MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfotomaculum carboxydivorans CO-1-SRB chromosome

Total Repeats: 59525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015565	T	6	6	33	38	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015565	TAA	2	6	104	109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922238
3	NC_015565	CAT	2	6	167	172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922238
4	NC_015565	TGGC	2	8	204	211	0 %	25 %	50 %	25 %	333922238
5	NC_015565	TAT	2	6	227	232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333922238
6	NC_015565	AAG	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922238
7	NC_015565	AAC	2	6	304	309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922238
8	NC_015565	AT	3	6	352	357	50 %	50 %	0 %	0 %	333922238
9	NC_015565	TA	3	6	470	475	50 %	50 %	0 %	0 %	333922238
10	NC_015565	ACATT	2	10	521	530	40 %	40 %	0 %	20 %	333922238
11	NC_015565	TAA	2	6	632	637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922238
12	NC_015565	GTA	2	6	643	648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922238
13	NC_015565	GAC	2	6	666	671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922238
14	NC_015565	GAA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922238
15	NC_015565	AAT	2	6	752	757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922238
16	NC_015565	GCC	2	6	773	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333922238
17	NC_015565	GGA	2	6	797	802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922238
18	NC_015565	A	6	6	885	890	100 %	0 %	0 %	0 %	333922238
19	NC_015565	GGAG	2	8	974	981	25 %	0 %	75 %	0 %	333922238
20	NC_015565	GGC	2	6	1040	1045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922238
21	NC_015565	GGA	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922238
22	NC_015565	A	6	6	1158	1163	100 %	0 %	0 %	0 %	333922238
23	NC_015565	GAA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922238
24	NC_015565	CAC	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922238
25	NC_015565	TTG	2	6	1300	1305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333922238
26	NC_015565	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922238
27	NC_015565	A	6	6	1401	1406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015565	AATT	2	8	1421	1428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015565	ATA	3	9	1451	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015565	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015565	AAC	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015565	TATTAC	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015565	ATA	2	6	1562	1567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015565	ATA	3	9	1572	1580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015565	A	7	7	1589	1595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015565	AAT	2	6	1618	1623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922239
37	NC_015565	TTAT	2	8	1712	1719	25 %	75 %	0 %	0 %	333922239
38	NC_015565	AAG	3	9	1797	1805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922239
39	NC_015565	CCAG	2	8	1820	1827	25 %	0 %	25 %	50 %	333922239
40	NC_015565	AGA	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922239
41	NC_015565	ATG	2	6	1941	1946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922239
42	NC_015565	GGA	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922239
43	NC_015565	TGA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922239
44	NC_015565	ACA	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922239
45	NC_015565	TGG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333922239
46	NC_015565	GAG	2	6	2150	2155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922239
47	NC_015565	TCA	2	6	2187	2192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922239
48	NC_015565	TTG	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333922239
49	NC_015565	GGGT	2	8	2433	2440	0 %	25 %	75 %	0 %	333922239
50	NC_015565	ATT	2	6	2480	2485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333922239
51	NC_015565	GAA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922239
52	NC_015565	AAC	2	6	2545	2550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922239
53	NC_015565	TTGA	2	8	2576	2583	25 %	50 %	25 %	0 %	333922239
54	NC_015565	ATTT	2	8	2612	2619	25 %	75 %	0 %	0 %	333922239
55	NC_015565	GTG	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015565	A	6	6	2729	2734	100 %	0 %	0 %	0 %	333922240
57	NC_015565	AAC	2	6	2743	2748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922240
58	NC_015565	ACG	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922240
59	NC_015565	TGTGA	2	10	2925	2934	20 %	40 %	40 %	0 %	333922240
60	NC_015565	AAC	2	6	2969	2974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922241
61	NC_015565	ATC	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922241
62	NC_015565	CTG	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922241
63	NC_015565	TAT	2	6	3074	3079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333922241
64	NC_015565	TCC	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333922241
65	NC_015565	TTAA	2	8	3200	3207	50 %	50 %	0 %	0 %	333922241
66	NC_015565	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	333922241
67	NC_015565	GTTTT	2	10	3278	3287	0 %	80 %	20 %	0 %	333922241
68	NC_015565	GGA	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922241
69	NC_015565	CATG	2	8	3380	3387	25 %	25 %	25 %	25 %	333922241
70	NC_015565	CTG	2	6	3425	3430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922241
71	NC_015565	AT	3	6	3462	3467	50 %	50 %	0 %	0 %	333922241
72	NC_015565	AGC	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922241
73	NC_015565	T	7	7	3513	3519	0 %	100 %	0 %	0 %	333922241
74	NC_015565	A	6	6	3536	3541	100 %	0 %	0 %	0 %	333922241
75	NC_015565	GAA	2	6	3644	3649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922241
76	NC_015565	T	6	6	3663	3668	0 %	100 %	0 %	0 %	333922241
77	NC_015565	GGC	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922241
78	NC_015565	CAAA	2	8	3679	3686	75 %	0 %	0 %	25 %	333922241
79	NC_015565	GAT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922241
80	NC_015565	GAT	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922241
81	NC_015565	TAT	2	6	3888	3893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333922241
82	NC_015565	ACC	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922241
83	NC_015565	TGA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922241
84	NC_015565	AGG	2	6	4047	4052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922241
85	NC_015565	A	7	7	4095	4101	100 %	0 %	0 %	0 %	333922242
86	NC_015565	ATT	2	6	4105	4110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333922242
87	NC_015565	GAAAAA	2	12	4207	4218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333922242
88	NC_015565	TTA	2	6	4226	4231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333922242
89	NC_015565	TAC	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922242
90	NC_015565	GATA	2	8	4375	4382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015565	ATT	2	6	4410	4415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015565	ATGG	2	8	4479	4486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015565	CATGGA	2	12	4491	4502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333922243
