MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 59840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_014836	TGGA	2	8	293907	293914	25 %	25 %	50 %	0 %	317050452
6003	NC_014836	AGA	2	6	294045	294050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050452
6004	NC_014836	GT	3	6	294099	294104	0 %	50 %	50 %	0 %	317050452
6005	NC_014836	CAT	2	6	294214	294219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050452
6006	NC_014836	TCT	2	6	294227	294232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050452
6007	NC_014836	GGC	2	6	294322	294327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050452
6008	NC_014836	AGC	2	6	294414	294419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050452
6009	NC_014836	CAG	2	6	294421	294426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050452
6010	NC_014836	CTC	2	6	294427	294432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050452
6011	NC_014836	GCC	2	6	294446	294451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050452
6012	NC_014836	GCC	2	6	294575	294580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050452
6013	NC_014836	GCT	2	6	294650	294655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050452
6014	NC_014836	GGA	2	6	294673	294678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050452
6015	NC_014836	TCA	2	6	294711	294716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050452
6016	NC_014836	CTG	2	6	294740	294745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050452
6017	NC_014836	GCCG	2	8	294785	294792	0 %	0 %	50 %	50 %	317050452
6018	NC_014836	CCA	2	6	294849	294854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050452
6019	NC_014836	ATC	2	6	294860	294865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050452
6020	NC_014836	G	7	7	294886	294892	0 %	0 %	100 %	0 %	317050452
6021	NC_014836	TGAA	2	8	294924	294931	50 %	25 %	25 %	0 %	317050452
6022	NC_014836	GCA	2	6	295009	295014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050452
6023	NC_014836	TCT	2	6	295094	295099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050452
6024	NC_014836	CAG	2	6	295217	295222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050452
6025	NC_014836	GAG	2	6	295330	295335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014836	CGGA	2	8	295400	295407	25 %	0 %	50 %	25 %	317050453
6027	NC_014836	TGT	2	6	295491	295496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050453
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6029	NC_014836	GAT	2	6	295569	295574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050453
6030	NC_014836	TGC	2	6	295631	295636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050453
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6032	NC_014836	CTGG	2	8	295723	295730	0 %	25 %	50 %	25 %	317050453
6033	NC_014836	GAGCTG	2	12	295747	295758	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317050453
6034	NC_014836	CGA	2	6	295767	295772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050453
6035	NC_014836	T	8	8	295830	295837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014836	CA	3	6	295898	295903	50 %	0 %	0 %	50 %	317050454
6037	NC_014836	C	6	6	296052	296057	0 %	0 %	0 %	100 %	317050454
6038	NC_014836	ACC	2	6	296064	296069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050454
6039	NC_014836	AGG	2	6	296089	296094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050454
6040	NC_014836	GAA	2	6	296102	296107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050454
6041	NC_014836	GTG	2	6	296108	296113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050454
6042	NC_014836	ATG	2	6	296115	296120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050454
6043	NC_014836	GGAGTA	2	12	296168	296179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	317050454
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6050	NC_014836	TGC	2	6	296476	296481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050454
6051	NC_014836	CCG	3	9	296547	296555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050454
6052	NC_014836	GAT	2	6	296558	296563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050454
6053	NC_014836	CAGC	2	8	296624	296631	25 %	0 %	25 %	50 %	317050454
6054	NC_014836	CCAC	2	8	296634	296641	25 %	0 %	0 %	75 %	317050454
6055	NC_014836	GGT	2	6	296696	296701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050454
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6057	NC_014836	CAA	2	6	296923	296928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_014836	TAC	2	6	296966	296971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050455
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6060	NC_014836	CCAT	2	8	297099	297106	25 %	25 %	0 %	50 %	317050455
6061	NC_014836	GAG	2	6	297122	297127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050455
6062	NC_014836	CTG	2	6	297215	297220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050455
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6065	NC_014836	TAC	2	6	297398	297403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050455
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6084	NC_014836	TGCCT	2	10	298026	298035	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6085	NC_014836	CCAG	2	8	298053	298060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6088	NC_014836	GTT	2	6	298141	298146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6094	NC_014836	GTA	2	6	298557	298562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_014836	CCG	2	6	298567	298572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_014836	T	6	6	298580	298585	0 %	100 %	0 %	0 %	317050457
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6101	NC_014836	TCTTCC	2	12	298706	298717	0 %	50 %	0 %	50 %	317050457
6102	NC_014836	CA	3	6	298772	298777	50 %	0 %	0 %	50 %	317050457
6103	NC_014836	GCT	2	6	298813	298818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050457
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6107	NC_014836	GCA	2	6	298914	298919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_014836	TCG	2	6	298920	298925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_014836	CACC	2	8	299055	299062	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6110	NC_014836	GTG	2	6	299118	299123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_014836	AGGA	2	8	299207	299214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6114	NC_014836	ACC	2	6	299252	299257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050458
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6116	NC_014836	A	6	6	299294	299299	100 %	0 %	0 %	0 %	317050458
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6124	NC_014836	CAA	2	6	299719	299724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050458
6125	NC_014836	CTG	2	6	299741	299746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050458
6126	NC_014836	C	7	7	299771	299777	0 %	0 %	0 %	100 %	317050458
6127	NC_014836	CAT	2	6	299800	299805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050458
6128	NC_014836	CTG	2	6	299849	299854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050458
6129	NC_014836	GC	3	6	299857	299862	0 %	0 %	50 %	50 %	317050458
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6139	NC_014836	AGA	2	6	300324	300329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050458
6140	NC_014836	ATG	2	6	300356	300361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050458
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6142	NC_014836	TCT	2	6	300471	300476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050458
