MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 77613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014216	TGGC	2	8	39932	39939	0 %	25 %	50 %	25 %	297568022
1002	NC_014216	AGA	2	6	40050	40055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568022
1003	NC_014216	TGGCC	2	10	40061	40070	0 %	20 %	40 %	40 %	297568022
1004	NC_014216	GCA	2	6	40126	40131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568022
1005	NC_014216	CTG	2	6	40246	40251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568022
1006	NC_014216	GAA	2	6	40271	40276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568022
1007	NC_014216	GGT	2	6	40456	40461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568022
1008	NC_014216	T	7	7	40461	40467	0 %	100 %	0 %	0 %	297568022
1009	NC_014216	CAGGC	2	10	40603	40612	20 %	0 %	40 %	40 %	297568022
1010	NC_014216	CGG	3	9	40649	40657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568022
1011	NC_014216	GCC	2	6	40700	40705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568022
1012	NC_014216	A	6	6	40715	40720	100 %	0 %	0 %	0 %	297568022
1013	NC_014216	TGA	2	6	40734	40739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568022
1014	NC_014216	GAT	2	6	40783	40788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568022
1015	NC_014216	CAGC	2	8	40871	40878	25 %	0 %	25 %	50 %	297568022
1016	NC_014216	ACT	2	6	40916	40921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568022
1017	NC_014216	A	6	6	40948	40953	100 %	0 %	0 %	0 %	297568022
1018	NC_014216	G	6	6	40970	40975	0 %	0 %	100 %	0 %	297568022
1019	NC_014216	CTG	2	6	40990	40995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568022
1020	NC_014216	AGA	2	6	41027	41032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568022
1021	NC_014216	AAG	2	6	41035	41040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568022
1022	NC_014216	ACG	2	6	41087	41092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568022
1023	NC_014216	GCCAA	2	10	41101	41110	40 %	0 %	20 %	40 %	297568022
1024	NC_014216	AGAA	2	8	41144	41151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014216	T	6	6	41174	41179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014216	T	6	6	41206	41211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014216	AGAA	2	8	41220	41227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014216	A	6	6	41226	41231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014216	A	6	6	41233	41238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014216	CCA	2	6	41300	41305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_014216	GAA	2	6	41311	41316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014216	GCC	2	6	41335	41340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_014216	CTG	2	6	41415	41420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014216	CGG	2	6	41440	41445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_014216	TTTGC	2	10	41527	41536	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_014216	GTG	2	6	41553	41558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014216	GGC	2	6	41635	41640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_014216	GGCC	2	8	41737	41744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_014216	CCG	2	6	41762	41767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_014216	A	6	6	41790	41795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014216	GAG	2	6	41815	41820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014216	ATTGG	2	10	41850	41859	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014216	TGACG	2	10	41948	41957	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_014216	GCC	2	6	41961	41966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_014216	CTGG	2	8	42035	42042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_014216	A	7	7	42054	42060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014216	TACC	2	8	42068	42075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_014216	CGC	2	6	42080	42085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_014216	GGC	2	6	42092	42097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014216	TGG	2	6	42103	42108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014216	AGC	2	6	42181	42186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_014216	CAA	2	6	42197	42202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014216	TGC	2	6	42223	42228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014216	TTGC	2	8	42267	42274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_014216	AGG	2	6	42318	42323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014216	GAA	2	6	42332	42337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014216	TC	3	6	42348	42353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_014216	GTT	2	6	42384	42389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014216	CAG	2	6	42618	42623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_014216	CAAA	2	8	42624	42631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_014216	CGG	2	6	42711	42716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014216	ATG	2	6	42718	42723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014216	GC	3	6	42768	42773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_014216	CT	5	10	42923	42932	0 %	50 %	0 %	50 %	297568023
1065	NC_014216	GCA	2	6	42949	42954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568023
1066	NC_014216	TGG	2	6	42966	42971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568023
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1068	NC_014216	TGG	3	9	43206	43214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568023
1069	NC_014216	ACC	2	6	43217	43222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568023
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1072	NC_014216	TGC	2	6	43305	43310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568023
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1074	NC_014216	CGG	2	6	43425	43430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568023
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1081	NC_014216	GGC	2	6	43636	43641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568023
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1088	NC_014216	GC	3	6	43872	43877	0 %	0 %	50 %	50 %	297568023
1089	NC_014216	CGG	2	6	43887	43892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568023
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1098	NC_014216	CCGG	2	8	44286	44293	0 %	0 %	50 %	50 %	297568024
1099	NC_014216	AT	3	6	44302	44307	50 %	50 %	0 %	0 %	297568024
1100	NC_014216	CTG	2	6	44348	44353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568024
1101	NC_014216	GCC	2	6	44367	44372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568024
1102	NC_014216	TGC	2	6	44394	44399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568024
1103	NC_014216	GCC	2	6	44459	44464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568024
1104	NC_014216	GCC	2	6	44471	44476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568024
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1112	NC_014216	GCC	2	6	44917	44922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568025
1113	NC_014216	TGC	3	9	44942	44950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568025
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1117	NC_014216	GGC	2	6	45012	45017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568025
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1121	NC_014216	CCCGG	2	10	45165	45174	0 %	0 %	40 %	60 %	297568025
1122	NC_014216	TGG	2	6	45179	45184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568025
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1128	NC_014216	GGCCAA	3	18	45363	45380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568025
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1254	NC_014216	TGT	2	6	50002	50007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1380	NC_014216	TGG	2	6	54725	54730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568034
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1464	NC_014216	CAGTG	2	10	57402	57411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1496	NC_014216	CTG	2	6	58514	58519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1497	NC_014216	AGC	2	6	58539	58544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_014216	ACC	2	6	58651	58656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568038
1499	NC_014216	ATC	2	6	58669	58674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568038
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