MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP chromosome

Total Repeats: 53264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015161	CCCA	2	8	228802	228809	25 %	0 %	0 %	75 %	325282464
5502	NC_015161	CAG	2	6	228823	228828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282464
5503	NC_015161	GCG	2	6	228833	228838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282464
5504	NC_015161	CGC	2	6	228957	228962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282464
5505	NC_015161	CGC	2	6	228990	228995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282464
5506	NC_015161	CAC	2	6	229033	229038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282464
5507	NC_015161	GCC	2	6	229057	229062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282464
5508	NC_015161	GTC	2	6	229087	229092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282464
5509	NC_015161	CAG	2	6	229093	229098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282464
5510	NC_015161	CGG	2	6	229100	229105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282464
5511	NC_015161	GCC	2	6	229114	229119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282464
5512	NC_015161	ACC	2	6	229139	229144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282464
5513	NC_015161	GCC	2	6	229147	229152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282464
5514	NC_015161	CCA	2	6	229164	229169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282464
5515	NC_015161	GTCATG	2	12	229190	229201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325282464
5516	NC_015161	GCA	2	6	229206	229211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282464
5517	NC_015161	GAA	2	6	229272	229277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_015161	GCC	2	6	229300	229305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_015161	GAA	2	6	229358	229363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325282465
5520	NC_015161	GTG	2	6	229390	229395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282465
5521	NC_015161	CCA	2	6	229402	229407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282465
5522	NC_015161	CGG	2	6	229427	229432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282465
5523	NC_015161	CGTGGG	2	12	229499	229510	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325282465
5524	NC_015161	TAC	2	6	229593	229598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325282465
5525	NC_015161	GTGGGC	2	12	229608	229619	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325282465
5526	NC_015161	GTG	2	6	229671	229676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282465
5527	NC_015161	AGCC	2	8	229814	229821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_015161	T	6	6	229832	229837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_015161	GTGGC	2	10	229838	229847	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5530	NC_015161	TGCT	2	8	229849	229856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_015161	CGGCG	2	10	229858	229867	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5532	NC_015161	CGC	2	6	229904	229909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282466
5533	NC_015161	GCT	2	6	229942	229947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282466
5534	NC_015161	ACC	2	6	229967	229972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282466
5535	NC_015161	GGCG	2	8	229984	229991	0 %	0 %	75 %	25 %	325282466
5536	NC_015161	GCC	2	6	230022	230027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282466
5537	NC_015161	CCG	3	9	230028	230036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282466
5538	NC_015161	CTG	2	6	230069	230074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282466
5539	NC_015161	CTG	2	6	230147	230152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282466
5540	NC_015161	TCT	2	6	230181	230186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325282466
5541	NC_015161	CGG	2	6	230187	230192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282466
5542	NC_015161	CCAG	2	8	230224	230231	25 %	0 %	25 %	50 %	325282466
5543	NC_015161	GCC	2	6	230233	230238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282466
5544	NC_015161	GCG	2	6	230251	230256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282466
5545	NC_015161	GCA	2	6	230278	230283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282466
5546	NC_015161	GGCT	2	8	230297	230304	0 %	25 %	50 %	25 %	325282466
5547	NC_015161	CTGGC	2	10	230315	230324	0 %	20 %	40 %	40 %	325282466
5548	NC_015161	CACTG	2	10	230409	230418	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5549	NC_015161	GGGT	2	8	230425	230432	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_015161	GCGA	2	8	230442	230449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_015161	CCA	2	6	230477	230482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_015161	CTG	2	6	230546	230551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282467
5553	NC_015161	GTG	2	6	230618	230623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282467
5554	NC_015161	GACC	2	8	230659	230666	25 %	0 %	25 %	50 %	325282467
5555	NC_015161	ATT	2	6	230793	230798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325282467
5556	NC_015161	GTG	2	6	230849	230854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282467
5557	NC_015161	CGG	2	6	230902	230907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282467
5558	NC_015161	GAG	2	6	230978	230983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325282467
5559	NC_015161	TGG	2	6	230994	230999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282467
5560	NC_015161	CGC	2	6	231004	231009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282467
5561	NC_015161	ACCGCG	2	12	231015	231026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325282467
