MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 59840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_014836	CCA	2	6	820858	820863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050956
17003	NC_014836	GGT	2	6	820876	820881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050956
17004	NC_014836	CAG	2	6	820961	820966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050956
17005	NC_014836	AGA	2	6	821044	821049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050956
17006	NC_014836	GCA	2	6	821050	821055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050956
17007	NC_014836	CCA	2	6	821140	821145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050956
17008	NC_014836	CTG	2	6	821180	821185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050956
17009	NC_014836	GCT	2	6	821198	821203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050956
17010	NC_014836	GTG	2	6	821208	821213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050956
17011	NC_014836	AGC	2	6	821257	821262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050956
17012	NC_014836	CCA	2	6	821269	821274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050956
17013	NC_014836	GCT	2	6	821275	821280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050956
17014	NC_014836	CCA	2	6	821326	821331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050956
17015	NC_014836	CAG	2	6	821396	821401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050956
17016	NC_014836	GCC	2	6	821411	821416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050956
17017	NC_014836	AGGC	2	8	821444	821451	25 %	0 %	50 %	25 %	317050956
17018	NC_014836	ATG	2	6	821460	821465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050956
17019	NC_014836	CAG	2	6	821582	821587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050956
17020	NC_014836	CTC	2	6	821612	821617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17021	NC_014836	T	6	6	821625	821630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_014836	GGA	2	6	821656	821661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_014836	TCG	2	6	821793	821798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050957
17024	NC_014836	CCT	2	6	821887	821892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050957
17025	NC_014836	ACC	3	9	821937	821945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050957
17026	NC_014836	TTTCA	2	10	821984	821993	20 %	60 %	0 %	20 %	317050957
17027	NC_014836	GC	3	6	822043	822048	0 %	0 %	50 %	50 %	317050957
17028	NC_014836	TCG	2	6	822141	822146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050957
17029	NC_014836	CAG	2	6	822251	822256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050957
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17031	NC_014836	TGG	2	6	822289	822294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050957
17032	NC_014836	CCGGC	2	10	822310	822319	0 %	0 %	40 %	60 %	317050957
17033	NC_014836	CCA	2	6	822364	822369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050957
17034	NC_014836	TGCAGA	2	12	822373	822384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317050957
17035	NC_014836	GCC	2	6	822420	822425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050957
17036	NC_014836	CGG	2	6	822433	822438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050957
17037	NC_014836	CGC	2	6	822442	822447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050957
17038	NC_014836	TGAC	2	8	822450	822457	25 %	25 %	25 %	25 %	317050957
17039	NC_014836	TGA	2	6	822481	822486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050957
17040	NC_014836	GCGATA	2	12	822494	822505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317050957
17041	NC_014836	GGC	2	6	822572	822577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050957
17042	NC_014836	GAG	2	6	822656	822661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050957
17043	NC_014836	CAT	2	6	822670	822675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050957
17044	NC_014836	GCT	2	6	822712	822717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050957
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17046	NC_014836	GA	4	8	823120	823127	50 %	0 %	50 %	0 %	317050957
17047	NC_014836	T	6	6	823163	823168	0 %	100 %	0 %	0 %	317050957
17048	NC_014836	TGT	2	6	823204	823209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050957
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17050	NC_014836	GTGG	2	8	823250	823257	0 %	25 %	75 %	0 %	317050957
17051	NC_014836	GCT	2	6	823298	823303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050957
17052	NC_014836	TCA	2	6	823324	823329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050957
17053	NC_014836	TGG	2	6	823348	823353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050957
17054	NC_014836	TGG	2	6	823372	823377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050957
17055	NC_014836	GCC	2	6	823443	823448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050957
17056	NC_014836	CGA	2	6	823465	823470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050957
17057	NC_014836	TGG	2	6	823556	823561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_014836	GGCG	2	8	823604	823611	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17059	NC_014836	TTC	2	6	823660	823665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17060	NC_014836	CAACG	2	10	823681	823690	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17061	NC_014836	CTT	2	6	823722	823727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_014836	TTATT	2	10	823752	823761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_014836	AGG	2	6	823765	823770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_014836	TCA	2	6	823813	823818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050958
17065	NC_014836	CAAG	2	8	823855	823862	50 %	0 %	25 %	25 %	317050958
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17092	NC_014836	GGCT	2	8	825138	825145	0 %	25 %	50 %	25 %	317050958
17093	NC_014836	ATC	2	6	825167	825172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050958
17094	NC_014836	CCCAC	2	10	825183	825192	20 %	0 %	0 %	80 %	317050958
17095	NC_014836	GC	3	6	825223	825228	0 %	0 %	50 %	50 %	317050958
17096	NC_014836	A	6	6	825231	825236	100 %	0 %	0 %	0 %	317050958
17097	NC_014836	ACC	2	6	825246	825251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050958
