MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio desulfuricans ND132 chromosome

Total Repeats: 89207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016803	AT	3	6	10	15	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016803	GTCCC	2	10	54	63	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_016803	TCCC	2	8	97	104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016803	CA	3	6	117	122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016803	CCTGAC	2	12	235	246	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376294793
6	NC_016803	CCG	3	9	309	317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294793
7	NC_016803	GC	4	8	357	364	0 %	0 %	50 %	50 %	376294793
8	NC_016803	GGC	2	6	379	384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294793
9	NC_016803	A	6	6	398	403	100 %	0 %	0 %	0 %	376294793
10	NC_016803	CGGCCC	2	12	414	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294793
11	NC_016803	CGA	2	6	496	501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294793
12	NC_016803	TCG	3	9	504	512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294793
13	NC_016803	CTC	2	6	556	561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294793
14	NC_016803	ACC	2	6	576	581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294793
15	NC_016803	GCCT	2	8	680	687	0 %	25 %	25 %	50 %	376294793
16	NC_016803	TCC	2	6	689	694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294793
17	NC_016803	CTC	2	6	785	790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294793
18	NC_016803	CTT	2	6	802	807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294793
19	NC_016803	A	6	6	819	824	100 %	0 %	0 %	0 %	376294793
20	NC_016803	AGG	2	6	828	833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376294793
21	NC_016803	GTC	2	6	878	883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294793
22	NC_016803	CGC	3	9	992	1000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294793
23	NC_016803	ATC	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294793
24	NC_016803	CAC	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294793
25	NC_016803	AAC	2	6	1109	1114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376294793
26	NC_016803	CCTGG	2	10	1159	1168	0 %	20 %	40 %	40 %	376294793
27	NC_016803	ATC	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294793
28	NC_016803	C	6	6	1437	1442	0 %	0 %	0 %	100 %	376294793
29	NC_016803	GAC	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294793
30	NC_016803	ACC	2	6	1463	1468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294793
31	NC_016803	C	6	6	1492	1497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_016803	CTT	2	6	1567	1572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016803	T	6	6	1571	1576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016803	CGG	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016803	G	6	6	1622	1627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016803	TG	3	6	1675	1680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016803	G	6	6	1721	1726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016803	GGTT	2	8	1728	1735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016803	G	6	6	1758	1763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016803	GC	3	6	1837	1842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016803	CGC	2	6	1864	1869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016803	GTC	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016803	GCG	2	6	1903	1908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016803	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016803	G	6	6	1991	1996	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016803	G	6	6	1999	2004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016803	G	6	6	2009	2014	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016803	G	6	6	2017	2022	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016803	GGC	2	6	2027	2032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016803	GTC	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294794
51	NC_016803	GCGG	2	8	2102	2109	0 %	0 %	75 %	25 %	376294794
52	NC_016803	TCGGGG	2	12	2145	2156	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	376294794
53	NC_016803	CCGG	2	8	2180	2187	0 %	0 %	50 %	50 %	376294794
54	NC_016803	GGC	2	6	2193	2198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294794
55	NC_016803	GGT	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294794
56	NC_016803	TGG	2	6	2278	2283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294794
57	NC_016803	TTG	2	6	2289	2294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376294794
58	NC_016803	GAAGTC	2	12	2297	2308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376294794
59	NC_016803	CGG	2	6	2344	2349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294794
60	NC_016803	CCGGCC	2	12	2381	2392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294794
61	NC_016803	TGT	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376294794
62	NC_016803	AGC	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016803	CGG	2	6	2563	2568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016803	CCG	2	6	2602	2607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
65	NC_016803	GAC	2	6	2688	2693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294795
66	NC_016803	CGC	2	6	2720	2725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
67	NC_016803	CGT	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294795
68	NC_016803	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294795
69	NC_016803	CGC	2	6	2816	2821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
70	NC_016803	GTG	2	6	2823	2828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294795
71	NC_016803	GCC	2	6	2838	2843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
72	NC_016803	CGCGGA	2	12	2867	2878	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	376294795
73	NC_016803	CGG	2	6	2942	2947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294795
74	NC_016803	GCC	2	6	2979	2984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
75	NC_016803	GTA	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294795
76	NC_016803	CCG	2	6	3028	3033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
77	NC_016803	GTT	2	6	3042	3047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376294795
78	NC_016803	GCG	2	6	3064	3069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294795
