MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016629	GGC	2	6	194542	194547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298560
4002	NC_016629	CTG	2	6	194608	194613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298560
4003	NC_016629	AGG	2	6	194630	194635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298560
4004	NC_016629	CTG	2	6	194680	194685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298560
4005	NC_016629	CGG	2	6	194739	194744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298560
4006	NC_016629	TA	3	6	194852	194857	50 %	50 %	0 %	0 %	374298561
4007	NC_016629	GAA	2	6	194877	194882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298561
4008	NC_016629	GC	3	6	194935	194940	0 %	0 %	50 %	50 %	374298561
4009	NC_016629	GTC	2	6	194950	194955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298561
4010	NC_016629	CTC	2	6	195057	195062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298561
4011	NC_016629	GCC	2	6	195063	195068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298561
4012	NC_016629	TGA	2	6	195148	195153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298561
4013	NC_016629	TGA	2	6	195167	195172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298561
4014	NC_016629	GAA	2	6	195261	195266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298561
4015	NC_016629	GGT	2	6	195290	195295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298561
4016	NC_016629	GAT	2	6	195317	195322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298561
4017	NC_016629	CCT	2	6	195323	195328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298561
4018	NC_016629	CAG	2	6	195375	195380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298561
4019	NC_016629	GCTG	2	8	195422	195429	0 %	25 %	50 %	25 %	374298561
4020	NC_016629	AGCC	2	8	195454	195461	25 %	0 %	25 %	50 %	374298561
4021	NC_016629	CT	3	6	195682	195687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_016629	AATG	2	8	195764	195771	50 %	25 %	25 %	0 %	374298562
4023	NC_016629	CGAG	2	8	195786	195793	25 %	0 %	50 %	25 %	374298562
4024	NC_016629	ACG	2	6	195800	195805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4025	NC_016629	GCC	2	6	195814	195819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298562
4026	NC_016629	GTC	2	6	196000	196005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4027	NC_016629	CTG	2	6	196009	196014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4028	NC_016629	GCC	2	6	196021	196026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298562
4029	NC_016629	CTT	2	6	196104	196109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298562
4030	NC_016629	GGT	2	6	196183	196188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
4031	NC_016629	CG	3	6	196269	196274	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
4032	NC_016629	CGA	2	6	196302	196307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4033	NC_016629	GGC	2	6	196494	196499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298562
4034	NC_016629	TGC	2	6	196565	196570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4035	NC_016629	TGG	2	6	196604	196609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
4036	NC_016629	ACCT	2	8	196618	196625	25 %	25 %	0 %	50 %	374298562
4037	NC_016629	CAC	2	6	196632	196637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298562
4038	NC_016629	GGC	2	6	196656	196661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298562
4039	NC_016629	GC	3	6	196726	196731	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
4040	NC_016629	TCA	2	6	196739	196744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298562
4041	NC_016629	GCAT	2	8	196823	196830	25 %	25 %	25 %	25 %	374298562
4042	NC_016629	GACAG	2	10	196848	196857	40 %	0 %	40 %	20 %	374298562
4043	NC_016629	TCC	2	6	196894	196899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298562
4044	NC_016629	CCGG	2	8	196912	196919	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
4045	NC_016629	CAA	2	6	196971	196976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298562
4046	NC_016629	GC	4	8	197121	197128	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
4047	NC_016629	AGG	2	6	197147	197152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298562
4048	NC_016629	TGG	2	6	197165	197170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
4049	NC_016629	CG	3	6	197210	197215	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
4050	NC_016629	GACG	2	8	197244	197251	25 %	0 %	50 %	25 %	374298562
4051	NC_016629	GGA	2	6	197270	197275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298562
4052	NC_016629	ACG	2	6	197345	197350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4053	NC_016629	CGC	2	6	197399	197404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298562
4054	NC_016629	CGGG	2	8	197440	197447	0 %	0 %	75 %	25 %	374298562
4055	NC_016629	GTC	2	6	197455	197460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4056	NC_016629	AAGC	2	8	197577	197584	50 %	0 %	25 %	25 %	374298562
4057	NC_016629	TCT	2	6	197609	197614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298562
4058	NC_016629	CG	3	6	197615	197620	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
4059	NC_016629	AGA	2	6	197660	197665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298562
4060	NC_016629	GTG	2	6	197674	197679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
