MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 59840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014836	CAG	2	6	25345	25350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050223
502	NC_014836	GGA	2	6	25371	25376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050223
503	NC_014836	GCG	2	6	25408	25413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050223
504	NC_014836	TTC	2	6	25430	25435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050223
505	NC_014836	TTC	2	6	25462	25467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050223
506	NC_014836	TAT	2	6	25471	25476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317050223
507	NC_014836	CAG	2	6	25525	25530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050223
508	NC_014836	CAG	2	6	25540	25545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050223
509	NC_014836	CAC	2	6	25587	25592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050224
510	NC_014836	GCT	2	6	25616	25621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050224
511	NC_014836	CAC	2	6	25625	25630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050224
512	NC_014836	T	6	6	25660	25665	0 %	100 %	0 %	0 %	317050224
513	NC_014836	ACA	2	6	25833	25838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050224
514	NC_014836	GCTCC	2	10	25855	25864	0 %	20 %	20 %	60 %	317050224
515	NC_014836	T	6	6	25902	25907	0 %	100 %	0 %	0 %	317050224
516	NC_014836	GGT	2	6	26125	26130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050224
517	NC_014836	GCAG	2	8	26257	26264	25 %	0 %	50 %	25 %	317050224
518	NC_014836	TCG	2	6	26283	26288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050224
519	NC_014836	GCA	2	6	26326	26331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050224
520	NC_014836	CGATAT	2	12	26365	26376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317050224
521	NC_014836	TCA	2	6	26473	26478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050224
522	NC_014836	TGG	2	6	26487	26492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050224
523	NC_014836	TGA	2	6	26494	26499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050224
524	NC_014836	AGG	2	6	26559	26564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050224
525	NC_014836	ATC	2	6	26585	26590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050224
526	NC_014836	AGG	2	6	26598	26603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050224
527	NC_014836	TCC	2	6	26690	26695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_014836	ATC	2	6	26708	26713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014836	A	7	7	26719	26725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014836	TGA	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014836	GAT	2	6	26810	26815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014836	CAGT	2	8	26838	26845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_014836	A	7	7	26902	26908	100 %	0 %	0 %	0 %	317050225
534	NC_014836	CTG	2	6	26945	26950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
535	NC_014836	AGG	2	6	26951	26956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050225
536	NC_014836	TCG	2	6	27050	27055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
537	NC_014836	ATT	2	6	27154	27159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317050225
538	NC_014836	CTG	2	6	27187	27192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
539	NC_014836	CAG	2	6	27205	27210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050225
540	NC_014836	CAGC	2	8	27227	27234	25 %	0 %	25 %	50 %	317050225
541	NC_014836	CTG	2	6	27304	27309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
542	NC_014836	CAA	2	6	27327	27332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050225
543	NC_014836	TCC	2	6	27339	27344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050225
544	NC_014836	GCA	2	6	27351	27356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050225
545	NC_014836	GCG	2	6	27363	27368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050225
546	NC_014836	GC	3	6	27409	27414	0 %	0 %	50 %	50 %	317050225
547	NC_014836	CCA	2	6	27422	27427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050225
548	NC_014836	TGC	2	6	27467	27472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
549	NC_014836	TCT	2	6	27486	27491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050225
550	NC_014836	GAT	2	6	27514	27519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050225
551	NC_014836	GCT	2	6	27528	27533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
552	NC_014836	CTG	2	6	27562	27567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
553	NC_014836	TCC	2	6	27593	27598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050225
554	NC_014836	TGC	2	6	27605	27610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
555	NC_014836	GAG	2	6	27677	27682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050225
556	NC_014836	CCA	2	6	27795	27800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050225
557	NC_014836	TGG	2	6	27809	27814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050225
558	NC_014836	GCA	2	6	27851	27856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050225
559	NC_014836	GTG	2	6	27886	27891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050225
