MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016629	GCCG	2	8	146556	146563	0 %	0 %	50 %	50 %	374298515
3002	NC_016629	CGG	2	6	146658	146663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298515
3003	NC_016629	CGG	2	6	146667	146672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298515
3004	NC_016629	CTC	2	6	146711	146716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_016629	ATT	2	6	146863	146868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016629	ACC	2	6	146917	146922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_016629	TTCC	2	8	146945	146952	0 %	50 %	0 %	50 %	374298516
3008	NC_016629	GCC	2	6	146957	146962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298516
3009	NC_016629	CCG	2	6	147033	147038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298516
3010	NC_016629	GC	3	6	147081	147086	0 %	0 %	50 %	50 %	374298516
3011	NC_016629	GC	3	6	147123	147128	0 %	0 %	50 %	50 %	374298516
3012	NC_016629	CTG	2	6	147136	147141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298516
3013	NC_016629	CGG	2	6	147174	147179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298516
3014	NC_016629	GCT	2	6	147199	147204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298516
3015	NC_016629	TCC	2	6	147248	147253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298516
3016	NC_016629	ACG	2	6	147338	147343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298516
3017	NC_016629	AAC	2	6	147452	147457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298516
3018	NC_016629	CTG	2	6	147569	147574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298517
3019	NC_016629	GGCTG	2	10	147576	147585	0 %	20 %	60 %	20 %	374298517
3020	NC_016629	CCG	2	6	147606	147611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298517
3021	NC_016629	CGA	2	6	147619	147624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298517
3022	NC_016629	TCA	2	6	147660	147665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298517
3023	NC_016629	GCACG	2	10	147670	147679	20 %	0 %	40 %	40 %	374298517
3024	NC_016629	CTTC	2	8	147753	147760	0 %	50 %	0 %	50 %	374298517
3025	NC_016629	CGC	2	6	147816	147821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298517
3026	NC_016629	CG	3	6	147926	147931	0 %	0 %	50 %	50 %	374298517
3027	NC_016629	GAG	2	6	147941	147946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298517
3028	NC_016629	T	6	6	147969	147974	0 %	100 %	0 %	0 %	374298517
3029	NC_016629	GAG	2	6	147978	147983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298517
3030	NC_016629	CTG	2	6	147992	147997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298517
3031	NC_016629	CGCC	2	8	148162	148169	0 %	0 %	25 %	75 %	374298517
3032	NC_016629	GC	4	8	148189	148196	0 %	0 %	50 %	50 %	374298517
3033	NC_016629	TCA	2	6	148350	148355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298517
3034	NC_016629	CTG	2	6	148535	148540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298518
3035	NC_016629	CGC	2	6	148541	148546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298518
3036	NC_016629	GCC	2	6	148622	148627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298518
3037	NC_016629	CGG	2	6	148630	148635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298518
3038	NC_016629	GCT	2	6	148657	148662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298518
3039	NC_016629	GC	3	6	148663	148668	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
3040	NC_016629	GTG	2	6	148859	148864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298518
3041	NC_016629	GGT	2	6	148924	148929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298518
3042	NC_016629	GGC	2	6	148975	148980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298518
3043	NC_016629	GC	3	6	148993	148998	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
3044	NC_016629	CG	3	6	149007	149012	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
3045	NC_016629	GC	3	6	149161	149166	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
3046	NC_016629	GC	3	6	149169	149174	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
3047	NC_016629	GTG	2	6	149180	149185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298518
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3049	NC_016629	TGG	2	6	149217	149222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298518
3050	NC_016629	TGC	2	6	149241	149246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298518
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3052	NC_016629	GTT	2	6	149272	149277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298518
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3055	NC_016629	CGC	2	6	149437	149442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298518
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3057	NC_016629	CAA	2	6	149632	149637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298518
3058	NC_016629	GC	3	6	149659	149664	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
3059	NC_016629	GAG	2	6	149672	149677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298518
3060	NC_016629	GCG	2	6	149697	149702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298518
3061	NC_016629	CG	3	6	149716	149721	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
3062	NC_016629	CAT	2	6	149793	149798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298519
3063	NC_016629	GC	3	6	149803	149808	0 %	0 %	50 %	50 %	374298519
3064	NC_016629	TCG	2	6	149815	149820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298519
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3066	NC_016629	GAC	2	6	149929	149934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298519
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3118	NC_016629	GCT	2	6	152501	152506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_016629	CAGAA	2	10	152636	152645	60 %	0 %	20 %	20 %	374298522
3120	NC_016629	GC	3	6	152700	152705	0 %	0 %	50 %	50 %	374298522
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3123	NC_016629	CCG	2	6	152905	152910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298522
3124	NC_016629	GCCTGG	2	12	152964	152975	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374298522
3125	NC_016629	CGG	2	6	153054	153059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298522
3126	NC_016629	GCA	2	6	153089	153094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298522
3127	NC_016629	TCA	2	6	153111	153116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298522
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3129	NC_016629	ATC	2	6	153188	153193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298522
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3132	NC_016629	CCG	2	6	153417	153422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298522
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3134	NC_016629	TGC	2	6	153508	153513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298522
3135	NC_016629	GC	3	6	153542	153547	0 %	0 %	50 %	50 %	374298522
3136	NC_016629	ACC	2	6	153561	153566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298522
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3138	NC_016629	A	6	6	153653	153658	100 %	0 %	0 %	0 %	374298522
3139	NC_016629	GC	3	6	153764	153769	0 %	0 %	50 %	50 %	374298523
