MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_013223	GAA	2	6	2661364	2661369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406458
48003	NC_013223	CTG	2	6	2661448	2661453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406458
48004	NC_013223	TA	3	6	2661500	2661505	50 %	50 %	0 %	0 %	258406458
48005	NC_013223	CAT	3	9	2661534	2661542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406458
48006	NC_013223	CCCTGA	2	12	2661557	2661568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258406458
48007	NC_013223	TGC	2	6	2661587	2661592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406458
48008	NC_013223	GAT	2	6	2661687	2661692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406458
48009	NC_013223	CGG	2	6	2661735	2661740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406458
48010	NC_013223	CCA	2	6	2661767	2661772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406458
48011	NC_013223	GGC	2	6	2661796	2661801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406458
48012	NC_013223	CCA	2	6	2661869	2661874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406458
48013	NC_013223	TGA	2	6	2661932	2661937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406458
48014	NC_013223	TGG	2	6	2662025	2662030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406458
48015	NC_013223	ACAA	2	8	2662036	2662043	75 %	0 %	0 %	25 %	258406458
48016	NC_013223	CAC	2	6	2662059	2662064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406458
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48018	NC_013223	CGG	2	6	2662116	2662121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406458
48019	NC_013223	GGCC	2	8	2662191	2662198	0 %	0 %	50 %	50 %	258406458
48020	NC_013223	C	6	6	2662253	2662258	0 %	0 %	0 %	100 %	258406458
48021	NC_013223	GCC	2	6	2662313	2662318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406458
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48030	NC_013223	CT	3	6	2662848	2662853	0 %	50 %	0 %	50 %	258406458
48031	NC_013223	TGC	2	6	2662880	2662885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406458
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48102	NC_013223	CCGG	2	8	2667095	2667102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48103	NC_013223	GAA	2	6	2667114	2667119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48104	NC_013223	A	6	6	2667118	2667123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48105	NC_013223	CTG	2	6	2667149	2667154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406463
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48115	NC_013223	CGC	2	6	2667418	2667423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406463
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48117	NC_013223	GTC	2	6	2667587	2667592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406463
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48230	NC_013223	CCG	2	6	2672861	2672866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48231	NC_013223	CAA	2	6	2672869	2672874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48232	NC_013223	CAC	2	6	2672875	2672880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48233	NC_013223	CAA	2	6	2672941	2672946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48235	NC_013223	GC	3	6	2672997	2673002	0 %	0 %	50 %	50 %	258406465
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48351	NC_013223	AG	3	6	2679118	2679123	50 %	0 %	50 %	0 %	258406468
48352	NC_013223	TCA	2	6	2679148	2679153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406468
48353	NC_013223	CTGCCC	2	12	2679156	2679167	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	258406468
48354	NC_013223	AGCG	2	8	2679174	2679181	25 %	0 %	50 %	25 %	258406468
48355	NC_013223	CG	3	6	2679180	2679185	0 %	0 %	50 %	50 %	258406468
48356	NC_013223	GT	3	6	2679234	2679239	0 %	50 %	50 %	0 %	258406468
48357	NC_013223	GCA	2	6	2679268	2679273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406468
48358	NC_013223	CGG	2	6	2679299	2679304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406468
48359	NC_013223	AAC	2	6	2679322	2679327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406468
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48362	NC_013223	CCA	2	6	2679577	2679582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406468
48363	NC_013223	GTC	2	6	2679659	2679664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406468
48364	NC_013223	CCGGGC	2	12	2679672	2679683	0 %	0 %	50 %	50 %	258406468
48365	NC_013223	GCC	2	6	2679688	2679693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406468
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48367	NC_013223	CGA	2	6	2679896	2679901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406468
48368	NC_013223	TCC	2	6	2679906	2679911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406468
48369	NC_013223	GTC	2	6	2679981	2679986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406468
48370	NC_013223	TGG	2	6	2680016	2680021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406468
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48374	NC_013223	C	6	6	2680132	2680137	0 %	0 %	0 %	100 %	258406468
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48378	NC_013223	GAC	2	6	2680272	2680277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406468
48379	NC_013223	TGC	2	6	2680357	2680362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406468
48380	NC_013223	CGGC	2	8	2680379	2680386	0 %	0 %	50 %	50 %	258406468
48381	NC_013223	GCC	2	6	2680407	2680412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406468
48382	NC_013223	A	7	7	2680426	2680432	100 %	0 %	0 %	0 %	258406468
48383	NC_013223	ACC	2	6	2680534	2680539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406468
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48385	NC_013223	GCA	2	6	2680604	2680609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406468
48386	NC_013223	A	6	6	2680702	2680707	100 %	0 %	0 %	0 %	258406468
48387	NC_013223	CGC	2	6	2680732	2680737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406468
48388	NC_013223	GGGC	2	8	2680771	2680778	0 %	0 %	75 %	25 %	258406468
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48397	NC_013223	CGCC	2	8	2681153	2681160	0 %	0 %	25 %	75 %	258406468
48398	NC_013223	CCCG	2	8	2681180	2681187	0 %	0 %	25 %	75 %	258406468
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48406	NC_013223	CTGA	2	8	2681675	2681682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48407	NC_013223	ATCCAG	2	12	2681745	2681756	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258406469
48408	NC_013223	CA	3	6	2681790	2681795	50 %	0 %	0 %	50 %	258406469
48409	NC_013223	CCG	2	6	2681896	2681901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406469
