MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 77613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014216	TTCT	2	8	180704	180711	0 %	75 %	0 %	25 %	297568136
4502	NC_014216	GCTG	2	8	180715	180722	0 %	25 %	50 %	25 %	297568136
4503	NC_014216	ATA	2	6	180740	180745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297568136
4504	NC_014216	TGG	3	9	180789	180797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_014216	A	8	8	180825	180832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014216	GGT	2	6	180857	180862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568137
4507	NC_014216	ATC	2	6	180932	180937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568137
4508	NC_014216	GAT	2	6	180982	180987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568137
4509	NC_014216	ATC	2	6	181031	181036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568137
4510	NC_014216	TCG	2	6	181106	181111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568137
4511	NC_014216	TGC	2	6	181140	181145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568137
4512	NC_014216	A	6	6	181169	181174	100 %	0 %	0 %	0 %	297568137
4513	NC_014216	CGC	2	6	181199	181204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568137
4514	NC_014216	CTC	2	6	181225	181230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568137
4515	NC_014216	GTG	2	6	181379	181384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568137
4516	NC_014216	ATG	2	6	181511	181516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568137
4517	NC_014216	TGT	2	6	181569	181574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568137
4518	NC_014216	CCG	2	6	181584	181589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568137
4519	NC_014216	CGAC	2	8	181595	181602	25 %	0 %	25 %	50 %	297568137
4520	NC_014216	AGC	2	6	181616	181621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568137
4521	NC_014216	A	7	7	181675	181681	100 %	0 %	0 %	0 %	297568137
4522	NC_014216	A	7	7	181843	181849	100 %	0 %	0 %	0 %	297568137
4523	NC_014216	TGC	2	6	181866	181871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568137
4524	NC_014216	AAT	2	6	182002	182007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297568137
4525	NC_014216	TACG	2	8	182028	182035	25 %	25 %	25 %	25 %	297568137
4526	NC_014216	CCA	2	6	182070	182075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568137
4527	NC_014216	GCC	3	9	182123	182131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568137
4528	NC_014216	TTC	3	9	182137	182145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568137
4529	NC_014216	G	7	7	182221	182227	0 %	0 %	100 %	0 %	297568137
4530	NC_014216	CCG	2	6	182262	182267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568137
4531	NC_014216	GA	3	6	182291	182296	50 %	0 %	50 %	0 %	297568137
4532	NC_014216	TTC	2	6	182329	182334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568137
4533	NC_014216	CAG	2	6	182395	182400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568137
4534	NC_014216	CCA	2	6	182427	182432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568137
4535	NC_014216	TCT	2	6	182528	182533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568138
4536	NC_014216	GGT	2	6	182638	182643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568138
4537	NC_014216	TTG	2	6	182665	182670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568138
4538	NC_014216	TGT	2	6	182681	182686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568138
4539	NC_014216	TGG	2	6	182697	182702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568138
4540	NC_014216	ACC	2	6	182795	182800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568138
4541	NC_014216	CAT	2	6	182848	182853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568138
4542	NC_014216	CTC	2	6	182856	182861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_014216	CCTG	2	8	182931	182938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_014216	CAT	2	6	182984	182989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_014216	TGG	2	6	183026	183031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014216	A	6	6	183100	183105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_014216	GACCG	2	10	183142	183151	20 %	0 %	40 %	40 %	297568139
4548	NC_014216	G	6	6	183191	183196	0 %	0 %	100 %	0 %	297568139
4549	NC_014216	GCCG	2	8	183215	183222	0 %	0 %	50 %	50 %	297568139
4550	NC_014216	GCA	2	6	183250	183255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568139
4551	NC_014216	CTT	2	6	183311	183316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568139
4552	NC_014216	GAT	2	6	183401	183406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568139
4553	NC_014216	CTG	2	6	183407	183412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568139
4554	NC_014216	GTG	2	6	183413	183418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568139
4555	NC_014216	CGG	2	6	183448	183453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568139
4556	NC_014216	GCT	2	6	183481	183486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568139
4557	NC_014216	GA	3	6	183491	183496	50 %	0 %	50 %	0 %	297568139
4558	NC_014216	TGG	4	12	183552	183563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568139
4559	NC_014216	A	6	6	183566	183571	100 %	0 %	0 %	0 %	297568139
4560	NC_014216	GCG	2	6	183575	183580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568139
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4562	NC_014216	CCTGGT	2	12	183631	183642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568139
4563	NC_014216	CCG	2	6	183735	183740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568139
4564	NC_014216	G	7	7	183802	183808	0 %	0 %	100 %	0 %	297568139
4565	NC_014216	GGT	2	6	183886	183891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568139
