MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_016629	CAT	2	6	1151695	1151700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299404
24002	NC_016629	C	6	6	1151865	1151870	0 %	0 %	0 %	100 %	374299404
24003	NC_016629	GAG	2	6	1151882	1151887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299404
24004	NC_016629	GCA	2	6	1152037	1152042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299404
24005	NC_016629	TGCG	2	8	1152063	1152070	0 %	25 %	50 %	25 %	374299404
24006	NC_016629	ACG	2	6	1152074	1152079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299404
24007	NC_016629	CAGC	2	8	1152160	1152167	25 %	0 %	25 %	50 %	374299404
24008	NC_016629	GCCA	2	8	1152178	1152185	25 %	0 %	25 %	50 %	374299404
24009	NC_016629	GCC	2	6	1152191	1152196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299404
24010	NC_016629	CGGCCT	2	12	1152202	1152213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374299404
24011	NC_016629	GCAG	2	8	1152278	1152285	25 %	0 %	50 %	25 %	374299404
24012	NC_016629	GAC	2	6	1152325	1152330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299404
24013	NC_016629	CTG	2	6	1152383	1152388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299404
24014	NC_016629	GAC	2	6	1152395	1152400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299404
24015	NC_016629	AGGG	2	8	1152437	1152444	25 %	0 %	75 %	0 %	374299404
24016	NC_016629	GCC	2	6	1152485	1152490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299404
24017	NC_016629	GTG	2	6	1152512	1152517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299404
24018	NC_016629	GCG	2	6	1152562	1152567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299404
24019	NC_016629	AGGGAG	2	12	1152576	1152587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299404
24020	NC_016629	CCATG	2	10	1152625	1152634	20 %	20 %	20 %	40 %	374299404
24021	NC_016629	TGGCCT	2	12	1152732	1152743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299404
24022	NC_016629	GA	3	6	1152809	1152814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24023	NC_016629	TCATT	2	10	1152870	1152879	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24024	NC_016629	GGT	2	6	1152962	1152967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299405
24025	NC_016629	TCG	2	6	1153033	1153038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299405
24026	NC_016629	TCG	2	6	1153072	1153077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299405
24027	NC_016629	TGCA	2	8	1153099	1153106	25 %	25 %	25 %	25 %	374299405
24028	NC_016629	GCCG	2	8	1153107	1153114	0 %	0 %	50 %	50 %	374299405
24029	NC_016629	CGA	2	6	1153136	1153141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299405
24030	NC_016629	CAGC	2	8	1153217	1153224	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24031	NC_016629	GC	3	6	1153234	1153239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24032	NC_016629	AGGG	2	8	1153249	1153256	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24033	NC_016629	GGC	2	6	1153289	1153294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24034	NC_016629	GGC	2	6	1153302	1153307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24035	NC_016629	TGA	3	9	1153325	1153333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24036	NC_016629	CGA	2	6	1153354	1153359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299406
24037	NC_016629	CGC	2	6	1153402	1153407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299406
24038	NC_016629	TGC	3	9	1153470	1153478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299406
24039	NC_016629	GTG	2	6	1153503	1153508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299406
24040	NC_016629	TTG	2	6	1153527	1153532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374299406
24041	NC_016629	CTC	2	6	1153598	1153603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299406
24042	NC_016629	AGG	2	6	1153615	1153620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299406
24043	NC_016629	GCCCG	2	10	1153638	1153647	0 %	0 %	40 %	60 %	374299406
24044	NC_016629	GCC	2	6	1153658	1153663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299406
24045	NC_016629	TTG	2	6	1153713	1153718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374299406
24046	NC_016629	CTT	2	6	1153724	1153729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299406
24047	NC_016629	TTC	2	6	1153731	1153736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299406
24048	NC_016629	TGG	2	6	1153740	1153745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299406
24049	NC_016629	GCG	2	6	1153746	1153751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299406
24050	NC_016629	GAC	2	6	1153754	1153759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299406
24051	NC_016629	TTC	2	6	1153760	1153765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299406
24052	NC_016629	CCA	2	6	1153795	1153800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299406
24053	NC_016629	TGG	2	6	1153807	1153812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299406
24054	NC_016629	GTA	2	6	1153817	1153822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299406
24055	NC_016629	T	6	6	1153823	1153828	0 %	100 %	0 %	0 %	374299406
24056	NC_016629	CCT	2	6	1153921	1153926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299406
24057	NC_016629	CACC	2	8	1153978	1153985	25 %	0 %	0 %	75 %	374299406
24058	NC_016629	CGC	2	6	1153988	1153993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299406
24059	NC_016629	GCC	3	9	1153995	1154003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299406
24060	NC_016629	GGA	2	6	1154011	1154016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299406
24061	NC_016629	CAA	2	6	1154128	1154133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24062	NC_016629	CCGCAA	2	12	1154292	1154303	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374299407
24063	NC_016629	GC	3	6	1154314	1154319	0 %	0 %	50 %	50 %	374299407
24064	NC_016629	CCTGGC	2	12	1154325	1154336	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374299407
24065	NC_016629	CGG	2	6	1154343	1154348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299407
24066	NC_016629	GCTCG	2	10	1154358	1154367	0 %	20 %	40 %	40 %	374299407
24067	NC_016629	GGCCAA	2	12	1154379	1154390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299407
24068	NC_016629	CGC	2	6	1154439	1154444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299407
24069	NC_016629	ACTC	2	8	1154549	1154556	25 %	25 %	0 %	50 %	374299407