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48411	NC_013223	A	7	7	2682322	2682328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48412	NC_013223	ACC	2	6	2682385	2682390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48413	NC_013223	CTG	2	6	2682395	2682400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48415	NC_013223	TTCT	2	8	2682501	2682508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48416	NC_013223	A	7	7	2682518	2682524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48417	NC_013223	ATG	2	6	2682546	2682551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48418	NC_013223	ACA	2	6	2682554	2682559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48419	NC_013223	A	8	8	2682576	2682583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48420	NC_013223	CAA	2	6	2682630	2682635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48421	NC_013223	A	7	7	2682673	2682679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48422	NC_013223	GAA	2	6	2682717	2682722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48423	NC_013223	GGA	2	6	2682724	2682729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48424	NC_013223	GCG	2	6	2682872	2682877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406470
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48433	NC_013223	GAG	2	6	2683344	2683349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48434	NC_013223	ACC	2	6	2683377	2683382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48435	NC_013223	TTC	2	6	2683435	2683440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48436	NC_013223	AGGGG	2	10	2683449	2683458	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48437	NC_013223	ATG	2	6	2683486	2683491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48438	NC_013223	TTC	2	6	2683605	2683610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48439	NC_013223	GGAC	2	8	2683616	2683623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48440	NC_013223	TTCGAT	2	12	2683675	2683686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48441	NC_013223	CGC	2	6	2683717	2683722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48442	NC_013223	TTC	2	6	2683725	2683730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48443	NC_013223	TCT	2	6	2683737	2683742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48444	NC_013223	GCC	2	6	2683771	2683776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48445	NC_013223	ACCG	2	8	2683821	2683828	25 %	0 %	25 %	50 %	258406471
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48451	NC_013223	A	6	6	2684028	2684033	100 %	0 %	0 %	0 %	258406471
48452	NC_013223	CAC	2	6	2684058	2684063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406471
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48455	NC_013223	GCCA	2	8	2684146	2684153	25 %	0 %	25 %	50 %	258406471
48456	NC_013223	GCCA	2	8	2684275	2684282	25 %	0 %	25 %	50 %	258406471
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48461	NC_013223	TGC	2	6	2684594	2684599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48462	NC_013223	GGT	2	6	2684631	2684636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406472
48463	NC_013223	GTC	2	6	2684648	2684653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406472
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48465	NC_013223	CAG	2	6	2684699	2684704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406472
48466	NC_013223	GCCGG	2	10	2684803	2684812	0 %	0 %	60 %	40 %	258406472
48467	NC_013223	TGG	2	6	2684917	2684922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406472
48468	NC_013223	GCTG	2	8	2684936	2684943	0 %	25 %	50 %	25 %	258406472
48469	NC_013223	GC	3	6	2684987	2684992	0 %	0 %	50 %	50 %	258406472
48470	NC_013223	CTC	2	6	2684993	2684998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406472
48471	NC_013223	GC	3	6	2685004	2685009	0 %	0 %	50 %	50 %	258406472
48472	NC_013223	CAA	2	6	2685035	2685040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406472
48473	NC_013223	CCA	2	6	2685052	2685057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406472
48474	NC_013223	CAGAC	2	10	2685135	2685144	40 %	0 %	20 %	40 %	258406472
48475	NC_013223	TCC	2	6	2685202	2685207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48476	NC_013223	GCCC	2	8	2685234	2685241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48477	NC_013223	CGGA	2	8	2685339	2685346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48478	NC_013223	GCCCG	2	10	2685441	2685450	0 %	0 %	40 %	60 %	258406473
48479	NC_013223	GCA	2	6	2685462	2685467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406473
48480	NC_013223	AGA	2	6	2685544	2685549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406473
48481	NC_013223	GCT	2	6	2685595	2685600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406473
48482	NC_013223	CTT	2	6	2685601	2685606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406473
48483	NC_013223	TCT	2	6	2685611	2685616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406473
48484	NC_013223	GCC	2	6	2685644	2685649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406473
48485	NC_013223	CGA	2	6	2685668	2685673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48486	NC_013223	AGC	2	6	2685788	2685793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48487	NC_013223	CCG	2	6	2685847	2685852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48488	NC_013223	GCGG	2	8	2685895	2685902	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48489	NC_013223	TTC	3	9	2685943	2685951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48490	NC_013223	GGAC	2	8	2685954	2685961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48491	NC_013223	CCTT	2	8	2685974	2685981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48492	NC_013223	TTCGAT	2	12	2686013	2686024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48493	NC_013223	CGATTT	2	12	2686027	2686038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48494	NC_013223	TTC	2	6	2686075	2686080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48495	NC_013223	GCC	2	6	2686083	2686088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48496	NC_013223	TCT	2	6	2686108	2686113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48497	NC_013223	CT	3	6	2686112	2686117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48498	NC_013223	ATGT	2	8	2686156	2686163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48499	NC_013223	CCA	2	6	2686193	2686198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48500	NC_013223	CCT	2	6	2686267	2686272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406474

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