560	NC_014836	GCT	2	6	28056	28061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050225
561	NC_014836	A	6	6	28089	28094	100 %	0 %	0 %	0 %	317050226
562	NC_014836	T	6	6	28116	28121	0 %	100 %	0 %	0 %	317050226
563	NC_014836	TG	3	6	28169	28174	0 %	50 %	50 %	0 %	317050226
564	NC_014836	GC	3	6	28227	28232	0 %	0 %	50 %	50 %	317050226
565	NC_014836	TG	3	6	28234	28239	0 %	50 %	50 %	0 %	317050226
566	NC_014836	GCC	2	6	28384	28389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050226
567	NC_014836	GAG	2	6	28479	28484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050226
568	NC_014836	AGC	2	6	28510	28515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050226
569	NC_014836	TA	3	6	28543	28548	50 %	50 %	0 %	0 %	317050226
570	NC_014836	ACC	2	6	28584	28589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050226
571	NC_014836	ATG	2	6	28657	28662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050226
572	NC_014836	TGC	2	6	28690	28695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050226
573	NC_014836	TCA	2	6	28711	28716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050226
574	NC_014836	TGC	2	6	28723	28728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050226
575	NC_014836	GGGGA	2	10	28753	28762	20 %	0 %	80 %	0 %	317050226
576	NC_014836	GAT	2	6	28797	28802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050226
577	NC_014836	AGC	2	6	28819	28824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050226
578	NC_014836	GTG	2	6	28977	28982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050226
579	NC_014836	TCAC	2	8	29069	29076	25 %	25 %	0 %	50 %	317050227
580	NC_014836	C	6	6	29079	29084	0 %	0 %	0 %	100 %	317050227
581	NC_014836	TCA	2	6	29120	29125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050227
582	NC_014836	GGC	2	6	29206	29211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050227
583	NC_014836	GCA	2	6	29220	29225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050227
584	NC_014836	CG	3	6	29243	29248	0 %	0 %	50 %	50 %	317050227
585	NC_014836	TGA	2	6	29310	29315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050227
586	NC_014836	GAT	2	6	29359	29364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050227
587	NC_014836	GCG	2	6	29377	29382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050227
588	NC_014836	CA	3	6	29467	29472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_014836	TGCT	2	8	29537	29544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_014836	GTC	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014836	GCG	2	6	29601	29606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014836	GTT	2	6	29632	29637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014836	CAGC	2	8	29739	29746	25 %	0 %	25 %	50 %	317050228
594	NC_014836	AGT	2	6	29788	29793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050228
595	NC_014836	GCG	2	6	29891	29896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050228
596	NC_014836	TCA	2	6	29927	29932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050228
597	NC_014836	GAT	2	6	29997	30002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050228
598	NC_014836	ATA	2	6	30013	30018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050228
599	NC_014836	AGG	2	6	30040	30045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050228
600	NC_014836	CAG	2	6	30060	30065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050228
601	NC_014836	GAT	2	6	30168	30173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050228
602	NC_014836	CCG	2	6	30194	30199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050228
603	NC_014836	ACC	3	9	30205	30213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050228
604	NC_014836	CCA	2	6	30281	30286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050228
605	NC_014836	GCC	2	6	30324	30329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050228
606	NC_014836	GAT	2	6	30333	30338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050228
607	NC_014836	GCA	2	6	30344	30349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050228
608	NC_014836	GGC	3	9	30428	30436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050228
609	NC_014836	AGG	2	6	30475	30480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050228
610	NC_014836	GAA	2	6	30501	30506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050228
611	NC_014836	GGAG	2	8	30555	30562	25 %	0 %	75 %	0 %	317050228
612	NC_014836	GGT	2	6	30588	30593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050228
613	NC_014836	TGA	2	6	30632	30637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050228
614	NC_014836	GCC	2	6	30654	30659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050228
615	NC_014836	CCA	2	6	30665	30670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050228
616	NC_014836	GAA	2	6	30702	30707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050228
617	NC_014836	GGCCA	2	10	30732	30741	20 %	0 %	40 %	40 %	317050228
618	NC_014836	CCA	2	6	30755	30760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050228
619	NC_014836	TGA	2	6	30776	30781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050228
620	NC_014836	GGT	2	6	30801	30806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050228
621	NC_014836	AGA	2	6	30830	30835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050228