24070	NC_016629	CGGCCG	2	12	1154567	1154578	0 %	0 %	50 %	50 %	374299407
24071	NC_016629	ACC	2	6	1154605	1154610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299407
24072	NC_016629	GGCGTG	2	12	1154617	1154628	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374299407
24073	NC_016629	CCA	2	6	1154745	1154750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299407
24074	NC_016629	ACT	2	6	1154807	1154812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299407
24075	NC_016629	CGG	3	9	1154817	1154825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299407
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24079	NC_016629	TCA	2	6	1154966	1154971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299407
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24082	NC_016629	ATG	2	6	1155094	1155099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299407
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24084	NC_016629	ACG	2	6	1155137	1155142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299407
24085	NC_016629	AAG	2	6	1155208	1155213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299407
24086	NC_016629	ATC	2	6	1155232	1155237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299407
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24088	NC_016629	CGA	2	6	1155345	1155350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299407
24089	NC_016629	GGCCAT	2	12	1155393	1155404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374299407
24090	NC_016629	CCTC	2	8	1155479	1155486	0 %	25 %	0 %	75 %	374299407
24091	NC_016629	CGG	2	6	1155558	1155563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299407
24092	NC_016629	GGCC	2	8	1155609	1155616	0 %	0 %	50 %	50 %	374299407
24093	NC_016629	CCT	2	6	1155626	1155631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299407
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24096	NC_016629	CCGG	2	8	1155840	1155847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24097	NC_016629	TCC	2	6	1155849	1155854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24098	NC_016629	GAG	2	6	1155900	1155905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24099	NC_016629	GAG	2	6	1155909	1155914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24100	NC_016629	GGC	2	6	1155915	1155920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24101	NC_016629	CTC	2	6	1155924	1155929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24102	NC_016629	CAG	2	6	1155951	1155956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24103	NC_016629	GCTT	2	8	1156017	1156024	0 %	50 %	25 %	25 %	374299408
24104	NC_016629	CAC	2	6	1156035	1156040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299408
24105	NC_016629	CTG	2	6	1156051	1156056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299408
24106	NC_016629	ACA	2	6	1156124	1156129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374299408
24107	NC_016629	GCA	2	6	1156137	1156142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299408
24108	NC_016629	AGGC	2	8	1156157	1156164	25 %	0 %	50 %	25 %	374299408
24109	NC_016629	GCT	2	6	1156233	1156238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299408
24110	NC_016629	ATGGAC	2	12	1156246	1156257	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374299408
24111	NC_016629	GTG	2	6	1156288	1156293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299408
24112	NC_016629	GC	3	6	1156323	1156328	0 %	0 %	50 %	50 %	374299408
24113	NC_016629	CTG	2	6	1156387	1156392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299408
24114	NC_016629	CGG	2	6	1156404	1156409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299408
24115	NC_016629	TCCT	2	8	1156435	1156442	0 %	50 %	0 %	50 %	374299408
24116	NC_016629	CGC	2	6	1156446	1156451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299408
24117	NC_016629	GCT	2	6	1156467	1156472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299408
24118	NC_016629	CGG	2	6	1156538	1156543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299408
24119	NC_016629	TCA	2	6	1156544	1156549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299408
24120	NC_016629	CCT	2	6	1156619	1156624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299408
24121	NC_016629	CGC	2	6	1156740	1156745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299408
24122	NC_016629	GCC	2	6	1156756	1156761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299408
24123	NC_016629	GCC	2	6	1156795	1156800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299408
24124	NC_016629	GAAC	2	8	1156806	1156813	50 %	0 %	25 %	25 %	374299408
24125	NC_016629	GGC	2	6	1156823	1156828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299408
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24140	NC_016629	TGG	2	6	1157739	1157744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24141	NC_016629	GCCG	2	8	1157758	1157765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24142	NC_016629	GCA	2	6	1157790	1157795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299410
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24144	NC_016629	GC	3	6	1157940	1157945	0 %	0 %	50 %	50 %	374299410
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24154	NC_016629	CGA	2	6	1158319	1158324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299410
24155	NC_016629	CGG	2	6	1158355	1158360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299410
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24160	NC_016629	GTGA	2	8	1158525	1158532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24191	NC_016629	TAT	2	6	1160036	1160041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24202	NC_016629	CGC	2	6	1160587	1160592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24203	NC_016629	CGG	2	6	1160597	1160602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24204	NC_016629	GC	3	6	1160603	1160608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24205	NC_016629	TC	3	6	1160634	1160639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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24208	NC_016629	T	7	7	1160742	1160748	0 %	100 %	0 %	0 %	374299413
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24216	NC_016629	CGC	2	6	1161218	1161223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299413
