MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_013223	TGC	2	6	2411851	2411856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406240
43503	NC_013223	GACC	2	8	2411900	2411907	25 %	0 %	25 %	50 %	258406240
43504	NC_013223	GCT	2	6	2412115	2412120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406241
43505	NC_013223	ATT	2	6	2412176	2412181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406241
43506	NC_013223	CCG	2	6	2412274	2412279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406241
43507	NC_013223	GGA	2	6	2412353	2412358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406241
43508	NC_013223	CAGCGG	2	12	2412359	2412370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258406241
43509	NC_013223	CTC	2	6	2412413	2412418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406241
43510	NC_013223	CA	3	6	2412481	2412486	50 %	0 %	0 %	50 %	258406241
43511	NC_013223	GGA	2	6	2412529	2412534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406241
43512	NC_013223	C	8	8	2412595	2412602	0 %	0 %	0 %	100 %	258406241
43513	NC_013223	CCA	2	6	2412675	2412680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406241
43514	NC_013223	TCC	2	6	2412690	2412695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406241
43515	NC_013223	GTCC	2	8	2412711	2412718	0 %	25 %	25 %	50 %	258406241
43516	NC_013223	CCT	2	6	2412723	2412728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406241
43517	NC_013223	CAT	2	6	2412811	2412816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406241
43518	NC_013223	ATC	2	6	2412845	2412850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406241
43519	NC_013223	CAG	2	6	2412860	2412865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406241
43520	NC_013223	CGGGTG	2	12	2412887	2412898	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258406241
43521	NC_013223	GCC	2	6	2412916	2412921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406241
43522	NC_013223	C	6	6	2412920	2412925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43523	NC_013223	CA	3	6	2412937	2412942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43524	NC_013223	CT	3	6	2412968	2412973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43525	NC_013223	TGT	2	6	2413039	2413044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406242
43526	NC_013223	GGC	2	6	2413115	2413120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406242
43527	NC_013223	CAC	2	6	2413127	2413132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406242
43528	NC_013223	TGGC	2	8	2413154	2413161	0 %	25 %	50 %	25 %	258406242
43529	NC_013223	AATG	2	8	2413170	2413177	50 %	25 %	25 %	0 %	258406242
43530	NC_013223	A	6	6	2413279	2413284	100 %	0 %	0 %	0 %	258406242
43531	NC_013223	TCTGG	2	10	2413313	2413322	0 %	40 %	40 %	20 %	258406242
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43534	NC_013223	GGGCC	2	10	2413472	2413481	0 %	0 %	60 %	40 %	258406242
43535	NC_013223	ACGC	2	8	2413508	2413515	25 %	0 %	25 %	50 %	258406242
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43544	NC_013223	CAAAA	2	10	2413845	2413854	80 %	0 %	0 %	20 %	258406242
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43552	NC_013223	TGGCT	2	10	2414462	2414471	0 %	40 %	40 %	20 %	258406243
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43555	NC_013223	GTC	2	6	2414561	2414566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406243
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43557	NC_013223	T	6	6	2414571	2414576	0 %	100 %	0 %	0 %	258406243
43558	NC_013223	CTG	2	6	2414621	2414626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406243
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43562	NC_013223	GTG	2	6	2414791	2414796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406243
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43567	NC_013223	CGCGG	2	10	2415067	2415076	0 %	0 %	60 %	40 %	258406243
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43573	NC_013223	TGC	2	6	2415540	2415545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406244
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43583	NC_013223	CCCG	2	8	2416114	2416121	0 %	0 %	25 %	75 %	258406245
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43588	NC_013223	GA	3	6	2416450	2416455	50 %	0 %	50 %	0 %	258406245
43589	NC_013223	TCA	2	6	2416506	2416511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406245
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43609	NC_013223	GCT	2	6	2417438	2417443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43610	NC_013223	GCCT	2	8	2417457	2417464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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43612	NC_013223	GGGC	2	8	2417531	2417538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43613	NC_013223	TCT	2	6	2417694	2417699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406246
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43618	NC_013223	CCA	2	6	2417907	2417912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406246
43619	NC_013223	CGG	3	9	2417921	2417929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406246
43620	NC_013223	TCC	2	6	2417942	2417947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406246
43621	NC_013223	GAT	2	6	2417974	2417979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406246
43622	NC_013223	ACC	2	6	2418037	2418042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406246
43623	NC_013223	GC	3	6	2418057	2418062	0 %	0 %	50 %	50 %	258406246
43624	NC_013223	GCA	2	6	2418072	2418077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406246
43625	NC_013223	CCT	2	6	2418102	2418107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406246
43626	NC_013223	ATAC	2	8	2418240	2418247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43627	NC_013223	GGC	2	6	2418379	2418384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43628	NC_013223	CT	3	6	2418406	2418411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43629	NC_013223	TCA	3	9	2418570	2418578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406247
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43632	NC_013223	TGCG	2	8	2418681	2418688	0 %	25 %	50 %	25 %	258406247
43633	NC_013223	CACC	2	8	2418838	2418845	25 %	0 %	0 %	75 %	258406247
