MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 77613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8003	NC_014216	GGCA	2	8	317717	317724	25 %	0 %	50 %	25 %	297568259
8004	NC_014216	CGC	2	6	317734	317739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568259
8005	NC_014216	G	8	8	317746	317753	0 %	0 %	100 %	0 %	297568259
8006	NC_014216	GGT	2	6	317803	317808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568259
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8011	NC_014216	CGG	2	6	317904	317909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568259
8012	NC_014216	CAG	3	9	317929	317937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568259
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8019	NC_014216	GCA	3	9	318225	318233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568259
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8021	NC_014216	AGG	2	6	318511	318516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_014216	ATC	2	6	318581	318586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568260
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8239	NC_014216	G	6	6	326133	326138	0 %	0 %	100 %	0 %	297568269
8240	NC_014216	GGT	2	6	326143	326148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568269
8241	NC_014216	CGC	2	6	326149	326154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568269
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8243	NC_014216	CTG	2	6	326267	326272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568269
8244	NC_014216	GCC	3	9	326279	326287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568269
8245	NC_014216	CCAGCG	2	12	326353	326364	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297568269
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8248	NC_014216	CTG	2	6	326609	326614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568269
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8252	NC_014216	GCC	2	6	326714	326719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568269
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8254	NC_014216	CTG	2	6	326798	326803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568269
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8256	NC_014216	CTG	3	9	326879	326887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568269
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8258	NC_014216	GCG	2	6	327063	327068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568269
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8271	NC_014216	GCT	2	6	327723	327728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568270
8272	NC_014216	GTG	2	6	327754	327759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568270
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8274	NC_014216	GTG	2	6	327814	327819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568270
8275	NC_014216	GGT	2	6	327855	327860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568270
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8278	NC_014216	CTG	2	6	328045	328050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568270
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8280	NC_014216	ATGGT	2	10	328076	328085	20 %	40 %	40 %	0 %	297568270
8281	NC_014216	CAC	2	6	328131	328136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568270
8282	NC_014216	A	8	8	328240	328247	100 %	0 %	0 %	0 %	297568270
8283	NC_014216	CGC	2	6	328276	328281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568270
8284	NC_014216	ACG	3	9	328328	328336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568270
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8288	NC_014216	CTG	3	9	328453	328461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568270
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8291	NC_014216	CAGC	2	8	328602	328609	25 %	0 %	25 %	50 %	297568270
8292	NC_014216	TG	3	6	328621	328626	0 %	50 %	50 %	0 %	297568270
8293	NC_014216	GAT	2	6	328683	328688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568270
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8297	NC_014216	AAGG	2	8	328873	328880	50 %	0 %	50 %	0 %	297568270
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8307	NC_014216	CCA	2	6	329516	329521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568270
8308	NC_014216	CAT	2	6	329532	329537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568270
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8312	NC_014216	GTT	2	6	329682	329687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568270
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8314	NC_014216	GCC	2	6	329827	329832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568270
8315	NC_014216	ATT	2	6	329872	329877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297568270
8316	NC_014216	TACGG	2	10	329946	329955	20 %	20 %	40 %	20 %	297568270
8317	NC_014216	GGT	2	6	329988	329993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568270
8318	NC_014216	GAC	2	6	330046	330051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568270
8319	NC_014216	CTG	3	9	330052	330060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568270
8320	NC_014216	CTTT	2	8	330078	330085	0 %	75 %	0 %	25 %	297568270
8321	NC_014216	GTT	2	6	330097	330102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568270
8322	NC_014216	GCT	2	6	330183	330188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8323	NC_014216	AGCA	2	8	330294	330301	50 %	0 %	25 %	25 %	297568271
