MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 77613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014216	ATC	2	6	219563	219568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568177
5502	NC_014216	CAG	2	6	219570	219575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5503	NC_014216	TTC	2	6	219605	219610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568177
5504	NC_014216	TGGG	2	8	219631	219638	0 %	25 %	75 %	0 %	297568177
5505	NC_014216	GCA	2	6	219657	219662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5506	NC_014216	GCT	2	6	219670	219675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5507	NC_014216	T	8	8	219689	219696	0 %	100 %	0 %	0 %	297568177
5508	NC_014216	AG	3	6	219745	219750	50 %	0 %	50 %	0 %	297568177
5509	NC_014216	TCT	3	9	219780	219788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568177
5510	NC_014216	TTG	2	6	219806	219811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568177
5511	NC_014216	GCC	2	6	219858	219863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568177
5512	NC_014216	TGG	2	6	219867	219872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568177
5513	NC_014216	T	7	7	219879	219885	0 %	100 %	0 %	0 %	297568177
5514	NC_014216	GTT	2	6	219916	219921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568177
5515	NC_014216	TGT	2	6	219939	219944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568177
5516	NC_014216	GGC	2	6	219950	219955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568177
5517	NC_014216	CAG	2	6	219965	219970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5518	NC_014216	GCG	2	6	219974	219979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568177
5519	NC_014216	GC	3	6	220035	220040	0 %	0 %	50 %	50 %	297568177
5520	NC_014216	GGCG	2	8	220108	220115	0 %	0 %	75 %	25 %	297568177
5521	NC_014216	TCA	2	6	220129	220134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568177
5522	NC_014216	TGG	2	6	220135	220140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568177
5523	NC_014216	GAT	2	6	220160	220165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568177
5524	NC_014216	CCA	2	6	220231	220236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568177
5525	NC_014216	GTC	2	6	220244	220249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5526	NC_014216	GCC	2	6	220325	220330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568177
5527	NC_014216	GTCCAG	2	12	220376	220387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5528	NC_014216	GCC	2	6	220406	220411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568177
5529	NC_014216	CCCGG	2	10	220430	220439	0 %	0 %	40 %	60 %	297568177
5530	NC_014216	CGT	2	6	220501	220506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5531	NC_014216	CGCT	2	8	220557	220564	0 %	25 %	25 %	50 %	297568177
5532	NC_014216	CTG	2	6	220668	220673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5533	NC_014216	GAT	2	6	220679	220684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568177
5534	NC_014216	TGG	2	6	220702	220707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568177
5535	NC_014216	GGT	2	6	220724	220729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568177
5536	NC_014216	CGG	2	6	220764	220769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568177
5537	NC_014216	GCG	2	6	220770	220775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568177
5538	NC_014216	CGC	2	6	220828	220833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568177
5539	NC_014216	CTG	2	6	220851	220856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5540	NC_014216	GCA	2	6	220960	220965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5541	NC_014216	TTC	2	6	220979	220984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568177
5542	NC_014216	AG	3	6	221064	221069	50 %	0 %	50 %	0 %	297568177
5543	NC_014216	GCA	3	9	221071	221079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568177
5544	NC_014216	GCG	2	6	221109	221114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568177
5545	NC_014216	ATG	2	6	221126	221131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568177
5546	NC_014216	AGAA	2	8	221140	221147	75 %	0 %	25 %	0 %	297568177
5547	NC_014216	CAT	2	6	221199	221204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_014216	A	7	7	221236	221242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_014216	G	6	6	221265	221270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_014216	T	6	6	221368	221373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_014216	TCC	2	6	221438	221443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568178
5552	NC_014216	TTG	2	6	221486	221491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568178
5553	NC_014216	CAA	2	6	221524	221529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568178
5554	NC_014216	C	6	6	221531	221536	0 %	0 %	0 %	100 %	297568178
5555	NC_014216	GCC	3	9	221561	221569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568178
5556	NC_014216	TCTT	2	8	221579	221586	0 %	75 %	0 %	25 %	297568178
5557	NC_014216	GGC	2	6	221628	221633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568179
5558	NC_014216	GC	3	6	221632	221637	0 %	0 %	50 %	50 %	297568179
5559	NC_014216	AGCC	2	8	221734	221741	25 %	0 %	25 %	50 %	297568179
5560	NC_014216	CCG	2	6	221751	221756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568179
5561	NC_014216	TCG	3	9	221887	221895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568179
5562	NC_014216	GGT	2	6	221907	221912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568179
