MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_013223	CCAAC	2	10	2326286	2326295	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
42003	NC_013223	T	6	6	2326353	2326358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42004	NC_013223	TTGGC	2	10	2326411	2326420	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42005	NC_013223	GCG	2	6	2326584	2326589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406148
42006	NC_013223	CAA	2	6	2326648	2326653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406148
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42008	NC_013223	GCT	2	6	2326864	2326869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406148
42009	NC_013223	CGG	2	6	2326921	2326926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406148
42010	NC_013223	CCA	2	6	2327179	2327184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406148
42011	NC_013223	CTGC	2	8	2327272	2327279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42012	NC_013223	TGA	2	6	2327551	2327556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406149
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42015	NC_013223	CAA	2	6	2327675	2327680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406149
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42017	NC_013223	ATCG	2	8	2327759	2327766	25 %	25 %	25 %	25 %	258406149
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42030	NC_013223	CTG	2	6	2328720	2328725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406150
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42063	NC_013223	CT	3	6	2330392	2330397	0 %	50 %	0 %	50 %	258406151
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42105	NC_013223	AG	3	6	2332826	2332831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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42109	NC_013223	T	6	6	2333105	2333110	0 %	100 %	0 %	0 %	258406153
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42112	NC_013223	GCAGTA	2	12	2333253	2333264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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42119	NC_013223	GTT	2	6	2333590	2333595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406154
42120	NC_013223	CA	4	8	2333596	2333603	50 %	0 %	0 %	50 %	258406154
42121	NC_013223	AGTGG	2	10	2333607	2333616	20 %	20 %	60 %	0 %	258406154
42122	NC_013223	CCG	2	6	2333715	2333720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406154
42123	NC_013223	ACTCA	2	10	2333789	2333798	40 %	20 %	0 %	40 %	258406154
42124	NC_013223	A	7	7	2333922	2333928	100 %	0 %	0 %	0 %	258406154
42125	NC_013223	G	6	6	2333952	2333957	0 %	0 %	100 %	0 %	258406154
42126	NC_013223	TCC	2	6	2334111	2334116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406154
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42129	NC_013223	AGC	2	6	2334303	2334308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406154
42130	NC_013223	CG	3	6	2334378	2334383	0 %	0 %	50 %	50 %	258406154
42131	NC_013223	A	7	7	2334459	2334465	100 %	0 %	0 %	0 %	258406154
42132	NC_013223	TGC	2	6	2334485	2334490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406154
42133	NC_013223	ATC	2	6	2334498	2334503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406154
42134	NC_013223	CGG	2	6	2334576	2334581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406154
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42136	NC_013223	TGT	2	6	2334624	2334629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406154
42137	NC_013223	GT	3	6	2334671	2334676	0 %	50 %	50 %	0 %	258406154
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42142	NC_013223	CCG	2	6	2335097	2335102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406154
42143	NC_013223	A	7	7	2335190	2335196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42144	NC_013223	CCA	2	6	2335217	2335222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42145	NC_013223	CA	3	6	2335239	2335244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42146	NC_013223	GAA	2	6	2335262	2335267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42147	NC_013223	GCC	2	6	2335294	2335299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42148	NC_013223	GCCAA	2	10	2335420	2335429	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42149	NC_013223	CCA	2	6	2335548	2335553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406155
42150	NC_013223	CCA	2	6	2335570	2335575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406155
42151	NC_013223	GC	3	6	2335590	2335595	0 %	0 %	50 %	50 %	258406155
42152	NC_013223	TGC	2	6	2335623	2335628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406155
42153	NC_013223	AAG	2	6	2335631	2335636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406155
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42155	NC_013223	CCCGCC	2	12	2335675	2335686	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	258406155
42156	NC_013223	A	6	6	2335698	2335703	100 %	0 %	0 %	0 %	258406155
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42166	NC_013223	CGTT	2	8	2336218	2336225	0 %	50 %	25 %	25 %	258406155
