MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 77613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014216	TGT	2	6	17985	17990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568007
502	NC_014216	TTC	2	6	17995	18000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568007
503	NC_014216	GGC	3	9	18087	18095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014216	A	7	7	18130	18136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014216	GA	3	6	18149	18154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014216	T	6	6	18162	18167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014216	GGC	2	6	18180	18185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014216	AGAA	2	8	18234	18241	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014216	GCG	2	6	18246	18251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_014216	TG	3	6	18271	18276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014216	A	6	6	18288	18293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014216	TGG	2	6	18296	18301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014216	GACC	2	8	18324	18331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
514	NC_014216	TGT	2	6	18374	18379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014216	ACA	2	6	18383	18388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014216	CG	3	6	18422	18427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_014216	TCT	2	6	18447	18452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_014216	CGGG	2	8	18477	18484	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
519	NC_014216	CTG	2	6	18542	18547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568008
520	NC_014216	TCGA	2	8	18569	18576	25 %	25 %	25 %	25 %	297568008
521	NC_014216	T	6	6	18599	18604	0 %	100 %	0 %	0 %	297568008
522	NC_014216	CTT	2	6	18607	18612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568008
523	NC_014216	GAT	2	6	18626	18631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568008
524	NC_014216	GGC	2	6	18632	18637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568008
525	NC_014216	CCG	2	6	18644	18649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568008
526	NC_014216	GCCGGG	2	12	18691	18702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568008
527	NC_014216	GGC	2	6	18704	18709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568008
528	NC_014216	C	6	6	18714	18719	0 %	0 %	0 %	100 %	297568008
529	NC_014216	TGC	2	6	18925	18930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568008
530	NC_014216	GCAC	2	8	18931	18938	25 %	0 %	25 %	50 %	297568008
531	NC_014216	CCG	2	6	18946	18951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568008
532	NC_014216	CCTT	2	8	18996	19003	0 %	50 %	0 %	50 %	297568008
533	NC_014216	CGC	2	6	19046	19051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568008
534	NC_014216	CCG	2	6	19082	19087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568008
535	NC_014216	CCTG	2	8	19282	19289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
536	NC_014216	T	7	7	19327	19333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014216	CGC	2	6	19357	19362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_014216	CGCC	2	8	19369	19376	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
539	NC_014216	TGC	2	6	19491	19496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568009
540	NC_014216	CCG	2	6	19566	19571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568009
541	NC_014216	AGC	2	6	19572	19577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568009
542	NC_014216	GAA	2	6	19637	19642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568009
543	NC_014216	GAA	2	6	19763	19768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568009
544	NC_014216	CTG	2	6	19778	19783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568009
545	NC_014216	CGG	2	6	19793	19798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568009
546	NC_014216	CGG	2	6	19906	19911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568009
547	NC_014216	GCC	2	6	19926	19931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568009
548	NC_014216	C	6	6	19953	19958	0 %	0 %	0 %	100 %	297568009
549	NC_014216	CAG	2	6	19985	19990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568009
550	NC_014216	TGAG	2	8	20034	20041	25 %	25 %	50 %	0 %	297568009
551	NC_014216	CCA	2	6	20058	20063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568009
552	NC_014216	GCG	2	6	20152	20157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568009
553	NC_014216	GGT	2	6	20158	20163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568009
554	NC_014216	ACT	2	6	20184	20189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568009
555	NC_014216	GCG	2	6	20210	20215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568009
556	NC_014216	GCC	2	6	20219	20224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568009
557	NC_014216	CTG	2	6	20246	20251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568009
558	NC_014216	CAA	2	6	20266	20271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568009
559	NC_014216	GTG	2	6	20279	20284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568009
560	NC_014216	GGC	2	6	20293	20298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568009
561	NC_014216	GAC	2	6	20333	20338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568009
562	NC_014216	CGC	2	6	20345	20350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568009
563	NC_014216	CGCC	2	8	20368	20375	0 %	0 %	25 %	75 %	297568009
564	NC_014216	CACC	2	8	20383	20390	25 %	0 %	0 %	75 %	297568009
565	NC_014216	GTG	2	6	20447	20452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568009
566	NC_014216	GCC	2	6	20483	20488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568009
567	NC_014216	CAC	2	6	20551	20556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568009
568	NC_014216	CTG	2	6	20567	20572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568009
569	NC_014216	GGC	2	6	20592	20597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568009