5563	NC_014216	GCA	2	6	221924	221929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568179
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5579	NC_014216	CAG	2	6	222477	222482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568179
5580	NC_014216	CTG	2	6	222504	222509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568179
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5582	NC_014216	CTT	2	6	222572	222577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568179
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5584	NC_014216	CCGG	2	8	222604	222611	0 %	0 %	50 %	50 %	297568179
5585	NC_014216	TCC	2	6	222637	222642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568179
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5587	NC_014216	AAT	2	6	222884	222889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_014216	CAAT	2	8	222940	222947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_014216	CGGCC	2	10	223002	223011	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5590	NC_014216	GTT	2	6	223028	223033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_014216	CGG	2	6	223108	223113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_014216	CCT	2	6	223145	223150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_014216	CGG	3	9	223166	223174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_014216	TTGCTT	2	12	223255	223266	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5595	NC_014216	GCC	2	6	223267	223272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_014216	GAG	2	6	223301	223306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_014216	ATG	2	6	223315	223320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_014216	T	6	6	223330	223335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_014216	GGA	2	6	223372	223377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_014216	GCT	2	6	223432	223437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568180
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5605	NC_014216	CTG	2	6	223628	223633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568180
5606	NC_014216	CCTC	2	8	223638	223645	0 %	25 %	0 %	75 %	297568180
5607	NC_014216	CCGG	2	8	223690	223697	0 %	0 %	50 %	50 %	297568180
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5610	NC_014216	CGG	2	6	223875	223880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568180
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5612	NC_014216	CGG	2	6	223903	223908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568180
5613	NC_014216	GTC	2	6	223912	223917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568180
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5615	NC_014216	C	6	6	224017	224022	0 %	0 %	0 %	100 %	297568181
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5618	NC_014216	CTG	3	9	224084	224092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568181
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5623	NC_014216	GAG	2	6	224321	224326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568181
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5627	NC_014216	T	6	6	224438	224443	0 %	100 %	0 %	0 %	297568181
5628	NC_014216	GGC	2	6	224482	224487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568181
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5688	NC_014216	CCGCA	2	10	226905	226914	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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5732	NC_014216	CGGC	2	8	228680	228687	0 %	0 %	50 %	50 %	297568183
5733	NC_014216	CTGC	2	8	228700	228707	0 %	25 %	25 %	50 %	297568183
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5737	NC_014216	GGC	2	6	228852	228857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568184
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5739	NC_014216	GGA	2	6	228901	228906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568184
5740	NC_014216	ATCC	2	8	228907	228914	25 %	25 %	0 %	50 %	297568184
5741	NC_014216	CTG	2	6	228917	228922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568184
5742	NC_014216	GCCG	2	8	228923	228930	0 %	0 %	50 %	50 %	297568184
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5744	NC_014216	TGA	2	6	229065	229070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568184
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5988	NC_014216	GCA	2	6	238647	238652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568195
5989	NC_014216	CTT	2	6	238653	238658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568195
5990	NC_014216	GTTG	2	8	238751	238758	0 %	50 %	50 %	0 %	297568195
5991	NC_014216	GTT	2	6	238767	238772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568195
5992	NC_014216	T	6	6	238775	238780	0 %	100 %	0 %	0 %	297568195
5993	NC_014216	TCT	2	6	238792	238797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568196
5994	NC_014216	T	6	6	238797	238802	0 %	100 %	0 %	0 %	297568196
5995	NC_014216	T	7	7	238807	238813	0 %	100 %	0 %	0 %	297568196
5996	NC_014216	GGC	2	6	238892	238897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568196
5997	NC_014216	CGG	2	6	238906	238911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568196
5998	NC_014216	GAT	3	9	238919	238927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568196
5999	NC_014216	CCAG	2	8	239017	239024	25 %	0 %	25 %	50 %	297568196
6000	NC_014216	CGGC	2	8	239094	239101	0 %	0 %	50 %	50 %	297568196

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