4061	NC_016629	ACG	2	6	197702	197707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4062	NC_016629	AAG	2	6	197719	197724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298562
4063	NC_016629	TCG	2	6	197816	197821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4064	NC_016629	TATC	2	8	197871	197878	25 %	50 %	0 %	25 %	374298562
4065	NC_016629	CGG	2	6	197895	197900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298562
4066	NC_016629	CAT	3	9	197901	197909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298562
4067	NC_016629	TCA	2	6	197969	197974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298562
4068	NC_016629	TGGGCG	2	12	198008	198019	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374298562
4069	NC_016629	CCG	2	6	198046	198051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298562
4070	NC_016629	TGG	2	6	198071	198076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
4071	NC_016629	GGCA	2	8	198079	198086	25 %	0 %	50 %	25 %	374298562
4072	NC_016629	CTGACC	2	12	198202	198213	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374298562
4073	NC_016629	CG	3	6	198216	198221	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
4074	NC_016629	TGC	2	6	198224	198229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4075	NC_016629	CGT	2	6	198261	198266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
4076	NC_016629	GCG	2	6	198334	198339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298562
4077	NC_016629	GGCGTA	2	12	198624	198635	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4078	NC_016629	ACT	2	6	198796	198801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298563
4079	NC_016629	GCCA	2	8	198830	198837	25 %	0 %	25 %	50 %	374298563
4080	NC_016629	CAT	2	6	198872	198877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298563
4081	NC_016629	AG	3	6	199005	199010	50 %	0 %	50 %	0 %	374298563
4082	NC_016629	GAA	2	6	199013	199018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298563
4083	NC_016629	GCAG	2	8	199078	199085	25 %	0 %	50 %	25 %	374298563
4084	NC_016629	GAT	2	6	199142	199147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298563
4085	NC_016629	GTG	2	6	199207	199212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298563
4086	NC_016629	TTG	2	6	199215	199220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298563
4087	NC_016629	CGT	2	6	199240	199245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298563
4088	NC_016629	GC	3	6	199299	199304	0 %	0 %	50 %	50 %	374298563
4089	NC_016629	CAC	2	6	199317	199322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298563
4090	NC_016629	GCA	2	6	199329	199334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298563
4091	NC_016629	AAG	2	6	199364	199369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298563
4092	NC_016629	TTGA	2	8	199376	199383	25 %	50 %	25 %	0 %	374298563
4093	NC_016629	GA	3	6	199382	199387	50 %	0 %	50 %	0 %	374298563
4094	NC_016629	CAC	2	6	199406	199411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298563
4095	NC_016629	ACT	2	6	199449	199454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298563
4096	NC_016629	AGGC	2	8	199523	199530	25 %	0 %	50 %	25 %	374298564
4097	NC_016629	TCG	2	6	199538	199543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298564
4098	NC_016629	ATC	2	6	199544	199549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298564
4099	NC_016629	TCC	2	6	199604	199609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298564
4100	NC_016629	GCAG	2	8	199638	199645	25 %	0 %	50 %	25 %	374298564
4101	NC_016629	CCA	2	6	199662	199667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298564
4102	NC_016629	GGC	2	6	199677	199682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298564
4103	NC_016629	CAC	2	6	199708	199713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298564
4104	NC_016629	TCG	2	6	199730	199735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298564
4105	NC_016629	TGG	2	6	199767	199772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298564
4106	NC_016629	CAC	2	6	199792	199797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298564
4107	NC_016629	GGT	2	6	199861	199866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298564
4108	NC_016629	GTC	2	6	199924	199929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298564
4109	NC_016629	GC	3	6	199938	199943	0 %	0 %	50 %	50 %	374298564
4110	NC_016629	CCG	2	6	199944	199949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298564
4111	NC_016629	CTC	2	6	199987	199992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298564
4112	NC_016629	CAG	3	9	199999	200007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298564
4113	NC_016629	TGC	2	6	200025	200030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298564
4114	NC_016629	CTT	2	6	200050	200055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298564
4115	NC_016629	CCT	2	6	200092	200097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298564
4116	NC_016629	CTC	2	6	200107	200112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298564
4117	NC_016629	CAC	2	6	200143	200148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298564
4118	NC_016629	GCCG	2	8	200155	200162	0 %	0 %	50 %	50 %	374298564
4119	NC_016629	GAT	2	6	200233	200238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298564
4120	NC_016629	TCC	2	6	200276	200281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298564