94	NC_015565	TAA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922243
95	NC_015565	GTAT	2	8	4577	4584	25 %	50 %	25 %	0 %	333922243
96	NC_015565	GCA	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922243
97	NC_015565	GGT	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333922243
98	NC_015565	ACA	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922243
99	NC_015565	GGA	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922243
100	NC_015565	CGGG	2	8	4725	4732	0 %	0 %	75 %	25 %	333922243
101	NC_015565	CGG	2	6	4769	4774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922243
102	NC_015565	TGC	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922243
103	NC_015565	TGGCGG	2	12	4815	4826	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333922243
104	NC_015565	GGT	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333922243
105	NC_015565	ATC	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922243
106	NC_015565	GCAAAA	2	12	4976	4987	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333922243
107	NC_015565	TTTAG	2	10	5044	5053	20 %	60 %	20 %	0 %	333922243
108	NC_015565	TAAA	2	8	5090	5097	75 %	25 %	0 %	0 %	333922243
109	NC_015565	GA	3	6	5122	5127	50 %	0 %	50 %	0 %	333922243
110	NC_015565	C	6	6	5133	5138	0 %	0 %	0 %	100 %	333922243
111	NC_015565	TTG	2	6	5258	5263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333922243
112	NC_015565	CAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922243
113	NC_015565	GGT	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333922243
114	NC_015565	A	6	6	5415	5420	100 %	0 %	0 %	0 %	333922243
115	NC_015565	GGA	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922243
116	NC_015565	TCA	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922243
117	NC_015565	TTG	2	6	5549	5554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333922243
118	NC_015565	AGA	2	6	5589	5594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922243
119	NC_015565	ATT	2	6	5617	5622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333922243
120	NC_015565	CTG	2	6	5636	5641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922243
121	NC_015565	CCCGGG	2	12	5642	5653	0 %	0 %	50 %	50 %	333922243
122	NC_015565	AGC	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922243
123	NC_015565	TGG	2	6	5771	5776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333922243
124	NC_015565	GGAT	2	8	5876	5883	25 %	25 %	50 %	0 %	333922243
125	NC_015565	ATC	2	6	5983	5988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922243
126	NC_015565	CTG	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922243
127	NC_015565	CCT	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333922243
128	NC_015565	AGA	2	6	6159	6164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922243
129	NC_015565	ATT	2	6	6165	6170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333922243
130	NC_015565	AG	3	6	6173	6178	50 %	0 %	50 %	0 %	333922243
131	NC_015565	AAC	2	6	6236	6241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922243
132	NC_015565	ACC	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922243
133	NC_015565	GGA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333922243
134	NC_015565	CCG	2	6	6354	6359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333922243
135	NC_015565	AT	3	6	6401	6406	50 %	50 %	0 %	0 %	333922243
136	NC_015565	GTAA	2	8	6427	6434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015565	ATAAA	2	10	6436	6445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015565	TTAA	2	8	6446	6453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015565	AGG	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_015565	ATTT	2	8	7466	7473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015565	A	6	6	7500	7505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015565	ATG	2	6	7582	7587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_015565	TCGTG	2	10	11575	11584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
254	NC_015565	GA	4	8	11638	11645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_015565	TAC	2	6	11737	11742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_015565	AC	3	6	11899	11904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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262	NC_015565	AGG	2	6	11959	11964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_015565	AAATA	2	10	12209	12218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015565	A	6	6	12218	12223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_015565	GGT	2	6	12360	12365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_015565	CCA	2	6	12382	12387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_015565	CCA	2	6	12495	12500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_015565	GAA	2	6	12685	12690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015565	CGA	2	6	12724	12729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_015565	CGG	2	6	12806	12811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_015565	AGG	2	6	12852	12857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015565	GGA	2	6	12889	12894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
277	NC_015565	AGAA	2	8	12897	12904	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015565	GCG	2	6	12923	12928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_015565	A	6	6	12988	12993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_015565	TGC	2	6	13030	13035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_015565	AC	3	6	13046	13051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_015565	G	6	6	13125	13130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015565	ACC	2	6	13131	13136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_015565	C	6	6	13135	13140	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
285	NC_015565	GGGAG	2	10	13206	13215	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015565	A	6	6	13328	13333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_015565	GA	3	6	13943	13948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015565	CCG	2	6	14002	14007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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298	NC_015565	CA	3	6	14215	14220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
299	NC_015565	AAG	2	6	14248	14253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_015565	ACC	2	6	14886	14891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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313	NC_015565	CGCAGG	2	12	15336	15347	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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322	NC_015565	AT	3	6	16112	16117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_015565	TATT	2	8	16130	16137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_015565	ATTGG	2	10	20463	20472	20 %	40 %	40 %	0 %	333922252
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409	NC_015565	TAG	2	6	20499	20504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922252
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