MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_013223	CCA	2	6	2607621	2607626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406414
47003	NC_013223	CGC	2	6	2607777	2607782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406414
47004	NC_013223	GACC	2	8	2607809	2607816	25 %	0 %	25 %	50 %	258406414
47005	NC_013223	CGC	2	6	2607825	2607830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406414
47006	NC_013223	CGA	2	6	2607843	2607848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406414
47007	NC_013223	CGCT	2	8	2607892	2607899	0 %	25 %	25 %	50 %	258406415
47008	NC_013223	TCT	2	6	2607921	2607926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406415
47009	NC_013223	TGCCC	2	10	2607940	2607949	0 %	20 %	20 %	60 %	258406415
47010	NC_013223	CACG	2	8	2608030	2608037	25 %	0 %	25 %	50 %	258406415
47011	NC_013223	GCA	2	6	2608099	2608104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406415
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47013	NC_013223	GCC	2	6	2608184	2608189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406415
47014	NC_013223	GCC	2	6	2608235	2608240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406415
47015	NC_013223	CAC	2	6	2608253	2608258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406415
47016	NC_013223	GC	3	6	2608279	2608284	0 %	0 %	50 %	50 %	258406415
47017	NC_013223	GCT	2	6	2608288	2608293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406415
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47019	NC_013223	GCA	2	6	2608308	2608313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406415
47020	NC_013223	GC	3	6	2608344	2608349	0 %	0 %	50 %	50 %	258406415
47021	NC_013223	CCG	2	6	2608363	2608368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406415
47022	NC_013223	GC	3	6	2608399	2608404	0 %	0 %	50 %	50 %	258406415
47023	NC_013223	ATC	2	6	2608418	2608423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406415
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47027	NC_013223	CTG	2	6	2608577	2608582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406415
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47029	NC_013223	GGCC	2	8	2608656	2608663	0 %	0 %	50 %	50 %	258406416
47030	NC_013223	GCC	2	6	2608719	2608724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406416
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47045	NC_013223	T	6	6	2609582	2609587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47238	NC_013223	TCA	2	6	2621130	2621135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406427
47239	NC_013223	CTTT	2	8	2621169	2621176	0 %	75 %	0 %	25 %	258406427
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47269	NC_013223	ATAA	2	8	2622584	2622591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47270	NC_013223	GA	3	6	2622614	2622619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47271	NC_013223	AT	3	6	2622625	2622630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47272	NC_013223	TA	3	6	2622652	2622657	50 %	50 %	0 %	0 %	258406428
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47329	NC_013223	CGG	2	6	2625871	2625876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406428
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47332	NC_013223	CG	3	6	2626085	2626090	0 %	0 %	50 %	50 %	258406428
47333	NC_013223	CAA	2	6	2626152	2626157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406428
47334	NC_013223	GGT	2	6	2626170	2626175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406428
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47337	NC_013223	T	7	7	2626353	2626359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47338	NC_013223	AT	3	6	2626362	2626367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47339	NC_013223	AT	3	6	2626382	2626387	50 %	50 %	0 %	0 %	258406429
47340	NC_013223	TATT	2	8	2626439	2626446	25 %	75 %	0 %	0 %	258406429
47341	NC_013223	AT	3	6	2626469	2626474	50 %	50 %	0 %	0 %	258406429
47342	NC_013223	T	7	7	2626474	2626480	0 %	100 %	0 %	0 %	258406429
47343	NC_013223	ATTT	2	8	2626495	2626502	25 %	75 %	0 %	0 %	258406429
47344	NC_013223	GCA	2	6	2626520	2626525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406429
47345	NC_013223	A	6	6	2626649	2626654	100 %	0 %	0 %	0 %	258406429
47346	NC_013223	ATTTGA	2	12	2626759	2626770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258406429
47347	NC_013223	AAGC	2	8	2626781	2626788	50 %	0 %	25 %	25 %	258406429
47348	NC_013223	CATA	2	8	2626839	2626846	50 %	25 %	0 %	25 %	258406429
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47350	NC_013223	CTG	2	6	2627034	2627039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406429
47351	NC_013223	TTA	2	6	2627043	2627048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406429
47352	NC_013223	ATTTAA	2	12	2627159	2627170	50 %	50 %	0 %	0 %	258406429
47353	NC_013223	TCT	2	6	2627183	2627188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406430
47354	NC_013223	TA	3	6	2627189	2627194	50 %	50 %	0 %	0 %	258406430
47355	NC_013223	TCT	3	9	2627233	2627241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406430
47356	NC_013223	A	6	6	2627298	2627303	100 %	0 %	0 %	0 %	258406430
47357	NC_013223	GGCCTC	2	12	2627343	2627354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258406430
47358	NC_013223	TG	3	6	2627405	2627410	0 %	50 %	50 %	0 %	258406430
47359	NC_013223	CGA	2	6	2627414	2627419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406430
47360	NC_013223	GCA	2	6	2627489	2627494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406430
47361	NC_013223	TCTCC	2	10	2627522	2627531	0 %	40 %	0 %	60 %	258406430
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47363	NC_013223	GTG	2	6	2627809	2627814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406431
47364	NC_013223	TTC	2	6	2627842	2627847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406431
47365	NC_013223	CGG	2	6	2627877	2627882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406431
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47369	NC_013223	AGGTC	2	10	2628044	2628053	20 %	20 %	40 %	20 %	258406431
47370	NC_013223	GTC	2	6	2628096	2628101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406431
47371	NC_013223	GCC	3	9	2628153	2628161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406431
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47373	NC_013223	GCG	2	6	2628215	2628220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406431
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47379	NC_013223	CCT	3	9	2628531	2628539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406432
47380	NC_013223	GC	3	6	2628542	2628547	0 %	0 %	50 %	50 %	258406432
47381	NC_013223	CGACCG	2	12	2628567	2628578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258406432
