MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 77613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55502	NC_014216	GCG	2	6	2221511	2221516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297569866
55503	NC_014216	CCACC	2	10	2221530	2221539	20 %	0 %	0 %	80 %	297569866
55504	NC_014216	CCG	2	6	2221584	2221589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569866
55505	NC_014216	TGCC	2	8	2221593	2221600	0 %	25 %	25 %	50 %	297569866
55506	NC_014216	CGG	3	9	2221618	2221626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55507	NC_014216	TGC	2	6	2221635	2221640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55508	NC_014216	GCC	2	6	2221706	2221711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569867
55509	NC_014216	CGG	2	6	2221768	2221773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297569867
55510	NC_014216	CCAT	2	8	2221798	2221805	25 %	25 %	0 %	50 %	297569867
55511	NC_014216	GGC	2	6	2221830	2221835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297569867
55512	NC_014216	CGA	2	6	2221874	2221879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569867
55513	NC_014216	CAG	2	6	2221956	2221961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569867
55514	NC_014216	T	7	7	2221990	2221996	0 %	100 %	0 %	0 %	297569867
55515	NC_014216	ATC	2	6	2222022	2222027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297569867
55516	NC_014216	CCG	2	6	2222054	2222059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569867
55517	NC_014216	GCC	2	6	2222121	2222126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569867
55518	NC_014216	CT	3	6	2222172	2222177	0 %	50 %	0 %	50 %	297569867
55519	NC_014216	GC	3	6	2222210	2222215	0 %	0 %	50 %	50 %	297569867
55520	NC_014216	GCT	2	6	2222266	2222271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569867
55521	NC_014216	CCGG	2	8	2222290	2222297	0 %	0 %	50 %	50 %	297569867
55522	NC_014216	CGCTAC	2	12	2222331	2222342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297569867
55523	NC_014216	GCT	2	6	2222345	2222350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569867
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55542	NC_014216	CA	3	6	2222995	2223000	50 %	0 %	0 %	50 %	297569867
55543	NC_014216	CG	3	6	2223044	2223049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55544	NC_014216	GGT	2	6	2223054	2223059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55545	NC_014216	GCC	2	6	2223101	2223106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569868
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55551	NC_014216	T	6	6	2223305	2223310	0 %	100 %	0 %	0 %	297569868
55552	NC_014216	CTG	2	6	2223311	2223316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569868
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55555	NC_014216	GCC	2	6	2223387	2223392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569868
55556	NC_014216	TCC	2	6	2223434	2223439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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55617	NC_014216	TCG	2	6	2225852	2225857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569871
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55847	NC_014216	CAT	2	6	2234119	2234124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297569879
55848	NC_014216	CGCC	2	8	2234125	2234132	0 %	0 %	25 %	75 %	297569879
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55851	NC_014216	GCG	3	9	2234225	2234233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297569879
55852	NC_014216	CGGCC	2	10	2234245	2234254	0 %	0 %	40 %	60 %	297569879
55853	NC_014216	CA	3	6	2234323	2234328	50 %	0 %	0 %	50 %	297569879
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55859	NC_014216	CAG	2	6	2234485	2234490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569879
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55872	NC_014216	CAG	2	6	2235142	2235147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569881
55873	NC_014216	GCC	2	6	2235187	2235192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569881
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55881	NC_014216	CGA	2	6	2235447	2235452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569881
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55883	NC_014216	CAC	2	6	2235493	2235498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297569881
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55886	NC_014216	CCA	2	6	2235663	2235668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297569881
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55893	NC_014216	GCG	2	6	2235850	2235855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297569881
55894	NC_014216	GGCC	2	8	2235864	2235871	0 %	0 %	50 %	50 %	297569881
55895	NC_014216	CCAG	2	8	2235882	2235889	25 %	0 %	25 %	50 %	297569881
55896	NC_014216	CCA	2	6	2235912	2235917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297569881
55897	NC_014216	ATG	2	6	2235923	2235928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297569881
55898	NC_014216	CCG	2	6	2235929	2235934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569881
