MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017310	AGG	2	6	436946	436951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152218
10002	NC_017310	CGA	2	6	436974	436979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152218
10003	NC_017310	ATG	2	6	436997	437002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152218
10004	NC_017310	TTG	2	6	437102	437107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_017310	TG	3	6	437150	437155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_017310	CAG	2	6	437167	437172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_017310	AGA	2	6	437266	437271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_017310	TGCA	2	8	437272	437279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10009	NC_017310	T	7	7	437305	437311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_017310	A	9	9	437338	437346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_017310	GAA	2	6	437350	437355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_017310	ATG	2	6	437595	437600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_017310	AGG	2	6	437617	437622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_017310	TCA	2	6	437624	437629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152219
10015	NC_017310	CCG	2	6	437651	437656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152219
10016	NC_017310	GAG	2	6	437728	437733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152219
10017	NC_017310	CCAT	2	8	437739	437746	25 %	25 %	0 %	50 %	387152219
10018	NC_017310	GTG	3	9	437758	437766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152219
10019	NC_017310	G	6	6	437797	437802	0 %	0 %	100 %	0 %	387152219
10020	NC_017310	TGCC	2	8	437832	437839	0 %	25 %	25 %	50 %	387152219
10021	NC_017310	GTC	2	6	437908	437913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152219
10022	NC_017310	GGCT	2	8	437971	437978	0 %	25 %	50 %	25 %	387152219
10023	NC_017310	GCC	2	6	438003	438008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152219
10024	NC_017310	CT	3	6	438149	438154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_017310	CTT	2	6	438161	438166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_017310	GCG	2	6	438273	438278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_017310	GTGGCG	2	12	438342	438353	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10028	NC_017310	CCG	2	6	438356	438361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_017310	GCC	2	6	438422	438427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152220
10030	NC_017310	TTG	2	6	438477	438482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152220
10031	NC_017310	CTG	2	6	438513	438518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152220
10032	NC_017310	CGCC	2	8	438640	438647	0 %	0 %	25 %	75 %	387152220
10033	NC_017310	TGGC	2	8	438717	438724	0 %	25 %	50 %	25 %	387152220
10034	NC_017310	GCG	2	6	438758	438763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152220
10035	NC_017310	ATG	2	6	438768	438773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152220
10036	NC_017310	G	6	6	438818	438823	0 %	0 %	100 %	0 %	387152220
10037	NC_017310	GCC	2	6	438839	438844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152220
10038	NC_017310	ATG	2	6	438858	438863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152220
10039	NC_017310	GC	3	6	438926	438931	0 %	0 %	50 %	50 %	387152220
10040	NC_017310	ATG	2	6	438965	438970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_017310	GTG	2	6	438981	438986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_017310	AT	3	6	439057	439062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_017310	CAA	2	6	439098	439103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_017310	CGGCA	2	10	439127	439136	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10045	NC_017310	GTG	2	6	439144	439149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_017310	AGGA	2	8	439177	439184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017310	CGT	2	6	439216	439221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152221
10048	NC_017310	GAAGA	2	10	439262	439271	60 %	0 %	40 %	0 %	387152221
10049	NC_017310	CCG	2	6	439335	439340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152221
10050	NC_017310	GCC	2	6	439370	439375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152221
10051	NC_017310	CTG	2	6	439433	439438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152221
10052	NC_017310	GAA	2	6	439441	439446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152221
10053	NC_017310	CG	3	6	439483	439488	0 %	0 %	50 %	50 %	387152221
10054	NC_017310	AAG	2	6	439490	439495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152221
10055	NC_017310	AAG	2	6	439547	439552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152221
10056	NC_017310	AAG	3	9	439589	439597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152221
10057	NC_017310	CGC	2	6	439732	439737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152221
10058	NC_017310	CCG	2	6	439755	439760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152221
10059	NC_017310	CGC	3	9	439765	439773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152221
10060	NC_017310	AAG	2	6	439775	439780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152221
10061	NC_017310	GCT	2	6	439882	439887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152221
10062	NC_017310	GCA	2	6	439906	439911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152221
10063	NC_017310	AGA	2	6	439932	439937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152221
10064	NC_017310	T	6	6	440010	440015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_017310	AGG	2	6	440056	440061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_017310	ACC	2	6	440068	440073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_017310	CGG	2	6	440221	440226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152222
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10070	NC_017310	TCT	2	6	440301	440306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152222
10071	NC_017310	GCC	2	6	440384	440389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152222
10072	NC_017310	GGC	2	6	440446	440451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152222
10073	NC_017310	GCA	2	6	440487	440492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152222
10074	NC_017310	CGG	2	6	440658	440663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152222
10075	NC_017310	TCA	3	9	440676	440684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152222
10076	NC_017310	TGC	2	6	440703	440708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152222
10077	NC_017310	GTC	2	6	440828	440833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152223
10078	NC_017310	TCC	2	6	440837	440842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152223
10079	NC_017310	GGGC	2	8	440900	440907	0 %	0 %	75 %	25 %	387152223
10080	NC_017310	GC	3	6	440976	440981	0 %	0 %	50 %	50 %	387152223
10081	NC_017310	ACC	2	6	441062	441067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152223
10082	NC_017310	GCC	2	6	441127	441132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152223
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10085	NC_017310	CG	4	8	441234	441241	0 %	0 %	50 %	50 %	387152223
10086	NC_017310	TGC	2	6	441266	441271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152223
10087	NC_017310	CGA	2	6	441273	441278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152223
10088	NC_017310	TGG	2	6	441305	441310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152223
