MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_013223	CTC	2	6	2468645	2468650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406291
44502	NC_013223	GTT	2	6	2468673	2468678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406291
44503	NC_013223	CCAGGC	2	12	2468720	2468731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258406291
44504	NC_013223	GGT	2	6	2468819	2468824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406291
44505	NC_013223	A	6	6	2468855	2468860	100 %	0 %	0 %	0 %	258406291
44506	NC_013223	CTGC	2	8	2468962	2468969	0 %	25 %	25 %	50 %	258406291
44507	NC_013223	GGC	2	6	2469017	2469022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406291
44508	NC_013223	AC	3	6	2469069	2469074	50 %	0 %	0 %	50 %	258406291
44509	NC_013223	CAA	2	6	2469077	2469082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406291
44510	NC_013223	CGG	2	6	2469086	2469091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406291
44511	NC_013223	CAGGAG	2	12	2469165	2469176	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258406291
44512	NC_013223	CGG	2	6	2469215	2469220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406291
44513	NC_013223	CGACA	2	10	2469222	2469231	40 %	0 %	20 %	40 %	258406291
44514	NC_013223	GCAG	2	8	2469353	2469360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44515	NC_013223	GCC	2	6	2469482	2469487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44516	NC_013223	GTTC	2	8	2469659	2469666	0 %	50 %	25 %	25 %	258406292
44517	NC_013223	CTC	2	6	2469684	2469689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406292
44518	NC_013223	TC	3	6	2469728	2469733	0 %	50 %	0 %	50 %	258406292
44519	NC_013223	GCC	2	6	2469826	2469831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406292
44520	NC_013223	CTC	2	6	2469876	2469881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406292
44521	NC_013223	ACC	2	6	2469883	2469888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406292
44522	NC_013223	CAA	3	9	2469894	2469902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406292
44523	NC_013223	CAACAC	2	12	2470008	2470019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44524	NC_013223	GGCAA	2	10	2470049	2470058	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44525	NC_013223	CTT	2	6	2470059	2470064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44526	NC_013223	CAC	2	6	2470131	2470136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44527	NC_013223	C	7	7	2470163	2470169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44528	NC_013223	CACG	2	8	2470188	2470195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44529	NC_013223	CGG	2	6	2470196	2470201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44530	NC_013223	CCA	2	6	2470292	2470297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44531	NC_013223	GCC	2	6	2470333	2470338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406293
44532	NC_013223	TGA	2	6	2470394	2470399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406293
44533	NC_013223	TTTC	2	8	2470500	2470507	0 %	75 %	0 %	25 %	258406293
44534	NC_013223	GC	3	6	2470588	2470593	0 %	0 %	50 %	50 %	258406293
44535	NC_013223	GTC	2	6	2470618	2470623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406293
44536	NC_013223	CAG	2	6	2470629	2470634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406293
44537	NC_013223	CTGGTG	2	12	2470639	2470650	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258406293
44538	NC_013223	GCT	2	6	2470671	2470676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406293
44539	NC_013223	CTG	2	6	2470681	2470686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406293
44540	NC_013223	TAT	2	6	2470756	2470761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406293
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44542	NC_013223	GGCCT	2	10	2470909	2470918	0 %	20 %	40 %	40 %	258406293
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44544	NC_013223	GGCT	2	8	2470981	2470988	0 %	25 %	50 %	25 %	258406293
44545	NC_013223	CGC	2	6	2471006	2471011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406293
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44547	NC_013223	GCC	2	6	2471152	2471157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406293
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44551	NC_013223	CTGG	2	8	2471523	2471530	0 %	25 %	50 %	25 %	258406293
44552	NC_013223	CTG	2	6	2471566	2471571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406293
44553	NC_013223	GCG	2	6	2471593	2471598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406293
44554	NC_013223	CAT	3	9	2471625	2471633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406293
44555	NC_013223	TACGC	2	10	2471759	2471768	20 %	20 %	20 %	40 %	258406294
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44557	NC_013223	TCTGG	2	10	2471872	2471881	0 %	40 %	40 %	20 %	258406294
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44567	NC_013223	GTC	2	6	2472639	2472644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44569	NC_013223	AAC	2	6	2472774	2472779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44570	NC_013223	GGA	2	6	2472806	2472811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44571	NC_013223	GAA	3	9	2472866	2472874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406295
44572	NC_013223	ACC	2	6	2472875	2472880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406295
44573	NC_013223	CAT	3	9	2472889	2472897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406295
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44579	NC_013223	CA	3	6	2473122	2473127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44580	NC_013223	AGG	2	6	2473128	2473133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44590	NC_013223	CTCATC	2	12	2473795	2473806	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258406296
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44616	NC_013223	CCA	2	6	2474926	2474931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44617	NC_013223	TGCC	2	8	2474938	2474945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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44742	NC_013223	CCG	2	6	2482815	2482820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44743	NC_013223	CG	3	6	2482819	2482824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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44982	NC_013223	TTG	2	6	2496220	2496225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406312
44983	NC_013223	CGG	2	6	2496280	2496285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406312
44984	NC_013223	CAT	2	6	2496303	2496308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406312
44985	NC_013223	GACC	2	8	2496318	2496325	25 %	0 %	25 %	50 %	258406312
44986	NC_013223	TTC	2	6	2496360	2496365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406312
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44988	NC_013223	TTC	2	6	2496444	2496449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406312
44989	NC_013223	TCCT	2	8	2496468	2496475	0 %	50 %	0 %	50 %	258406312
44990	NC_013223	GAGC	2	8	2496498	2496505	25 %	0 %	50 %	25 %	258406312
44991	NC_013223	GAC	2	6	2496597	2496602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406312
44992	NC_013223	GCA	2	6	2496614	2496619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406312
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44999	NC_013223	A	6	6	2496828	2496833	100 %	0 %	0 %	0 %	258406312
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