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42169	NC_013223	G	7	7	2336349	2336355	0 %	0 %	100 %	0 %	258406155
42170	NC_013223	GTC	2	6	2336372	2336377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406155
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42177	NC_013223	AATC	2	8	2336746	2336753	50 %	25 %	0 %	25 %	258406155
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42185	NC_013223	TGC	2	6	2337253	2337258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406156
42186	NC_013223	AAT	2	6	2337261	2337266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406156
42187	NC_013223	CACTGT	2	12	2337339	2337350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258406156
42188	NC_013223	TTC	2	6	2337502	2337507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406156
42189	NC_013223	CAG	2	6	2337580	2337585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406156
42190	NC_013223	CGC	2	6	2337690	2337695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406156
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42193	NC_013223	A	7	7	2337895	2337901	100 %	0 %	0 %	0 %	258406156
42194	NC_013223	TCAT	2	8	2338082	2338089	25 %	50 %	0 %	25 %	258406157
42195	NC_013223	TCT	2	6	2338098	2338103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406157
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42201	NC_013223	CGCA	2	8	2338325	2338332	25 %	0 %	25 %	50 %	258406157
42202	NC_013223	CTC	2	6	2338359	2338364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406157
42203	NC_013223	GGCGC	2	10	2338382	2338391	0 %	0 %	60 %	40 %	258406157
42204	NC_013223	GCC	2	6	2338477	2338482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406157
42205	NC_013223	CAG	2	6	2338661	2338666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406157
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42207	NC_013223	CAG	2	6	2338684	2338689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406157
42208	NC_013223	AGC	2	6	2338707	2338712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406157
42209	NC_013223	GGCCTC	2	12	2338751	2338762	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258406157
42210	NC_013223	CG	3	6	2338806	2338811	0 %	0 %	50 %	50 %	258406157
42211	NC_013223	CGGT	2	8	2338897	2338904	0 %	25 %	50 %	25 %	258406157
42212	NC_013223	CAAA	2	8	2338910	2338917	75 %	0 %	0 %	25 %	258406157
42213	NC_013223	AAAC	2	8	2338954	2338961	75 %	0 %	0 %	25 %	258406157
42214	NC_013223	AGG	2	6	2339219	2339224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42215	NC_013223	A	7	7	2339281	2339287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42216	NC_013223	CAT	2	6	2339312	2339317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42217	NC_013223	CGC	2	6	2339398	2339403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406158
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42219	NC_013223	T	6	6	2339483	2339488	0 %	100 %	0 %	0 %	258406158
42220	NC_013223	AGT	2	6	2339606	2339611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406158
42221	NC_013223	CT	3	6	2339728	2339733	0 %	50 %	0 %	50 %	258406159
42222	NC_013223	TCT	2	6	2339867	2339872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406159
42223	NC_013223	CAA	2	6	2339885	2339890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406159
42224	NC_013223	TCA	2	6	2339944	2339949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406159
42225	NC_013223	GA	3	6	2340194	2340199	50 %	0 %	50 %	0 %	258406159
42226	NC_013223	CCG	2	6	2340254	2340259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406159
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42228	NC_013223	TCC	2	6	2340487	2340492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406159
42229	NC_013223	TCG	2	6	2340506	2340511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406159
42230	NC_013223	GCC	2	6	2340553	2340558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406159
42231	NC_013223	AG	3	6	2340565	2340570	50 %	0 %	50 %	0 %	258406159
42232	NC_013223	CAG	2	6	2340573	2340578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406159
42233	NC_013223	CAA	2	6	2340778	2340783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406160
42234	NC_013223	GCT	2	6	2340787	2340792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406160
42235	NC_013223	CCG	2	6	2340887	2340892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406160
42236	NC_013223	AGGG	2	8	2340978	2340985	25 %	0 %	75 %	0 %	258406160
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42238	NC_013223	GCG	2	6	2341193	2341198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406160
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42329	NC_013223	AGC	2	6	2347108	2347113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406173
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42341	NC_013223	T	6	6	2348168	2348173	0 %	100 %	0 %	0 %	258406175
42342	NC_013223	GGCAT	2	10	2348187	2348196	20 %	20 %	40 %	20 %	258406175
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42347	NC_013223	TTTG	2	8	2348310	2348317	0 %	75 %	25 %	0 %	258406175
42348	NC_013223	CACC	2	8	2348422	2348429	25 %	0 %	0 %	75 %	258406176
42349	NC_013223	T	6	6	2348462	2348467	0 %	100 %	0 %	0 %	258406176