570	NC_014216	GCC	2	6	20640	20645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568009
571	NC_014216	GCG	2	6	20692	20697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568009
572	NC_014216	ACA	2	6	20724	20729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568009
573	NC_014216	CT	3	6	20740	20745	0 %	50 %	0 %	50 %	297568009
574	NC_014216	TGG	2	6	20965	20970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568010
575	NC_014216	CTG	2	6	20979	20984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
576	NC_014216	CTG	2	6	20994	20999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
577	NC_014216	GCT	3	9	21050	21058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
578	NC_014216	TCG	2	6	21079	21084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
579	NC_014216	CGG	2	6	21087	21092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
580	NC_014216	CGG	2	6	21105	21110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
581	NC_014216	CCCTGG	2	12	21148	21159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297568010
582	NC_014216	CTG	2	6	21195	21200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
583	NC_014216	CTG	2	6	21261	21266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
584	NC_014216	CGGC	2	8	21346	21353	0 %	0 %	50 %	50 %	297568010
585	NC_014216	GTGTAT	2	12	21357	21368	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	297568010
586	NC_014216	CGG	2	6	21389	21394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
587	NC_014216	ACCT	2	8	21405	21412	25 %	25 %	0 %	50 %	297568010
588	NC_014216	GGT	2	6	21443	21448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568010
589	NC_014216	CTG	2	6	21486	21491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
590	NC_014216	GCCGGG	2	12	21507	21518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
591	NC_014216	GGC	2	6	21533	21538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
592	NC_014216	GGGC	2	8	21542	21549	0 %	0 %	75 %	25 %	297568010
593	NC_014216	GGC	2	6	21561	21566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
594	NC_014216	CAC	3	9	21600	21608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568010
595	NC_014216	GTG	2	6	21678	21683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568010
596	NC_014216	TGG	2	6	21757	21762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568010
597	NC_014216	CTG	2	6	21783	21788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
598	NC_014216	G	7	7	21834	21840	0 %	0 %	100 %	0 %	297568010
599	NC_014216	CTG	2	6	21903	21908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
600	NC_014216	CTG	2	6	21915	21920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
601	NC_014216	GACC	2	8	21956	21963	25 %	0 %	25 %	50 %	297568010
602	NC_014216	CGGC	2	8	21989	21996	0 %	0 %	50 %	50 %	297568010
603	NC_014216	CCG	2	6	22084	22089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568010
604	NC_014216	GTG	2	6	22134	22139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568010
605	NC_014216	CCTT	2	8	22162	22169	0 %	50 %	0 %	50 %	297568010
606	NC_014216	ATG	2	6	22171	22176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568010
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608	NC_014216	ACC	2	6	22293	22298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568010
609	NC_014216	GCT	2	6	22313	22318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
610	NC_014216	GAT	2	6	22355	22360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568010
611	NC_014216	CAG	2	6	22427	22432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568010
612	NC_014216	AAAT	2	8	22438	22445	75 %	25 %	0 %	0 %	297568010
613	NC_014216	CAG	2	6	22527	22532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568010
614	NC_014216	TGC	2	6	22567	22572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
615	NC_014216	GCCT	2	8	22587	22594	0 %	25 %	25 %	50 %	297568010
616	NC_014216	GCG	2	6	22601	22606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
617	NC_014216	GTC	2	6	22686	22691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
618	NC_014216	T	6	6	22723	22728	0 %	100 %	0 %	0 %	297568010
619	NC_014216	CTG	2	6	22740	22745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
620	NC_014216	GCC	2	6	22749	22754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568010
621	NC_014216	GCC	2	6	22770	22775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568010
622	NC_014216	GCC	2	6	22794	22799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568010
623	NC_014216	CGG	3	9	22802	22810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
624	NC_014216	AGC	2	6	22840	22845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568010
625	NC_014216	TTA	2	6	22855	22860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297568010
626	NC_014216	GCT	2	6	22871	22876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
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628	NC_014216	GC	3	6	22924	22929	0 %	0 %	50 %	50 %	297568010
629	NC_014216	TGT	2	6	22945	22950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568010
630	NC_014216	CTG	2	6	22953	22958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
631	NC_014216	CGG	2	6	22970	22975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
632	NC_014216	GCT	2	6	23054	23059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
633	NC_014216	GGC	2	6	23079	23084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
634	NC_014216	CGG	2	6	23102	23107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568010
635	NC_014216	GGT	2	6	23108	23113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568010
636	NC_014216	GCT	2	6	23114	23119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010
637	NC_014216	TAA	2	6	23185	23190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297568010
638	NC_014216	AGG	2	6	23215	23220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568010
639	NC_014216	TGA	3	9	23223	23231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568010
640	NC_014216	CGC	2	6	23258	23263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568011