10089	NC_017310	G	6	6	441345	441350	0 %	0 %	100 %	0 %	387152223
10090	NC_017310	CA	3	6	441369	441374	50 %	0 %	0 %	50 %	387152223
10091	NC_017310	CG	3	6	441387	441392	0 %	0 %	50 %	50 %	387152223
10092	NC_017310	CAT	2	6	441432	441437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152223
10093	NC_017310	CGCC	2	8	441449	441456	0 %	0 %	25 %	75 %	387152223
10094	NC_017310	GAG	2	6	441523	441528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152223
10095	NC_017310	GCT	2	6	441530	441535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152223
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10098	NC_017310	CAT	2	6	441647	441652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152224
10099	NC_017310	GGCG	2	8	441695	441702	0 %	0 %	75 %	25 %	387152224
10100	NC_017310	ATC	2	6	441753	441758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152224
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10102	NC_017310	CAGG	2	8	441878	441885	25 %	0 %	50 %	25 %	387152224
10103	NC_017310	GGC	2	6	441896	441901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152224
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10105	NC_017310	CGT	2	6	441963	441968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152224
10106	NC_017310	ATC	2	6	441993	441998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152224
10107	NC_017310	TCA	2	6	442003	442008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152224
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10109	NC_017310	GGT	2	6	442064	442069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152224
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10111	NC_017310	GC	3	6	442074	442079	0 %	0 %	50 %	50 %	387152224
10112	NC_017310	TCG	2	6	442108	442113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152224
10113	NC_017310	CTA	2	6	442118	442123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152224
10114	NC_017310	CGT	2	6	442144	442149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152224
10115	NC_017310	CGA	3	9	442247	442255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152225
10116	NC_017310	CAT	2	6	442281	442286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152225
10117	NC_017310	GC	3	6	442356	442361	0 %	0 %	50 %	50 %	387152225
10118	NC_017310	CG	3	6	442451	442456	0 %	0 %	50 %	50 %	387152225
10119	NC_017310	GTG	2	6	442457	442462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152225
10120	NC_017310	GGA	2	6	442477	442482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152225
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10122	NC_017310	TCT	2	6	442625	442630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152225
10123	NC_017310	CCCG	2	8	442632	442639	0 %	0 %	25 %	75 %	387152225
10124	NC_017310	GGC	2	6	442669	442674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152225
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10127	NC_017310	TGC	2	6	442754	442759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152225
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10228	NC_017310	GTC	2	6	447142	447147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10230	NC_017310	CA	3	6	447274	447279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10231	NC_017310	GTC	2	6	447330	447335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152229
10232	NC_017310	TGCA	2	8	447423	447430	25 %	25 %	25 %	25 %	387152229
10233	NC_017310	GCG	2	6	447437	447442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152229
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10237	NC_017310	GC	3	6	447556	447561	0 %	0 %	50 %	50 %	387152229
10238	NC_017310	CGT	2	6	447648	447653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152229
10239	NC_017310	GCAG	2	8	447737	447744	25 %	0 %	50 %	25 %	387152229
10240	NC_017310	ACC	2	6	447763	447768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152229
10241	NC_017310	GCA	2	6	447815	447820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152229
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10243	NC_017310	CAT	2	6	447875	447880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152229
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10363	NC_017310	CGA	2	6	452680	452685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152234
10364	NC_017310	CTC	2	6	452696	452701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152234
10365	NC_017310	GTGCTG	2	12	452744	452755	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387152234
10366	NC_017310	TTG	2	6	452895	452900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152234
10367	NC_017310	AGT	2	6	452998	453003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152234
10368	NC_017310	CG	3	6	453018	453023	0 %	0 %	50 %	50 %	387152234
10369	NC_017310	T	6	6	453096	453101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10370	NC_017310	GCGG	2	8	453115	453122	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10371	NC_017310	GCGGG	2	10	453131	453140	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10372	NC_017310	CAG	2	6	453149	453154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152235
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10377	NC_017310	GGT	2	6	453268	453273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152235
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10389	NC_017310	GGC	3	9	453808	453816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152236
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10392	NC_017310	GTA	3	9	453952	453960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152236
10393	NC_017310	TCGT	2	8	453967	453974	0 %	50 %	25 %	25 %	387152236
10394	NC_017310	GAA	2	6	454007	454012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10395	NC_017310	CGGG	2	8	454118	454125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10396	NC_017310	ATG	2	6	454211	454216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10397	NC_017310	TGA	2	6	454220	454225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10400	NC_017310	CG	3	6	454323	454328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10401	NC_017310	ACCG	2	8	454339	454346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10402	NC_017310	TGC	2	6	454379	454384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10404	NC_017310	AACCA	2	10	454427	454436	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10405	NC_017310	AGG	2	6	454529	454534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152237
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10444	NC_017310	CGG	2	6	456156	456161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152238
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10467	NC_017310	ACG	2	6	457134	457139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152239
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10470	NC_017310	CCAG	2	8	457253	457260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10471	NC_017310	GCCT	2	8	457302	457309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10472	NC_017310	CGG	2	6	457379	457384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152240
10473	NC_017310	TC	3	6	457404	457409	0 %	50 %	0 %	50 %	387152240
10474	NC_017310	GC	3	6	457418	457423	0 %	0 %	50 %	50 %	387152240
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10479	NC_017310	TCC	2	6	457567	457572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152240
10480	NC_017310	CAT	2	6	457598	457603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152240
10481	NC_017310	ATG	2	6	457624	457629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152240
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