MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_016629	GCAC	2	8	3409126	3409133	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70002	NC_016629	GGA	2	6	3409137	3409142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70003	NC_016629	GA	3	6	3409141	3409146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70004	NC_016629	CCTT	2	8	3409359	3409366	0 %	50 %	0 %	50 %	374301408
70005	NC_016629	TGG	2	6	3409411	3409416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301408
70006	NC_016629	GTG	2	6	3409498	3409503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301408
70007	NC_016629	TTG	2	6	3409518	3409523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374301408
70008	NC_016629	GCC	2	6	3409561	3409566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301408
70009	NC_016629	GCA	2	6	3409595	3409600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301408
70010	NC_016629	GGC	2	6	3409605	3409610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301408
70011	NC_016629	CTG	2	6	3409656	3409661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301408
70012	NC_016629	CTT	2	6	3409729	3409734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301408
70013	NC_016629	TCAAGA	2	12	3409774	3409785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374301408
70014	NC_016629	TCC	2	6	3409890	3409895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301408
70015	NC_016629	T	6	6	3409900	3409905	0 %	100 %	0 %	0 %	374301408
70016	NC_016629	CAC	2	6	3409973	3409978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301408
70017	NC_016629	TTC	2	6	3410088	3410093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301408
70018	NC_016629	GAG	2	6	3410100	3410105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301408
70019	NC_016629	TCA	2	6	3410113	3410118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301408
70020	NC_016629	AGC	2	6	3410137	3410142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301408
70021	NC_016629	TGC	2	6	3410188	3410193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301408
70022	NC_016629	ATCC	2	8	3410205	3410212	25 %	25 %	0 %	50 %	374301408
70023	NC_016629	ATA	2	6	3410244	3410249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374301408
70024	NC_016629	GACA	2	8	3410279	3410286	50 %	0 %	25 %	25 %	374301408
70025	NC_016629	ATC	2	6	3410310	3410315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301408
70026	NC_016629	CAT	2	6	3410408	3410413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301408
70027	NC_016629	GTG	2	6	3410442	3410447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301408
70028	NC_016629	CCT	2	6	3410465	3410470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301408
70029	NC_016629	AGG	2	6	3410518	3410523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301408
70030	NC_016629	CAG	2	6	3410547	3410552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301408
70031	NC_016629	GCT	2	6	3410567	3410572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301408
70032	NC_016629	AAG	2	6	3410604	3410609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301408
70033	NC_016629	TGA	2	6	3410684	3410689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301408
70034	NC_016629	ATT	2	6	3410752	3410757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374301408
70035	NC_016629	AGA	2	6	3410765	3410770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301408
70036	NC_016629	TGA	2	6	3410771	3410776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301408
70037	NC_016629	A	7	7	3410793	3410799	100 %	0 %	0 %	0 %	374301408
70038	NC_016629	CCCCGC	2	12	3410876	3410887	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	374301408
70039	NC_016629	GGA	2	6	3410944	3410949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70040	NC_016629	TGG	2	6	3411013	3411018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301409
70041	NC_016629	GCA	2	6	3411083	3411088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301409
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70043	NC_016629	TCA	2	6	3411253	3411258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301409
70044	NC_016629	ATCC	2	8	3411410	3411417	25 %	25 %	0 %	50 %	374301409
70045	NC_016629	CTT	2	6	3411432	3411437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301409
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70047	NC_016629	CAT	2	6	3411683	3411688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301409
70048	NC_016629	GGCAAG	2	12	3411747	3411758	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374301409
70049	NC_016629	GC	4	8	3411811	3411818	0 %	0 %	50 %	50 %	374301409
70050	NC_016629	CTG	2	6	3411928	3411933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301409
70051	NC_016629	GCCC	2	8	3412077	3412084	0 %	0 %	25 %	75 %	374301410
70052	NC_016629	GCG	2	6	3412116	3412121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301410
70053	NC_016629	GCA	2	6	3412126	3412131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301410
70054	NC_016629	TGC	2	6	3412143	3412148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301410
70055	NC_016629	CTC	2	6	3412152	3412157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301410
70056	NC_016629	TTAGAA	2	12	3412241	3412252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374301410
70057	NC_016629	ACGA	2	8	3412266	3412273	50 %	0 %	25 %	25 %	374301410
