MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43004	NC_013223	GTG	2	6	2385525	2385530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406215
43005	NC_013223	GATTT	2	10	2385546	2385555	20 %	60 %	20 %	0 %	258406215
43006	NC_013223	TCGGC	2	10	2385568	2385577	0 %	20 %	40 %	40 %	258406215
43007	NC_013223	TGC	2	6	2385609	2385614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406215
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43012	NC_013223	CAC	2	6	2385877	2385882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43013	NC_013223	CGT	2	6	2385909	2385914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43015	NC_013223	GAT	2	6	2386090	2386095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406216
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43017	NC_013223	GTG	3	9	2386121	2386129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406216
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43019	NC_013223	GCA	2	6	2386272	2386277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406216
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43118	NC_013223	CCG	2	6	2391565	2391570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406221
43119	NC_013223	CAC	2	6	2391575	2391580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406221
43120	NC_013223	TCAG	2	8	2391636	2391643	25 %	25 %	25 %	25 %	258406221
43121	NC_013223	GTG	2	6	2391701	2391706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406221
43122	NC_013223	TCC	2	6	2391756	2391761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406221
43123	NC_013223	GGA	2	6	2391762	2391767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406221
43124	NC_013223	CAG	2	6	2391785	2391790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406221
43125	NC_013223	AAG	2	6	2391803	2391808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406221
43126	NC_013223	GGC	2	6	2391854	2391859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406221
43127	NC_013223	GCG	2	6	2391870	2391875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406221
43128	NC_013223	ATGG	2	8	2391961	2391968	25 %	25 %	50 %	0 %	258406222
43129	NC_013223	ACC	2	6	2392126	2392131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406222
43130	NC_013223	GCG	2	6	2392186	2392191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406222
43131	NC_013223	AGG	2	6	2392247	2392252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406222
43132	NC_013223	GGCCCC	2	12	2392312	2392323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406222
43133	NC_013223	TGG	2	6	2392443	2392448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406222
43134	NC_013223	TGT	2	6	2392452	2392457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406222
43135	NC_013223	CCT	2	6	2392468	2392473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406222
43136	NC_013223	GTCCG	2	10	2392505	2392514	0 %	20 %	40 %	40 %	258406222
43137	NC_013223	GCC	2	6	2392516	2392521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406222
43138	NC_013223	GC	3	6	2392559	2392564	0 %	0 %	50 %	50 %	258406222
43139	NC_013223	CAA	2	6	2392614	2392619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406222
43140	NC_013223	GGTT	2	8	2392636	2392643	0 %	50 %	50 %	0 %	258406222
43141	NC_013223	GGT	2	6	2392675	2392680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406222
43142	NC_013223	CGA	2	6	2392683	2392688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406222
43143	NC_013223	CCG	2	6	2392700	2392705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406222
43144	NC_013223	G	6	6	2392729	2392734	0 %	0 %	100 %	0 %	258406222
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43147	NC_013223	CGC	2	6	2392766	2392771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406222
43148	NC_013223	GCA	2	6	2392829	2392834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406222
43149	NC_013223	CGG	2	6	2392904	2392909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406222
43150	NC_013223	ATC	2	6	2392939	2392944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406222
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43153	NC_013223	TGG	2	6	2393040	2393045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406222
43154	NC_013223	CTT	2	6	2393106	2393111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406222
43155	NC_013223	C	6	6	2393209	2393214	0 %	0 %	0 %	100 %	258406222
43156	NC_013223	G	6	6	2393232	2393237	0 %	0 %	100 %	0 %	258406222
43157	NC_013223	T	6	6	2393242	2393247	0 %	100 %	0 %	0 %	258406222
43158	NC_013223	CCT	2	6	2393259	2393264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406222
43159	NC_013223	GGC	2	6	2393278	2393283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406222
43160	NC_013223	C	6	6	2393308	2393313	0 %	0 %	0 %	100 %	258406222
43161	NC_013223	CAA	2	6	2393320	2393325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406222
43162	NC_013223	AC	3	6	2393378	2393383	50 %	0 %	0 %	50 %	258406222
43163	NC_013223	CCA	2	6	2393435	2393440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406222
43164	NC_013223	CCAG	2	8	2393506	2393513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43165	NC_013223	CG	4	8	2393623	2393630	0 %	0 %	50 %	50 %	258406223
43166	NC_013223	CG	3	6	2393635	2393640	0 %	0 %	50 %	50 %	258406223
43167	NC_013223	CTG	2	6	2393644	2393649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406223
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43170	NC_013223	CCA	2	6	2393740	2393745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406223
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43172	NC_013223	TTGG	2	8	2393814	2393821	0 %	50 %	50 %	0 %	258406223
43173	NC_013223	ACAT	2	8	2393910	2393917	50 %	25 %	0 %	25 %	258406223
43174	NC_013223	TCC	2	6	2393958	2393963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406223
43175	NC_013223	TGA	2	6	2394019	2394024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406223
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43180	NC_013223	A	6	6	2394286	2394291	100 %	0 %	0 %	0 %	258406224
43181	NC_013223	TC	3	6	2394336	2394341	0 %	50 %	0 %	50 %	258406224
43182	NC_013223	CCG	2	6	2394410	2394415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406224
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43185	NC_013223	CA	3	6	2394478	2394483	50 %	0 %	0 %	50 %	258406224
43186	NC_013223	GCG	2	6	2394563	2394568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406224
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43188	NC_013223	CGC	2	6	2394606	2394611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406224
43189	NC_013223	GGGC	2	8	2394674	2394681	0 %	0 %	75 %	25 %	258406224
