MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 24992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013890	CCG	3	9	26422	26430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431982
502	NC_013890	GGT	2	6	26523	26528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431982
503	NC_013890	TA	4	8	26643	26650	50 %	50 %	0 %	0 %	289431982
504	NC_013890	GTA	2	6	26703	26708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431982
505	NC_013890	CCA	2	6	26735	26740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431982
506	NC_013890	GAA	2	6	26742	26747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431982
507	NC_013890	AATAAG	2	12	26748	26759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289431982
508	NC_013890	GTT	2	6	26772	26777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431982
509	NC_013890	GTA	2	6	26821	26826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431982
510	NC_013890	CTG	2	6	26961	26966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431982
511	NC_013890	GCC	2	6	27051	27056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431982
512	NC_013890	CTG	2	6	27112	27117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431982
513	NC_013890	AC	3	6	27119	27124	50 %	0 %	0 %	50 %	289431982
514	NC_013890	GGT	2	6	27132	27137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431982
515	NC_013890	GGC	2	6	27222	27227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431982
516	NC_013890	CAG	2	6	27306	27311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431982
517	NC_013890	TGA	2	6	27329	27334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431982
518	NC_013890	CCAC	2	8	27409	27416	25 %	0 %	0 %	75 %	289431982
519	NC_013890	TTAT	2	8	27451	27458	25 %	75 %	0 %	0 %	289431982
520	NC_013890	TTTA	2	8	27467	27474	25 %	75 %	0 %	0 %	289431983
521	NC_013890	AAT	2	6	27561	27566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431983
522	NC_013890	ATT	2	6	27573	27578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431983
523	NC_013890	ACA	2	6	27583	27588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289431983
524	NC_013890	TGG	2	6	27596	27601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431983
525	NC_013890	CCG	2	6	27718	27723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431983
526	NC_013890	TAA	2	6	27755	27760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431983
527	NC_013890	AAG	2	6	27812	27817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431983
528	NC_013890	TTG	2	6	27820	27825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431983
529	NC_013890	CGGT	2	8	27955	27962	0 %	25 %	50 %	25 %	289431983
530	NC_013890	ACC	2	6	27979	27984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431983
531	NC_013890	GCC	2	6	28003	28008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431983
532	NC_013890	T	6	6	28016	28021	0 %	100 %	0 %	0 %	289431983
533	NC_013890	ACA	2	6	28045	28050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289431983
534	NC_013890	CCA	2	6	28181	28186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431983
535	NC_013890	CTT	2	6	28241	28246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431983
536	NC_013890	CCA	2	6	28262	28267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431983
537	NC_013890	ACTC	2	8	28289	28296	25 %	25 %	0 %	50 %	289431983
538	NC_013890	CAGA	2	8	28484	28491	50 %	0 %	25 %	25 %	289431983
539	NC_013890	AGT	2	6	28551	28556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431983
540	NC_013890	GGC	2	6	28557	28562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431983
541	NC_013890	TCA	2	6	28603	28608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431983
542	NC_013890	GGC	2	6	28674	28679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431983
543	NC_013890	CAA	2	6	28745	28750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289431983
544	NC_013890	TCT	2	6	28765	28770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431983
545	NC_013890	GCC	3	9	28806	28814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431983
546	NC_013890	TC	3	6	28914	28919	0 %	50 %	0 %	50 %	289431984
547	NC_013890	ATG	2	6	28935	28940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431984
548	NC_013890	TGA	2	6	28951	28956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431984
549	NC_013890	GA	3	6	28955	28960	50 %	0 %	50 %	0 %	289431984
550	NC_013890	TCT	2	6	28975	28980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431984
551	NC_013890	AT	3	6	28999	29004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013890	GT	3	6	29039	29044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013890	GCT	2	6	29078	29083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_013890	AAT	2	6	29088	29093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013890	ATG	2	6	29108	29113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013890	GTT	2	6	29114	29119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013890	TATC	2	8	29153	29160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_013890	AAAT	2	8	29165	29172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013890	AT	3	6	29171	29176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013890	AT	4	8	29254	29261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013890	GAAA	2	8	29268	29275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013890	AAAT	2	8	29276	29283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013890	AGG	2	6	29300	29305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013890	TAT	2	6	29324	29329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431985
