MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016629	ATC	2	6	1008831	1008836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299293
21003	NC_016629	TGA	2	6	1008862	1008867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299293
21004	NC_016629	CCA	2	6	1008871	1008876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299293
21005	NC_016629	CG	3	6	1008880	1008885	0 %	0 %	50 %	50 %	374299293
21006	NC_016629	CCG	2	6	1008910	1008915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299293
21007	NC_016629	GGGC	2	8	1008973	1008980	0 %	0 %	75 %	25 %	374299293
21008	NC_016629	CGT	2	6	1008982	1008987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299293
21009	NC_016629	CCT	2	6	1009033	1009038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299293
21010	NC_016629	CTT	2	6	1009052	1009057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299293
21011	NC_016629	GAA	2	6	1009076	1009081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299293
21012	NC_016629	ATG	2	6	1009143	1009148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299293
21013	NC_016629	CCACGA	2	12	1009243	1009254	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374299293
21014	NC_016629	CG	3	6	1009274	1009279	0 %	0 %	50 %	50 %	374299293
21015	NC_016629	CCCTTG	2	12	1009380	1009391	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374299293
21016	NC_016629	GC	3	6	1009412	1009417	0 %	0 %	50 %	50 %	374299293
21017	NC_016629	CTC	2	6	1009433	1009438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299293
21018	NC_016629	ATG	2	6	1009449	1009454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299293
21019	NC_016629	AGG	2	6	1009534	1009539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299293
21020	NC_016629	CAGGGT	2	12	1009565	1009576	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374299293
21021	NC_016629	GC	3	6	1009614	1009619	0 %	0 %	50 %	50 %	374299293
21022	NC_016629	CCA	3	9	1009681	1009689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299293
21023	NC_016629	ACGGC	2	10	1009690	1009699	20 %	0 %	40 %	40 %	374299293
21024	NC_016629	TGA	2	6	1009723	1009728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299293
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21033	NC_016629	TGA	2	6	1010104	1010109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299293
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21052	NC_016629	GC	3	6	1010715	1010720	0 %	0 %	50 %	50 %	374299293
21053	NC_016629	CCGTG	2	10	1010763	1010772	0 %	20 %	40 %	40 %	374299293
21054	NC_016629	TCG	2	6	1010778	1010783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299293
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21056	NC_016629	AAC	2	6	1010844	1010849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21057	NC_016629	GCTT	2	8	1010926	1010933	0 %	50 %	25 %	25 %	374299294
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21088	NC_016629	CTTG	2	8	1012616	1012623	0 %	50 %	25 %	25 %	374299295
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21114	NC_016629	GGT	2	6	1013557	1013562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21115	NC_016629	TCGGA	2	10	1013622	1013631	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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21117	NC_016629	ACC	2	6	1013685	1013690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21118	NC_016629	GAT	2	6	1013708	1013713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_016629	CTT	2	6	1013733	1013738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21120	NC_016629	T	7	7	1013742	1013748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21121	NC_016629	TGC	2	6	1013946	1013951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21123	NC_016629	TAA	2	6	1013983	1013988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21125	NC_016629	A	6	6	1014032	1014037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21126	NC_016629	T	7	7	1014044	1014050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21127	NC_016629	ATACA	2	10	1014066	1014075	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21128	NC_016629	TTA	2	6	1014084	1014089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21129	NC_016629	AAT	2	6	1014096	1014101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21221	NC_016629	GCCG	2	8	1018526	1018533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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21226	NC_016629	TGG	2	6	1018598	1018603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21227	NC_016629	TTCTC	2	10	1018636	1018645	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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21233	NC_016629	GCT	2	6	1018768	1018773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299299
21234	NC_016629	GCA	2	6	1018813	1018818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299299
21235	NC_016629	GGT	2	6	1018843	1018848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299299