70058	NC_016629	GCT	2	6	3412330	3412335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301410
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70063	NC_016629	GGC	2	6	3412637	3412642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301410
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70069	NC_016629	CAG	2	6	3412815	3412820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301411
70070	NC_016629	GCT	2	6	3412911	3412916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301411
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70080	NC_016629	TAC	2	6	3413542	3413547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301411
70081	NC_016629	GCCT	2	8	3413551	3413558	0 %	25 %	25 %	50 %	374301411
70082	NC_016629	CTTGGC	2	12	3413733	3413744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301411
70083	NC_016629	ACT	2	6	3413842	3413847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301411
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70085	NC_016629	CT	3	6	3413988	3413993	0 %	50 %	0 %	50 %	374301411
70086	NC_016629	GCA	3	9	3413997	3414005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301411
70087	NC_016629	GCG	2	6	3414018	3414023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301411
70088	NC_016629	GCA	2	6	3414025	3414030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301411
70089	NC_016629	AACA	2	8	3414031	3414038	75 %	0 %	0 %	25 %	374301411
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70091	NC_016629	TCGCGC	2	12	3414239	3414250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70092	NC_016629	CTG	2	6	3414306	3414311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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70099	NC_016629	AAAG	2	8	3414626	3414633	75 %	0 %	25 %	0 %	374301412
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70101	NC_016629	TC	3	6	3414755	3414760	0 %	50 %	0 %	50 %	374301412
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70109	NC_016629	ACA	2	6	3415119	3415124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70110	NC_016629	TAACCG	2	12	3415204	3415215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70111	NC_016629	ATC	2	6	3415231	3415236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70112	NC_016629	CAA	2	6	3415295	3415300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70113	NC_016629	TCC	2	6	3415325	3415330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301413
70114	NC_016629	AT	3	6	3415346	3415351	50 %	50 %	0 %	0 %	374301413
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70116	NC_016629	CGG	2	6	3415487	3415492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301413
70117	NC_016629	GGC	2	6	3415850	3415855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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70233	NC_016629	CAA	2	6	3421503	3421508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301417
70234	NC_016629	ATAC	2	8	3421533	3421540	50 %	25 %	0 %	25 %	374301417
70235	NC_016629	TGC	2	6	3421553	3421558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301417
70236	NC_016629	GGC	2	6	3421611	3421616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301417
70237	NC_016629	CCT	2	6	3421628	3421633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301417
70238	NC_016629	CGG	2	6	3421646	3421651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301417
70239	NC_016629	CTT	2	6	3421665	3421670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301417
70240	NC_016629	CTT	2	6	3421673	3421678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301417
70241	NC_016629	TTG	2	6	3421747	3421752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374301417
70242	NC_016629	CTG	2	6	3421833	3421838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301417
70243	NC_016629	TCC	2	6	3421863	3421868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301418
70244	NC_016629	CAC	2	6	3421920	3421925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301418
70245	NC_016629	CAT	2	6	3421935	3421940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301418
70246	NC_016629	CGC	2	6	3421945	3421950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301418
70247	NC_016629	TC	3	6	3421966	3421971	0 %	50 %	0 %	50 %	374301418
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70249	NC_016629	TGC	2	6	3422050	3422055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301418
70250	NC_016629	CAT	3	9	3422109	3422117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301418
70251	NC_016629	TGGC	2	8	3422126	3422133	0 %	25 %	50 %	25 %	374301418
70252	NC_016629	TTTC	2	8	3422184	3422191	0 %	75 %	0 %	25 %	374301418
70253	NC_016629	CTCGT	2	10	3422245	3422254	0 %	40 %	20 %	40 %	374301418
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70264	NC_016629	ATC	2	6	3422666	3422671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301418
70265	NC_016629	AG	4	8	3422822	3422829	50 %	0 %	50 %	0 %	374301418
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70272	NC_016629	CGG	2	6	3423189	3423194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301418
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70304	NC_016629	CAC	2	6	3425073	3425078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301419
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70306	NC_016629	GC	3	6	3425109	3425114	0 %	0 %	50 %	50 %	374301419
70307	NC_016629	CG	3	6	3425145	3425150	0 %	0 %	50 %	50 %	374301419
