MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_013223	CTG	2	6	2553071	2553076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406368
46002	NC_013223	CAA	2	6	2553166	2553171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406368
46003	NC_013223	GATC	2	8	2553172	2553179	25 %	25 %	25 %	25 %	258406368
46004	NC_013223	GAG	2	6	2553218	2553223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406368
46005	NC_013223	CGC	2	6	2553318	2553323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406368
46006	NC_013223	AGT	2	6	2553391	2553396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406368
46007	NC_013223	ACG	2	6	2553429	2553434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406368
46008	NC_013223	GCC	2	6	2553602	2553607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406368
46009	NC_013223	TCT	2	6	2553660	2553665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406368
46010	NC_013223	A	6	6	2553707	2553712	100 %	0 %	0 %	0 %	258406368
46011	NC_013223	ACG	2	6	2553735	2553740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406368
46012	NC_013223	CGAA	2	8	2554008	2554015	50 %	0 %	25 %	25 %	258406368
46013	NC_013223	GAA	2	6	2554043	2554048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406368
46014	NC_013223	CCT	2	6	2554083	2554088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406368
46015	NC_013223	CTT	2	6	2554138	2554143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406368
46016	NC_013223	TTC	2	6	2554202	2554207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406368
46017	NC_013223	CTCAAG	2	12	2554316	2554327	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258406368
46018	NC_013223	TCA	2	6	2554356	2554361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406368
46019	NC_013223	CAA	2	6	2554378	2554383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406368
46020	NC_013223	AGAA	2	8	2554482	2554489	75 %	0 %	25 %	0 %	258406368
46021	NC_013223	AGG	2	6	2554533	2554538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406368
46022	NC_013223	GCC	2	6	2554547	2554552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406368
46023	NC_013223	GCC	2	6	2554584	2554589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46024	NC_013223	ATC	2	6	2554730	2554735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406369
46025	NC_013223	T	7	7	2554750	2554756	0 %	100 %	0 %	0 %	258406369
46026	NC_013223	TGC	2	6	2554803	2554808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406369
46027	NC_013223	ACC	2	6	2554827	2554832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406369
46028	NC_013223	CAT	2	6	2554918	2554923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406369
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46031	NC_013223	CA	3	6	2555057	2555062	50 %	0 %	0 %	50 %	258406369
46032	NC_013223	CCG	2	6	2555080	2555085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406369
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46034	NC_013223	ATC	2	6	2555213	2555218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406369
46035	NC_013223	TGAAC	2	10	2555274	2555283	40 %	20 %	20 %	20 %	258406369
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46037	NC_013223	GCCGC	2	10	2555307	2555316	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46038	NC_013223	TTG	2	6	2555361	2555366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406370
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46044	NC_013223	GC	3	6	2555695	2555700	0 %	0 %	50 %	50 %	258406370
46045	NC_013223	CTC	2	6	2555745	2555750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406370
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46050	NC_013223	TGC	2	6	2556046	2556051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406370
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46052	NC_013223	CGG	3	9	2556188	2556196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406370
46053	NC_013223	CAC	2	6	2556231	2556236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406370
46054	NC_013223	CGA	2	6	2556251	2556256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406370
46055	NC_013223	GCCA	2	8	2556295	2556302	25 %	0 %	25 %	50 %	258406370
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46062	NC_013223	GACCGA	2	12	2556683	2556694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406370
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46064	NC_013223	GCC	2	6	2556870	2556875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46065	NC_013223	GC	3	6	2557030	2557035	0 %	0 %	50 %	50 %	258406371
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46099	NC_013223	GGCCTT	2	12	2558720	2558731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406372
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46107	NC_013223	TGA	2	6	2559049	2559054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406372
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46111	NC_013223	CG	3	6	2559213	2559218	0 %	0 %	50 %	50 %	258406372
46112	NC_013223	TCG	2	6	2559300	2559305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406372
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46114	NC_013223	GAC	2	6	2559440	2559445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406372
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46116	NC_013223	CA	3	6	2559646	2559651	50 %	0 %	0 %	50 %	258406372
46117	NC_013223	GGC	2	6	2559704	2559709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406372
46118	NC_013223	TCT	2	6	2559882	2559887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46119	NC_013223	TCA	2	6	2560065	2560070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406373
46120	NC_013223	CCA	2	6	2560095	2560100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406373
46121	NC_013223	GTG	2	6	2560149	2560154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406373
46122	NC_013223	GCA	2	6	2560180	2560185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406373
46123	NC_013223	TTG	2	6	2560306	2560311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406373
46124	NC_013223	CGG	2	6	2560339	2560344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406373
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46127	NC_013223	CGC	2	6	2560458	2560463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406373
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46132	NC_013223	CCT	2	6	2560727	2560732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406373
46133	NC_013223	CCGG	2	8	2560764	2560771	0 %	0 %	50 %	50 %	258406373
46134	NC_013223	GGC	2	6	2560806	2560811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406373
46135	NC_013223	GACC	2	8	2560856	2560863	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46136	NC_013223	ATG	2	6	2560978	2560983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406374
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46168	NC_013223	ATTG	2	8	2562933	2562940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46169	NC_013223	CG	3	6	2562982	2562987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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46195	NC_013223	CAGT	2	8	2564217	2564224	25 %	25 %	25 %	25 %	258406376
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46212	NC_013223	A	6	6	2565218	2565223	100 %	0 %	0 %	0 %	258406377
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46226	NC_013223	GC	3	6	2565782	2565787	0 %	0 %	50 %	50 %	258406378
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46233	NC_013223	CCA	2	6	2566019	2566024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406378
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46472	NC_013223	GCC	2	6	2579729	2579734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406389
46473	NC_013223	TG	3	6	2579751	2579756	0 %	50 %	50 %	0 %	258406389
46474	NC_013223	GCC	2	6	2579760	2579765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406389
46475	NC_013223	ACCA	2	8	2579903	2579910	50 %	0 %	0 %	50 %	258406389
46476	NC_013223	CGC	2	6	2579923	2579928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406389
46477	NC_013223	CGG	3	9	2579965	2579973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406389
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46479	NC_013223	AGC	2	6	2580066	2580071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406389
46480	NC_013223	GCCT	2	8	2580098	2580105	0 %	25 %	25 %	50 %	258406389
46481	NC_013223	CCGCTG	2	12	2580119	2580130	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258406389
46482	NC_013223	C	6	6	2580172	2580177	0 %	0 %	0 %	100 %	258406389
46483	NC_013223	GGCGA	2	10	2580281	2580290	20 %	0 %	60 %	20 %	258406389
46484	NC_013223	CGC	2	6	2580346	2580351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406389
46485	NC_013223	CATGCC	2	12	2580386	2580397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258406389
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46492	NC_013223	AAG	2	6	2580522	2580527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406389
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46495	NC_013223	GCG	2	6	2580696	2580701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406389
46496	NC_013223	CGC	2	6	2580725	2580730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406389
46497	NC_013223	CGG	2	6	2580780	2580785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406389
46498	NC_013223	CCT	2	6	2580799	2580804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406389
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46500	NC_013223	GCC	2	6	2580878	2580883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406389

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