21236	NC_016629	GC	3	6	1018899	1018904	0 %	0 %	50 %	50 %	374299299
21237	NC_016629	TCT	2	6	1018909	1018914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299299
21238	NC_016629	GGCG	2	8	1018955	1018962	0 %	0 %	75 %	25 %	374299299
21239	NC_016629	CCT	2	6	1019053	1019058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299299
21240	NC_016629	CGG	2	6	1019122	1019127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299299
21241	NC_016629	CGG	2	6	1019140	1019145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299299
21242	NC_016629	GTACAG	2	12	1019207	1019218	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374299299
21243	NC_016629	AT	3	6	1019297	1019302	50 %	50 %	0 %	0 %	374299299
21244	NC_016629	CGGC	2	8	1019325	1019332	0 %	0 %	50 %	50 %	374299299
21245	NC_016629	GAG	2	6	1019376	1019381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299299
21246	NC_016629	CTTGTC	2	12	1019477	1019488	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374299299
21247	NC_016629	GCA	3	9	1019548	1019556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299299
21248	NC_016629	CG	3	6	1019575	1019580	0 %	0 %	50 %	50 %	374299299
21249	NC_016629	CGC	2	6	1019614	1019619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299299
21250	NC_016629	TTG	2	6	1019652	1019657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374299299
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21252	NC_016629	GTC	2	6	1019807	1019812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299299
21253	NC_016629	GC	3	6	1019904	1019909	0 %	0 %	50 %	50 %	374299299
21254	NC_016629	CCA	2	6	1019917	1019922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299299
21255	NC_016629	GGC	2	6	1019950	1019955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299299
21256	NC_016629	GAT	2	6	1019957	1019962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299299
21257	NC_016629	CTT	2	6	1020206	1020211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299299
21258	NC_016629	GCG	2	6	1020225	1020230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299299
21259	NC_016629	TCG	2	6	1020288	1020293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299299
21260	NC_016629	TCT	2	6	1020331	1020336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299299
21261	NC_016629	TGCTC	2	10	1020400	1020409	0 %	40 %	20 %	40 %	374299299
21262	NC_016629	TCC	2	6	1020564	1020569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21263	NC_016629	CAAGA	2	10	1020651	1020660	60 %	0 %	20 %	20 %	374299300
21264	NC_016629	CATG	2	8	1020663	1020670	25 %	25 %	25 %	25 %	374299300
21265	NC_016629	ATC	2	6	1020718	1020723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299300
21266	NC_016629	CGG	2	6	1020774	1020779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299300
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21270	NC_016629	GCC	2	6	1020964	1020969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299300
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21273	NC_016629	TGC	2	6	1021073	1021078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299300
21274	NC_016629	CGG	2	6	1021092	1021097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299300
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21279	NC_016629	GC	3	6	1021251	1021256	0 %	0 %	50 %	50 %	374299300
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21282	NC_016629	CGG	2	6	1021314	1021319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299300
21283	NC_016629	GCT	2	6	1021332	1021337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299300
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21285	NC_016629	GCC	2	6	1021700	1021705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299301
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21289	NC_016629	GAT	2	6	1021984	1021989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299301
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21291	NC_016629	GTGACT	2	12	1022060	1022071	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374299301
21292	NC_016629	TCG	2	6	1022099	1022104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299301
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21294	NC_016629	GTC	2	6	1022296	1022301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299301
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21304	NC_016629	TTAG	2	8	1022651	1022658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21305	NC_016629	AAT	2	6	1022667	1022672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21307	NC_016629	CTCA	2	8	1022716	1022723	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21308	NC_016629	CCT	2	6	1022756	1022761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21330	NC_016629	GCA	2	6	1023634	1023639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299302