641	NC_014216	CGG	2	6	23290	23295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568011
642	NC_014216	GCT	2	6	23314	23319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568011
643	NC_014216	GGC	2	6	23332	23337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568011
644	NC_014216	GCCG	3	12	23349	23360	0 %	0 %	50 %	50 %	297568011
645	NC_014216	CCT	2	6	23376	23381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568011
646	NC_014216	GCG	2	6	23400	23405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568011
647	NC_014216	GAT	2	6	23437	23442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568011
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649	NC_014216	TGG	2	6	23574	23579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568011
650	NC_014216	CTGCG	2	10	23621	23630	0 %	20 %	40 %	40 %	297568011
651	NC_014216	CAG	2	6	23677	23682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568011
652	NC_014216	GAA	2	6	23684	23689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568011
653	NC_014216	GAT	2	6	23701	23706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568011
654	NC_014216	GCA	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568011
655	NC_014216	GCC	2	6	23795	23800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568011
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659	NC_014216	CCG	2	6	23940	23945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568011
660	NC_014216	GAT	2	6	23951	23956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568011
661	NC_014216	TGA	2	6	24048	24053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568011
662	NC_014216	CAA	3	9	24073	24081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568011
663	NC_014216	A	7	7	24092	24098	100 %	0 %	0 %	0 %	297568011
664	NC_014216	CAT	2	6	24145	24150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568011
665	NC_014216	CGCC	2	8	24196	24203	0 %	0 %	25 %	75 %	297568011
666	NC_014216	AG	3	6	24212	24217	50 %	0 %	50 %	0 %	297568011
667	NC_014216	AGG	2	6	24225	24230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568011
668	NC_014216	TGG	2	6	24231	24236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568011
669	NC_014216	TGG	2	6	24284	24289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568011
670	NC_014216	TACGC	2	10	24349	24358	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
671	NC_014216	GGC	2	6	24403	24408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568012
672	NC_014216	GCC	2	6	24414	24419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568012
673	NC_014216	GCC	2	6	24438	24443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568012
674	NC_014216	CGC	2	6	24483	24488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568012
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676	NC_014216	TGG	2	6	24589	24594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568012
677	NC_014216	ACG	2	6	24679	24684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568012
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679	NC_014216	CGC	3	9	24710	24718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568012
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687	NC_014216	CGG	2	6	24946	24951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568012
688	NC_014216	CTG	2	6	24963	24968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568012
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690	NC_014216	GAA	2	6	25008	25013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568012
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696	NC_014216	CGC	3	9	25301	25309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568012
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699	NC_014216	CCA	2	6	25379	25384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
700	NC_014216	AAC	2	6	25461	25466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568013
701	NC_014216	AT	3	6	25480	25485	50 %	50 %	0 %	0 %	297568013
702	NC_014216	T	6	6	25489	25494	0 %	100 %	0 %	0 %	297568013
703	NC_014216	TTTGT	2	10	25547	25556	0 %	80 %	20 %	0 %	297568013
704	NC_014216	CTCAAG	2	12	25616	25627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297568013
705	NC_014216	CTC	2	6	25705	25710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568013
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707	NC_014216	GC	3	6	25919	25924	0 %	0 %	50 %	50 %	297568013
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713	NC_014216	AG	3	6	26279	26284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
714	NC_014216	AAT	2	6	26311	26316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
715	NC_014216	ATT	2	6	26420	26425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
716	NC_014216	TGG	2	6	26508	26513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
717	NC_014216	CCG	2	6	26526	26531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
718	NC_014216	GTC	2	6	26614	26619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
719	NC_014216	GAG	2	6	26680	26685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
720	NC_014216	GCCT	2	8	26807	26814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
721	NC_014216	GAA	2	6	26827	26832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
722	NC_014216	GCCTGC	2	12	26837	26848	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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724	NC_014216	A	6	6	26989	26994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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727	NC_014216	AAGG	2	8	27155	27162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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751	NC_014216	GGCGG	2	10	28056	28065	0 %	0 %	80 %	20 %	297568014
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754	NC_014216	CGG	2	6	28163	28168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568014
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758	NC_014216	CCG	2	6	28254	28259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568014
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