NC_017310	CGA	2	6	462911	462916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10589	NC_017310	CTA	2	6	462941	462946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152243
10590	NC_017310	GATC	2	8	462977	462984	25 %	25 %	25 %	25 %	387152243
10591	NC_017310	GTTC	2	8	462985	462992	0 %	50 %	25 %	25 %	387152243
10592	NC_017310	CCA	2	6	463024	463029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152243
10593	NC_017310	GGT	2	6	463040	463045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152243
10594	NC_017310	TCGGCA	2	12	463063	463074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387152243
10595	NC_017310	CTA	2	6	463148	463153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152243
10596	NC_017310	TGGA	2	8	463191	463198	25 %	25 %	50 %	0 %	387152243
10597	NC_017310	GAC	2	6	463378	463383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_017310	TG	3	6	463428	463433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_017310	TTG	2	6	463522	463527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152244
10600	NC_017310	CGT	2	6	463561	463566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152244
10601	NC_017310	CTTGC	2	10	463581	463590	0 %	40 %	20 %	40 %	387152244
10602	NC_017310	AGG	2	6	463666	463671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152244
10603	NC_017310	CGTTCG	2	12	463672	463683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152244
10604	NC_017310	GCA	2	6	463699	463704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152244
10605	NC_017310	GCG	2	6	463717	463722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152244
10606	NC_017310	GA	4	8	463746	463753	50 %	0 %	50 %	0 %	387152244
10607	NC_017310	TCG	2	6	463759	463764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152244
10608	NC_017310	GGT	2	6	463782	463787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152244
10609	NC_017310	ACC	2	6	463982	463987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152245
10610	NC_017310	CGCA	2	8	464003	464010	25 %	0 %	25 %	50 %	387152245
10611	NC_017310	GTC	2	6	464081	464086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152245
10612	NC_017310	GA	3	6	464158	464163	50 %	0 %	50 %	0 %	387152245
10613	NC_017310	TCG	2	6	464217	464222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152245
10614	NC_017310	CCT	2	6	464407	464412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10615	NC_017310	CAG	2	6	464524	464529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_017310	AG	3	6	464528	464533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_017310	CAG	2	6	464544	464549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_017310	GGT	2	6	464583	464588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152246
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10620	NC_017310	GGT	2	6	464740	464745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152246
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10859	NC_017310	ACG	2	6	474483	474488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152252
10860	NC_017310	CTA	2	6	474493	474498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152252
10861	NC_017310	CAT	2	6	474580	474585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152252
10862	NC_017310	CTA	2	6	474667	474672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152252
10863	NC_017310	TAC	2	6	474887	474892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152252
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10869	NC_017310	CAT	2	6	475264	475269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10872	NC_017310	TG	3	6	475426	475431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10873	NC_017310	TCA	2	6	475463	475468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152253
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10980	NC_017310	CAG	2	6	480936	480941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152258
10981	NC_017310	CCT	2	6	480968	480973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152258
10982	NC_017310	CAG	2	6	480996	481001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152258
10983	NC_017310	CGT	2	6	481031	481036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152258
10984	NC_017310	CCT	2	6	481061	481066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152258
10985	NC_017310	TCG	2	6	481126	481131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152258
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10987	NC_017310	CGTT	2	8	481303	481310	0 %	50 %	25 %	25 %	387152258
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10991	NC_017310	CGA	2	6	481463	481468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152258
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