5562	NC_015161	GCC	2	6	231041	231046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282467
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5565	NC_015161	TGG	2	6	231108	231113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282467
5566	NC_015161	CAT	2	6	231133	231138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325282467
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5568	NC_015161	CA	3	6	231183	231188	50 %	0 %	0 %	50 %	325282467
5569	NC_015161	GCC	2	6	231194	231199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282467
5570	NC_015161	CTG	2	6	231255	231260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282467
5571	NC_015161	CGCAC	2	10	231273	231282	20 %	0 %	20 %	60 %	325282467
5572	NC_015161	CTG	2	6	231302	231307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282467
5573	NC_015161	CGG	2	6	231391	231396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282467
5574	NC_015161	CTG	2	6	231416	231421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282467
5575	NC_015161	CCAG	2	8	231441	231448	25 %	0 %	25 %	50 %	325282467
5576	NC_015161	ACC	2	6	231576	231581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282467
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5578	NC_015161	TGGCC	2	10	231756	231765	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5579	NC_015161	GCCT	2	8	231767	231774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_015161	CAG	2	6	231798	231803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_015161	GC	3	6	231807	231812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_015161	GTT	2	6	231841	231846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_015161	CT	3	6	231856	231861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_015161	GTG	2	6	231900	231905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_015161	GGC	2	6	231916	231921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_015161	TTC	2	6	231975	231980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_015161	CTG	2	6	231983	231988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_015161	ACCG	2	8	231989	231996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_015161	G	6	6	232111	232116	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_015161	CAA	2	6	232184	232189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325282468
5592	NC_015161	GCC	2	6	232206	232211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282468
5593	NC_015161	CAC	3	9	232256	232264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282468
5594	NC_015161	CAC	2	6	232271	232276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282468
5595	NC_015161	ACC	3	9	232353	232361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282468
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5599	NC_015161	GGC	2	6	232398	232403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282468
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5603	NC_015161	TGC	2	6	232462	232467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282468
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5608	NC_015161	GCT	2	6	232629	232634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282468
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5613	NC_015161	CAC	2	6	232712	232717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282468
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5621	NC_015161	CCG	2	6	233095	233100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282468
5622	NC_015161	CAC	2	6	233147	233152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282468
5623	NC_015161	ACG	2	6	233188	233193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282468
5624	NC_015161	CGG	2	6	233210	233215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282468
5625	NC_015161	GC	3	6	233237	233242	0 %	0 %	50 %	50 %	325282468
5626	NC_015161	ACC	3	9	233313	233321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282468
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5628	NC_015161	ACC	3	9	233361	233369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282468
5629	NC_015161	CAT	2	6	233372	233377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325282468
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5654	NC_015161	GCCG	2	8	234146	234153	0 %	0 %	50 %	50 %	325282468
5655	NC_015161	T	6	6	234263	234268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5656	NC_015161	GTC	2	6	234338	234343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5658	NC_015161	AGC	2	6	234377	234382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5659	NC_015161	CAA	2	6	234384	234389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5660	NC_015161	T	7	7	234444	234450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5661	NC_015161	CCCTG	2	10	234459	234468	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5662	NC_015161	AGG	2	6	234495	234500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5668	NC_015161	GCG	2	6	234701	234706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282469
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5700	NC_015161	CTGAC	2	10	236357	236366	20 %	20 %	20 %	40 %	325282469
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5726	NC_015161	GCCG	3	12	237704	237715	0 %	0 %	50 %	50 %	325282470
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5733	NC_015161	CGG	2	6	238036	238041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282470
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5745	NC_015161	GCTG	2	8	238652	238659	0 %	25 %	50 %	25 %	325282470
5746	NC_015161	TGC	2	6	238729	238734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282470
5747	NC_015161	CCG	2	6	238750	238755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282470
5748	NC_015161	CTG	2	6	238797	238802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282470