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24225	NC_016629	TAT	2	6	1161672	1161677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24226	NC_016629	GCAG	2	8	1161689	1161696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24227	NC_016629	GGA	2	6	1161720	1161725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24228	NC_016629	GCC	2	6	1161833	1161838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24229	NC_016629	TCC	2	6	1161926	1161931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299414
24230	NC_016629	TGCAC	2	10	1161939	1161948	20 %	20 %	20 %	40 %	374299414
24231	NC_016629	CCT	2	6	1161966	1161971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299414
24232	NC_016629	CTT	2	6	1161975	1161980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299414
24233	NC_016629	CTGG	2	8	1161982	1161989	0 %	25 %	50 %	25 %	374299414
24234	NC_016629	CCT	2	6	1162122	1162127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24235	NC_016629	GGC	2	6	1162144	1162149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24236	NC_016629	CGC	2	6	1162194	1162199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299415
24237	NC_016629	TAA	2	6	1162235	1162240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374299415
24238	NC_016629	TTTC	2	8	1162244	1162251	0 %	75 %	0 %	25 %	374299415
24239	NC_016629	AC	3	6	1162271	1162276	50 %	0 %	0 %	50 %	374299415
24240	NC_016629	GGC	2	6	1162281	1162286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299415
24241	NC_016629	GCA	2	6	1162311	1162316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299415
24242	NC_016629	GC	3	6	1162329	1162334	0 %	0 %	50 %	50 %	374299415
24243	NC_016629	GGGCC	2	10	1162350	1162359	0 %	0 %	60 %	40 %	374299415
24244	NC_016629	GGC	2	6	1162371	1162376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299415
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24264	NC_016629	A	6	6	1163280	1163285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24265	NC_016629	GCC	2	6	1163432	1163437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24266	NC_016629	GC	3	6	1163446	1163451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24267	NC_016629	CAC	2	6	1163530	1163535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24272	NC_016629	CGT	2	6	1163708	1163713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24278	NC_016629	CGGT	2	8	1164174	1164181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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24293	NC_016629	GCTT	2	8	1164939	1164946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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24341	NC_016629	TGG	2	6	1166917	1166922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299419
24342	NC_016629	CGAGC	2	10	1166933	1166942	20 %	0 %	40 %	40 %	374299419
24343	NC_016629	CGA	2	6	1166953	1166958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299419
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24345	NC_016629	CGT	2	6	1167040	1167045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299419
24346	NC_016629	AAGC	2	8	1167068	1167075	50 %	0 %	25 %	25 %	374299419
24347	NC_016629	CGC	2	6	1167076	1167081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299419
24348	NC_016629	A	7	7	1167094	1167100	100 %	0 %	0 %	0 %	374299419
24349	NC_016629	CG	3	6	1167159	1167164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24350	NC_016629	TGC	2	6	1167367	1167372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24351	NC_016629	GGC	2	6	1167468	1167473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24352	NC_016629	TCG	2	6	1167488	1167493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24353	NC_016629	GGC	2	6	1167503	1167508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24354	NC_016629	CCAG	2	8	1167565	1167572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24355	NC_016629	CAG	2	6	1167604	1167609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24356	NC_016629	CTC	2	6	1167670	1167675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299420
24357	NC_016629	CCT	2	6	1167743	1167748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299420
24358	NC_016629	AGG	2	6	1167755	1167760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299420
24359	NC_016629	CTT	2	6	1167762	1167767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299420
24360	NC_016629	CAG	2	6	1167777	1167782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299420
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24422	NC_016629	CTTGG	2	10	1170655	1170664	0 %	40 %	40 %	20 %	374299422
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24430	NC_016629	CG	3	6	1170867	1170872	0 %	0 %	50 %	50 %	374299423
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24458	NC_016629	TCGG	2	8	1172197	1172204	0 %	25 %	50 %	25 %	374299424
24459	NC_016629	CGC	2	6	1172314	1172319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299424
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24466	NC_016629	CTG	2	6	1172713	1172718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299424
24467	NC_016629	ACCATG	2	12	1172828	1172839	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374299425
24468	NC_016629	ACC	2	6	1172861	1172866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299425
24469	NC_016629	GC	4	8	1172899	1172906	0 %	0 %	50 %	50 %	374299425
24470	NC_016629	CTT	2	6	1172929	1172934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299425
24471	NC_016629	CGG	2	6	1172938	1172943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299425
24472	NC_016629	ATC	2	6	1172972	1172977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299425
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24475	NC_016629	CGG	2	6	1173022	1173027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299425
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24492	NC_016629	GGA	2	6	1173469	1173474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299425
24493	NC_016629	CTG	2	6	1173683	1173688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299425
24494	NC_016629	CG	3	6	1173690	1173695	0 %	0 %	50 %	50 %	374299425
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24496	NC_016629	AGC	2	6	1173765	1173770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299425
24497	NC_016629	GC	3	6	1173972	1173977	0 %	0 %	50 %	50 %	374299425
24498	NC_016629	GAG	2	6	1173989	1173994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299425
24499	NC_016629	CCTC	2	8	1174039	1174046	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24500	NC_016629	GGCA	2	8	1174120	1174127	25 %	0 %	50 %	25 %	374299426

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