MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 4314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015162	CAC	2	6	158088	158093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284416
3502	NC_015162	TAC	2	6	158201	158206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284417
3503	NC_015162	GGCA	2	8	158227	158234	25 %	0 %	50 %	25 %	325284417
3504	NC_015162	CCT	2	6	158237	158242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284417
3505	NC_015162	GAC	2	6	158291	158296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284417
3506	NC_015162	CAG	2	6	158297	158302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284417
3507	NC_015162	GC	3	6	158317	158322	0 %	0 %	50 %	50 %	325284417
3508	NC_015162	CTG	2	6	158426	158431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284417
3509	NC_015162	AGC	2	6	158445	158450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284417
3510	NC_015162	GCT	2	6	158579	158584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284417
3511	NC_015162	TG	3	6	158589	158594	0 %	50 %	50 %	0 %	325284417
3512	NC_015162	GCC	2	6	158678	158683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284418
3513	NC_015162	AGC	2	6	158690	158695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3514	NC_015162	CTG	2	6	158698	158703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3515	NC_015162	TGA	2	6	158730	158735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284418
3516	NC_015162	TGA	2	6	158916	158921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284418
3517	NC_015162	CGGC	2	8	159005	159012	0 %	0 %	50 %	50 %	325284418
3518	NC_015162	CAA	2	6	159070	159075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284418
3519	NC_015162	CAG	2	6	159133	159138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3520	NC_015162	AGG	2	6	159172	159177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284418
3521	NC_015162	CAA	2	6	159181	159186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284418
3522	NC_015162	CAG	2	6	159256	159261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3523	NC_015162	TTCGG	2	10	159283	159292	0 %	40 %	40 %	20 %	325284418
3524	NC_015162	GCA	2	6	159312	159317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3525	NC_015162	GCG	2	6	159478	159483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284418
3526	NC_015162	CTGAG	2	10	159541	159550	20 %	20 %	40 %	20 %	325284418
3527	NC_015162	GCC	2	6	159563	159568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284418
3528	NC_015162	CTTCGT	2	12	159588	159599	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325284418
3529	NC_015162	GCC	2	6	159606	159611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284418
3530	NC_015162	GTT	2	6	159690	159695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325284418
3531	NC_015162	GT	3	6	159704	159709	0 %	50 %	50 %	0 %	325284418
3532	NC_015162	CAC	2	6	159747	159752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284418
3533	NC_015162	GCA	2	6	159762	159767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3534	NC_015162	GTA	2	6	159790	159795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284418
3535	NC_015162	GTG	2	6	159796	159801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284418
3536	NC_015162	GCA	2	6	159849	159854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3537	NC_015162	ACC	2	6	159869	159874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284418
3538	NC_015162	GCCTG	2	10	159891	159900	0 %	20 %	40 %	40 %	325284418
3539	NC_015162	CTT	2	6	159903	159908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284418
3540	NC_015162	AGAT	2	8	159917	159924	50 %	25 %	25 %	0 %	325284418
3541	NC_015162	GCA	2	6	159954	159959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3542	NC_015162	GGCTC	2	10	159978	159987	0 %	20 %	40 %	40 %	325284418
3543	NC_015162	AGC	2	6	160004	160009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3544	NC_015162	TGCG	2	8	160023	160030	0 %	25 %	50 %	25 %	325284418
3545	NC_015162	AGC	3	9	160052	160060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3546	NC_015162	GGT	2	6	160198	160203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284418
3547	NC_015162	CAG	2	6	160204	160209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3548	NC_015162	GTA	2	6	160213	160218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284418
3549	NC_015162	GCT	3	9	160533	160541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3550	NC_015162	CAG	2	6	160561	160566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3551	NC_015162	AGC	2	6	160573	160578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284418
3552	NC_015162	GCAG	2	8	160620	160627	25 %	0 %	50 %	25 %	325284418
3553	NC_015162	GAT	2	6	160669	160674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284418
3554	NC_015162	GGA	2	6	160764	160769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284418
3555	NC_015162	CCAG	2	8	160811	160818	25 %	0 %	25 %	50 %	325284418
3556	NC_015162	ACC	2	6	160868	160873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284418
3557	NC_015162	CTT	2	6	160875	160880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284418
3558	NC_015162	ACC	2	6	160898	160903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284418
3559	NC_015162	AGA	2	6	160904	160909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284418
3560	NC_015162	ATAG	2	8	160999	161006	50 %	25 %	25 %	0 %	325284418
3561	NC_015162	TGA	2	6	161223	161228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284418
3562	NC_015162	ATT	2	6	161530	161535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325284419
