MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_016629	GAA	2	6	3621499	3621504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74002	NC_016629	AAT	2	6	3621571	3621576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74003	NC_016629	AG	3	6	3621585	3621590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74004	NC_016629	GAA	2	6	3621603	3621608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301597
74005	NC_016629	TGG	2	6	3621650	3621655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301597
74006	NC_016629	TCA	2	6	3621707	3621712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301597
74007	NC_016629	ACA	2	6	3621716	3621721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301597
74008	NC_016629	CGG	2	6	3621723	3621728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301597
74009	NC_016629	TCAC	2	8	3621740	3621747	25 %	25 %	0 %	50 %	374301597
74010	NC_016629	CAC	2	6	3621790	3621795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301597
74011	NC_016629	AGA	2	6	3621878	3621883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301597
74012	NC_016629	ACG	2	6	3621893	3621898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301597
74013	NC_016629	AGG	2	6	3621947	3621952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301597
74014	NC_016629	CCA	2	6	3621977	3621982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301597
74015	NC_016629	AG	3	6	3622023	3622028	50 %	0 %	50 %	0 %	374301597
74016	NC_016629	CGG	2	6	3622029	3622034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301597
74017	NC_016629	TC	3	6	3622101	3622106	0 %	50 %	0 %	50 %	374301598
74018	NC_016629	AAC	2	6	3622119	3622124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301598
74019	NC_016629	ATC	2	6	3622128	3622133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301598
74020	NC_016629	CGC	2	6	3622208	3622213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301598
74021	NC_016629	GA	3	6	3622216	3622221	50 %	0 %	50 %	0 %	374301598
74022	NC_016629	CATC	2	8	3622233	3622240	25 %	25 %	0 %	50 %	374301598
74023	NC_016629	CGG	2	6	3622247	3622252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301598
74024	NC_016629	TCA	2	6	3622444	3622449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301598
74025	NC_016629	AAG	2	6	3622539	3622544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301598
74026	NC_016629	TGGCCG	2	12	3622570	3622581	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374301598
74027	NC_016629	TGG	2	6	3622657	3622662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301598
74028	NC_016629	CAT	2	6	3622781	3622786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301598
74029	NC_016629	CAT	2	6	3622829	3622834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301598
74030	NC_016629	ACC	2	6	3622837	3622842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301598
74031	NC_016629	TGTC	2	8	3622849	3622856	0 %	50 %	25 %	25 %	374301598
74032	NC_016629	GAA	2	6	3622928	3622933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301598
74033	NC_016629	GTGC	2	8	3623012	3623019	0 %	25 %	50 %	25 %	374301598
74034	NC_016629	GCT	2	6	3623110	3623115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301598
74035	NC_016629	CTT	2	6	3623280	3623285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301599
74036	NC_016629	TCA	2	6	3623292	3623297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301599
74037	NC_016629	CCA	2	6	3623319	3623324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301599
74038	NC_016629	CCG	2	6	3623342	3623347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301599
74039	NC_016629	ATG	2	6	3623378	3623383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301599
74040	NC_016629	CAT	2	6	3623387	3623392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301599
74041	NC_016629	GCG	2	6	3623447	3623452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301599
74042	NC_016629	CTG	2	6	3623576	3623581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301599
74043	NC_016629	TGG	2	6	3623597	3623602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301599
74044	NC_016629	CGG	2	6	3623653	3623658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301599
74045	NC_016629	GT	3	6	3623702	3623707	0 %	50 %	50 %	0 %	374301599
74046	NC_016629	TGA	2	6	3623760	3623765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301599
74047	NC_016629	CCG	2	6	3623771	3623776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301599
74048	NC_016629	CGG	2	6	3623851	3623856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301599
74049	NC_016629	CTC	2	6	3623882	3623887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301599
74050	NC_016629	GCGG	2	8	3623888	3623895	0 %	0 %	75 %	25 %	374301599
74051	NC_016629	CTAC	2	8	3623899	3623906	25 %	25 %	0 %	50 %	374301599
74052	NC_016629	CGT	2	6	3623956	3623961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301599
74053	NC_016629	TCT	2	6	3623976	3623981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301599
74054	NC_016629	GAT	2	6	3623983	3623988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301599
74055	NC_016629	CTG	2	6	3624023	3624028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301599
74056	NC_016629	GCA	2	6	3624033	3624038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301599
74057	NC_016629	TGC	2	6	3624070	3624075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301599
74058	NC_016629	TCC	2	6	3624077	3624082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301599
74059	NC_016629	ATG	2	6	3624128	3624133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301599
74060	NC_016629	TCA	2	6	3624135	3624140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301599
74061	NC_016629	CAT	2	6	3624184	3624189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301599
74062	NC_016629	CTC	2	6	3624212	3624217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301599
74063	NC_016629	CAG	2	6	3624359	3624364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301600
74064	NC_016629	CTC	2	6	3624392	3624397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301600
74065	NC_016629	GGCGT	2	10	3624494	3624503	0 %	20 %	60 %	20 %	374301600
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74067	NC_016629	CAC	2	6	3624646	3624651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301600
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74069	NC_016629	TCA	2	6	3624858	3624863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301601
74070	NC_016629	CTCC	2	8	3624881	3624888	0 %	25 %	0 %	75 %	374301601
74071	NC_016629	GGCATG	2	12	3624953	3624964	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374301601
74072	NC_016629	ATC	2	6	3625019	3625024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301601
74073	NC_016629	TCATCG	2	12	3625050	3625061	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374301601
74074	NC_016629	GCT	2	6	3625087	3625092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301601