42350	NC_013223	CTT	2	6	2348483	2348488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406176
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42353	NC_013223	AAC	2	6	2348725	2348730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406177
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42355	NC_013223	TCCG	2	8	2348914	2348921	0 %	25 %	25 %	50 %	258406178
42356	NC_013223	CAC	2	6	2348937	2348942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406178
42357	NC_013223	CAT	2	6	2349053	2349058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406178
42358	NC_013223	TGC	2	6	2349180	2349185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406178
42359	NC_013223	TCA	2	6	2349230	2349235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406179
42360	NC_013223	GGT	2	6	2349286	2349291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406179
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42362	NC_013223	CCA	2	6	2349513	2349518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406179
42363	NC_013223	GCG	2	6	2349538	2349543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406179
42364	NC_013223	TCT	2	6	2349582	2349587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406179
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42366	NC_013223	CTG	2	6	2349785	2349790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406179
42367	NC_013223	TAT	2	6	2349813	2349818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406179
42368	NC_013223	ATGG	2	8	2349837	2349844	25 %	25 %	50 %	0 %	258406179
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42372	NC_013223	AG	3	6	2349996	2350001	50 %	0 %	50 %	0 %	258406180
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42374	NC_013223	AGAA	2	8	2350060	2350067	75 %	0 %	25 %	0 %	258406180
42375	NC_013223	CG	3	6	2350149	2350154	0 %	0 %	50 %	50 %	258406180
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42377	NC_013223	CGAAA	2	10	2350302	2350311	60 %	0 %	20 %	20 %	258406181
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42379	NC_013223	GAT	2	6	2350368	2350373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406181
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42383	NC_013223	GAA	2	6	2350530	2350535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406182
42384	NC_013223	GAC	2	6	2350597	2350602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406182
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42386	NC_013223	GGT	2	6	2350636	2350641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406182
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42389	NC_013223	TTC	2	6	2350683	2350688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406182
42390	NC_013223	GACC	2	8	2350747	2350754	25 %	0 %	25 %	50 %	258406182
42391	NC_013223	CTT	2	6	2350822	2350827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406182
42392	NC_013223	GGT	2	6	2350907	2350912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406182
42393	NC_013223	TGG	2	6	2351086	2351091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406182
42394	NC_013223	TTG	2	6	2351115	2351120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406182
42395	NC_013223	GAC	2	6	2351167	2351172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406182
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42400	NC_013223	T	6	6	2351383	2351388	0 %	100 %	0 %	0 %	258406183
42401	NC_013223	ACG	2	6	2351422	2351427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406183
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42405	NC_013223	GTA	2	6	2351598	2351603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406183
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42408	NC_013223	T	6	6	2351793	2351798	0 %	100 %	0 %	0 %	258406184
42409	NC_013223	ACG	2	6	2351866	2351871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406184
42410	NC_013223	TCT	2	6	2351881	2351886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406184
42411	NC_013223	GGA	2	6	2351895	2351900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406184
42412	NC_013223	CTT	2	6	2351931	2351936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406184
42413	NC_013223	GCCC	2	8	2352015	2352022	0 %	0 %	25 %	75 %	258406184
42414	NC_013223	CCGC	2	8	2352057	2352064	0 %	0 %	25 %	75 %	258406184
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42424	NC_013223	CAGGG	2	10	2352778	2352787	20 %	0 %	60 %	20 %	258406185
42425	NC_013223	T	6	6	2352854	2352859	0 %	100 %	0 %	0 %	258406185
42426	NC_013223	GCCG	2	8	2352919	2352926	0 %	0 %	50 %	50 %	258406186
42427	NC_013223	CTG	2	6	2352958	2352963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406186
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42432	NC_013223	CAC	2	6	2353377	2353382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406187
42433	NC_013223	GGC	2	6	2353445	2353450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406187
42434	NC_013223	CTT	2	6	2353454	2353459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406187
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42437	NC_013223	CAC	2	6	2353559	2353564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406187