4121	NC_016629	AGC	2	6	200282	200287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298564
4122	NC_016629	CTT	2	6	200296	200301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298564
4123	NC_016629	ACTCC	2	10	200310	200319	20 %	20 %	0 %	60 %	374298564
4124	NC_016629	CGG	2	6	200331	200336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298564
4125	NC_016629	AGTAT	2	10	200418	200427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016629	TCCG	2	8	200519	200526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_016629	CCG	2	6	200536	200541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_016629	CAA	2	6	200583	200588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_016629	CGCA	2	8	200624	200631	25 %	0 %	25 %	50 %	374298565
4130	NC_016629	AT	3	6	200639	200644	50 %	50 %	0 %	0 %	374298565
4131	NC_016629	CTGCA	2	10	200718	200727	20 %	20 %	20 %	40 %	374298565
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4136	NC_016629	ACG	2	6	201013	201018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298565
4137	NC_016629	GCAA	2	8	201028	201035	50 %	0 %	25 %	25 %	374298565
4138	NC_016629	GGC	2	6	201056	201061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298565
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4145	NC_016629	CTG	2	6	201417	201422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298565
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4152	NC_016629	CG	3	6	201705	201710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4153	NC_016629	T	6	6	201715	201720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_016629	CCG	2	6	201786	201791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4155	NC_016629	AGG	2	6	201886	201891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4159	NC_016629	GCT	2	6	202024	202029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298566
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4233	NC_016629	GTC	2	6	205123	205128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298569
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4240	NC_016629	GTC	2	6	205423	205428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298569
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4242	NC_016629	GCC	2	6	205531	205536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298569
4243	NC_016629	CGC	2	6	205539	205544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298569
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4245	NC_016629	GCAG	2	8	205605	205612	25 %	0 %	50 %	25 %	374298569
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4363	NC_016629	GCAAG	2	10	211874	211883	40 %	0 %	40 %	20 %	374298573
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4367	NC_016629	GCT	2	6	212018	212023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298573
4368	NC_016629	GGC	2	6	212030	212035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298573
4369	NC_016629	GC	3	6	212034	212039	0 %	0 %	50 %	50 %	374298573
4370	NC_016629	AGGC	2	8	212041	212048	25 %	0 %	50 %	25 %	374298573
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4374	NC_016629	GCC	2	6	212131	212136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298573
4375	NC_016629	GCG	2	6	212218	212223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298573
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4380	NC_016629	GTA	2	6	212586	212591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298574
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4382	NC_016629	TGC	2	6	212644	212649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298574
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4385	NC_016629	CG	3	6	212840	212845	0 %	0 %	50 %	50 %	374298574
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4388	NC_016629	GTA	2	6	213147	213152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298574
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4396	NC_016629	CCGC	2	8	213611	213618	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4398	NC_016629	A	6	6	213726	213731	100 %	0 %	0 %	0 %	374298575
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4402	NC_016629	TCAA	2	8	213930	213937	50 %	25 %	0 %	25 %	374298576
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4484	NC_016629	GCTGC	2	10	218252	218261	0 %	20 %	40 %	40 %	374298580
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4489	NC_016629	ATCC	2	8	218419	218426	25 %	25 %	0 %	50 %	374298580
4490	NC_016629	CTCA	2	8	218431	218438	25 %	25 %	0 %	50 %	374298580
4491	NC_016629	GCG	2	6	218448	218453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298580
4492	NC_016629	GCC	2	6	218478	218483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298580
4493	NC_016629	ATC	2	6	218492	218497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298580
4494	NC_016629	CGCT	2	8	218528	218535	0 %	25 %	25 %	50 %	374298580
4495	NC_016629	GCC	2	6	218537	218542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298580
4496	NC_016629	CCGG	2	8	218595	218602	0 %	0 %	50 %	50 %	374298580
4497	NC_016629	TGC	2	6	218613	218618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298580
4498	NC_016629	GC	3	6	218650	218655	0 %	0 %	50 %	50 %	374298580
4499	NC_016629	AG	4	8	218795	218802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_016629	CGCC	2	8	218843	218850	0 %	0 %	25 %	75 %	374298581

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