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17099	NC_014836	ACA	2	6	825279	825284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050958
17100	NC_014836	AC	3	6	825349	825354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17101	NC_014836	T	7	7	825378	825384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_014836	A	6	6	825439	825444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17103	NC_014836	T	8	8	825487	825494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_014836	CAG	2	6	825523	825528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050959
17105	NC_014836	CAG	2	6	825544	825549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050959
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17107	NC_014836	GCT	2	6	825582	825587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050959
17108	NC_014836	T	6	6	825592	825597	0 %	100 %	0 %	0 %	317050959
17109	NC_014836	TGA	2	6	825626	825631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050959
17110	NC_014836	CAG	2	6	825661	825666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050959
17111	NC_014836	GTC	2	6	825715	825720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050959
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17114	NC_014836	TGA	2	6	826004	826009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050959
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17118	NC_014836	CAT	2	6	826227	826232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050959
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17240	NC_014836	TGG	2	6	831210	831215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050963
17241	NC_014836	CATGG	2	10	831241	831250	20 %	20 %	40 %	20 %	317050963
17242	NC_014836	GGT	2	6	831256	831261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050963
17243	NC_014836	AGC	2	6	831293	831298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050963
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17245	NC_014836	CTG	2	6	831376	831381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050963
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17248	NC_014836	TCT	2	6	831512	831517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050963
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17250	NC_014836	TGT	2	6	831644	831649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050963
17251	NC_014836	CAGGCG	2	12	831850	831861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17252	NC_014836	GACA	2	8	831863	831870	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17253	NC_014836	TGAT	2	8	831871	831878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17254	NC_014836	CA	3	6	831897	831902	50 %	0 %	0 %	50 %	317050964
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17256	NC_014836	CTG	2	6	831959	831964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050964
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17271	NC_014836	CGA	2	6	832594	832599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050964
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17275	NC_014836	GCACG	2	10	832926	832935	20 %	0 %	40 %	40 %	317050964
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17283	NC_014836	AGGG	2	8	833369	833376	25 %	0 %	75 %	0 %	317050964
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17322	NC_014836	GGA	2	6	835422	835427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17323	NC_014836	CTG	3	9	835474	835482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050966
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17350	NC_014836	GCA	2	6	836682	836687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050966
17351	NC_014836	AGCG	2	8	836764	836771	25 %	0 %	50 %	25 %	317050966
17352	NC_014836	TTGAGC	2	12	836780	836791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	317050966
17353	NC_014836	GCA	2	6	836793	836798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050966
17354	NC_014836	GCT	2	6	836901	836906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050966
17355	NC_014836	GCCA	2	8	836930	836937	25 %	0 %	25 %	50 %	317050966
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17393	NC_014836	CGT	2	6	838878	838883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17477	NC_014836	TGC	2	6	842789	842794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050970
17478	NC_014836	GC	3	6	842881	842886	0 %	0 %	50 %	50 %	317050970
17479	NC_014836	CAG	2	6	842894	842899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050970
17480	NC_014836	AGG	2	6	842939	842944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050970
17481	NC_014836	GCA	3	9	842979	842987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050970
17482	NC_014836	GCA	2	6	842991	842996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050970
17483	NC_014836	CAG	2	6	843001	843006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050970
17484	NC_014836	GAT	2	6	843019	843024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050970
17485	NC_014836	AGAGGG	2	12	843099	843110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050970
17486	NC_014836	GGC	2	6	843223	843228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050970
17487	NC_014836	CAG	2	6	843241	843246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050970
17488	NC_014836	GGC	2	6	843298	843303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050970
17489	NC_014836	AG	3	6	843345	843350	50 %	0 %	50 %	0 %	317050970
17490	NC_014836	TGA	2	6	843414	843419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050970
17491	NC_014836	GTG	2	6	843446	843451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050970
17492	NC_014836	GAGAA	2	10	843467	843476	60 %	0 %	40 %	0 %	317050970
17493	NC_014836	T	6	6	843498	843503	0 %	100 %	0 %	0 %	317050970
17494	NC_014836	AAGG	2	8	843585	843592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17495	NC_014836	AT	3	6	843652	843657	50 %	50 %	0 %	0 %	317050971
17496	NC_014836	GCCT	2	8	843695	843702	0 %	25 %	25 %	50 %	317050971
17497	NC_014836	CTG	2	6	843728	843733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050971
17498	NC_014836	CTG	2	6	843767	843772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050971
17499	NC_014836	GCT	2	6	843776	843781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050971
17500	NC_014836	AGC	2	6	843786	843791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050971

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