43190	NC_013223	CTG	2	6	2394682	2394687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406224
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43193	NC_013223	CAA	2	6	2394856	2394861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406224
43194	NC_013223	TCG	2	6	2394863	2394868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406224
43195	NC_013223	C	6	6	2394902	2394907	0 %	0 %	0 %	100 %	258406224
43196	NC_013223	CGT	2	6	2394928	2394933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406224
43197	NC_013223	CAC	2	6	2394940	2394945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406224
43198	NC_013223	GAC	2	6	2394961	2394966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406224
43199	NC_013223	GCC	2	6	2395073	2395078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43200	NC_013223	ACC	2	6	2395178	2395183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43201	NC_013223	GCC	2	6	2395192	2395197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43202	NC_013223	A	7	7	2395203	2395209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43203	NC_013223	CAG	2	6	2395216	2395221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43204	NC_013223	A	6	6	2395239	2395244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43205	NC_013223	GCC	2	6	2395299	2395304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43206	NC_013223	GAC	2	6	2395343	2395348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43207	NC_013223	A	6	6	2395362	2395367	100 %	0 %	0 %	0 %	258406225
43208	NC_013223	AGA	2	6	2395397	2395402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406225
43209	NC_013223	C	7	7	2395421	2395427	0 %	0 %	0 %	100 %	258406225
43210	NC_013223	CGT	2	6	2395450	2395455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406225
43211	NC_013223	CTC	2	6	2395527	2395532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406225
43212	NC_013223	TTC	2	6	2395546	2395551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406225
43213	NC_013223	AGG	3	9	2395552	2395560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406225
43214	NC_013223	GAATC	2	10	2395561	2395570	40 %	20 %	20 %	20 %	258406225
43215	NC_013223	CAA	2	6	2395641	2395646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406225
43216	NC_013223	TAT	2	6	2395725	2395730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406225
43217	NC_013223	CAT	2	6	2395814	2395819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406225
43218	NC_013223	GC	3	6	2395837	2395842	0 %	0 %	50 %	50 %	258406225
43219	NC_013223	CAAT	2	8	2395901	2395908	50 %	25 %	0 %	25 %	258406225
43220	NC_013223	ACT	2	6	2395939	2395944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406225
43221	NC_013223	TGG	2	6	2395987	2395992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406225
43222	NC_013223	G	6	6	2396000	2396005	0 %	0 %	100 %	0 %	258406225
43223	NC_013223	CTG	2	6	2396079	2396084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406225
43224	NC_013223	ATC	2	6	2396109	2396114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406225
43225	NC_013223	TGG	2	6	2396128	2396133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406225
43226	NC_013223	CTCCA	2	10	2396237	2396246	20 %	20 %	0 %	60 %	258406225
43227	NC_013223	ACG	2	6	2396251	2396256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406225
43228	NC_013223	TGAT	2	8	2396264	2396271	25 %	50 %	25 %	0 %	258406225
43229	NC_013223	AC	3	6	2396352	2396357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43230	NC_013223	CAC	2	6	2396362	2396367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43231	NC_013223	CAA	2	6	2396548	2396553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406226
43232	NC_013223	GCC	2	6	2396711	2396716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406226
43233	NC_013223	CCG	2	6	2396750	2396755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406226
43234	NC_013223	CCA	2	6	2396764	2396769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406226
43235	NC_013223	ACAA	2	8	2396828	2396835	75 %	0 %	0 %	25 %	258406226
43236	NC_013223	GGC	2	6	2396866	2396871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406226
43237	NC_013223	GAC	2	6	2396950	2396955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406226
43238	NC_013223	GAG	2	6	2397169	2397174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43283	NC_013223	T	7	7	2399313	2399319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43284	NC_013223	CTG	2	6	2399415	2399420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406230
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43307	NC_013223	GGC	2	6	2401053	2401058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406230
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43339	NC_013223	AGC	2	6	2402969	2402974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406232
43340	NC_013223	C	6	6	2402974	2402979	0 %	0 %	0 %	100 %	258406232
43341	NC_013223	TTG	2	6	2403245	2403250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406232
43342	NC_013223	CGG	2	6	2403288	2403293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406232
43343	NC_013223	GCGT	2	8	2403309	2403316	0 %	25 %	50 %	25 %	258406232
43344	NC_013223	GAACCC	2	12	2403334	2403345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	258406232
43345	NC_013223	CAGAG	2	10	2403388	2403397	40 %	0 %	40 %	20 %	258406232
43346	NC_013223	ATC	2	6	2403476	2403481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406232
43347	NC_013223	TTCC	2	8	2403672	2403679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43348	NC_013223	GCA	2	6	2403704	2403709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406233
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43351	NC_013223	CGC	2	6	2403959	2403964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406233
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43353	NC_013223	CA	3	6	2404085	2404090	50 %	0 %	0 %	50 %	258406233
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43355	NC_013223	GCG	2	6	2404125	2404130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406233
43356	NC_013223	GCC	2	6	2404164	2404169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406233
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43442	NC_013223	GGTTA	2	10	2408698	2408707	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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43471	NC_013223	GT	3	6	2410167	2410172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43472	NC_013223	T	7	7	2410211	2410217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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