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47383	NC_013223	GGTC	2	8	2628688	2628695	0 %	25 %	50 %	25 %	258406432
47384	NC_013223	GAG	2	6	2628895	2628900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406432
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47397	NC_013223	GCG	2	6	2629619	2629624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406433
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47399	NC_013223	CCGG	2	8	2629755	2629762	0 %	0 %	50 %	50 %	258406433
47400	NC_013223	GAT	2	6	2629779	2629784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406433
47401	NC_013223	CTGA	2	8	2629818	2629825	25 %	25 %	25 %	25 %	258406433
47402	NC_013223	TCG	2	6	2629948	2629953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406433
47403	NC_013223	AG	3	6	2630094	2630099	50 %	0 %	50 %	0 %	258406433
47404	NC_013223	GGT	2	6	2630102	2630107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406433
47405	NC_013223	CAC	2	6	2630124	2630129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406433
47406	NC_013223	AGCC	2	8	2630165	2630172	25 %	0 %	25 %	50 %	258406433
47407	NC_013223	CTT	2	6	2630186	2630191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406433
47408	NC_013223	CGA	2	6	2630207	2630212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406433
47409	NC_013223	GCAC	2	8	2630363	2630370	25 %	0 %	25 %	50 %	258406433
47410	NC_013223	TCC	2	6	2630530	2630535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47411	NC_013223	GATG	2	8	2630545	2630552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47412	NC_013223	GGCCGG	2	12	2630589	2630600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406434
47413	NC_013223	ACG	2	6	2630635	2630640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406434
47414	NC_013223	AGC	2	6	2630728	2630733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406434
47415	NC_013223	CGG	2	6	2630743	2630748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406434
47416	NC_013223	GTA	2	6	2630751	2630756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406434
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47419	NC_013223	GC	3	6	2630854	2630859	0 %	0 %	50 %	50 %	258406434
47420	NC_013223	CGG	2	6	2630918	2630923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406434
47421	NC_013223	CCGCC	2	10	2630927	2630936	0 %	0 %	20 %	80 %	258406434
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47424	NC_013223	CA	3	6	2631194	2631199	50 %	0 %	0 %	50 %	258406435
47425	NC_013223	GC	3	6	2631200	2631205	0 %	0 %	50 %	50 %	258406435
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47427	NC_013223	CGG	2	6	2631349	2631354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406435
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47429	NC_013223	TCC	2	6	2631603	2631608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406435
47430	NC_013223	CCG	2	6	2631614	2631619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406435
47431	NC_013223	TCG	2	6	2631627	2631632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406435
47432	NC_013223	AGA	2	6	2631664	2631669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406435
47433	NC_013223	GGT	2	6	2631691	2631696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406435
47434	NC_013223	GCA	2	6	2631731	2631736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406435
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47437	NC_013223	TTCG	2	8	2631871	2631878	0 %	50 %	25 %	25 %	258406435
47438	NC_013223	TGA	2	6	2631892	2631897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406435
47439	NC_013223	CCGC	2	8	2631908	2631915	0 %	0 %	25 %	75 %	258406435
47440	NC_013223	TGA	2	6	2631967	2631972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406435
47441	NC_013223	TCGG	2	8	2632026	2632033	0 %	25 %	50 %	25 %	258406435
47442	NC_013223	CGC	2	6	2632051	2632056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406435
47443	NC_013223	GTC	2	6	2632146	2632151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406435
47444	NC_013223	AC	3	6	2632368	2632373	50 %	0 %	0 %	50 %	258406435
47445	NC_013223	CCG	2	6	2632422	2632427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406435
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47449	NC_013223	CCG	2	6	2632509	2632514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406435
47450	NC_013223	ATGACC	2	12	2632515	2632526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258406435
47451	NC_013223	GGC	2	6	2632622	2632627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406435
47452	NC_013223	CCA	3	9	2632753	2632761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406435
47453	NC_013223	CCT	2	6	2632801	2632806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406435
47454	NC_013223	TGC	2	6	2632912	2632917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406435
47455	NC_013223	AGG	2	6	2633036	2633041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406436
47456	NC_013223	TGGCCT	2	12	2633060	2633071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406436
47457	NC_013223	CAG	2	6	2633148	2633153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406436
47458	NC_013223	TGT	2	6	2633177	2633182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406436
47459	NC_013223	TTG	2	6	2633200	2633205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406436
47460	NC_013223	CCATGG	2	12	2633258	2633269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258406436
47461	NC_013223	ACA	2	6	2633291	2633296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406436
47462	NC_013223	AGG	2	6	2633342	2633347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406436
47463	NC_013223	GCA	2	6	2633352	2633357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406436
47464	NC_013223	GTC	2	6	2633436	2633441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406436
47465	NC_013223	ATG	2	6	2633470	2633475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406436
47466	NC_013223	GTTC	2	8	2633615	2633622	0 %	50 %	25 %	25 %	258406436
47467	NC_013223	GCGG	2	8	2633655	2633662	0 %	0 %	75 %	25 %	258406436
47468	NC_013223	CA	3	6	2633703	2633708	50 %	0 %	0 %	50 %	258406436
47469	NC_013223	GCA	2	6	2633799	2633804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406436
47470	NC_013223	ATA	2	6	2633907	2633912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406436
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47472	NC_013223	ACGG	2	8	2634001	2634008	25 %	0 %	50 %	25 %	258406437
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47477	NC_013223	TTG	2	6	2634324	2634329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406437
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