79	NC_016803	GC	3	6	3098	3103	0 %	0 %	50 %	50 %	376294795
80	NC_016803	GAG	2	6	3105	3110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376294795
81	NC_016803	CCA	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294795
82	NC_016803	CGG	2	6	3155	3160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294795
83	NC_016803	CCA	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294795
84	NC_016803	CG	3	6	3244	3249	0 %	0 %	50 %	50 %	376294795
85	NC_016803	CGG	2	6	3275	3280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294795
86	NC_016803	CGC	2	6	3311	3316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
87	NC_016803	GTC	2	6	3324	3329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294795
88	NC_016803	GGCG	2	8	3347	3354	0 %	0 %	75 %	25 %	376294795
89	NC_016803	CGT	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294795
90	NC_016803	GGC	2	6	3456	3461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294795
91	NC_016803	AGT	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294795
92	NC_016803	GC	3	6	3500	3505	0 %	0 %	50 %	50 %	376294795
93	NC_016803	G	6	6	3617	3622	0 %	0 %	100 %	0 %	376294795
94	NC_016803	GTT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376294795
95	NC_016803	CGGG	2	8	3689	3696	0 %	0 %	75 %	25 %	376294795
96	NC_016803	CCT	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294795
97	NC_016803	GCC	2	6	3753	3758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
98	NC_016803	GTG	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294795
99	NC_016803	GGT	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294795
100	NC_016803	GGTG	2	8	3851	3858	0 %	25 %	75 %	0 %	376294795
101	NC_016803	GCC	2	6	3906	3911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294795
102	NC_016803	GGC	2	6	3924	3929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294795
103	NC_016803	TCG	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294795
104	NC_016803	GGA	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376294795
105	NC_016803	GAG	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376294795
106	NC_016803	GCG	2	6	4224	4229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294796
107	NC_016803	GGC	2	6	4341	4346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294796
108	NC_016803	CAG	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294796
109	NC_016803	G	6	6	4532	4537	0 %	0 %	100 %	0 %	376294796
110	NC_016803	CAG	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294796
111	NC_016803	GGGACC	2	12	4629	4640	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	376294796
112	NC_016803	GGC	2	6	4641	4646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294796
113	NC_016803	CGG	2	6	4691	4696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294796
114	NC_016803	CGCA	2	8	4753	4760	25 %	0 %	25 %	50 %	376294796
115	NC_016803	GC	3	6	4767	4772	0 %	0 %	50 %	50 %	376294796
116	NC_016803	TCG	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294796
117	NC_016803	GCGAG	2	10	4865	4874	20 %	0 %	60 %	20 %	376294796
118	NC_016803	CTC	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294796
119	NC_016803	GCGG	2	8	4970	4977	0 %	0 %	75 %	25 %	376294796
120	NC_016803	CGT	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294797
121	NC_016803	CGTT	2	8	5096	5103	0 %	50 %	25 %	25 %	376294797
122	NC_016803	GAA	2	6	5134	5139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376294797
123	NC_016803	GCC	2	6	5149	5154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294797
124	NC_016803	AGG	2	6	5174	5179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376294797
125	NC_016803	TGA	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294797
126	NC_016803	GAT	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294797
127	NC_016803	CAT	2	6	5212	5217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294797
128	NC_016803	GCCC	2	8	5280	5287	0 %	0 %	25 %	75 %	376294797
129	NC_016803	GAT	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294797
130	NC_016803	ACC	3	9	5336	5344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294797
131	NC_016803	GGTCAG	2	12	5497	5508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	376294797
132	NC_016803	CG	3	6	5518	5523	0 %	0 %	50 %	50 %	376294797
133	NC_016803	CG	3	6	5557	5562	0 %	0 %	50 %	50 %	376294797
134	NC_016803	GAT	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294797
135	NC_016803	GC	3	6	5598	5603	0 %	0 %	50 %	50 %	376294797
136	NC_016803	CGG	4	12	5640	5651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294797
137	NC_016803	CCA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294797
138	NC_016803	GCCCTG	2	12	5695	5706	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	376294797
139	NC_016803	CAG	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294797
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141	NC_016803	CGG	2	6	5763	5768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294797
142	NC_016803	GTC	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294797
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254	NC_016803	A	8	8	10340	10347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_016803	T	6	6	10370	10375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_016803	GCC	2	6	10435	10440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294803
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267	NC_016803	CCT	2	6	10845	10850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294803
268	NC_016803	CGG	2	6	10863	10868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294803
269	NC_016803	GGT	2	6	10873	10878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294803
270	NC_016803	GCG	2	6	10889	10894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294803
271	NC_016803	GCG	3	9	10910	10918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294803
272	NC_016803	GTC	2	6	10930	10935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294803
273	NC_016803	CGA	2	6	10944	10949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294803
274	NC_016803	CGG	2	6	10980	10985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294803
275	NC_016803	CTT	2	6	11044	11049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294803
276	NC_016803	GGC	2	6	11050	11055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294803
277	NC_016803	CTT	2	6	11125	11130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294803
278	NC_016803	CAT	2	6	11137	11142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294803