6143	NC_014836	TGG	2	6	300498	300503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050458
6144	NC_014836	GC	3	6	300554	300559	0 %	0 %	50 %	50 %	317050458
6145	NC_014836	ACC	2	6	300560	300565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050458
6146	NC_014836	CTCA	2	8	300649	300656	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6147	NC_014836	AAG	2	6	300673	300678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6148	NC_014836	AAGCA	2	10	300684	300693	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6149	NC_014836	A	7	7	300837	300843	100 %	0 %	0 %	0 %	317050459
6150	NC_014836	GGCGCT	2	12	300887	300898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317050459
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6235	NC_014836	T	6	6	305370	305375	0 %	100 %	0 %	0 %	317050464
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6245	NC_014836	GAC	2	6	305856	305861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050464
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6371	NC_014836	GTG	2	6	312165	312170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050471
6372	NC_014836	GC	3	6	312193	312198	0 %	0 %	50 %	50 %	317050471
6373	NC_014836	TCT	2	6	312284	312289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050471
6374	NC_014836	TTC	3	9	312346	312354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050471
6375	NC_014836	TTC	2	6	312398	312403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050472
6376	NC_014836	GGT	2	6	312427	312432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050472
6377	NC_014836	GGC	2	6	312461	312466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050472
6378	NC_014836	GGC	2	6	312470	312475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050472
6379	NC_014836	GCG	2	6	312590	312595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050472
6380	NC_014836	TGG	2	6	312721	312726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050472
6381	NC_014836	TGCCGT	2	12	312745	312756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050472
6382	NC_014836	TGA	2	6	312811	312816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050472
6383	NC_014836	GCC	4	12	312876	312887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050472
6384	NC_014836	GATGGT	2	12	312959	312970	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	317050472
6385	NC_014836	CCA	2	6	313027	313032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050472
6386	NC_014836	GGC	2	6	313046	313051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050472
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6388	NC_014836	CAT	2	6	313091	313096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050472
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6390	NC_014836	TTC	2	6	313154	313159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050472
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6398	NC_014836	GCG	2	6	313536	313541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050472
6399	NC_014836	CCG	2	6	313584	313589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050472
6400	NC_014836	ATG	2	6	313593	313598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050472
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6402	NC_014836	CAG	2	6	313747	313752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050473
6403	NC_014836	GCT	2	6	313794	313799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050473
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6405	NC_014836	TGT	2	6	313851	313856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050473
6406	NC_014836	ACA	2	6	313859	313864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050473
6407	NC_014836	TCA	2	6	313883	313888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050473
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6410	NC_014836	GCCCAG	2	12	313995	314006	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317050473
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6413	NC_014836	TGAG	2	8	314131	314138	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6414	NC_014836	TTTC	2	8	314168	314175	0 %	75 %	0 %	25 %	317050474
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6439	NC_014836	GGT	2	6	315368	315373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050474
6440	NC_014836	TGA	2	6	315388	315393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050474
6441	NC_014836	GCT	2	6	315410	315415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050474
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6452	NC_014836	TGT	2	6	315829	315834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050474
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6454	NC_014836	GCA	2	6	316000	316005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050474
6455	NC_014836	CCG	2	6	316053	316058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050474
6456	NC_014836	AGC	2	6	316062	316067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050474
6457	NC_014836	GAT	2	6	316070	316075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050474
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6471	NC_014836	GCA	2	6	316936	316941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050474
6472	NC_014836	AG	3	6	316985	316990	50 %	0 %	50 %	0 %	317050474
6473	NC_014836	TGC	2	6	316994	316999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050474
6474	NC_014836	GTC	2	6	317015	317020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050474
6475	NC_014836	TTGC	2	8	317049	317056	0 %	50 %	25 %	25 %	317050474
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6477	NC_014836	CAT	2	6	317092	317097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050474
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6479	NC_014836	T	7	7	317181	317187	0 %	100 %	0 %	0 %	317050474
6480	NC_014836	TCG	2	6	317199	317204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050474
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6482	NC_014836	GCT	2	6	317242	317247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6483	NC_014836	C	6	6	317253	317258	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6484	NC_014836	CGT	2	6	317264	317269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6486	NC_014836	CAG	2	6	317380	317385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6487	NC_014836	GCT	2	6	317386	317391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6488	NC_014836	TGC	2	6	317436	317441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050475
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6491	NC_014836	CGG	2	6	317818	317823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050475
6492	NC_014836	TGT	2	6	317881	317886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050475
6493	NC_014836	CGG	2	6	317973	317978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050475
6494	NC_014836	CGC	2	6	317992	317997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050475
6495	NC_014836	TCAA	2	8	318105	318112	50 %	25 %	0 %	25 %	317050475
6496	NC_014836	CCA	2	6	318133	318138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050475
6497	NC_014836	TGC	2	6	318218	318223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_014836	TGGA	2	8	318248	318255	25 %	25 %	50 %	0 %	317050476
6499	NC_014836	ATG	2	6	318326	318331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050476
6500	NC_014836	ATA	2	6	318332	318337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050476

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