3563	NC_015162	CAA	2	6	161569	161574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284419
3564	NC_015162	CGG	2	6	161744	161749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284419
3565	NC_015162	GCT	2	6	161837	161842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284419
3566	NC_015162	AGCA	2	8	161844	161851	50 %	0 %	25 %	25 %	325284419
3567	NC_015162	CTG	2	6	161886	161891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284419
3568	NC_015162	TGC	2	6	161995	162000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284419
3569	NC_015162	CAG	2	6	162025	162030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284419
3570	NC_015162	GCCT	2	8	162084	162091	0 %	25 %	25 %	50 %	325284419
3571	NC_015162	GC	3	6	162095	162100	0 %	0 %	50 %	50 %	325284419
3572	NC_015162	ACC	2	6	162225	162230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284419
3573	NC_015162	AGC	2	6	162256	162261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284419
3574	NC_015162	GCA	2	6	162314	162319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284419
3575	NC_015162	AAG	2	6	162357	162362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_015162	ATT	2	6	162369	162374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_015162	GC	3	6	162401	162406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_015162	CCGA	2	8	162420	162427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_015162	ACA	2	6	162475	162480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284420
3580	NC_015162	GAA	2	6	162481	162486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284420
3581	NC_015162	AAG	2	6	162523	162528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284420
3582	NC_015162	CCA	2	6	162593	162598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284420
3583	NC_015162	TTC	2	6	162628	162633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284420
3584	NC_015162	CAT	2	6	162756	162761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284420
3585	NC_015162	GCAGCG	2	12	162824	162835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284420
3586	NC_015162	CTG	2	6	162865	162870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284420
3587	NC_015162	CGC	2	6	162966	162971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284420
3588	NC_015162	ATCCAC	2	12	162997	163008	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325284420
3589	NC_015162	GCCG	2	8	163080	163087	0 %	0 %	50 %	50 %	325284420
3590	NC_015162	TGGT	2	8	163276	163283	0 %	50 %	50 %	0 %	325284420
3591	NC_015162	GCT	2	6	163328	163333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284421
3592	NC_015162	GCG	2	6	163378	163383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284421
3593	NC_015162	CAG	2	6	163481	163486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284421
3594	NC_015162	GAA	2	6	163506	163511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284421
3595	NC_015162	GCC	2	6	163560	163565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284421
3596	NC_015162	AGGA	2	8	163594	163601	50 %	0 %	50 %	0 %	325284421
3597	NC_015162	CTG	4	12	163608	163619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284421
3598	NC_015162	AGG	2	6	163639	163644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284421
3599	NC_015162	CTG	2	6	163656	163661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284421
3600	NC_015162	TCC	2	6	163718	163723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284421
3601	NC_015162	CGC	2	6	163734	163739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284421
3602	NC_015162	ACG	2	6	163864	163869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284421
3603	NC_015162	GACG	2	8	163932	163939	25 %	0 %	50 %	25 %	325284421
3604	NC_015162	C	7	7	163940	163946	0 %	0 %	0 %	100 %	325284421
3605	NC_015162	AGC	3	9	163984	163992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284421
3606	NC_015162	CGA	2	6	164012	164017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284421
3607	NC_015162	CAC	2	6	164066	164071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284421
3608	NC_015162	GCCC	2	8	164091	164098	0 %	0 %	25 %	75 %	325284421
3609	NC_015162	ACC	2	6	164115	164120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284421
3610	NC_015162	ATC	2	6	164127	164132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284421
3611	NC_015162	CAT	2	6	164244	164249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284422
3612	NC_015162	TCA	2	6	164330	164335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284422
3613	NC_015162	CTGG	2	8	164358	164365	0 %	25 %	50 %	25 %	325284422
3614	NC_015162	CGC	2	6	164466	164471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284422
3615	NC_015162	AGC	2	6	164475	164480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284422
3616	NC_015162	CAGGAA	2	12	164500	164511	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325284422
3617	NC_015162	AC	3	6	164589	164594	50 %	0 %	0 %	50 %	325284422
3618	NC_015162	AGC	2	6	164602	164607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284422
3619	NC_015162	GACC	2	8	164613	164620	25 %	0 %	25 %	50 %	325284422
3620	NC_015162	GGC	2	6	164642	164647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284423
3621	NC_015162	CCG	2	6	164708	164713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284423
3622	NC_015162	CCTGAC	2	12	164714	164725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284423
3623	NC_015162	CCAGA	2	10	164735	164744	40 %	0 %	20 %	40 %	325284423
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3632	NC_015162	TGGG	2	8	165162	165169	0 %	25 %	75 %	0 %	325284423