279	NC_016803	GCG	2	6	11180	11185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294803
280	NC_016803	ATT	2	6	11197	11202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376294804
281	NC_016803	CTT	2	6	11257	11262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294804
282	NC_016803	GCC	2	6	11315	11320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294804
283	NC_016803	AGGC	2	8	11325	11332	25 %	0 %	50 %	25 %	376294804
284	NC_016803	CGT	3	9	11374	11382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294804
285	NC_016803	GAT	2	6	11390	11395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294804
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287	NC_016803	GCC	2	6	11540	11545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294804
288	NC_016803	CTT	2	6	11561	11566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294804
289	NC_016803	CTTC	2	8	11590	11597	0 %	50 %	0 %	50 %	376294804
290	NC_016803	CTT	2	6	11663	11668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294804
291	NC_016803	GCC	2	6	11693	11698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294804
292	NC_016803	GGTG	2	8	11707	11714	0 %	25 %	75 %	0 %	376294804
293	NC_016803	GTA	2	6	11717	11722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294804
294	NC_016803	CTCGGC	2	12	11735	11746	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	376294804
295	NC_016803	GCC	2	6	11795	11800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294804
296	NC_016803	CGA	2	6	11815	11820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294804
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298	NC_016803	ATG	2	6	11868	11873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294804
299	NC_016803	CGG	2	6	11925	11930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294804
300	NC_016803	TGG	2	6	11934	11939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294804
301	NC_016803	ACC	2	6	12050	12055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
302	NC_016803	TG	3	6	12073	12078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
303	NC_016803	G	6	6	12164	12169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
304	NC_016803	CCG	2	6	12176	12181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294805
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309	NC_016803	TGAACT	2	12	12321	12332	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	376294805
310	NC_016803	GC	3	6	12358	12363	0 %	0 %	50 %	50 %	376294805
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343	NC_016803	CGT	2	6	13930	13935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294806
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346	NC_016803	CGG	2	6	14059	14064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294806
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349	NC_016803	A	6	6	14318	14323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_016803	GTGCT	2	10	14424	14433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
351	NC_016803	TCG	2	6	14532	14537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294807
352	NC_016803	CGG	2	6	14542	14547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294807
353	NC_016803	ACC	2	6	14558	14563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294807
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382	NC_016803	CGG	2	6	15967	15972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294807
383	NC_016803	CTG	2	6	15991	15996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294807
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386	NC_016803	CG	4	8	16114	16121	0 %	0 %	50 %	50 %	376294807
387	NC_016803	ACG	2	6	16167	16172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294807
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389	NC_016803	AAG	2	6	16235	16240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376294807
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395	NC_016803	CGC	2	6	16483	16488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294807
396	NC_016803	GCCC	2	8	16500	16507	0 %	0 %	25 %	75 %	376294807
397	NC_016803	AAG	2	6	16538	16543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376294807
398	NC_016803	AGT	2	6	16554	16559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294807
399	NC_016803	T	8	8	16606	16613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_016803	TTAC	2	8	16640	16647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
401	NC_016803	CAA	2	6	16661	16666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_016803	GGAC	2	8	16667	16674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
403	NC_016803	CGA	2	6	16682	16687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294808
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455	NC_016803	GCCTAC	2	12	19315	19326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376294810
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471	NC_016803	TCCT	2	8	20232	20239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
472	NC_016803	CCT	2	6	20280	20285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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474	NC_016803	CGTC	2	8	20363	20370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
475	NC_016803	GGC	3	9	20380	20388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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477	NC_016803	CGGAT	2	10	20478	20487	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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480	NC_016803	AGAA	2	8	20561	20568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_016803	CTC	2	6	20617	20622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
485	NC_016803	A	6	6	20654	20659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_016803	GGAG	2	8	20818	20825	25 %	0 %	75 %	0 %	376294812
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493	NC_016803	GAT	2	6	20900	20905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294812
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497	NC_016803	AGG	2	6	20967	20972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376294812
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499	NC_016803	CGG	2	6	21001	21006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294812
500	NC_016803	AGC	2	6	21013	21018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294812

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