4566	NC_014216	AT	3	6	183902	183907	50 %	50 %	0 %	0 %	297568139
4567	NC_014216	GAA	2	6	183917	183922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568139
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4570	NC_014216	CCG	2	6	184026	184031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568139
4571	NC_014216	CCG	2	6	184064	184069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568139
4572	NC_014216	GCT	2	6	184081	184086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568139
4573	NC_014216	GTTTT	2	10	184186	184195	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_014216	T	7	7	184192	184198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_014216	AGG	2	6	184252	184257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014216	TGA	2	6	184291	184296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568140
4577	NC_014216	GGC	2	6	184306	184311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568140
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4579	NC_014216	GCC	2	6	184389	184394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568140
4580	NC_014216	CGG	3	9	184553	184561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568140
4581	NC_014216	GCGCC	2	10	184669	184678	0 %	0 %	40 %	60 %	297568140
4582	NC_014216	ATC	2	6	184760	184765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568140
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4584	NC_014216	GTC	2	6	184845	184850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568141
4585	NC_014216	AGGCC	2	10	184910	184919	20 %	0 %	40 %	40 %	297568141
4586	NC_014216	GCG	2	6	184945	184950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568141
4587	NC_014216	CGG	2	6	185070	185075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568141
4588	NC_014216	GCGG	2	8	185084	185091	0 %	0 %	75 %	25 %	297568141
4589	NC_014216	TGC	2	6	185102	185107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568141
4590	NC_014216	CTG	2	6	185185	185190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568141
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4592	NC_014216	CTGGC	2	10	185311	185320	0 %	20 %	40 %	40 %	297568141
4593	NC_014216	TGG	2	6	185321	185326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568141
4594	NC_014216	CGGC	2	8	185364	185371	0 %	0 %	50 %	50 %	297568141
4595	NC_014216	TCCG	2	8	185393	185400	0 %	25 %	25 %	50 %	297568141
4596	NC_014216	CTG	2	6	185466	185471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_014216	GTG	2	6	185479	185484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014216	CAG	2	6	185522	185527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_014216	CCT	2	6	185530	185535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568142
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4601	NC_014216	GCCA	2	8	185697	185704	25 %	0 %	25 %	50 %	297568142
4602	NC_014216	CTC	2	6	185708	185713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568142
4603	NC_014216	CGC	2	6	185755	185760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568142
4604	NC_014216	GT	3	6	185790	185795	0 %	50 %	50 %	0 %	297568142
4605	NC_014216	GGC	2	6	185830	185835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568142
4606	NC_014216	ACC	2	6	185964	185969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568142
4607	NC_014216	TCC	2	6	185976	185981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568142
4608	NC_014216	GAT	2	6	185990	185995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568142
4609	NC_014216	CTT	2	6	186119	186124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568142
4610	NC_014216	TGAG	2	8	186184	186191	25 %	25 %	50 %	0 %	297568142
4611	NC_014216	TTG	2	6	186234	186239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568142
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4613	NC_014216	CCG	2	6	186370	186375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568142
4614	NC_014216	CTGG	2	8	186413	186420	0 %	25 %	50 %	25 %	297568142
4615	NC_014216	T	6	6	186481	186486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014216	TTTA	2	8	186551	186558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014216	AGC	2	6	186600	186605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_014216	AGG	2	6	186626	186631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014216	GAAG	2	8	186684	186691	50 %	0 %	50 %	0 %	297568143
4620	NC_014216	T	8	8	186750	186757	0 %	100 %	0 %	0 %	297568143
4621	NC_014216	GCC	2	6	186809	186814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568143
4622	NC_014216	A	6	6	186816	186821	100 %	0 %	0 %	0 %	297568143
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4624	NC_014216	TGC	2	6	186857	186862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568143
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4646	NC_014216	T	8	8	187743	187750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4992	NC_014216	CCG	2	6	199799	199804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568157
4993	NC_014216	TTG	2	6	199826	199831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568157
4994	NC_014216	AGC	2	6	199896	199901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568157
4995	NC_014216	GGTT	2	8	199998	200005	0 %	50 %	50 %	0 %	297568157
4996	NC_014216	GGAA	2	8	200043	200050	50 %	0 %	50 %	0 %	297568157
4997	NC_014216	CCG	2	6	200099	200104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568157
4998	NC_014216	ACTTT	2	10	200117	200126	20 %	60 %	0 %	20 %	297568157
4999	NC_014216	GCC	2	6	200128	200133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568157
5000	NC_014216	GGT	2	6	200178	200183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568157

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