565	NC_013890	GGA	2	6	29336	29341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431985
566	NC_013890	GAA	2	6	29372	29377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431985
567	NC_013890	AGTT	2	8	29407	29414	25 %	50 %	25 %	0 %	289431985
568	NC_013890	GAT	2	6	29433	29438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431985
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570	NC_013890	TTGCT	2	10	29545	29554	0 %	60 %	20 %	20 %	289431985
571	NC_013890	GAT	2	6	29568	29573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431985
572	NC_013890	ATTC	2	8	29586	29593	25 %	50 %	0 %	25 %	289431985
573	NC_013890	TTTA	2	8	29610	29617	25 %	75 %	0 %	0 %	289431985
574	NC_013890	GGC	2	6	29626	29631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431985
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576	NC_013890	ATT	2	6	29661	29666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431985
577	NC_013890	GCTG	2	8	29669	29676	0 %	25 %	50 %	25 %	289431985
578	NC_013890	CAT	2	6	29837	29842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431985
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580	NC_013890	TCT	2	6	29958	29963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431986
581	NC_013890	TAT	2	6	29964	29969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431986
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583	NC_013890	TAA	2	6	30071	30076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431986
584	NC_013890	GGC	2	6	30078	30083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431986
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586	NC_013890	TGG	2	6	30260	30265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431986
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591	NC_013890	TAT	2	6	30525	30530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431986
592	NC_013890	ATT	2	6	30592	30597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431986
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595	NC_013890	CTG	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431986
596	NC_013890	TTC	2	6	30780	30785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431986
597	NC_013890	TAT	2	6	30789	30794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431986
598	NC_013890	GCT	2	6	30864	30869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431986
599	NC_013890	T	6	6	30897	30902	0 %	100 %	0 %	0 %	289431986
600	NC_013890	GTTT	2	8	30911	30918	0 %	75 %	25 %	0 %	289431986
601	NC_013890	AAT	2	6	30975	30980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431987
602	NC_013890	CGG	2	6	31129	31134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431987
603	NC_013890	AAAT	2	8	31166	31173	75 %	25 %	0 %	0 %	289431987
604	NC_013890	T	7	7	31190	31196	0 %	100 %	0 %	0 %	289431987
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608	NC_013890	TA	3	6	31422	31427	50 %	50 %	0 %	0 %	289431987
609	NC_013890	CAG	2	6	31506	31511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431987
610	NC_013890	TTA	2	6	31525	31530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431987
611	NC_013890	TCA	2	6	31544	31549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431987
612	NC_013890	ACCGC	2	10	31565	31574	20 %	0 %	20 %	60 %	289431988
613	NC_013890	GCC	2	6	31619	31624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431988
614	NC_013890	TGT	2	6	31818	31823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431988
615	NC_013890	AT	3	6	31867	31872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013890	CAG	2	6	32004	32009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013890	GTAT	2	8	32026	32033	25 %	50 %	25 %	0 %	289431989
618	NC_013890	TTG	2	6	32038	32043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431989
619	NC_013890	TTG	2	6	32055	32060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431989
620	NC_013890	GCG	2	6	32106	32111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431989
621	NC_013890	GCG	2	6	32341	32346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431989
622	NC_013890	TAA	2	6	32407	32412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431989
623	NC_013890	TCT	2	6	32443	32448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431989
624	NC_013890	TGA	2	6	32495	32500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431989
625	NC_013890	GTTA	2	8	32522	32529	25 %	50 %	25 %	0 %	289431989
626	NC_013890	TTC	2	6	32552	32557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431989
627	NC_013890	GTAATA	2	12	32577	32588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289431989
628	NC_013890	ATG	2	6	32601	32606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431989
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630	NC_013890	TG	3	6	32736	32741	0 %	50 %	50 %	0 %	289431989
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