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3642	NC_015162	AGC	2	6	165727	165732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284423
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3645	NC_015162	GCGT	2	8	165853	165860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3745	NC_015162	GCC	2	6	170612	170617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284429
3746	NC_015162	GCT	2	6	170626	170631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284429
3747	NC_015162	GCC	2	6	170655	170660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284429
3748	NC_015162	GC	3	6	170668	170673	0 %	0 %	50 %	50 %	325284429
3749	NC_015162	CGC	2	6	170702	170707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284429
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3759	NC_015162	GAT	2	6	171539	171544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3760	NC_015162	CCTTTT	2	12	171558	171569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3761	NC_015162	GAT	2	6	171584	171589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3762	NC_015162	GCTG	2	8	171652	171659	0 %	25 %	50 %	25 %	325284430
3763	NC_015162	CTG	2	6	171821	171826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284430
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3776	NC_015162	AC	3	6	172383	172388	50 %	0 %	0 %	50 %	325284431
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3851	NC_015162	CAGCG	2	10	176217	176226	20 %	0 %	40 %	40 %	325284436
3852	NC_015162	CAG	2	6	176234	176239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284436
3853	NC_015162	CCG	2	6	176288	176293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284436
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3856	NC_015162	CCA	2	6	176483	176488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284436
3857	NC_015162	GTC	2	6	176581	176586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284436
3858	NC_015162	GTGGTC	2	12	176587	176598	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325284436
3859	NC_015162	CTG	2	6	176602	176607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284436
3860	NC_015162	TCC	2	6	176620	176625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284436
3861	NC_015162	GAG	2	6	176627	176632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284436
3862	NC_015162	CTG	2	6	177028	177033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3863	NC_015162	TGGT	2	8	177037	177044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3864	NC_015162	GGGTC	2	10	177054	177063	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3865	NC_015162	ACCA	2	8	177086	177093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3866	NC_015162	ATG	2	6	177105	177110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3867	NC_015162	ACC	2	6	177176	177181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284437
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3869	NC_015162	CTG	2	6	177218	177223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284437
3870	NC_015162	CAT	3	9	177232	177240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284437
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3874	NC_015162	CTG	2	6	177452	177457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284437
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3879	NC_015162	CA	3	6	177544	177549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3880	NC_015162	TC	3	6	177553	177558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3881	NC_015162	CAGG	2	8	177565	177572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3882	NC_015162	GGGA	2	8	177573	177580	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3883	NC_015162	CCG	2	6	177631	177636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284438
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3885	NC_015162	CTG	2	6	177702	177707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284438
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3980	NC_015162	CAGC	2	8	181774	181781	25 %	0 %	25 %	50 %	325284440
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3984	NC_015162	ATC	2	6	181983	181988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284440
3985	NC_015162	A	6	6	182035	182040	100 %	0 %	0 %	0 %	325284440
3986	NC_015162	GAA	2	6	182075	182080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284440
3987	NC_015162	GCA	3	9	182092	182100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284440
3988	NC_015162	TGAA	2	8	182130	182137	50 %	25 %	25 %	0 %	325284440
3989	NC_015162	GCG	2	6	182196	182201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284441
3990	NC_015162	GCC	2	6	182226	182231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284441
3991	NC_015162	AAC	2	6	182233	182238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284441
3992	NC_015162	ACA	2	6	182284	182289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284441
3993	NC_015162	AGA	2	6	182303	182308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284441
3994	NC_015162	CAAC	2	8	182392	182399	50 %	0 %	0 %	50 %	325284441
3995	NC_015162	CTG	2	6	182424	182429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284441
3996	NC_015162	CAG	2	6	182649	182654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284441
3997	NC_015162	CAA	2	6	182747	182752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284441
3998	NC_015162	TGA	3	9	182845	182853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284441
3999	NC_015162	TC	3	6	182929	182934	0 %	50 %	0 %	50 %	325284441
4000	NC_015162	CTG	2	6	182949	182954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284441

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