MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76001	NC_017310	TAC	2	6	3415944	3415949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76002	NC_017310	CGCA	2	8	3416018	3416025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76003	NC_017310	CGC	2	6	3416074	3416079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76004	NC_017310	TCA	2	6	3416121	3416126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76005	NC_017310	CA	3	6	3416145	3416150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76006	NC_017310	GGA	2	6	3416157	3416162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76007	NC_017310	CAG	2	6	3416253	3416258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154842
76008	NC_017310	TGG	2	6	3416281	3416286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387154842
76009	NC_017310	GAA	2	6	3416291	3416296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387154842
76010	NC_017310	CGC	2	6	3416327	3416332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154842
76011	NC_017310	AAT	2	6	3416401	3416406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387154842
76012	NC_017310	AG	3	6	3416425	3416430	50 %	0 %	50 %	0 %	387154843
76013	NC_017310	TAC	2	6	3416433	3416438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154843
76014	NC_017310	CG	4	8	3416453	3416460	0 %	0 %	50 %	50 %	387154843
76015	NC_017310	GAC	2	6	3416472	3416477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154843
76016	NC_017310	GC	3	6	3416483	3416488	0 %	0 %	50 %	50 %	387154843
76017	NC_017310	ACC	2	6	3416512	3416517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387154843
76018	NC_017310	CGA	2	6	3416531	3416536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154843
76019	NC_017310	GCC	2	6	3416565	3416570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154843
76020	NC_017310	ACG	2	6	3416578	3416583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154843
76021	NC_017310	CGG	3	9	3416645	3416653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154843
76022	NC_017310	GGCG	2	8	3416742	3416749	0 %	0 %	75 %	25 %	387154843
76023	NC_017310	CG	3	6	3416752	3416757	0 %	0 %	50 %	50 %	387154843
76024	NC_017310	CAGG	2	8	3416810	3416817	25 %	0 %	50 %	25 %	387154843
76025	NC_017310	CGA	2	6	3416828	3416833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154843
76026	NC_017310	CGA	2	6	3416867	3416872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154843
76027	NC_017310	GCG	2	6	3416875	3416880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154843
76028	NC_017310	GCG	3	9	3416926	3416934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154843
76029	NC_017310	TTC	2	6	3416961	3416966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387154843
76030	NC_017310	TGCCC	2	10	3416977	3416986	0 %	20 %	20 %	60 %	387154843
76031	NC_017310	TCA	2	6	3417010	3417015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154843
76032	NC_017310	GCA	2	6	3417053	3417058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154843
76033	NC_017310	CCG	2	6	3417085	3417090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154843
76034	NC_017310	CTGCGT	2	12	3417111	3417122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154843
76035	NC_017310	GGCGAA	2	12	3417123	3417134	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387154843
76036	NC_017310	GTC	2	6	3417171	3417176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154843
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76039	NC_017310	GTC	2	6	3417225	3417230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154843
76040	NC_017310	CGA	2	6	3417290	3417295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154843
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76042	NC_017310	CGT	2	6	3417413	3417418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154843
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76045	NC_017310	CGA	2	6	3417476	3417481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154843
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76049	NC_017310	C	6	6	3417575	3417580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76050	NC_017310	CGG	2	6	3417604	3417609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76051	NC_017310	CCG	2	6	3417656	3417661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76052	NC_017310	GGC	2	6	3417695	3417700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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76054	NC_017310	CCG	2	6	3417752	3417757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76055	NC_017310	GTG	2	6	3417872	3417877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76056	NC_017310	T	7	7	3417878	3417884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76062	NC_017310	CG	3	6	3418071	3418076	0 %	0 %	50 %	50 %	387154844
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76118	NC_017310	GCC	2	6	3420701	3420706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154846
76119	NC_017310	TCC	2	6	3420707	3420712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387154846
76120	NC_017310	CGC	2	6	3420782	3420787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154846
76121	NC_017310	GC	3	6	3420810	3420815	0 %	0 %	50 %	50 %	387154846
76122	NC_017310	GTT	2	6	3420878	3420883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387154846