3140	NC_016629	GGCT	2	8	153776	153783	0 %	25 %	50 %	25 %	374298523
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3145	NC_016629	CAT	2	6	153930	153935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298523
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3153	NC_016629	GCT	2	6	154343	154348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298523
3154	NC_016629	TGC	2	6	154385	154390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298523
3155	NC_016629	GC	3	6	154405	154410	0 %	0 %	50 %	50 %	374298523
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3174	NC_016629	GC	3	6	155405	155410	0 %	0 %	50 %	50 %	374298524
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3182	NC_016629	CCA	2	6	156007	156012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3190	NC_016629	CATG	2	8	156371	156378	25 %	25 %	25 %	25 %	374298525
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3224	NC_016629	TCT	2	6	157996	158001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3225	NC_016629	CG	3	6	158005	158010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3226	NC_016629	GAA	2	6	158017	158022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3227	NC_016629	AAG	2	6	158084	158089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3228	NC_016629	TCT	2	6	158202	158207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298526
3229	NC_016629	CTGC	2	8	158231	158238	0 %	25 %	25 %	50 %	374298526
3230	NC_016629	GCC	2	6	158264	158269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298526
3231	NC_016629	CCT	2	6	158445	158450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298526
3232	NC_016629	T	6	6	158497	158502	0 %	100 %	0 %	0 %	374298526
3233	NC_016629	CCG	2	6	158532	158537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3234	NC_016629	CGGTG	2	10	158579	158588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3235	NC_016629	TCTATA	2	12	158607	158618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3236	NC_016629	ATCA	2	8	158619	158626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3237	NC_016629	AGATCA	2	12	158687	158698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374298527
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3240	NC_016629	TCGCCC	2	12	159159	159170	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374298527
3241	NC_016629	AACGCC	2	12	159179	159190	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374298527
3242	NC_016629	TCC	2	6	159279	159284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298527
3243	NC_016629	CTC	2	6	159347	159352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298527
3244	NC_016629	GTC	2	6	159380	159385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298527
3245	NC_016629	GTG	2	6	159519	159524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298527
3246	NC_016629	AGC	2	6	159555	159560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298527
3247	NC_016629	GAG	2	6	159636	159641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298527
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3259	NC_016629	CTTG	2	8	160214	160221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3260	NC_016629	ATC	2	6	160230	160235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298528
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3283	NC_016629	CCGT	2	8	161657	161664	0 %	25 %	25 %	50 %	374298529
3284	NC_016629	GAC	2	6	161672	161677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298529
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3288	NC_016629	A	7	7	161938	161944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3289	NC_016629	GGTT	2	8	161998	162005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3290	NC_016629	GTA	2	6	162011	162016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3291	NC_016629	GATC	2	8	162038	162045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3292	NC_016629	GCA	2	6	162230	162235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298530
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3314	NC_016629	GAT	2	6	162850	162855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3330	NC_016629	CTGC	2	8	163730	163737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3331	NC_016629	GGC	2	6	163747	163752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3332	NC_016629	AGA	2	6	163770	163775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3333	NC_016629	CAACGG	2	12	163807	163818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3335	NC_016629	CCT	2	6	163893	163898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3336	NC_016629	AGG	2	6	163905	163910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3337	NC_016629	CATC	2	8	163920	163927	25 %	25 %	0 %	50 %	374298532
3338	NC_016629	TC	3	6	163932	163937	0 %	50 %	0 %	50 %	374298532
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3352	NC_016629	CCTGGC	2	12	164935	164946	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374298533
3353	NC_016629	CAG	2	6	164964	164969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298533
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3355	NC_016629	GTTCC	2	10	165031	165040	0 %	40 %	20 %	40 %	374298533
3356	NC_016629	CG	3	6	165063	165068	0 %	0 %	50 %	50 %	374298533
3357	NC_016629	TGG	2	6	165069	165074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298533
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3360	NC_016629	CGG	2	6	165319	165324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298533
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3362	NC_016629	CGCACG	2	12	165644	165655	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374298533
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3367	NC_016629	GCG	2	6	165762	165767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298533
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3369	NC_016629	TCT	2	6	165786	165791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298533
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3484	NC_016629	GCCTT	2	10	170670	170679	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3487	NC_016629	A	6	6	170697	170702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3488	NC_016629	AGCA	2	8	170745	170752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3489	NC_016629	ATA	2	6	170802	170807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_016629	T	6	6	170808	170813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_016629	GAG	2	6	170815	170820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3494	NC_016629	GGT	2	6	171147	171152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298539
3495	NC_016629	CGG	2	6	171204	171209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298539
3496	NC_016629	ACC	2	6	171230	171235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298539
3497	NC_016629	TGG	2	6	171266	171271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298539
3498	NC_016629	CAG	2	6	171289	171294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3499	NC_016629	GCA	2	6	171330	171335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3500	NC_016629	CTG	2	6	171424	171429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298539

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