43634	NC_013223	GGC	2	6	2418864	2418869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406247
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43642	NC_013223	CTG	2	6	2419583	2419588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406247
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43645	NC_013223	AGCG	2	8	2419694	2419701	25 %	0 %	50 %	25 %	258406247
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43647	NC_013223	GGC	2	6	2419722	2419727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406247
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43653	NC_013223	CGG	2	6	2420159	2420164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406247
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43655	NC_013223	CGG	2	6	2420281	2420286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406247
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43676	NC_013223	CTG	2	6	2421286	2421291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406248
43677	NC_013223	G	6	6	2421299	2421304	0 %	0 %	100 %	0 %	258406248
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43704	NC_013223	CTG	2	6	2422704	2422709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406249
43705	NC_013223	CGG	2	6	2422721	2422726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406249
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43707	NC_013223	CAC	3	9	2422845	2422853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43708	NC_013223	GGC	2	6	2422969	2422974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43709	NC_013223	TTGTC	2	10	2422975	2422984	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43710	NC_013223	ACC	3	9	2423050	2423058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43711	NC_013223	ATCTCG	2	12	2423121	2423132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258406250
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43719	NC_013223	GTT	2	6	2423621	2423626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406250
43720	NC_013223	GAA	2	6	2423653	2423658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406250
43721	NC_013223	TGG	2	6	2423679	2423684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406250
43722	NC_013223	CGAC	2	8	2423686	2423693	25 %	0 %	25 %	50 %	258406250
43723	NC_013223	CAT	2	6	2423779	2423784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406250
43724	NC_013223	CGA	2	6	2423788	2423793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406250
43725	NC_013223	C	6	6	2423856	2423861	0 %	0 %	0 %	100 %	258406250
43726	NC_013223	GAC	2	6	2424026	2424031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406250
43727	NC_013223	TGGGCC	2	12	2424171	2424182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258406250
43728	NC_013223	CGA	2	6	2424193	2424198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406250
43729	NC_013223	GC	3	6	2424245	2424250	0 %	0 %	50 %	50 %	258406250
43730	NC_013223	CAC	2	6	2424304	2424309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406250
43731	NC_013223	G	7	7	2424476	2424482	0 %	0 %	100 %	0 %	258406250
43732	NC_013223	TCG	2	6	2424525	2424530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406250
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43734	NC_013223	TGG	2	6	2424636	2424641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406250
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43746	NC_013223	CGG	3	9	2425720	2425728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406250
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43847	NC_013223	GGC	2	6	2431439	2431444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406253
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43849	NC_013223	TCC	2	6	2431529	2431534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43851	NC_013223	GGA	2	6	2431785	2431790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43960	NC_013223	GT	3	6	2437543	2437548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43968	NC_013223	TCCTGA	2	12	2438226	2438237	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258406258
43969	NC_013223	CTG	2	6	2438258	2438263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406258
43970	NC_013223	GAT	2	6	2438291	2438296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406258
43971	NC_013223	TCC	2	6	2438414	2438419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406258
43972	NC_013223	CTG	2	6	2438579	2438584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406259
43973	NC_013223	GTT	2	6	2438600	2438605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406259
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43975	NC_013223	GAC	2	6	2438618	2438623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406259
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43980	NC_013223	GCCA	2	8	2438793	2438800	25 %	0 %	25 %	50 %	258406259
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43982	NC_013223	GCA	3	9	2438899	2438907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406259
43983	NC_013223	CCGG	2	8	2438922	2438929	0 %	0 %	50 %	50 %	258406259
43984	NC_013223	CAT	2	6	2438957	2438962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406259
43985	NC_013223	GTCG	2	8	2438980	2438987	0 %	25 %	50 %	25 %	258406259
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43988	NC_013223	ATG	2	6	2439108	2439113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406259
43989	NC_013223	G	6	6	2439220	2439225	0 %	0 %	100 %	0 %	258406259
43990	NC_013223	CGG	2	6	2439382	2439387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406259
43991	NC_013223	A	6	6	2439393	2439398	100 %	0 %	0 %	0 %	258406259
43992	NC_013223	CGG	2	6	2439433	2439438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406259
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43994	NC_013223	AAAT	2	8	2439495	2439502	75 %	25 %	0 %	0 %	258406259
43995	NC_013223	CT	3	6	2439525	2439530	0 %	50 %	0 %	50 %	258406259
43996	NC_013223	GCT	2	6	2439538	2439543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406259
43997	NC_013223	TCG	2	6	2439612	2439617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406259
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43999	NC_013223	TGC	2	6	2439768	2439773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406259
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