76123	NC_017310	CAT	2	6	3420884	3420889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154846
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76125	NC_017310	GCA	2	6	3420944	3420949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154846
76126	NC_017310	GCA	2	6	3420951	3420956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154846
76127	NC_017310	CTG	2	6	3420996	3421001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154846
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76130	NC_017310	CGCA	2	8	3421100	3421107	25 %	0 %	25 %	50 %	387154846
76131	NC_017310	CGT	2	6	3421181	3421186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154846
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76139	NC_017310	GC	3	6	3421691	3421696	0 %	0 %	50 %	50 %	387154846
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76142	NC_017310	CGT	2	6	3421869	3421874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76143	NC_017310	TGC	2	6	3421883	3421888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
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76149	NC_017310	CGA	2	6	3422157	3422162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154847
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76152	NC_017310	ACG	2	6	3422246	3422251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76153	NC_017310	CAT	3	9	3422547	3422555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154847
76154	NC_017310	GC	3	6	3422608	3422613	0 %	0 %	50 %	50 %	387154847
76155	NC_017310	CGG	2	6	3422622	3422627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154847
76156	NC_017310	AGA	2	6	3422651	3422656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387154847
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76161	NC_017310	GCC	2	6	3422815	3422820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154847
76162	NC_017310	CA	3	6	3422836	3422841	50 %	0 %	0 %	50 %	387154847
76163	NC_017310	AGC	2	6	3422850	3422855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154847
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76165	NC_017310	GGT	2	6	3422944	3422949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387154847
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76170	NC_017310	CGT	2	6	3423045	3423050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
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76173	NC_017310	CCA	2	6	3423098	3423103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387154847
76174	NC_017310	ATG	2	6	3423112	3423117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387154847
76175	NC_017310	CAT	2	6	3423132	3423137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154847
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76177	NC_017310	CATCG	2	10	3423228	3423237	20 %	20 %	20 %	40 %	387154847
76178	NC_017310	GCC	2	6	3423262	3423267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154847
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76181	NC_017310	TCG	2	6	3423428	3423433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76182	NC_017310	TCA	2	6	3423437	3423442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154847
76183	NC_017310	CGA	2	6	3423489	3423494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154847
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76186	NC_017310	TCT	2	6	3423584	3423589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387154847
76187	NC_017310	GGC	2	6	3423625	3423630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154847
76188	NC_017310	GA	3	6	3423721	3423726	50 %	0 %	50 %	0 %	387154847
76189	NC_017310	TCG	2	6	3423728	3423733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76190	NC_017310	CGC	2	6	3423788	3423793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154847
76191	NC_017310	C	6	6	3423793	3423798	0 %	0 %	0 %	100 %	387154847
76192	NC_017310	ATG	2	6	3423832	3423837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387154847
76193	NC_017310	GCG	2	6	3423850	3423855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154847
76194	NC_017310	GAT	2	6	3423891	3423896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387154847
76195	NC_017310	GGC	2	6	3423897	3423902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154847
76196	NC_017310	CGA	2	6	3423935	3423940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76197	NC_017310	ACG	2	6	3424001	3424006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76198	NC_017310	CAA	2	6	3424071	3424076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387154847
76199	NC_017310	GCAG	2	8	3424104	3424111	25 %	0 %	50 %	25 %	387154847
76200	NC_017310	GGC	2	6	3424171	3424176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154847
76201	NC_017310	GTC	2	6	3424213	3424218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76202	NC_017310	GCC	2	6	3424273	3424278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154847
76203	NC_017310	GAC	2	6	3424365	3424370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76204	NC_017310	TGC	2	6	3424430	3424435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76205	NC_017310	GGC	2	6	3424452	3424457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154847
76206	NC_017310	GCC	2	6	3424483	3424488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154847
76207	NC_017310	ATC	2	6	3424489	3424494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154847