74075	NC_016629	TCG	2	6	3625149	3625154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301601
74076	NC_016629	TGGGCT	2	12	3625236	3625247	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374301601
74077	NC_016629	CCTT	2	8	3625263	3625270	0 %	50 %	0 %	50 %	374301601
74078	NC_016629	TTCG	2	8	3625330	3625337	0 %	50 %	25 %	25 %	374301601
74079	NC_016629	TCG	2	6	3625374	3625379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301601
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74088	NC_016629	GCA	2	6	3625702	3625707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301602
74089	NC_016629	TCG	2	6	3625785	3625790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301602
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74100	NC_016629	GCC	2	6	3626096	3626101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301602
74101	NC_016629	GATTCT	2	12	3626140	3626151	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374301603
74102	NC_016629	CTG	2	6	3626156	3626161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301603
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74105	NC_016629	GCG	2	6	3626265	3626270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301603
74106	NC_016629	GCT	2	6	3626286	3626291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301603
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74109	NC_016629	CGG	2	6	3626509	3626514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301603
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74112	NC_016629	CGA	2	6	3626719	3626724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301603
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74115	NC_016629	GCG	2	6	3626808	3626813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301603
74116	NC_016629	CTG	2	6	3626816	3626821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301603
74117	NC_016629	CCGCTG	2	12	3626840	3626851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374301603
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74119	NC_016629	GCC	2	6	3626892	3626897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301603
74120	NC_016629	TCG	2	6	3626943	3626948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301603
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74124	NC_016629	CGG	2	6	3627112	3627117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301603
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74128	NC_016629	CAT	2	6	3627442	3627447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301603
74129	NC_016629	CG	4	8	3627534	3627541	0 %	0 %	50 %	50 %	374301603
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74166	NC_016629	TTTCA	2	10	3629383	3629392	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74167	NC_016629	GTC	2	6	3629443	3629448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74168	NC_016629	CGG	2	6	3629513	3629518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74169	NC_016629	T	7	7	3629521	3629527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74170	NC_016629	GAG	2	6	3629535	3629540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74171	NC_016629	TCTT	2	8	3629576	3629583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74172	NC_016629	GCG	2	6	3629651	3629656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74173	NC_016629	AGC	2	6	3629774	3629779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74174	NC_016629	TC	3	6	3629818	3629823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74175	NC_016629	CAG	2	6	3629872	3629877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301605
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74200	NC_016629	CTG	2	6	3631193	3631198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74201	NC_016629	TGA	2	6	3631211	3631216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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74203	NC_016629	ATT	2	6	3631384	3631389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74204	NC_016629	GCT	2	6	3631423	3631428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301606
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74215	NC_016629	TGC	2	6	3632288	3632293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301607
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74220	NC_016629	GGACT	2	10	3632424	3632433	20 %	20 %	40 %	20 %	374301607
74221	NC_016629	CTC	2	6	3632463	3632468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301607
74222	NC_016629	GGC	2	6	3632477	3632482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301607
74223	NC_016629	CT	3	6	3632602	3632607	0 %	50 %	0 %	50 %	374301607
74224	NC_016629	CAC	2	6	3632616	3632621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301607
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74227	NC_016629	CAC	2	6	3633007	3633012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301608
74228	NC_016629	CAGG	2	8	3633137	3633144	25 %	0 %	50 %	25 %	374301608
74229	NC_016629	TGCC	2	8	3633169	3633176	0 %	25 %	25 %	50 %	374301608
74230	NC_016629	CTG	2	6	3633192	3633197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301608
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74232	NC_016629	AGA	2	6	3633226	3633231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301608
74233	NC_016629	GC	3	6	3633291	3633296	0 %	0 %	50 %	50 %	374301608
74234	NC_016629	GTGG	2	8	3633302	3633309	0 %	25 %	75 %	0 %	374301608
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74268	NC_016629	AGGA	2	8	3635262	3635269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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74346	NC_016629	T	6	6	3640166	3640171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74347	NC_016629	ACC	2	6	3640249	3640254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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74350	NC_016629	CT	4	8	3640438	3640445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74351	NC_016629	GATC	2	8	3640519	3640526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74352	NC_016629	TGC	2	6	3640647	3640652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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74354	NC_016629	TTC	2	6	3640872	3640877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74355	NC_016629	GAT	2	6	3640931	3640936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74356	NC_016629	TC	3	6	3640952	3640957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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74360	NC_016629	GGT	2	6	3641050	3641055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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74458	NC_016629	TG	3	6	3646918	3646923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74459	NC_016629	A	6	6	3646942	3646947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74463	NC_016629	TCA	2	6	3647076	3647081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301617
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