55899	NC_014216	TCA	2	6	2235980	2235985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55902	NC_014216	TGC	2	6	2236132	2236137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569882
55903	NC_014216	GCC	2	6	2236173	2236178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569882
55904	NC_014216	TAA	2	6	2236191	2236196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297569882
55905	NC_014216	TGA	2	6	2236213	2236218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297569882
55906	NC_014216	CATC	2	8	2236303	2236310	25 %	25 %	0 %	50 %	297569882
55907	NC_014216	ATCAAA	2	12	2236358	2236369	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	297569882
55908	NC_014216	CGT	2	6	2236405	2236410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569882
55909	NC_014216	CCGGT	2	10	2236435	2236444	0 %	20 %	40 %	40 %	297569882
55910	NC_014216	CAC	2	6	2236475	2236480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297569882
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55912	NC_014216	ACC	2	6	2236566	2236571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297569882
55913	NC_014216	GTC	2	6	2236595	2236600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569882
55914	NC_014216	CGT	2	6	2236603	2236608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569882
55915	NC_014216	CAG	2	6	2236667	2236672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569882
55916	NC_014216	CAG	2	6	2236706	2236711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569882
55917	NC_014216	G	6	6	2236711	2236716	0 %	0 %	100 %	0 %	297569882
55918	NC_014216	GCC	2	6	2236721	2236726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569882
55919	NC_014216	CGGCA	2	10	2236817	2236826	20 %	0 %	40 %	40 %	297569882
55920	NC_014216	CGG	2	6	2236831	2236836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297569882
55921	NC_014216	GGTA	2	8	2236921	2236928	25 %	25 %	50 %	0 %	297569882
55922	NC_014216	CGA	2	6	2236987	2236992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569882
55923	NC_014216	CCAT	2	8	2237001	2237008	25 %	25 %	0 %	50 %	297569882
55924	NC_014216	TGC	2	6	2237046	2237051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569882
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55926	NC_014216	GGCT	2	8	2237267	2237274	0 %	25 %	50 %	25 %	297569883
55927	NC_014216	GGA	2	6	2237292	2237297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297569883
55928	NC_014216	ACC	2	6	2237336	2237341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297569883
55929	NC_014216	CTC	2	6	2237380	2237385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297569883
55930	NC_014216	GCC	2	6	2237387	2237392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569883
55931	NC_014216	CGG	2	6	2237398	2237403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297569883
55932	NC_014216	GCT	2	6	2237414	2237419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569883
55933	NC_014216	GCCGCT	2	12	2237426	2237437	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297569883
55934	NC_014216	GCC	2	6	2237450	2237455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569883
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55938	NC_014216	GCC	2	6	2237486	2237491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569883
55939	NC_014216	CTT	2	6	2237497	2237502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297569883
55940	NC_014216	CCT	2	6	2237523	2237528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297569883
55941	NC_014216	CCAG	2	8	2237535	2237542	25 %	0 %	25 %	50 %	297569883
55942	NC_014216	CCT	2	6	2237574	2237579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297569883
55943	NC_014216	CGC	2	6	2237593	2237598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297569883
55944	NC_014216	GGAA	2	8	2237614	2237621	50 %	0 %	50 %	0 %	297569883
55945	NC_014216	CGGG	2	8	2237645	2237652	0 %	0 %	75 %	25 %	297569883
55946	NC_014216	GGT	2	6	2237662	2237667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297569883
55947	NC_014216	CTG	2	6	2237685	2237690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569883
55948	NC_014216	CGG	2	6	2237752	2237757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297569884
55949	NC_014216	TCC	2	6	2237773	2237778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297569884
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55951	NC_014216	GGGC	2	8	2237814	2237821	0 %	0 %	75 %	25 %	297569884
55952	NC_014216	C	6	6	2237901	2237906	0 %	0 %	0 %	100 %	297569884
55953	NC_014216	T	7	7	2237987	2237993	0 %	100 %	0 %	0 %	297569884
55954	NC_014216	ATC	2	6	2238013	2238018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297569884
55955	NC_014216	CAT	2	6	2238096	2238101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297569884
55956	NC_014216	GCA	2	6	2238111	2238116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297569884
55957	NC_014216	GGCCC	2	10	2238150	2238159	0 %	0 %	40 %	60 %	297569884
55958	NC_014216	CAC	2	6	2238192	2238197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297569884
55959	NC_014216	G	6	6	2238199	2238204	0 %	0 %	100 %	0 %	297569884
55960	NC_014216	GTC	2	6	2238207	2238212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297569884
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