76208	NC_017310	CTG	2	6	3424513	3424518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76209	NC_017310	ACA	2	6	3424553	3424558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387154847
76210	NC_017310	TCG	2	6	3424622	3424627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76211	NC_017310	CG	3	6	3424693	3424698	0 %	0 %	50 %	50 %	387154847
76212	NC_017310	CGT	2	6	3424743	3424748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154847
76213	NC_017310	AGCG	2	8	3424787	3424794	25 %	0 %	50 %	25 %	387154847
76214	NC_017310	CGG	2	6	3424802	3424807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154847
76215	NC_017310	TCT	2	6	3424859	3424864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387154847
76216	NC_017310	AGA	2	6	3424919	3424924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387154847
76217	NC_017310	GAC	2	6	3424942	3424947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76218	NC_017310	GCC	2	6	3425015	3425020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154848
76219	NC_017310	GAT	2	6	3425084	3425089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387154848
76220	NC_017310	AGGC	2	8	3425124	3425131	25 %	0 %	50 %	25 %	387154848
76221	NC_017310	ACG	2	6	3425136	3425141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154848
76222	NC_017310	TTC	2	6	3425231	3425236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387154848
76223	NC_017310	TCG	2	6	3425277	3425282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154848
76224	NC_017310	GCCCG	2	10	3425287	3425296	0 %	0 %	40 %	60 %	387154848
76225	NC_017310	TCG	2	6	3425385	3425390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154848
76226	NC_017310	CGG	3	9	3425403	3425411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154848
76227	NC_017310	GGC	2	6	3425440	3425445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154848
76228	NC_017310	GCC	2	6	3425481	3425486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154848
76229	NC_017310	ATGC	2	8	3425556	3425563	25 %	25 %	25 %	25 %	387154848
76230	NC_017310	TCG	2	6	3425580	3425585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154848
76231	NC_017310	TGG	2	6	3425682	3425687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76232	NC_017310	ACGGCT	2	12	3425767	3425778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76233	NC_017310	CAT	2	6	3425839	3425844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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76235	NC_017310	C	6	6	3425922	3425927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76236	NC_017310	TTA	2	6	3425947	3425952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76352	NC_017310	CATC	2	8	3430724	3430731	25 %	25 %	0 %	50 %	387154852
76353	NC_017310	TGC	2	6	3430742	3430747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154852
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76358	NC_017310	CTG	2	6	3431064	3431069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154853
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76388	NC_017310	CGTC	2	8	3432672	3432679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76389	NC_017310	C	6	6	3432731	3432736	0 %	0 %	0 %	100 %	387154855
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76468	NC_017310	CAG	3	9	3435507	3435515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154855
76469	NC_017310	CA	3	6	3435524	3435529	50 %	0 %	0 %	50 %	387154855
76470	NC_017310	CGC	2	6	3435549	3435554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154855
76471	NC_017310	CATGG	2	10	3435624	3435633	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76472	NC_017310	CGGG	2	8	3435665	3435672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76473	NC_017310	GCC	2	6	3435727	3435732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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76476	NC_017310	TTGAGT	2	12	3435797	3435808	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387154856
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76479	NC_017310	CG	3	6	3435866	3435871	0 %	0 %	50 %	50 %	387154856
76480	NC_017310	CAC	2	6	3435955	3435960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387154856
76481	NC_017310	CATG	2	8	3436014	3436021	25 %	25 %	25 %	25 %	387154856
76482	NC_017310	CAC	2	6	3436048	3436053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387154856
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76490	NC_017310	CGC	2	6	3436498	3436503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154856
76491	NC_017310	GCC	2	6	3436522	3436527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154856
76492	NC_017310	GC	3	6	3436554	3436559	0 %	0 %	50 %	50 %	387154856
76493	NC_017310	ATG	2	6	3436583	3436588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387154856
76494	NC_017310	TCT	2	6	3436620	3436625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387154856
76495	NC_017310	GCC	2	6	3436672	3436677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154856
76496	NC_017310	CAG	2	6	3436711	3436716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154856
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76498	NC_017310	CCG	2	6	3436821	3436826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154856
76499	NC_017310	TTG	2	6	3436850	3436855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387154856
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