MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23005	NC_016629	ATT	2	6	1101191	1101196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23006	NC_016629	AAAC	2	8	1101246	1101253	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23007	NC_016629	GAG	2	6	1101280	1101285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23009	NC_016629	GC	3	6	1101416	1101421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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23238	NC_016629	CGG	2	6	1111879	1111884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299376
23239	NC_016629	AGC	2	6	1111971	1111976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299376
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23242	NC_016629	TCA	2	6	1112164	1112169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299376
23243	NC_016629	CGTG	2	8	1112215	1112222	0 %	25 %	50 %	25 %	374299376
23244	NC_016629	CGGC	2	8	1112223	1112230	0 %	0 %	50 %	50 %	374299376
23245	NC_016629	GCCC	2	8	1112284	1112291	0 %	0 %	25 %	75 %	374299376
23246	NC_016629	GCAG	2	8	1112425	1112432	25 %	0 %	50 %	25 %	374299376
23247	NC_016629	GAT	2	6	1112480	1112485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299376
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23253	NC_016629	CGT	2	6	1112680	1112685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299376
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23255	NC_016629	CTGCT	2	10	1112767	1112776	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23256	NC_016629	GAT	2	6	1112834	1112839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299377
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23262	NC_016629	GC	3	6	1113408	1113413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23263	NC_016629	TCCT	2	8	1113436	1113443	0 %	50 %	0 %	50 %	374299378
23264	NC_016629	CGA	2	6	1113510	1113515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299378
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23318	NC_016629	GGA	2	6	1115764	1115769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23325	NC_016629	AGCG	2	8	1115954	1115961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23326	NC_016629	CTGCG	2	10	1115963	1115972	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23327	NC_016629	GCGA	2	8	1115994	1116001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23328	NC_016629	A	7	7	1116006	1116012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23329	NC_016629	TC	3	6	1116046	1116051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23330	NC_016629	GTG	2	6	1116061	1116066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23331	NC_016629	GCC	2	6	1116201	1116206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23332	NC_016629	CAT	2	6	1116223	1116228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23333	NC_016629	TGGC	2	8	1116308	1116315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23334	NC_016629	GGCAA	2	10	1116344	1116353	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23335	NC_016629	CTA	2	6	1116357	1116362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23336	NC_016629	CAG	2	6	1116475	1116480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23337	NC_016629	AGCA	2	8	1116688	1116695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23338	NC_016629	GC	3	6	1116707	1116712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23339	NC_016629	TCT	2	6	1116810	1116815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23340	NC_016629	CGG	2	6	1116853	1116858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299380
23341	NC_016629	GGT	3	9	1116913	1116921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299380
23342	NC_016629	TC	3	6	1116931	1116936	0 %	50 %	0 %	50 %	374299380
23343	NC_016629	CCCG	2	8	1116965	1116972	0 %	0 %	25 %	75 %	374299380
23344	NC_016629	CCT	2	6	1117015	1117020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299380
23345	NC_016629	GAT	2	6	1117252	1117257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299381
23346	NC_016629	CGTA	2	8	1117398	1117405	25 %	25 %	25 %	25 %	374299381
23347	NC_016629	GC	4	8	1117455	1117462	0 %	0 %	50 %	50 %	374299381
23348	NC_016629	ACC	2	6	1117628	1117633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299381
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23350	NC_016629	GTC	2	6	1117819	1117824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299381
23351	NC_016629	ACA	2	6	1117853	1117858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374299381
23352	NC_016629	CGA	2	6	1117917	1117922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299381
23353	NC_016629	GACC	2	8	1117975	1117982	25 %	0 %	25 %	50 %	374299381
23354	NC_016629	TTGG	2	8	1118033	1118040	0 %	50 %	50 %	0 %	374299381
23355	NC_016629	CAA	2	6	1118097	1118102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374299381
23356	NC_016629	GGA	2	6	1118241	1118246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299382
23357	NC_016629	TCCA	2	8	1118260	1118267	25 %	25 %	0 %	50 %	374299382
23358	NC_016629	AGC	2	6	1118287	1118292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299382
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23392	NC_016629	TG	3	6	1119678	1119683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23475	NC_016629	ATG	2	6	1124743	1124748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299387
23476	NC_016629	GAA	2	6	1124820	1124825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299387
23477	NC_016629	CCT	2	6	1124889	1124894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299387
23478	NC_016629	TCAT	2	8	1124902	1124909	25 %	50 %	0 %	25 %	374299387
23479	NC_016629	CTAC	2	8	1124984	1124991	25 %	25 %	0 %	50 %	374299387
23480	NC_016629	AGT	2	6	1125103	1125108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299387
23481	NC_016629	AG	3	6	1125130	1125135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23482	NC_016629	ATT	2	6	1125290	1125295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374299388
23483	NC_016629	TTCG	2	8	1125306	1125313	0 %	50 %	25 %	25 %	374299388
23484	NC_016629	CTG	2	6	1125387	1125392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299388
23485	NC_016629	AT	3	6	1125628	1125633	50 %	50 %	0 %	0 %	374299388
23486	NC_016629	AAT	2	6	1125653	1125658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374299388
23487	NC_016629	ATGGC	2	10	1125726	1125735	20 %	20 %	40 %	20 %	374299388
23488	NC_016629	TTA	2	6	1125757	1125762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374299388
23489	NC_016629	CTC	2	6	1125779	1125784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299388
23490	NC_016629	GGTA	2	8	1125818	1125825	25 %	25 %	50 %	0 %	374299388
23491	NC_016629	TGG	2	6	1125850	1125855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299388
23492	NC_016629	CCA	2	6	1125899	1125904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299388
23493	NC_016629	GC	3	6	1125916	1125921	0 %	0 %	50 %	50 %	374299388
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23496	NC_016629	TAC	2	6	1126184	1126189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299388
23497	NC_016629	TCA	2	6	1126253	1126258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299388
23498	NC_016629	AATC	2	8	1126439	1126446	50 %	25 %	0 %	25 %	374299388
23499	NC_016629	A	6	6	1126454	1126459	100 %	0 %	0 %	0 %	374299388
23500	NC_016629	TCG	2	6	1126510	1126515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299388

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