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42440	NC_013223	CCA	2	6	2353664	2353669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406187
42441	NC_013223	CTT	2	6	2353676	2353681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406187
42442	NC_013223	CAC	2	6	2353697	2353702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406187
42443	NC_013223	GCTCGG	2	12	2353790	2353801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258406187
42444	NC_013223	TCG	2	6	2353864	2353869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406187
42445	NC_013223	TCG	2	6	2353912	2353917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406187
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42450	NC_013223	GCG	2	6	2354089	2354094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406187
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42452	NC_013223	CGC	2	6	2354322	2354327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406187
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42454	NC_013223	CTT	2	6	2354428	2354433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406188
42455	NC_013223	TCT	2	6	2354441	2354446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406188
42456	NC_013223	GCCC	2	8	2354498	2354505	0 %	0 %	25 %	75 %	258406188
42457	NC_013223	GCA	2	6	2354520	2354525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42458	NC_013223	CGG	2	6	2354615	2354620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406188
42459	NC_013223	CATA	2	8	2354676	2354683	50 %	25 %	0 %	25 %	258406188
42460	NC_013223	CGA	2	6	2354764	2354769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42461	NC_013223	CCG	2	6	2354903	2354908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406188
42462	NC_013223	CG	3	6	2355093	2355098	0 %	0 %	50 %	50 %	258406188
42463	NC_013223	GAT	2	6	2355112	2355117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406188
42464	NC_013223	TTC	2	6	2355163	2355168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406188
42465	NC_013223	ACG	2	6	2355186	2355191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42466	NC_013223	GATCGC	2	12	2355231	2355242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42467	NC_013223	TTG	2	6	2355410	2355415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406188
42468	NC_013223	GGC	2	6	2355460	2355465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406188
42469	NC_013223	AATA	2	8	2355501	2355508	75 %	25 %	0 %	0 %	258406188
42470	NC_013223	GGCA	2	8	2355634	2355641	25 %	0 %	50 %	25 %	258406188
42471	NC_013223	G	6	6	2355648	2355653	0 %	0 %	100 %	0 %	258406188
42472	NC_013223	ACC	2	6	2355668	2355673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406188
42473	NC_013223	ATTCAG	2	12	2355736	2355747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258406188
42474	NC_013223	TTC	2	6	2355790	2355795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406188
42475	NC_013223	CAG	2	6	2355814	2355819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42476	NC_013223	TGC	3	9	2355854	2355862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42477	NC_013223	TCG	2	6	2355875	2355880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42478	NC_013223	TCG	2	6	2355899	2355904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42479	NC_013223	TCA	2	6	2355932	2355937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406188
42480	NC_013223	ACA	2	6	2355968	2355973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406188
42481	NC_013223	TTC	2	6	2355985	2355990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406188
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42483	NC_013223	GCC	2	6	2356131	2356136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406188
42484	NC_013223	A	6	6	2356176	2356181	100 %	0 %	0 %	0 %	258406188
42485	NC_013223	AAT	2	6	2356255	2356260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406188
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42487	NC_013223	CGT	2	6	2356359	2356364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42488	NC_013223	GTC	3	9	2356418	2356426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42489	NC_013223	ATG	2	6	2356448	2356453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406188
42490	NC_013223	GCT	2	6	2356464	2356469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406188
42491	NC_013223	TTC	2	6	2356568	2356573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406189
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42494	NC_013223	AACC	2	8	2356663	2356670	50 %	0 %	0 %	50 %	258406189
42495	NC_013223	CTG	2	6	2356687	2356692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406189
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42498	NC_013223	GTC	2	6	2356831	2356836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406189
42499	NC_013223	CCA	2	6	2356908	2356913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406189
42500	NC_013223	CGA	2	6	2357030	2357035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406190

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