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21332	NC_016629	GAC	2	6	1023696	1023701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21333	NC_016629	AGG	2	6	1023752	1023757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21335	NC_016629	GGC	2	6	1023867	1023872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299303
21336	NC_016629	TGC	2	6	1023879	1023884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299303
21337	NC_016629	GAC	2	6	1023902	1023907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299303
21338	NC_016629	GGC	2	6	1023965	1023970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299303
21339	NC_016629	GAGCG	2	10	1024024	1024033	20 %	0 %	60 %	20 %	374299303
21340	NC_016629	GGC	2	6	1024065	1024070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299303
21341	NC_016629	GCC	2	6	1024094	1024099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21342	NC_016629	CTTC	2	8	1024121	1024128	0 %	50 %	0 %	50 %	374299304
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21344	NC_016629	CAG	2	6	1024221	1024226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299304
21345	NC_016629	CAG	2	6	1024236	1024241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299304
21346	NC_016629	CTT	2	6	1024302	1024307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299304
21347	NC_016629	CTG	3	9	1024347	1024355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299304
21348	NC_016629	ACC	2	6	1024385	1024390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299304
21349	NC_016629	GTT	2	6	1024449	1024454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374299304
21350	NC_016629	CG	4	8	1024511	1024518	0 %	0 %	50 %	50 %	374299304
21351	NC_016629	TCCG	2	8	1024527	1024534	0 %	25 %	25 %	50 %	374299304
21352	NC_016629	GCA	2	6	1024565	1024570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299304
21353	NC_016629	CGC	2	6	1024742	1024747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299304
21354	NC_016629	GAAG	2	8	1024769	1024776	50 %	0 %	50 %	0 %	374299304
21355	NC_016629	AGGA	2	8	1024795	1024802	50 %	0 %	50 %	0 %	374299304
21356	NC_016629	AGG	2	6	1024813	1024818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299304
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21467	NC_016629	GCCT	2	8	1029218	1029225	0 %	25 %	25 %	50 %	374299308
21468	NC_016629	CGG	2	6	1029255	1029260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299308
21469	NC_016629	AACCGC	2	12	1029300	1029311	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21470	NC_016629	A	6	6	1029352	1029357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21471	NC_016629	TAA	2	6	1029397	1029402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21472	NC_016629	GAAGC	2	10	1029495	1029504	40 %	0 %	40 %	20 %	374299309
21473	NC_016629	TCA	2	6	1029508	1029513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299309
21474	NC_016629	CATG	2	8	1029545	1029552	25 %	25 %	25 %	25 %	374299309
21475	NC_016629	AGG	2	6	1029565	1029570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299309
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21477	NC_016629	GCCG	2	8	1029624	1029631	0 %	0 %	50 %	50 %	374299309
21478	NC_016629	AGGC	2	8	1029692	1029699	25 %	0 %	50 %	25 %	374299309
21479	NC_016629	TGGGAT	2	12	1029719	1029730	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	374299309
21480	NC_016629	CAG	2	6	1029867	1029872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299309
21481	NC_016629	CAG	2	6	1029897	1029902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299309
21482	NC_016629	T	6	6	1029909	1029914	0 %	100 %	0 %	0 %	374299309
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21485	NC_016629	CAGA	2	8	1030097	1030104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21486	NC_016629	ACA	2	6	1030178	1030183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21487	NC_016629	CGG	2	6	1030246	1030251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299310
21488	NC_016629	CAG	2	6	1030259	1030264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299310
21489	NC_016629	ACC	2	6	1030335	1030340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299310
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21492	NC_016629	TGCG	2	8	1030435	1030442	0 %	25 %	50 %	25 %	374299310
21493	NC_016629	GCG	2	6	1030451	1030456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299310
21494	NC_016629	CGC	2	6	1030473	1030478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299310
21495	NC_016629	CAG	2	6	1030487	1030492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299310
21496	NC_016629	ATG	2	6	1030497	1030502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299310
21497	NC_016629	CCG	2	6	1030518	1030523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299310
21498	NC_016629	TGA	2	6	1030546	1030551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299310
21499	NC_016629	CTG	3	9	1030580	1030588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299310
21500	NC_016629	TCG	2	6	1030626	1030631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299310

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