70308	NC_016629	GCC	2	6	3425160	3425165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301419
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70313	NC_016629	GTC	2	6	3425469	3425474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301419
70314	NC_016629	A	6	6	3425479	3425484	100 %	0 %	0 %	0 %	374301419
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70324	NC_016629	GCT	2	6	3426316	3426321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301420
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70327	NC_016629	T	6	6	3426517	3426522	0 %	100 %	0 %	0 %	374301421
70328	NC_016629	CAG	2	6	3426523	3426528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301421
70329	NC_016629	GCC	2	6	3426542	3426547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301421
70330	NC_016629	TTC	3	9	3426548	3426556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301421
70331	NC_016629	CTT	2	6	3426592	3426597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301421
70332	NC_016629	CTT	2	6	3426631	3426636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301421
70333	NC_016629	TGGG	2	8	3426824	3426831	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70334	NC_016629	TGC	2	6	3426997	3427002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70335	NC_016629	CCA	2	6	3427093	3427098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301422
70336	NC_016629	CCA	2	6	3427186	3427191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301422
70337	NC_016629	ATC	2	6	3427235	3427240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301422
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70339	NC_016629	TTC	2	6	3427329	3427334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301423
70340	NC_016629	TTC	2	6	3427371	3427376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301423
70341	NC_016629	TCCTC	2	10	3427536	3427545	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
70342	NC_016629	AAC	2	6	3427559	3427564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70343	NC_016629	CCAT	2	8	3427568	3427575	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70344	NC_016629	ATTC	2	8	3427619	3427626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70345	NC_016629	AGC	2	6	3427664	3427669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70346	NC_016629	ATTAA	2	10	3427721	3427730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70347	NC_016629	T	8	8	3427788	3427795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70348	NC_016629	GA	3	6	3427797	3427802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70349	NC_016629	ACA	2	6	3427815	3427820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70350	NC_016629	CTC	2	6	3427881	3427886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301424
70351	NC_016629	TAA	2	6	3427907	3427912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374301424
70352	NC_016629	CCA	2	6	3427944	3427949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301424
70353	NC_016629	AAT	2	6	3428002	3428007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374301424
70354	NC_016629	CTTGGG	2	12	3428082	3428093	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374301424
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70356	NC_016629	GTG	2	6	3428246	3428251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301424
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70358	NC_016629	CTC	2	6	3428337	3428342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301424
70359	NC_016629	ACT	2	6	3428368	3428373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301424
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70363	NC_016629	GCG	2	6	3428533	3428538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301424
70364	NC_016629	A	6	6	3428569	3428574	100 %	0 %	0 %	0 %	374301424
70365	NC_016629	CTG	2	6	3428612	3428617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301424
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70367	NC_016629	CAT	2	6	3428831	3428836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301425
70368	NC_016629	T	7	7	3428860	3428866	0 %	100 %	0 %	0 %	374301425
70369	NC_016629	GCG	2	6	3428878	3428883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301425
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70374	NC_016629	GAAC	2	8	3429167	3429174	50 %	0 %	25 %	25 %	374301425
70375	NC_016629	TGA	2	6	3429203	3429208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301425
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70377	NC_016629	TGA	2	6	3429479	3429484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301425
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70380	NC_016629	GCA	2	6	3429641	3429646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301425
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70382	NC_016629	ATA	2	6	3429834	3429839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374301425
70383	NC_016629	CTT	2	6	3429851	3429856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301425
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70451	NC_016629	A	7	7	3434433	3434439	100 %	0 %	0 %	0 %	374301429
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70499	NC_016629	CAC	2	6	3436999	3437004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301432
70500	NC_016629	TCG	2	6	3437018	3437023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301432

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