5749	NC_015161	GAGCT	2	10	238848	238857	20 %	20 %	40 %	20 %	325282470
5750	NC_015161	GGCG	2	8	238877	238884	0 %	0 %	75 %	25 %	325282470
5751	NC_015161	CGC	2	6	238969	238974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282470
5752	NC_015161	GCA	2	6	238987	238992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282470
5753	NC_015161	TGC	3	9	238999	239007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282470
5754	NC_015161	GCGCT	2	10	239101	239110	0 %	20 %	40 %	40 %	325282470
5755	NC_015161	CTG	2	6	239139	239144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282470
5756	NC_015161	TGCCC	2	10	239246	239255	0 %	20 %	20 %	60 %	325282470
5757	NC_015161	TGG	2	6	239275	239280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282470
5758	NC_015161	CCG	2	6	239297	239302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282470
5759	NC_015161	CGA	2	6	239330	239335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282470
5760	NC_015161	AGGCCG	2	12	239359	239370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325282470
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5763	NC_015161	GCTG	2	8	239633	239640	0 %	25 %	50 %	25 %	325282470
5764	NC_015161	CCA	2	6	239740	239745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282470
5765	NC_015161	TCCC	2	8	239784	239791	0 %	25 %	0 %	75 %	325282470
5766	NC_015161	CCG	2	6	239809	239814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282470
5767	NC_015161	TGAA	2	8	239830	239837	50 %	25 %	25 %	0 %	325282470
5768	NC_015161	GGTGTG	2	12	239838	239849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282470
5769	NC_015161	CGA	2	6	240014	240019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282470
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5781	NC_015161	GCC	2	6	240789	240794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282470
5782	NC_015161	CCGCG	2	10	240851	240860	0 %	0 %	40 %	60 %	325282470
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5802	NC_015161	TGC	2	6	241822	241827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282470
5803	NC_015161	GAC	2	6	241830	241835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282470
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5807	NC_015161	GTACGG	2	12	241952	241963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325282470
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5835	NC_015161	AGAC	2	8	243348	243355	50 %	0 %	25 %	25 %	325282471
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5850	NC_015161	CAC	2	6	243928	243933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282471
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5855	NC_015161	TCA	2	6	244089	244094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325282471
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5863	NC_015161	GTT	2	6	244836	244841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325282471
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5865	NC_015161	ACG	2	6	244985	244990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282471
5866	NC_015161	CTG	2	6	245007	245012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282471
5867	NC_015161	GAC	2	6	245014	245019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282471
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5881	NC_015161	GTG	2	6	245789	245794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282471
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5887	NC_015161	CGTT	2	8	245991	245998	0 %	50 %	25 %	25 %	325282471
5888	NC_015161	C	7	7	246164	246170	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5889	NC_015161	GCG	2	6	246191	246196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5890	NC_015161	GAC	2	6	246226	246231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282472
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5892	NC_015161	CTG	2	6	246292	246297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282472
5893	NC_015161	CCTGAC	2	12	246450	246461	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325282472
5894	NC_015161	CAG	2	6	246466	246471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282472
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5896	NC_015161	CTG	2	6	246569	246574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282472
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5946	NC_015161	ACCCC	2	10	248073	248082	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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5987	NC_015161	GCCC	2	8	249488	249495	0 %	0 %	25 %	75 %	325282476
5988	NC_015161	CGACC	2	10	249510	249519	20 %	0 %	20 %	60 %	325282476
5989	NC_015161	CTG	2	6	249592	249597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282476
5990	NC_015161	AAGGC	2	10	249614	249623	40 %	0 %	40 %	20 %	325282476
5991	NC_015161	GCT	2	6	249666	249671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282476
5992	NC_015161	CAT	2	6	249699	249704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325282476
5993	NC_015161	TTC	2	6	249754	249759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325282476
5994	NC_015161	AGC	2	6	249800	249805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282476
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5996	NC_015161	CAT	2	6	249921	249926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325282476
5997	NC_015161	TGA	2	6	249929	249934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325282476
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5999	NC_015161	CGG	2	6	250044	250049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282476
6000	NC_015161	GGC	2	6	250086	250091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282476

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