622	NC_014836	CAC	2	6	30837	30842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050228
623	NC_014836	TGC	2	6	30863	30868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050228
624	NC_014836	GGC	2	6	30966	30971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050228
625	NC_014836	CAG	3	9	30981	30989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050228
626	NC_014836	ATG	2	6	30997	31002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050228
627	NC_014836	CTC	2	6	31030	31035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050229
628	NC_014836	TGCA	2	8	31079	31086	25 %	25 %	25 %	25 %	317050229
629	NC_014836	CAT	2	6	31099	31104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050229
630	NC_014836	CCA	2	6	31110	31115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050229
631	NC_014836	GCA	2	6	31119	31124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050229
632	NC_014836	CGG	3	9	31322	31330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050229
633	NC_014836	GGC	2	6	31333	31338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050229
634	NC_014836	GTG	2	6	31355	31360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050229
635	NC_014836	CAC	2	6	31378	31383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050229
636	NC_014836	TCA	2	6	31385	31390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050229
637	NC_014836	GGT	2	6	31411	31416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050229
638	NC_014836	GGC	2	6	31441	31446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050229
639	NC_014836	AG	3	6	31449	31454	50 %	0 %	50 %	0 %	317050229
640	NC_014836	CAT	2	6	31456	31461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050229
641	NC_014836	CAA	2	6	31547	31552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_014836	A	8	8	31551	31558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_014836	ATTT	2	8	31626	31633	25 %	75 %	0 %	0 %	317050230
644	NC_014836	CAGC	2	8	31705	31712	25 %	0 %	25 %	50 %	317050230
645	NC_014836	TGTC	2	8	31725	31732	0 %	50 %	25 %	25 %	317050230
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648	NC_014836	CT	3	6	31827	31832	0 %	50 %	0 %	50 %	317050230
649	NC_014836	CAG	2	6	31847	31852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050230
650	NC_014836	CGTT	2	8	31890	31897	0 %	50 %	25 %	25 %	317050230
651	NC_014836	GGTG	2	8	31982	31989	0 %	25 %	75 %	0 %	317050230
652	NC_014836	TTC	2	6	32246	32251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050230
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657	NC_014836	AT	3	6	32518	32523	50 %	50 %	0 %	0 %	317050230
658	NC_014836	GAAG	2	8	32561	32568	50 %	0 %	50 %	0 %	317050230
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661	NC_014836	GAT	2	6	32730	32735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
662	NC_014836	TCT	2	6	32755	32760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_014836	AGG	2	6	32763	32768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
664	NC_014836	TGA	3	9	32803	32811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
665	NC_014836	ATC	2	6	32817	32822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_014836	GTT	2	6	32914	32919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050231
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668	NC_014836	CAT	2	6	33011	33016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050231
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672	NC_014836	CGGTGT	2	12	33242	33253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
673	NC_014836	CT	4	8	33308	33315	0 %	50 %	0 %	50 %	317050232
674	NC_014836	CTG	3	9	33479	33487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050232
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680	NC_014836	CTG	2	6	33716	33721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050232
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689	NC_014836	GCC	2	6	33887	33892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050232
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752	NC_014836	GCG	2	6	36612	36617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050234
753	NC_014836	C	6	6	36726	36731	0 %	0 %	0 %	100 %	317050234
754	NC_014836	CTG	2	6	36734	36739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050234
755	NC_014836	ATC	2	6	36755	36760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050234
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759	NC_014836	CTG	2	6	37031	37036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050234
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872	NC_014836	AGGG	2	8	41583	41590	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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884	NC_014836	ATC	2	6	42214	42219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050240
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889	NC_014836	GCC	2	6	42400	42405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050240
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952	NC_014836	TA	3	6	46237	46242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_014836	TCG	2	6	48022	48027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050246

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