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8327	NC_014216	GCC	2	6	330509	330514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568271
8328	NC_014216	GAG	2	6	330550	330555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568271
8329	NC_014216	CTG	3	9	330609	330617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568271
8330	NC_014216	GGC	3	9	330732	330740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568271
8331	NC_014216	GAC	2	6	330745	330750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568271
8332	NC_014216	GCT	2	6	330771	330776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568271
8333	NC_014216	GCA	2	6	330777	330782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568271
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8335	NC_014216	CAA	2	6	330834	330839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568271
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8337	NC_014216	GAG	2	6	330913	330918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568271
8338	NC_014216	CTG	2	6	330925	330930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568271
8339	NC_014216	GCCGCT	2	12	330931	330942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297568271
8340	NC_014216	A	6	6	330959	330964	100 %	0 %	0 %	0 %	297568271
8341	NC_014216	GAAT	2	8	331161	331168	50 %	25 %	25 %	0 %	297568271
8342	NC_014216	CTG	2	6	331258	331263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568271
8343	NC_014216	GA	3	6	331295	331300	50 %	0 %	50 %	0 %	297568271
8344	NC_014216	G	7	7	331324	331330	0 %	0 %	100 %	0 %	297568271
8345	NC_014216	T	6	6	331402	331407	0 %	100 %	0 %	0 %	297568271
8346	NC_014216	ACC	2	6	331408	331413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568271
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8348	NC_014216	GGC	2	6	331480	331485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568271
8349	NC_014216	CAG	2	6	331615	331620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568272
8350	NC_014216	GCA	2	6	331624	331629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568272
8351	NC_014216	GGC	2	6	331647	331652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568272
8352	NC_014216	CGG	2	6	331653	331658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568272
8353	NC_014216	AGG	2	6	331718	331723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568272
8354	NC_014216	GGA	2	6	331755	331760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568272
8355	NC_014216	ATC	2	6	331771	331776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568272
8356	NC_014216	CGG	2	6	331780	331785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568272
8357	NC_014216	AGCA	2	8	331862	331869	50 %	0 %	25 %	25 %	297568272
8358	NC_014216	CGGGG	2	10	331936	331945	0 %	0 %	80 %	20 %	297568272
8359	NC_014216	GAG	2	6	331978	331983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568272
8360	NC_014216	CAT	2	6	332014	332019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568272
8361	NC_014216	A	6	6	332059	332064	100 %	0 %	0 %	0 %	297568272
8362	NC_014216	GAG	2	6	332071	332076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568272
8363	NC_014216	GCAGC	2	10	332133	332142	20 %	0 %	40 %	40 %	297568272
8364	NC_014216	ATG	2	6	332144	332149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568272
8365	NC_014216	CAA	2	6	332229	332234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568272
8366	NC_014216	GCC	2	6	332272	332277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568272
8367	NC_014216	TGG	3	9	332324	332332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568272
8368	NC_014216	CTG	2	6	332338	332343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568272
8369	NC_014216	TGC	2	6	332378	332383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568272
8370	NC_014216	TGG	2	6	332384	332389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568272
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8396	NC_014216	CGG	2	6	333585	333590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8397	NC_014216	CAG	2	6	333800	333805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568274
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8486	NC_014216	CCG	2	6	337539	337544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568278
8487	NC_014216	T	6	6	337613	337618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8488	NC_014216	CCCG	2	8	337640	337647	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8489	NC_014216	GCC	2	6	337673	337678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8490	NC_014216	GC	3	6	337702	337707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8491	NC_014216	ATCC	2	8	337711	337718	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8492	NC_014216	GTC	2	6	337724	337729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8493	NC_014216	TTC	2	6	337781	337786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8494	NC_014216	TAA	2	6	337792	337797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8495	NC_014216	T	6	6	337849	337854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8496	NC_014216	GGC	2	6	337876	337881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8497	NC_014216	A	7	7	337939	337945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8498	NC_014216	TAAT	2	8	337987	337994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8499	NC_014216	TCA	2	6	338004	338009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8500	NC_014216	ACA	2	6	338015	338020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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